巨桉种源遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记方法对巨桉11个种源80个个体进行了遗传变异的比较分析.通过20个10bp随机引物的扩增,共检测到149个位点,其中89个为多态性标记位点,总的多态位点百分率为59.73%.各个种源多态位点百分率较高,为42.86%～55.89%,多态位点最多的是8号种源,最低的是6号种源.Shannon表型多样度估测值的统计表明,遗传多样性主要存在种源内部.遗传变异在种源间占28.74%,在种源个体间占71.26%.Shannon表型多样度估测值在种源间为0.1720～0.2650,平均为0.2373.8号种源的遗传多样性最高,6号种源的遗传多样性最低;种源间的遗传距离为0.0391～0.1344,平均为0.0817.这些遗传变异为巨桉优良种源的早期选择提供了科学依据.     

樟子松天然群体的遗传结构

本文运用同工酶电泳技术对樟子松（ＰｉｎｕｓｓｙｌｖｅｓｔｒｉｓＬ．ｖａｒｍｎｇｏｌｉｃａＬｉｔｖ）天然群体的遗传结构进行了研究，分析了４个群体、３个酶系统（ＧＯＴ．ＭＤＨ．ＥＳＴ）的５个位点。结果表明：樟子松群体具有较高的变异水平，所有位点的平均期望杂合度Ｈｅ为０．４４；多态位点百分率Ｐ为８７．５％；每个位点的等位基因平均数为２．３８；樟子松群体内分化程度较大，群体间分化较小。群体内变异为９５．４％，群体间变异为４．６％。漠河群体、十八站群体、高峰群体与红花尔基群体间的遗传分化明显。     

乐昌含笑种群遗传多样性的研究

基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法分析了珍稀木兰科植物乐昌含笑6个种群的遗传多样性及分化程度。19条随机引物扩增出111个可分析位点,多态位点百分比为81．98％,经POPGENE分析发现,乐昌含笑的Nei’s基因多样度(Hc)为0．3255,Shannon表型指数(I)为0．4751,与其它植物比较具有较高水平的遗传多样性。6个乐昌含笑群体间基因分化系数(Gst)值为0．2226。群体内的遗传变异大于群体问的遗传变异。按照遗传距离将乐昌含笑6个群体划分为两类：第1类有广西三江、湖南宜章、湖南双牌和湖南资兴的群体,第2类包括江西官山和湖南醴陵的群体;研究表明：第2类种群的遗传多样性指数高于第1类种群的遗传多样性指数。     

红花石蒜遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对14个居群的红花石蒜进行遗传多样性研究,结果表明:POPGEN32分析显示红花石蒜物种的遗传多样性很高,多态位点百分率为92.31%,Shannon指数(H)为0.459 7,Ne i指数(I)为0.302 5;居群水平的遗传多样性较低,多态位点百分率平均为49.65%,Shannon指数(H)平均为0.262 0,Ne i指数(I)平均为0.176 3;居群间的遗传分化系数(Gst)为0.503 5,基因流(Nm)为0.698 3。AMOVA分子变异分析显示:居群间遗传分化程度高,46.12%的变异发生在居群内,53.88%的变异发生于居群间。生境的片段化使居群间的基因流受阻,可能是居群间高遗传分化和居群水平低遗传多样性的主要原因。     

用同工酶研究马尾松群体的遗传结构

本文应用同工酶分析技术结合形态、生长和物候等表型性状,分析了福建省沙县境内的5个马尾松天然小群体的遗传结构。结果表明,马尾松群体具有较高的遗传变异水平,5个小群体的多态位点百分率达64.5％,等位基因平均数为1.65,平均期望杂合度为0.216。小群体间的分化程度不高,5个小群体的平均遗传距离为0.0047;同工酶测定的总变异中,2.4％来自小群体间,其余的变异(97.6％)来自小群体内;而表型性状总的遗传变异中,6.5％左右来自小群体间,其余的变异(93.5％)来自小群体内。     

基于ISSR标记的杉木种源遗传多样性分析

为从分子水平探讨杉木(Cunninghamia lanceolata)种源空间遗传变异模式,采用ISSR分子标记对杉木全分布区内的40个种源进行遗传多样性分析。结果显示:9条ISSR引物共检测出133条带,其中122条多态性条带,多态条带百分率(PPB)为91.73%,各种源PPB和Shannon表型多样性指数(HPOP)分别为37.46%~55.75%和0.201 5~0.344 5,物种水平多态性条带百分率和Shannon信息指数(HSP)分别为89.86%和0.565 5;分子方差分析(AMOVA)揭示,种源间遗传分化系数(ΦST)为0.4651,这表明杉木种源具有较高的遗传多样性,种源间遗传分化较大。UPGMA法聚类表明,参试的40个杉木种源可分为7地理种源区。     

不同种源印楝遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对印楝进行遗传多样性分析,用9条引物进行扩增,共检测出81条清晰的位点,其中79条具有多态性,多态位点百分率为97．53％,Nei＇s基因多样性指数为0．3803,Shannon信息指数为0．5537,表明印楝遗传多样性很丰富。种源间遗传分化系数为0．4702,Shannon’s居群分化系数为0．4677,表明印楝种源内的遗传分化大于种源间的分化。聚类分析将13个种源分为2大类,来自缅甸的11个种源聚成一类,来自澳大利亚和印度的种源聚成另外一类。结果表明,ISSR分子标记技术适合于印楝的遗传多样性分析。     

10个南方皂荚群体遗传多样性的AFLP分析

[目的]研究南方皂荚的遗传多样性和遗传结构现状,为制定有效的保护策略和育种策略提供理论依据。[方法]采用扩增片段长度多态性技术对供试的215份皂荚的遗传多样性及遗传距离进行分析。[结果]表明:检测到1 782个位点,其中,有1 389个为多态性位点,多态位点百分率为77.94%;皂荚各群体Shannon’s信息指数平均为0.256;Nei’s多样性指数平均为0.168,表明皂荚群体的遗传多样性偏低,皂荚群体间存在着一定的遗传分化;根据遗传距离UPGMA聚类分析,将10个群体划分为4大类。由遗传分化系数和分子方差分析结果发现,群体内的变异是皂荚遗传变异的主体,74.79%的变异来自群体内。[结论]皂荚群体的遗传多样性与遗传结构的形成不仅与其分布广泛、种子特性及生活史有关,而且与人为的砍伐、引种、生境片段化等因素有重要关系。基于上述结果提出了皂荚的保护策略。     

新疆阿尔泰地区白杨派3个树种半同胞家系子代遗传多样性分析

利用SSR分子标记技术,对采自新疆额尔齐斯河流域阿尔泰市哈巴河及北屯地区的白杨派3个树种银白杨、银灰杨、欧洲山杨的半同胞家系子代进行遗传多样性分析.结果表明:筛选12对SSR引物在90个样本中共检测到58个等位基因(A)、112种基因型,多态位点百分率是100％,Nei遗传多样性指数(h)平均为0.648 5,Shannon多样性指数平均为1.234.基因分化系数(Fst)为0.337 l,即在总的遗传变异中有33.71％的变异来自于不同树种之间,绝大部分存在于子代个体间.白杨派内种间分化程度较高,种间遗传距离为0.3863～1.869;银灰杨的遗传变异最大,而银白杨的遗传变异最小.     

不同盐度梯度下一年蓬的遗传多样性和遗传分化

利用RAPD技术对3个不同盐度梯度下入侵杂草一年蓬的遗传多样性和遗传分化进行了研究。结果表明,12个随机引物在90株个体中共检测到187个可重复位点,其中多态位点158个,总多态位点百分率为84.49%,3个种群平均多态位点百分率为70.77%。采用Shannon信息指数计算的3个种群总的遗传多样性为0.4522,平均为0.4027;采用Nei指数计算的3个种群总的基因多样性为0.3042,平均为0.2746。3个种群的多态位点百分率、Shannon信息指数、Nei指数大小顺序均为P2>P1>P3。AMOVA分子变异显示,88.54%变异来源于种群内,11.46%变异来源于种群间。一年蓬高的遗传多样性与低的遗传分化与其生物学特性有关,是其广泛入侵的重要原因。     

香榧天然群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP分子标记技术,采用8对引物对6个香榧天然群体的92个个体进行了总基因组DNA水平上的多态性检测,共检测出364个位点,其中多态性位点63个.方差分析表明:基因谱带频率在群体间差异不明显,方差分量贡献率在群体间占11.14%,群体内占88.86%.6个群体均具有丰富的遗传多样性,多态位点百分率为79.73%～98.41%,其中绍兴>东白湖>磐安>钟家岭>嵊州>黄山,且群体内遗传多样性大于群体间遗传多样性.等位基因数为1.7939～1.9841,有效等位基因数为1.5416～1.6759,Shannon信息指数为0.4548～0.5471.群体分化系数为0.1136,群体内遗传多样性为0.3512,基因流为3.8997.遗传一致度平均值为0.9174,遗传距离平均值为0.0797.根据遗传一致度进行了UPGMA聚类分析.     

天然蒙古栎群体遗传多样性的RAPD分析

蒙古栎 (ＱｕｅｒｃｕｓｍｏｎｇｏｌｉｃａＦｉｓｃｈ)为壳斗科、栎属植物 ,主要分布区包括中国的华北、东北、内蒙古东部 ,朝鲜半岛 ,俄罗斯远东和蒙古的连续分布区及日本桦太、北海道的间断分布区 (吴晓春 ,1 993)。蒙古栎是我国东北的典型植被类型———红松阔叶林的主要伴生树种之一 ,同时在红松林被干扰破坏后是形成次生阔叶林面积较大的主要树种 ,也是分布区超过北纬 45°的唯一栎属植物。近年来 ,蒙古栎的分布区和群体数量呈扩张趋势 ,其原因除人为干扰外 ,可能涉及气候变化、物种特性、种内遗传多样性、种间互作等等。对蒙古栎群体…     

Genetic diversity and differentiation of fall webworm (Hyphantria cunea Drury) populations

The molecular variation and genetic relationships among five populations of the fall webworm (Hyphantria cunea Drury) in China were assessed using microsatellite technology. Ten microsatellite primers, producing polymorphic bands, were used across 300 samples. The percentage of polymorphic loci (PPB) was 98.36%; the percentage of polymorphic loci in five populations ranged from high to low in the following order: Cangzhou population, Yantai population, Qinhuangdao population, Dandong population, and Shijiazhuang population. The results showed that 34.38% of the total genetic variation of the fall webworm (GST) occurs among populations, while most variation (65.62%) exists within populations. Nei’s genetic distances ranged from 0.1386 to 0.3224. Using the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA), Nei’s genetic distances were analyzed by a clustering technique and the dendrogram shows that population differentiation is closely related to the time and geographic origin of the invasion. The major factors impacting genetic diversity of fall webworm populations are longitude, the plain area ratio, annual precipitation, latitude and time of invasion. The formation of genetic structure is correlated with characteristics of the life history and invasion ecology of the species.     

珙桐天然种群遗传多样性的ISSR标记分析

利用ISSR分子标记分析来自11个天然珙桐种群的遗传多样性。从100条引物中筛选出5条引物能扩增出稳定、清晰且具多态性的条带,共扩增出77个条带。其中74个为多态,多态条带百分率(PPB)为96.10%;各种群PPB值为37.66%～63.64%,平均为54.07%。种内Shannon多样性指数(HSP)为0.4849,种群内Shannon多样性指数(HPOP)为0.1886～0.3274,平均为0.2774。这表明珙桐在物种和种群水平上均维持较高的遗传多样性。分子方差分析显示,种群间与种群内遗传变异分别占总遗传变异的46.22%,53.78%,种群间呈高度遗传分化。种群间遗传距离与对应的地理距离呈显著正相关(r=0.546,P<0.01)。UPGMA法聚类分析将11个珙桐种群分为3组。研究结果为珙桐遗传资源保护策略制定提供有价值的种群遗传学信息。     

天山樱桃野生居群遗传多样性SSR分析

为给天山樱桃种质资源的保护和开发利用提供参考,应用SSR标记技术对新疆天山樱桃4个居群44份种质的遗传多样性进行分析。结果表明:筛选的14对SSR引物共检测到191个位点,包含148个多态性位点。Nei’s基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.239 8和0.367 6,各居群遗传分化系数为0.193 5,基因流为2.084 3。天山樱桃遗传分化水平较低,各居群间基因交流频繁,遗传变异主要存在于居群内。由基于遗传距离的聚类结果可知,裕民县与大西沟居群遗传关系最近,与特克斯居群遗传距离较远,4个天山樱桃居群中大西沟居群遗传多样性最高。     

Determination of inter- and intra-species genetic relationships among six Eucalyptus species based on inter-simple sequence repeats (ISSR)

Eucalyptus is the most economically important hardwood plantation tree cultivated in tropical and subtropical countries. Inter-simple sequence repeat (ISSR) markers were used to evaluate genetic relationships within and between individuals of six Eucalyptus species. A total of 583 loci (265 to 1535 bp) were amplified from 149 individuals belonging to the six Eucalyptus species using seven ISSR primers (two to three nucleotide repeats anchored with one or two nucleotides at the 3' or 5' region). The ISSR fragments indicated significant polymorphism and genetic diversity among the individuals. Cluster analysis and principal component analysis revealed the occurrence of wide genetic diversity among populations of E. tereticornis Sm., E. camaldulensis Dehnh. and E. urophylla S.T. Blake and narrow genetic diversity among populations of E. citriodora Hook. and E. grandis W. Hill ex Maiden. Genetic diversity was high in E. tereticornis Sm. (47.27%) and low in E. citriodora (18.64%). Maximum Nei's genetic identity (0.897) was observed between E. camaldulensis and E. tereticornis species, whereas maximum genetic diversity (0.286) was found between individuals of E. citriodora and E. grandis.     

Small-scale genetic diversity in oneseed hawthorn (<Emphasis Type="Italic">Crataegus monogyna</Emphasis> Jacq.)

We have examined the pattern of random amplified polymorphic DNA (RAPD) variation among six populations of Crataegus monogyna from northern Italy, extending over an area of about 20,000 km². The aim was to evaluate local differentiation in relation to geographical distance. Of the 73 loci analysed, 65 were polymorphic, and there were no bands at complete fixation at the population level. The mean genetic diversity was 0.291, with the values for individual populations ranging between 0.252 and 0.333. According to the analysis of molecular variance most of the genetic variation was found within populations (about 80%), with a significant proportion being attributable to genetic differences between populations. No evidence for isolation by distance was found in the set of populations sampled. The efficacy of RAPD markers in analysing genetic variation, and the contribution of the results in terms of the preservation of biodiversity and defining the most appropriate strategies for collecting forest reproductive material, are discussed.     

美国山核桃群体遗传多样性的RAPD分析

运用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记技术，采用Operon公司的10种随机引物，以采自美国东南部、北部、西部和我国江苏、浙江、湖北、湖南、云南等地的9个美国山核桃栽培群体45个单株的种子为材料，检测出多态位点42个。以这些多态位点为依据，计算了估测了多态性位点百分比、Shannon表型多样度指数、Virk群体内遗传距离和Nei氏群体间遗传距离，并用它们作为参数进行群体遗传多样性的RAPD分析。结果表明，参试的美国山核桃品种群体遗传变异明显，且群体间差异大于群体内差异，我国引种的群体遗传差异大于原产地美国的群体遗传差异。     

湘鄂西地区珙桐天然群体遗传结构的研究

以珙桐叶为材料,对湘西和鄂西两天然珙桐群体的60个样品进行RAPD分析.结果表明,9个随机多态引物,获得24个多态标记位点,平均每个引物产生2.67个多态位点;湘西和鄂西两群体之间的遗传多样性差异不明显,Shannon指数分别为0.427 4和0.448 1;种内平均遗传多样性为0.326 9,群体内平均遗传多样性为0.297 6,群体间的遗传多样性为0.029 3,基因分化系数为0.089 6,基因流为5.079 2.两个天然珙桐群体的遗传相似性非常高,达到0.923 3,遗传距离为0.079 8;湘西群体的多态百分位率略高于鄂西.这表明,湘西和鄂西两群体间存在着非常频繁的基因流.     

白桦种群间木材纤维性状的表型变异与分子标记的遗传多态性

以东北地区的5个白桦天然种群为研究材料,在木材纤维形态性状测定的基础上,采用ISSR、RAPD分子标记研究了5个种群的遗传变异以及种群间纤维形态性状与DNA分子标记的相关性.结果表明:白桦天然林成熟材(18～31年生)的木材纤维长度在种群间差异不显著,纤维宽度和长宽比差异显著,帽儿山种群的木材纤维形态性状最好,汪清最差;利用ISSR和RAPD 2种标记检测5个白桦种群的遗传多样性,所得的研究结果基本一致,多态位点比率最高的为辽宁新宾种群,其次是帽儿山和汪清,而塔河和金山屯最低;ISSR标记的AMOVA分析表明白桦种群间的遗传变异占总遗传变异的10.82%;RAPD标记的AMOVA分析表明白桦种群间的遗传变异占总遗传变异的12.94%,研究结果均显示白桦的遗传变异主要发生在种群内部.利用2种标记技术的种群聚类结果基本一致,这一结果与基于木材纤维性状的表型聚类基本一致, 而且种群间遗传距离和地理距离之间存在一定的相关性.