吉奥罗非鱼(新吉富罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂)和4个近缘遗传型罗非鱼的遗传差异的RAPD、SSR比较分析

以1个新型杂交鱼-吉奥罗非鱼(新吉富罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂)群体,4个近缘遗传型罗非鱼群体[奥尼(尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂)、新吉富罗非鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼]为实验材料,采用RAPD和SSR技术,比较分析这两个杂交种间及它们同亲本间的遗传差异.RAPD方面:①群体多态座位比例(P)-吉奥(20.4%)>新吉富(18.5%),但<奥利亚(21.4%)<奥尼(21.7%)<尼罗(22.3%);②Nei'S平均遗传相似系数(Ip)-吉奥(0.9086)<新吉富(0.9231),但>奥利亚(0.8895)>尼罗(0.8588)>奥尼(0.8069);③香农多样性指数(Ha)-吉奥(0.1326)>新吉富(0.1103),但<奥利亚(0.1514)<尼罗(0.1742)<奥尼(0.2410);④群体两两间遗传相似系数(Ipop)-吉奥-奥尼(0.9444)<吉奥-尼罗(0.9496)<吉奥-新吉富(0.9544),但>吉奥-奥利亚(0.9383).SSR方面:①平均有效等位基因数(Ne)-吉奥(2.43)>新吉富(2.31)>尼罗(1.94)>奥利亚(1.18),但<奥尼(2.82);②平均遗传杂合度(H)-吉奥(0.700)>尼罗(0.570)>奥利亚(0.497)>新吉富(0.398),但<奥尼(0.816);③群体的多态信息含量(PIC)-吉奥(0.661)>尼罗(0.568)>奥利亚(0.513)>新吉富(0.420),但<奥尼(0.692);④依据遗传距离构建的NJ树和UPGMA树,奥利亚罗非鱼单独为一支,吉奥等4种罗非鱼为一支.总的说来,RAPD和SSR两种技术检测结果所反映的群体遗传信息一致.这表明,无论是吉奥还是奥尼,两个杂交种在遗传上都同各自的母本较近,这同作者先前揭示的形态和生长等方面的母本效应一致.     

方斑东风螺2个养殖群体遗传变异的RAPD分析

运用RAPD技术对方斑东风螺(Babylonia areolata Lamarck)泰国养殖群体和海南养殖群体的遗传多样性进行研究。选取21个10 bp随机引物对方斑东风螺2个群体各20个个体进行RAPD分析,21个引物共检测出222条带。泰国养殖群体的多态位点比例为70.27%,Shannon多样性信息指数为0.1858,Nei’s基因多样性指数为0.249 1,群体内个体间平均遗传相似率为0.7920,平均遗传距离为0.2080;海南养殖群体的多态位点比例为73.87%,Shannon信息指数为0.2044,Nei’s基因多样性指数为0.2615,群体内个体间平均遗传相似率为0.7620,平均遗传距离为0.2380。群体内遗传变异占种内遗传变异的76.81%,群体间遗传变异占23.19%。以上分析表明,方斑东风螺泰国养殖群体和海南养殖群体的遗传多样性水平仍较高,但海南群体的遗传多样性水平比泰国群体要高。     

罗非鱼性别相关微卫星标记的初步筛选

为分析罗非鱼群体的遗传多样性以及筛选与罗非鱼性别相关的微卫星标记。应用24对微卫星引物,使用常规PCR及聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法在两个尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)群体和两个奥利亚罗非鱼(O.aureus)群体中初步筛选到UNH931、GM128、GM201、GM258、GM597以及UNH898共6个与性别相关的微卫星标记。然后使用降落PCR以及毛细管电泳的方法在两个尼罗罗非鱼群体、两个奥利亚罗非鱼群体以及ZY 1、WY 1、YY 1和YY 2型罗非鱼群体中进一步扩增这6个微卫星标记,统计各群体的遗传多样性参数:6个微卫星标记在上述群体共297个样本中检测到95个等位基因,其大小在97~302 bp之间,各位点在各群体等位基因数在1~13个之间,各群体平均观测等位基因数为2.167~9.333,平均有效等位基因数为1.624~4.966,平均观测杂合度为0.324~0.983,平均期望杂合度为0.329~0.782,平均多态信息含量为0.275~0.753;两个尼罗罗非鱼群体、WY 1和YY 2群体达到高度多态(PIC>0.5),两个奥利亚罗非鱼群体、ZY 1和YY 1群体为中度多态(0.25相似文献   

我国尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼养殖群体的遗传渐渗

用ＬＫＢ平板电泳仪，４．４％聚丙烯酰胺凝胶对南京罗非鱼良种场尼罗罗非鱼，奥利亚罗非鱼养殖群体肌，肝，脑，心，眼中的１０种同工酶进行电泳分析的结果表明，奥利亚罗非鱼的群体未见的多态位点，平均杂合度为０，是超“纯”的养殖群体，尼罗罗非鱼群体中有２０％的尼奥杂交鱼，其体形酷似尼罗，难以肉眼鉴别，由此可见，我国尼罗罗非鱼养殖群体中已存在遗传渐渗问题，须注意防杂和提纯。在剔除了杂交鱼后，该场尼罗罗非鱼群体的     

陕西秦岭细鳞鲑群体遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD技术,对秦岭细鳞鲑(Brachymystax lenok)黑河群体和湑水河群体的遗传多样性进行分析。结果显示:黑河群体的多态位点比例为25.8%,群体平均杂合度为0.1782,Shannon多样性指数为0.6520;湑水河的多态位点比例为23.4%,群体平均杂合度为0.1526,Shannon多样性指数为0.05214。黑河群体内各个体之间的遗传相似度度为0.9495,遗传距离为0.0664;湑水河群体内各个体之间的遗传相似度度为0.9549,遗传距离为0.0556;两群体之间的遗传距离为0.0152。     

吉奥罗非鱼（新吉富罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂）和4种近缘遗传型罗非鱼的遗传差异的RAPD、SSR比较分析

以1种新型杂交鱼-吉奥罗非鱼（新吉富罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂）群体，4种近缘遗传型罗非鱼[奥尼（尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂）、新吉富罗非鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼]为实验材料，采用RAPD和SSR技术，比较地分析杂交种间及它们同亲本间的遗传差异。RAPD方面：①群体多态座位比例（P）-吉奥（20.4%）>新吉富（18.5%），但奥利亚（21.4%）<奥尼（21.7%）<尼罗（22.3%）；②Nei's平均遗传相似系数(I_p)-吉奥（0.9086）<新吉富（0.9231），但>奥利亚（0.8895）>尼罗（0.8588）>奥尼（0.8069）；③香农多样性指数(H_o)-吉奥（0.1326）>新吉富（0.1103），但<奥利亚（0.1514）<尼罗（0.1742）<奥尼（0.2410）；④群体两两间遗传相似系数(I_pop)-吉奥-奥尼(0.9444)<吉奥-尼罗（0.9496）<吉奥-新吉富（0.9544），但>吉奥-奥利亚（0.9383）。SSR结果：① 平均有效等位基因（N_e）数-吉奥(2.43)>新吉富(2.31)>尼罗（1.94）>奥利亚（1.18），但<奥尼（2.82）；②平均遗传杂合度（H）-吉奥(0.700)>尼罗（0.570）>奥利亚（0.497）>新吉富(0.398)，但<奥尼 (0.816)；③ 群体的多态信息含量（PIC）-吉奥（0.661）>尼罗（0.568）>奥利亚（0.513）>新吉富（0.420），但<奥尼（0.692）； ④ 依据遗传距离构建的NJ树和UPGMA树，奥利亚罗非鱼单独为一支，吉奥等4种罗非鱼为一支。总的说来，RAPD和SSR两种技术检测结果所反映的群体遗传信息一致。这表明，无论是吉奥还是奥尼，两个杂交种在遗传上都同各自的母本较近，这同作者先前揭示的形态和生长等方面的母本效应一致。     

罗非鱼杂交F1代与亲本的遗传关系及其杂种优势的利用

用ＲＡＰＤ 技术研究奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼杂交子代和亲本的遗传关系及其在杂种优势中的应用。在所用的１６ 个随机引物中,有１１ 个引物在罗非鱼亲代和杂交子代间呈现多态。遗传相似性指数和遗传距离的计算结果表明,正交子代（ 尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂） 在遗传关系上界于亲代之间,不表现出明显的倾向性;而反交子代（ 奥利亚罗非鱼♀×尼罗罗非鱼♂） 却与母本奥利亚罗非鱼极其相似。说明正、反交子代与两亲本遗传相似性有明显的不同,表明遗传性状介于两亲本之间的杂交子代更有可能形成显著的杂种优势。同时发现,扩增片段ＯＰＡ０７１９００ 、ＯＰＡ０７９６０ 、ＯＰＺ１４７２０ 和ＯＰＺ１４６００ 可以作为鉴别尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼和正交子代的遗传标记。     

吉奥罗非鱼（新吉富罗非鱼♀&#215;奥利亚罗非鱼♂）和4个近缘遗传型罗非鱼的遗传差异的RAPD、SSR比较分析

以1个新型杂交鱼-吉奥罗非鱼（新吉富罗非鱼♀&#215;奥利亚罗非鱼♂）群体，4个近缘遗传型罗非鱼群体[奥尼（尼罗罗非鱼♀&#215;奥利亚罗非鱼♂）、新吉富罗非鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼]为实验材料，采用RAPD和SSR技术，比较分析这两个杂交种间及它们同亲本间的遗传差异。RAPD方面：①群体多态座位比例（P）-吉奥（20．4％）〉新吉富（18．5％），但〈奥利亚（21．4％）〈奥尼（21．7％）〈尼罗（22．3％）；②Nei’S平均遗传相似系数（Jp）-吉奥（0．9086）〈新吉富（0．9231），但〉奥利亚（0．8895）〉尼罗（0．8588）〉奥尼（0．8069）；③香农多样性指数（Ho）-吉奥（0．1326）〉新吉富（0．1103），但〈奥利亚（0．1514）〈尼罗（0．1742）〈奥尼（0．2410）；④群体两两间遗传相似系数（Ipop）-吉奥-奥尼（0．9444）〈吉奥-尼罗（0．9496）〈吉奥-新吉富（0．9544），但〉吉奥-奥利亚（0．9383）。SSR方面：①平均有效等位基因数（Ne）-吉奥（2．43）〉新吉富（2．31）〉尼罗（1．94）〉奥利亚（1．18），但〈奥尼（2．82）；②平均遗传杂合度（H）-吉奥（0．700）〉尼罗（0．570）〉奥利亚（0．497）〉新吉富（0．398），但〈奥尼（0．816）；③群体的多态信息含量（PIC）-吉奥（0．661）〉尼罗（0．568）〉奥利亚（0．513）〉新吉富（0．420），但〈奥尼（0．692）；④依据遗传距离构建的NJ树和UPGMA树，奥利亚罗非鱼单独为一支，吉奥等4种罗非鱼为一支。总的说来，RAPD和SSR两种技术检测结果所反映的群体遗传信息一致。这表明，无论是吉奥还是奥尼，两个杂交种在遗传上都同各自的母本较近，这同作者先前揭示的形态和生长等方面的母本效应一致。     

用RAPD分析对罗非鱼遗传变异的研究及其对杂种优势的应用

应用ＲＡＰＤ技术检测了一个奥利亚罗非鱼养殖群体和湘湖、美国和沙市三个尼罗非鱼和尼罗罗非鱼在群体内或群体间存在遗传差异。ＯＰＺ０６、Ｐ）Ｚ１０、ＯＰＺ１２和ＯＰＺ１９四个引物都有一个扩增片段具有种的特异性,可以作为临别尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼的遗传标记。群体内遗传相似性指数（Ｓ）表明,湘湖、美国和沙市三群体尼罗罗非鱼都保留了较高水平的遗传变异（Ｓ分别为０．７９８、０．７９５和０８２４）,而奥利亚罗非     

罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体的遗传多样性和遗传关系分析

罗非鱼“粤闽1号”是用尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)和奥利亚罗非鱼(O. aureus)培育的全雄罗非鱼新品种。采用同工酶电泳技术和线粒体DNA控制区序列分析方法,对罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体的遗传多样性、遗传结构及群体之间的遗传关系进行研究。同工酶电泳结果显示,酯酶(EST)和乳酸脱氢酶(LDH)的酶谱具有组织和群体特异性。肌肉和脾脏中的EST表达量极低,而肝脏中的EST表达量较高,LDH在3种组织中均有较高表达,但酶谱存在差异。在罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体中,共检测到10条EST酶带和5条LDH酶带,多态性位点比例(P)为12.50%~71.43%,平均观测杂合度(Ho)为0.0417~0.6143,Hardy-Weinberg遗传偏离指数(D)为?0.2347~0.9072。线粒体DNA控制区序列分析结果显示,mtDNA D-loop区的碱基组成无显著差异,均呈现出A+T碱基偏向性(63.39%)。在罗非鱼“粤闽1号”及其繁育群体中,共发现20种单倍型,核苷酸多样性指数(Pi)为0~0.0519,奥尼罗非鱼雌鱼(WY1)、尼罗罗非鱼雌鱼(XX)、尼罗罗非鱼雄鱼(XY)和罗非鱼“粤闽1号”(XY2)群体的Pi值(0.0440~0.0519)明显高于超雄尼罗罗非鱼(YY1)、超雄奥尼罗非鱼(YY2)和奥利亚罗非鱼雌鱼(WZ)群体的Pi值(0~0.0009)。各群体之间的遗传分化指数(FST)为?0.0115~0.9963,XY2与WY1群体之间、XX与XY群体之间以及WZ和YY2群体之间的遗传分化不显著(FST<0.05, P>0.05)。XY2群体与尼罗罗非鱼群体(XX群体和XY群体)和奥利亚罗非鱼群体(WZ群体)之间的平均遗传距离分别为0.0639和0.0695。在NJ系统进化树中,XX、XY、YY1和XY2群体聚为一支,WY1、WZ和YY2群体聚为另一支。本研究揭示了罗非鱼“粤闽1号”的生化和分子遗传特征,为其种质鉴定、繁育群体的构建和优良性状的稳定遗传提供理论基础。     

斑节对虾养殖群体遗传多样性的同工酶和RAPD分析

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）和RAPD方法对厦门养殖斑节对虾（Penaeus monodon Fabricius）群体的遗传多样性进行分析。9种同工酶共检测到21个座位，其中多态座位13个，多态座位比例为61．90％，预期杂合度0．151，观察杂合度0．120，Hardy—Weinberg遗传偏离指数（d）为-0．208，存在杂合子缺失。经x^2拟合度检验，多数座位偏离Hardy—Weinberg平衡，表明群体未达到随机交配。14个10bp引物共获得了83个标记，单个引物获得的标记数为2～11个，平均每个引物扩增出5．93个座位，其中多态标记数68个，多态位点比例为81．93％，杂合度为0．246，基因多样性为0．260，Shannon’S信息指数为0．397。两种方法均表明该斑节对虾养殖群体的遗传多样性水平较高，但可能已有近交衰退发生。     

青海湖裸鲤繁殖群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对青海湖裸鲤的3个洄游繁殖群体-黑马河(HM)、布哈河(BH)及沙柳河(SL)群体各30个个体的DNA多态性进行了分析。用13个引物在三个群体中共检测出85个位点，其中多态性位点68个。青海湖裸鲤群体总的DNA多态位点百分率为80．0％。数据分析结果显示：青海湖裸鲤3个群体总的Nei基因多样性为0．3395，Shannon遗传多样性信息指数为0．4861，存在着较为丰富的遗传多样性。青海湖裸鲤3个群体间平均遗传距离为0．0788，基因分化系数Gst为0．1070，表明3个繁殖群体间产生了一定程度的遗传分化，通过UPGMA方法进行聚类分析显示，HM群体和BH群体优先聚类，表示它们之间的基因交流程度要高于它们分别与SL群体之间的交流。     

皱纹盘鲍遗传多样性的RAPD分析

对采自山东长岛和辽宁大连海域的两个自然群体皱纹盘鲍的遗传多样性进行了RAPD分析。16个随机引物在两群体中共检测到了179个位点,其中,长岛和大连群体中的多态位点数分别为88和91个,两群体的多态位点百分率分别为49·16%和50·84%;Shannon′s多样性指数(H0)分别为0·2496和0·2668。有70%以上的遗传变异来自群体内,显示两群体内均有较高程度的遗传变异。研究结果表明,长岛和大连的皱纹盘鲍群体已出现了明显的遗传分化。     

塔里木裂腹鱼群体遗传多样性的AFLP分析

采用AFLP技术对喀拉喀什河、塔什库尔干河、阿克苏河多浪渠首、木扎提河4个群体共80尾塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi Günther)个体进行了遗传多样性分析。6对选择性扩增引物共扩增得到212个位点,其中多态性位点141个,多态位点比例为66.51%。4个群体的Shannon多样性指数(I)为0.316 9-0.544 3,Nei’s遗传多样性指数(H)为0.213 9-0.376 2,群体间的遗传距离为0.078 1-0.250 2。塔什库尔干河群体的多态位点比例、Shannon多样性指数和Nei’s遗传多样性指数均高于其它三个群体。AMOVA分析结果显示,群体总遗传变异85.17%来自群体内差异,而14.83%来自群体间差异,表明塔里木裂腹鱼遗传变异主要来源于群体内个体间,但群体间已存在一定程度的遗传分化。用UPGMA方法构建的群体系统进化树显示,多浪渠首群体和木扎提河群体首先聚类,然后依次与塔什库尔干河群体、喀拉喀什河群体聚类,这一方面与地理位置有关,另一方面与河流的自然环境有关。     

三个不同养殖群体金鱼遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对金鱼3个不同地区养殖群体-天津塘沽(TJ)、江苏苏州(JS)及福建福州(FZ)群体各20ind的DNA多态性进行了分析。在事先优化的反应条件下,所使用的100个随机引物中,有14个引物扩增出清晰稳定的片段,共计103条,大小在200~2500bp,其中多态性片段27条。金鱼总的DNA多态位点百分率为26.21%。数据分析结果显示,3个金鱼群体内遗传多样性偏低,遗传相似度为0.9519~0.9785。金鱼3个群体总的Nei基因多样性指数为0.1061,Shannon信息指数为0.1547。金鱼3个群体间平均遗传距离为0.0375,基因分化系数Gst为0.243,表明3个养殖群体间产生了一定程度的遗传分化。UPGMA法和NJ法的聚类分析显示,两者结果一致。TJ群体和JS群体优先聚类,再与FZ群体聚类。     

牙鲆和大菱鲆养殖群体的分子标记和遗传变异

用１６个１０碱基随机引物对养殖牙鲆（Ｐａｒａｌｉｃｈｔｈｙｓ ｏｌｉｖａｃｅｕｓ）和大菱鲆（Ａｃｏｐｈｔｈａｌｍｕｓ ｍａｘｉｍｕｓ）进行基因组随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）遗传分析。发现：（１）多个引物具有种的特异性扩增带。其中引物Ｓ７扩增的６９０和１１６０ｂｐ带,引物Ｓ２扩增的６８０ｂｐ带为牙鲆的种的特异性谱带;而引物Ｓ７扩增的６５３和８８９ｂｐ带,引物Ｓ２扩增的６５０、８７０、９９０及１１     

Genetic diversity of Nile tilapia populations revealed by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)

Genetic diversity of the Nile tilapia Oreochromis niloticus collected from the river Nile (Cairo, Assuit and Qena) and two Delta lakes (Burullus and Manzalla) in Egypt was examined by the analysis of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD). Of 25 primers examined,21 primers produced 230 RAPD bands. The percentage of polymorphic bands in Manzalla (29.4%) and Burullus (24%) populations was low compared with Assuit (30.54%), Cairo (33.5%) and Qena (44.84%) populations. The highest percentage of polymorphic bands was observed in the Qena population,suggesting a greater potential for use in breeding programs. The molecular phylogenetic tree constructed by unweighted pair‐group method of analysis shows Manzalla and Burullus populations strongly linked and separate from the Assuit and Cairo populations, with Qena population as outgroup. The data serve as a baseline analysis of the current genetic diversity found among O. niloticus populations in Egypt.     

Genetic variation inferred from RAPD fingerprinting in three species of tilapia

This study used random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting for estimating genetic variation and species differentiation in three species of tilapia. A 16-mer random primer generated RAPD markers ranging from 250 to 2400 base pairs (bp). Genetic similarity estimates obtained by pairwise comparisons based on the method of Nei and Li (1979) indicated high genetic similarity (mean genetic similarity (± sd), 0.73 (± 0.15) for Nile tilapia; 0.78 (± 0.12) for Mozambique tilapia; and 0.87 (± 0.07) for Aureus tilapia) within each of the tilapia species. The average interspecies genetic similarities obtained among the three species were 0.59 (± 0.07) for Mozambique/Nile tilapia, 0.46 (± 0.09) for Aureus/Nile tilapia and 0.38 (± 0.07) for Aureus/Mozambique tilapia pair. DNA profiles generated in each species of tilapia were unique. A total of 13 RAPD markers differentiating the three species of tilapia were detected. Our study presented RAPD markers as a new class of useful genetic markers for assessment of genetic diversity and species differentiation in tilapia.     

Genetic diversity of oriental river prawn (Macrobrachium nipponense De Haan) revealed by ISSR markers

日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是中国分布范围广、经济价值较大的一种重要淡水虾类.随着养殖规模的不断扩大,如何保持养殖群体的遗传品质已引起了人们的重视.但迄今为止,养殖的日本沼虾均来自未经系统遗传选育的野生群体,而养殖病害的日趋严重和养成规格、品质的下降已严重影响到日本沼虾养殖产业的健康发展.研究野生群体的遗传结构和遗传分化,揭示其遗传多样性是制定合理有效的保护和管理策略的前提和基础.ISSR(Inter-simple sequence repeats,简单重复序列中间区域)标记技术具有实验重复性好、信息量大、多态性高等优点,是一种理想的检测群体遗传变异的分子标记.因此,本研究应用ISSR标记技术对日本沼虾5个地理群体进行了初步的遗传分析,以期为合理开发和利用日本沼虾天然资源,以及建立和保护日本沼虾种质资源库及基因库提供理论依据.本研究对采自江苏苏州、江西南昌、云南西双版纳、湖北宜都和新疆博湖的5个地理群体进行了初步研究.从50个ISSR引物中筛选出9个条带清晰、稳定性和重复性好,且产生相对较多条带的引物用于全部DNA样品的PCR扩增.对日本沼虾5个地理群体的群体遗传分析表明,在所有榆测到的清晰且可重复的142个有效位点中,多态位点有138个.物种水平上,多态位点百分率(PPL)、等位基因数(No)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(Ⅰ)分别为97.18%、1.972、0.312、0.120和0.323.而在群体水平上,5个地理群体的多态位点百分率为29.58%～61.97%;等位基因数(No)为1.296～1.620;有效等位基因数(Ne)为1.165～1.281;Nei's基因多样性指数(H)为0.098～0.172;Shannon信息指数(Ⅰ)为0.147～0.267.从各个地理群体看,江西南昌群体的遗传多样性最高(PPB:61.97%,No:1.620,Ne:1.281,H:0.172,I:0.267),而湖北宜都群体最低(PPB:29.58%,No:1.296,Ne:1.165,H:0.098,I:0.147).群体内遗传多样度(HS)和总基因多样度(HT)分别为0.135和0.201,根据遗传多样性水平在群体内(HS)和群体间(HT-HS)的分化,各个群体之间的Nei's基因分化系数[GST=(HT-HS)/HT]是0.327.AMOVA分析表明,群体间的遗传变异占总遗传变异的38.59%,而61.41%的遗传变异源于群体内,群体之间表现出较高水平的遗传分化.与其他群体相比,新疆博湖群体和江苏苏州群体差异最小(FST:0.1923,遗传距离D:0.0542),而新疆博湖群体与云南西双版纳群体差异最大(FST:0.5950,D:0.1559).采用UPGMA法构建的分子系统树显示,5个地理群体明显地聚为2个族群,来自新疆博湖和江苏苏州的日本沼虾群体聚为一支,而江西南昌、湖北宜都和云南西双版纳的群体聚在一起.本研究使用9条引物对5个地理群体进行了扩增,共检测到138个多态位点,各群体的多态位点百分率(PPL)为29.58%～61.97%.与其他相关研究结果进行比较,发现对日本沼虾而言,ISSR技术是一个理想的检测群体遗传变异的分子标记.与其他群体相比,新疆博湖群体和江苏苏州群体各遗传参数均相近,且UPGMA系统树亦显示新疆博湖群体和江苏苏州群体的亲缘关系较近,推测它们可能来自同一个祖先群体.与其他野生群体相比,江西南昌群体的遗传多样性最高,该群体采自江西省鄱阳湖,鄱阳湖是中国最大的淡水湖泊,它接纳赣江、抚河、信江、饶河、修河5大河及博阳河、漳田河、潼津河的来水经调蓄后由湖口注入长江,是一个过水性、吞吐型、季节型的湖泊.上游河流汇入鄱阳湖引起群体迁移使不同生态型的基因交流,增加了迁入地的遗传多样性.从遗传角度来讲,一个物种保持足够的遗传变异性是适应不同生境、生存和进化的首要保证.因此,较高水平的遗传多样性对于保护和利用野生群体具有重要意义.本研究表明,在日本沼虾的多样性研究方面,ISSR标记技术是一个非常有效的检测群体遗传变异的遗传标记.研究结果可以为合理开发和利用日本沼虾自然野生资源,以及建立和保护日本沼虾种质资源库及基因库提供基础资料.