鳜鱼病毒核酸的初步分析

提取鳜鱼病毒核酸，分别用ＤＮａｓｅ、ＲＮａｓｅ和绿豆芽核酸酸处理表明，该病毒为双链ＤＮＡ病毒，用带ＥｃｏＲⅠ酶切位点的随机引物扩增病毒核酸，获得扩增核酸带谱。经低熔点琼脂糖回收ＰＣＲ产物，与质粒ｐＵＣ１９连接，获得三个重组子，已经对两个小插入片断进行了序列分析，插入序列分别为３６９ｂｐ和４５０ｂｐ。ＧｅｎＢａｎｋ检测显示，尚未有类似的序列报导。     

2种核酸快提取法对羊口疮病毒和羊痘病毒DNA提取效能的比对研究

目的 合理选择病毒快速核酸提取方法。方法 分别采用2种商品化核酸快提取法——Cell-to-cDNA裂解液(A法)和基于磁珠核酸提取方法(InnuPREP MP Basic Kit A,B法),提取羊临床样品中的羊口疮病毒(ORFV)和羊痘病毒(CaPV)核酸，使用实时荧光定量核酸扩增检测系统(qPCR)和重组酶聚合酶扩增结合侧流层析技术(RPA-LFD)方法进行平行检测，并与常规核酸提取方法(宝生物病毒DNA/RNA提取试剂盒，C法)比较。结果 与C法相比，在A法和B法提取的46份疑似orf拭子中，qPCR的ORFV核酸检出率分别为70.8%和87.5%,RPA-LFD的检出率分别为69.5%和82.6%;在A法和B法提取的52份疑似CaP的拭子样品中，qPCR的CaPV核酸检出率分别为77%和90%,RPA-LFD的检出率分别为65.5%和89.7%。对组织样品分析发现：A法不能用于组织样品的核酸提取；在B法提取的52份疑似orf组织样品核酸中，与C法相比，qPCR的ORFV核酸检出率为93.7%,RPA-LFD的检出率93.3%;对B法提取的61份疑似CaP组织样品核酸中，qPC...     

白斑狗鱼雌、雄基因组混池重测序研究

为研究白斑狗鱼(Esox lucius)雌、雄基因组差异,实验对20尾雌鱼和20尾雄鱼分别进行混池重测序。测序结果显示:雌、雄池待分析测序数(clean reads)分别为282400688条和277391000条,碱基测序错误率(Q30)为94.44%和93.98%。经过与参考基因组比对分析,得到2076647个雌性SNP和2076942个雄性SNP;105810个雌性Indel和647466个雄性Indel;具有显著性别特异的SNP位点10个;使用SNP-Index算法筛选出性别特异区域26个。对雌、雄基因组进行比对和组装分析,分别获得雌、雄特异序列524条和500条。选择116条雌性和160条雄性特异序列进行PCR验证,得到一条长度为773 bp具有雄性偏向性的序列。     

鳗鲡疱疹病毒的分离与鉴定

为获知鳗鲡"脱粘败血病"与病毒的关系,实验用蔗糖密度梯度离心的方法从发病的欧洲鳗鲡内脏器官组织匀浆液中纯化了病毒粒子,负染后利用电镜观察;进一步用EO细胞对病毒进行了分离、培养,并对感染病毒的细胞进行超薄切片,电镜观察;然后,提取病毒DNA,利用鳗鲡疱疹病毒的PCR检测方法对其进行了鉴定。结果显示,接种匀浆上清液的EO细胞出现细胞融合的病变效应;分离病毒的病毒粒子具囊膜,大小约为200 nm;从感染病毒的细胞上清液DNA中扩增出特异性条带,序列测定与比对分析表明,该序列与鳗鲡疱疹病毒欧洲株(AngHV-1)的序列完全一致。研究表明,利用EO细胞分离了一株鳗鲡病毒,经形态观察和DNA分析,确认该病毒为鳗鲡疱疹病毒,命名为AngHV-FJ。该研究为深入开展鳗鲡疱疹病毒的致病机制及鳗鲡"脱粘败血病"的防控研究奠定了重要基础。     

伪狂犬病病毒研究进展

伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)是疱疹病毒科a疱疹病毒亚科的成员,临床上引起Aujeszky氏病(Aujeszky'sdisease,AD)。对其病原,基因组结构,囊膜糖蛋白的主要种类及功能,诊断方法及防治措施作了较为全面的综述。     

罗氏沼虾白斑综合症病毒WSSV ORF147片段的克隆、表达与序列分析

白斑综合症病毒WSSV(White Spot Syndrome Virus),是严重危害虾类养殖业的主要病原之一.本实验根据已知南美白对虾WSSV ORF147序列设计1对特异性引物,从患疑似白斑病毒病的罗氏沼虾中提取总DNA,用PCR法扩增得到1特异性片段.将该片段克隆进pET-28a( )载体,测序表明该片段全长1 475 bp,最大开放式阅读框为1 380 bp,编码459个氨基酸,预计其相对分子质量为51.9 kDa;与GenBank登录的WSSV ORF147序列(登录号AF369029)进行比对,核苷酸同源性为99%,证实为WSSV ORF147片段.将该片段在大肠杆菌E coli中进行表达,能获得相应的特异多肽条带.根据测序结果推导WSSV ORF147多肽在N端有信号肽序列,并且在氨基酸序列的122～144区间形成跨膜螺旋区.     

鲤春病毒血症病毒焦磷酸测序检测技术的建立

通过收集鲤春病毒血症病毒基因序列,设计了鲤春病毒血症病毒最为保守的指纹序列,以及测序引物,建立了鲤春病毒血症病毒焦磷酸测序检测方法。对所构建的鲤春病毒血症病毒焦磷酸检测方法进行特异性试验和灵敏度检测,试验结果表明所建立的方法特异性好,在8种鱼类病毒中能够特异性检测出目的病毒,检测方法灵敏度高,最低检出核酸量为10pg/μL。对建立的焦磷酸测序检测方法进行了实际应用研究,选取国内采集与进口的鱼类样本共计80批次进行鲤春病毒血症病毒检测。结果显示,焦磷酸测序检测方法可以有效的检出常规RT-PCR不能检出的假阴性样本和弱阳性样本,该方法的灵敏度和特异性可以满足水生动物疫病检测的需要。     

上海地区2013—2018年鲤春病毒血症病毒的分离和进化特征分析

为了解上海市近年来鲤春病毒血症病毒(SVCV)的流行情况,探明上海市SVCV变异进化规律,对上海地区2013—2018年送检的养殖鲤(Cyprinus carpio)、锦鲤(Cyprinus carpio koi)、金鱼(Carassius auratus)等鲤科鱼类样品中的SVCV进行了病毒分离、鉴定和基因序列进化分析。结果显示: 上海地区近6年来每年均有SVCV检出,从125份样本中共分离获得了18株SVCV毒株,阳性率为14.4%。各毒株接种草鱼卵巢细胞(grass carp ovary, CO)后均可以导致明显的细胞病变效应(cytopathic effect, CPE)。免疫荧光实验也表明,病毒结构蛋白N、P、M和G均在感染细胞中高水平表达。进一步通过巢式PCR扩增和序列测定,获得了18株分离株G基因606bp的核酸序列。进化分析显示,上海地区的SVCV分离株均隶属于Ia分支,株间核酸序列同源性较高,但不同分离株之间核酸序列也呈现出一定程度的差异。其中2015年之后的分离株均聚类为同一小分支,提示其从同一祖先进化而来。实验结果显示,SVCV在上海地区持续以低水平流行并在不断进化。研究提示,养殖户应改变传统的养殖模式,提高防病意识和管理水平,相关部门也需要加强持续监测,以减少和控制鲤春病毒血症(SVC)的发生和流行。     

大黄鱼肿大细胞病毒不同毒株的细胞培养及主要衣壳蛋白基因比较

为建立大黄鱼肿大细胞病毒的培养方法,明确其分类地位,用肿大细胞病毒检测呈阳性的大黄鱼幼鱼病料 (FD201807和SA201808)肾组织匀浆液感染鳜仔鱼细胞系 (mandarin fish fry cell line-1,MFF-1)并连续传代,从病料组织匀浆液和细胞冻融液中提取病毒DNA,克隆病毒主要衣壳蛋白基因 (mcp),测序后与NCBI GenBank中的虹彩病毒科肿大细胞病毒属病毒mcp以及2018—2020年所检出的15株大黄鱼肿大细胞病毒mcp进行比对分析。结果显示,病毒传至第4代才可引起MFF-1细胞病变,细胞病变的主要特征为细胞脱壁、变圆、折光度增强;感染时间越长脱壁细胞越多,同时培养液中的颗粒增加;透射电镜下可见感染细胞的细胞质散在大小为130~150 nm的六边形病毒粒子和空壳。感染细胞的病变周期随传代代次的增加而缩短,第15代次的FD201807株感染细胞80%细胞病变的时间为3 d,第15代次的SA201808株感染细胞80%细胞病变的时间为7~8 d。mcp序列比对和聚类分析发现,SA201808株与FD201807株的mcp序列存在21个碱基差异,二者的mcp序列分别与大黄鱼虹彩病毒(large yellow croaker iridovirus, LYCIV) LYCIV-Zhoushan (GenBank: MW139932.1)和花鲈虹彩病毒 (Lateolabrax maculatus iridovirus, LMIV) (GenBank: MH577517.1)相近。15株从大黄鱼病料检出的肿大细胞病毒中,12株的mcp序列与SA201808株聚类;3株与FD201807聚类。本研究利用MFF-1细胞系分离培养了大黄鱼肿大细胞病毒,揭示了大黄鱼肿大细胞病毒存在差异,为更好地了解大黄鱼肿大细胞病毒提供了数据参考。     

太平洋牡蛎中诺瓦克样病毒的RT-PCR法检测和病毒聚合酶区部分序列的分析

利用pH9.5的甘氨酸缓冲液性处理太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)匀浆液,PEG沉淀病毒粒子的方法对未知的是否污染有诺瓦克样病毒(Norwalk-like Virus,NLVs)的牡蛎样品进行处理,并提取病毒RNA,进行RT-PCR,凝胶电泳检测扩增结果。初步建立了牡蛎中NVLs的检测方法。纯化所得的特异PCR产物,克隆到T-载体中,筛选转化子,提取质粒,并进行PCR电泳鉴定。重组质粒序列测定结果在NCBI上进行BLASTn显示所得产物与已发表的诺瓦克样病毒的相应序列具有极高的同源性(>95％);根据Genebee在线分析系统AliBee-Multiple Alignment进行对中国的诺瓦克样病毒粪便分离株和牡蛎分离株的扩增序列进行相似性分析,结果从我国养殖的牡蛎样品中和胃肠炎病人粪便中分离出2个的诺瓦克样病毒之间无显著的差异。     

动物病毒受体阻断剂的研究进展

病毒进入宿主机体后,病毒粘附蛋白(VAP)首先与宿主靶细胞膜特异受体结合,被吸附到宿主敏感细胞上,然后通过膜融合等方式侵入细胞中,完成脱囊膜或脱壳并进行复制、转录及装配等增殖过程。许多研究通过不同的途径试图寻找可以阻断病毒吸附的抑制剂,已取得了重要进展。近年来国内外文献表明,硫酸乙酰肝素(HS)是细胞膜上许多病毒的特异受体或者辅助受体,用一些可溶性的肝素,如肝素钠、硫酸软骨素可以特异阻断病毒的吸附和侵入。另外,具有糖结合活性的植物凝集素及一些糖类衍生物可以与细胞膜上的某些病毒特异受体糖蛋白结合,从而不同程度地抑制病毒和宿主细胞的结合。本文对该领域研究成果作一综述,旨在为今后对水产动物病毒阻断剂的研究提供参考。     

牡蛎疱疹病毒对魁蚶的致病性

为探明牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)对魁蚶的致病性,本研究使用发病魁蚶组织制作病毒悬液进行感染实验。感染实验分为空白组、阴性悬液注射组和病毒悬液注射组,并使用实时定量PCR法对感染后魁蚶体内病毒的时空分布进行检测。实验结果显示,空白组和阴性悬液组魁蚶感染后未检测到病毒粒子,病毒悬液注射组魁蚶经人工感染后,各部位病毒含量均呈先上升再下降随后又上升的趋势,最终达到106拷贝/ng DNA左右。通过电镜观察,在感染魁蚶的鳃、肝胰腺、外套膜中出现染色质边缘化甚至消失,细胞核肿胀、溶解,核仁消失,核膜扩张、不清晰,线粒体肿大,脊崩解,核糖体脱落等一系列细胞病理变化。在其细胞核和细胞质中均能发现大量直径为90~110 nm球形病毒粒子,该病毒粒子具囊膜,囊膜内可见均匀高电子密度的核衣壳,与自然发病魁蚶负染电镜中的病毒粒子形态相同。研究结果表明,Os HV-1可以感染魁蚶并与魁蚶大规模死亡有直接相关关系;魁蚶感染Os HV-1后机体产生应激反应,对Os HV-1有一定抑制作用,但其作用机制还有待进一步实验验证。     

草鱼出血病病毒854株基因组SDS—PAGE分析及其核酸类型鉴定

十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)结果表明:草鱼出血病病毒854株基因组由11个分段的核酸片段组成,总分子量约为14.46×10~6道尔顿。其中最大片段的分子量约为2.45×10~6道尔顿;最小片段的分子量约为0.38×10~6道尔顿。其基因组核酸片段电泳图谱具有病毒株的特异性.核酸酶敏感性试验表明该病毒的核酸为RNA。     

Salmonid fish viruses and cell interactions at early steps of the infective cycle

A flow cytometric virus-binding assay that directly visualizes the binding and entry of infectious pancreatic necrosis virus (IPNV), infectious haematopoietic necrosis virus (IHNV) and virus haemorrhagic septicaemia virus (VHSV) to several cell lines was established. The highest efficiency of binding was shown by the BF-2 cell line and this was used to study, at the attachment level, the interactions of these cells with salmonid fish viruses in coinfections, and to further determine if the earliest stage of the viral growth cycle could explain the previously described loss of infectivity of IHNV when IPNV is present. Our results demonstrated that IPNV binds to around 88% of cells either in single or dual infections, whereas IHNV attachment always decreased in the presence of any of the other viruses. VHSV binding was not affected by IPNV, but coinfection with IHNV reduced the percentage of virus-binding cells, which suggests competition for viral receptors or co-receptors. Internalization of the adsorbed IHNV was not decreased by coinfection with IPNV, so the hypothetical competence could be restricted to the binding step. Treatment of the cells with antiviral agents, such as amantadine or chloroquine, did not affect the binding of IPNV and VHSV, but reduced IHNV binding by more than 30%. Tributylamine affected viral binding of the three viruses to different degrees and inhibited IPNV or IHNV entry in a large percentage of cells treated for 30 min. Tributylamine also inhibited IHNV cytopathic effects in a dose-dependent manner, decreasing the virus yield by 4 log of the 50% endpoint titre, at 10 mm concentration. IPNV was also inhibited, but at a lower level. The results of this study support the hypothesis that IHNV, in contrast to VHSV or IPNV, is less efficient at completing its growth cycle in cells with a simultaneous infection with IPNV. It can be affected at several stages of viral infection and is more sensitive to the action of antiviral compounds.     

Factors controlling the early stages of viral haemorrhagic septicaemia epizootics: low exposure levels, virus amplification and fish-to-fish transmission

Viral haemorrhagic septicaemia virus, Genogroup IVa (VHSV), was highly infectious to Pacific herring, Clupea pallasii (Valenciennes), even at exposure doses occurring below the threshold of sensitivity for a standard viral plaque assay; however, further progression of the disease to a population‐level epizootic required viral amplification and effective fish‐to‐fish transmission. Among groups of herring injected with VHSV, the prevalence of infection was dose‐dependent, ranging from 100%, 75% and 38% after exposure to 19, 0.7 and 0.07 plaque‐forming units (PFU)/fish, respectively. Among Pacific herring exposed to waterborne VHSV (140 PFU mL^?1), the prevalence of infection, geometric mean viral tissue titre and cumulative mortality were greater among cohabitated herring than among cohorts that were held in individual aquaria, where fish‐to‐fish transmission was prevented. Fish‐to‐fish transmission among cohabitated herring probably occurred via exposure to shed virus which peaked at 680 PFU mL^?1; shed virus was not detected in the tank water from any isolated individuals. The results provide insights into mechanisms that initiate epizootic cascades in populations of wild herring and have implications for the design of VHSV surveys in wild fish populations.     

Equine viral arteritis

Equine viral arteritis (EVA) caused by the equine arteritis virus, member of the genus arterivirus within the family of Togaviridae was recently isolated from the seminal plasma of two stallions indicating that the virus infection is also prevalent in the Federal Republic of Germany despite the apparent lack of acute clinical symptoms in the horse population. These findings are further supported by data from serological screenings. Out of 739 horse sera, 28 (3.8%) were found to have EVA virus-specific antibodies with titers greater than or equal to 4. It is important to note that the percentage of sero-positive horses was found to be increased from 1.8% in 1987-1988 to 6.8% in 1989. A voluntary prophylactic programme based on virological and serological tests is proposed to prevent further spread of the EVA virus infection. The pathogenesis, clinical symptoms and diagnosis of EVA are also reviewed.