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《水产学杂志》2021,(3)
针对24尾养殖红尾仙女虾Branchinella thailandensis样本的25μL PCR体系,进行了Mg~(2+)、引物浓度、Taq DNA聚合酶3因素3水平L_9(3~4)正交实验;退火温度范围设置为48~59℃(间隔1℃),优化了ISSR反应体系及筛选的6个多态性和重复性较好的引物,分析了红尾仙女虾养殖群体的遗传多样性。结果共扩增出37个位点,其中32个多态位点,多态位点比率86.49%,Nei's指数和Shannon's指数分别为0.2570和0.3962,表明ISSR分子标记技术能够稳定可靠地应用于红尾仙女虾遗传多样性分析研究;红尾仙女虾养殖群体具有较高的遗传多样性,人工养殖环境对其遗传多样性的影响较小。 相似文献
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微卫星DNA在畜禽遗传育种中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
随着种群遗传学的发展,分子遗传标记特别是微卫星标记已经成为研究种群遗传的有力工具。微卫星是近年来常用的一种检测基因组DNA多态性新型的、建立在多聚酶链式反应(PCR)基础之上的一种遗传标记技术,因其数量分布广、多态性丰富及检测快速方便等优点而备受青睐,在畜禽的遗传育种中已得到了广泛的应用。就微卫星DNA的研究简史、结构特性、形成的机制、功能及其在畜禽育种中的应用等作一概述。 相似文献
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扩增片段长度多态性(Amp lified Fragm ent Length Polymorph ism,AFLP)是一种新的DNA指纹技术,具有多态性丰富、结果可靠、所需DNA量少等优点。AFLP标记技术在鱼类遗传研究上已得到广泛的应用,并取得了一定成果。 相似文献
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为探索人工增殖活动对本地大竹蛏(Solen grandis)种质资源带来的影响,采用SSR及ISSR分子标记手段对江苏大竹蛏野生群体与人工增殖群体的遗传多样性及遗传结构进行了联合分析。筛选的14对SSR引物扩增获得多态性位点150个(PPB=93.16%),Nei's基因多样性指数和平均Shannon信息指数分别为0.134 2和0.253 5;筛选的10条ISSR引物获得多态性位点85个(PPB=91.93%),Nei's基因多样性指数和平均Shannon信息指数分别为0.131 0和0.230 2。两种方法分析得到野生群体的遗传多样性参数均显著高于人工增殖群体,但两群体间并未产生明显的遗传分化。实验结果表明,江苏沿海大竹蛏群体的遗传多样性水平较高,人工增殖群体的遗传多样性虽有所下降,但并未导致该地区大竹蛏种质资源遗传结构的显著改变。因此人工增养殖活动仍然能够作为补充大竹蛏资源的主要手段,但应探索采用高效生态的增养殖模式,对大竹蛏的种质资源进行合理的开发与利用。 相似文献
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ISSR标记在坛紫菜不同色泽丝状体种质鉴定中的应用 总被引:15,自引:2,他引:13
ISSR标记在坛紫菜不同色泽丝状体种质鉴定中的应用=Application of ISSR markers in germplasm identification of different color’s Porphyra haitanensis filament strains[刊,中]/谢潮添(集美大学水产学院,厦门361021),纪德华,陈昌生,徐燕,张元//水产学报,—2007,31(1).-105~111
用ISSR分子标记技术对4个不同色泽坛紫菜(Porphyra haitanensis)丝状体品系(分别为桔黄色,褐绿色,棕红色和紫色)及1个野生型对照丝状体品系(褐红色)进行了遗传分析,共筛选出11条引物,PCR反应得到了129个扩增位点,多态位点比率达88.4%,有效等位基因数为1.6369,期望杂合度为0.3609,Shannon多样性指数为0.5265;根据Nei方法计算了这5个坛紫菜丝状体品系间的遗传相似性系数和遗传距离,结果发现4个不同色泽丝状体间的平均遗传距离为0.5727,它们同野生型对照的平均遗传距离为0.6564,同时应用UPMGA法对它们进行了聚类分析。最后应用引物812扩增的4个多态性位点构建了这5个不同坛紫菜丝状体的DNA指纹图谱,使每一品系都具有独特的DNA指纹,并将其转化成了计算机可以识别的数码指纹,可以方便地应用于坛紫菜丝状体的种质鉴定中。结果表明ISSR分子标记技术可以作为坛紫菜丝状体种质鉴定的有效技术手段,提供快捷、准确的鉴定结果。图3表5参24
关键词:坛紫菜; ISSR标记; 遗传分析; 种质鉴定
E-mail: cschen@jmu.edu.cn 相似文献
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为进一步开展鱼康浪白鱼的分子生物学研究,采用SLAF-seq(specific length amplification fragment sequencing)技术获取鱼康浪白鱼大量多态性SLAF标签,进而通过序列分析开发一批特异性高的单核苷酸多态性(SNP)标记。试验共获得688615个SLAF标签,平均测序深度为107.73 x,其中多态性SLAF标签205138个,通过序列分析检测到487 639个SNP标记。试验表明,SLAF-seq技术可较好地用于鱼康浪白鱼SNP位点开发,其效率远远高于ISSR(inter-simple sequence repeat)、AFLP(amplified fragment length polymorphism)、RAPD(random amplified polymorphism DNA)等传统分子标记技术。从全基因组范围获得的SNP位点标记可用以进一步完成后续群体进化分析和特异性SNP标记的开发。 相似文献