利用RAPD标记分析百合种质的遗传多样性

中国是百合属植物的起源中心,栽培和应用历史悠久。如何评价及充分利用我国丰富的百合资源是选育优质百合品种的一个重要课题。本研究以全国各地收集获得的45份百合种质（包括21份野生种和24个栽培品种）为材料,利用RAPD技术对这些百合材料进行遗传多样性的分析及亲缘关系的鉴定。结果表明：从300条引物中筛选获得29条可重复多态性引物（1条野生种特异引物：S249引物）。以45份百合材料总DNA为模板29条引物共扩增出398个多态性位点。UPGMA聚类分析表明：45份材料的遗传距离在0．158～0．504,平均遗传距离是0．370。45份材料可以分为5类：包括云南地区野生种、铁炮百合杂交系、亚洲百合杂交系、东方百合杂交系和其他地区野生种。     

朱砂根品种资源的RAPD分析

用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对朱砂根3种类型的15份资源进行遗传多样性分析和聚类分析.从200个随机引物中,筛选出17个对15份供试朱砂根资源均能产生多态性谱带的引物.在这17个引物所检测的247个位点中,229个位点为多态性位点,多态性高达92.71%.聚类分析结果表明,不同朱砂根类型之间存在明显的遗传差异,而且根据RAPD标记进行的朱砂根类型聚类结果与其形态上的分类结果基本一致.     

四种耐寒植物的RAPD分析

用RAPD分子标记对4种耐寒植物进行了基因组DNA遗传多样性分析,从35个随机引物中筛选出了扩增谱带清晰并呈现多态性的20个随机引物,每个引物能产生1-10条RAPD片段,多态性条带占67.61%.利用UPGMA聚类法对4种卫矛属植物的176条谱带进行聚类分析,结果表明,北海道黄杨和扶芳藤聚类成一组,大叶黄杨和金心黄杨聚类成另一组,可见,RAPD技术对卫矛属植物的分类鉴定和遗传多样性评价是有效可行的.     

辣椒种质资源的遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术对90份辣椒种质资源遗传多样性进行分析,从200个RAPD引物中筛选出10个引物分别对供试材料的DNA进行扩增,共扩增出70个位点,其中多态性谱带38条,多态性程度为54.3％.平均每个引物产生7条多态性谱带,每个引物可扩增出4～9条,谱带大小为100～2000 bp.对RAPD结果进行聚类分析...     

悬钩子属野生种及品种亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记方法,对39份悬钩子属(Rubus L.)野生种或变种及17份栽培品种进行分析,探讨这56份材料间亲缘关系的远近.通过试验从35个引物中筛选出12个能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出166条DNA片段,分子量在250～2300 bp之间,平均每条引物扩增出13.83条DNA片段,多态性比率为96.33％,然后采用NTSYS-pc软件和UPGMA法构建了系统树.聚类分析结果将野生种分成5大类群,其中15份栽培品种包含在内,而有2份栽培品种(酷它它和宝森)另成一类,区别于其他54份材料.试验认为ISSR分子标记技术适合作悬钩子属植物组间亲缘关系的分析.     

泡桐属植物遗传多样性的FISH-AFLP分析

运用FISH-AFLP技术对泡桐属14个种及变种进行了基因组DNA分子水平上的检测.结果表明,从64对AFLP引物组合中筛选出9对,共获得1 171条清晰可辨的条带,其中多态性条带1 158条,多态性带百分率达98.89%,14份供试材料的遗传相似系数为0.603 4~0.740 2,平均相似系数为0.671 8,反映出泡桐属不同种质间差异明显,具有丰富的多态性.本研究运用NTSYS 2.1版软件对样品进行UPGMA聚类,分析了泡桐属植物14个种的遗传多样性和亲缘关系,并对泡桐属部分植物的分类问题进行讨论.     

石斛的分子生物学鉴定--基于RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了15种石斛属药用植物,选用10个有效引物(10 bp)扩增出99条DNA片段,用于遗传多样性分析、构建UPGMA聚类图.分析结果表明:RAPD方法能有效鉴别所试石斛属植物,其多态位点百分率为84.85%,表现出丰富的遗传多样性.     

贵州樱桃种质资源遗传多样性的分子评价

为贵州樱桃种质资源的进一步开发利用提供参考,采用RAPD标记,对35份贵州地方樱桃(Prunus pseudocerasuL.)种质资源的遗传多样性进行了分子评价.结果表明,从94条RAPD引物中筛选出30条稳定性强、谱带清晰及多态性丰富的引物进行PCR扩增,共获得298个标记,其中多态性标记为255个,多态性比例为8...     

应用RAPD标记分析黑麦属的遗传多样性

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记，对黑麦属（Secale L）7个种共12份材料进行了遗传多样性检测。结果表明，被测材料间RAPD标记多态性较高。40个随机引物中，有25个引物（占62．5％）的扩增产物具有多态性。25个引物共扩增出167条带，其中89条带（占53．2％）有多态性，每个引物可扩增出1－10条多态性带，平均3．6条。RAPD标记遗传距离（GD）变异范围为0．1382－0．4512，平均值为0．2712。聚类分析表明，在GD值0．3850水平上，12份材料可聚3类，S.africamum和S.silvestre与其它材料间的遗传分化较大，分别单独聚为一类，其余10份材料则聚为一类。据此认为，RAPD标记可以作为黑麦属物种鉴定的指纹图谱。     

梨种质资源遗传多样性研究中的RAPD技术引物筛选

[研究目的]RAPD技术已广泛用于种质资源遗传多样性研究,中国梨属植物资源丰富,通过对RAPD多态性引物的筛选,为RAPD技术在梨属种质资源中的应用提供参考;[方法]以梨属44个种和品种为试验材料,通过RAPD扩增技术,筛选RAPD多态性引物;[结果]从50个随机引物中筛选出18个多态性引物,所选出的多态性引物每个引物扩增出的条带数在4～11之间,扩增出的DNA片段分子量大多在450～2000 bp之间,共扩增出118个条带,其中样品间相同的条带数有11条,呈现多态性的条带107条,所选引物的多态百分率达90.8%.[结论]所筛选的18个引物为梨属植物RAPD扩增多态性引物,可广泛用于梨属植物的RAPD扩增技术.     

The Genetic Diversity Study of Wild Wusuli Raccoon Dog From Nenjiang District

The ISSR method was developed to analyze the genetic diversity of 20 wild Wusuli raccoon dog from Nenjiang district. The results showed that there were significant genetic diversity and high polymorphism among individuals of the wild Wusuli raccoon dog. A total of 41 DNA bands were amplified by 9 primers, and 37 of them were polymorphism, the proportion of polymorphism was 90.24%, 2-8 polymorphism bands could be amplified by each primer, and 4.56 on average, the length of the product was 200-2 000 bp.     

24个荸荠品种遗传多样性RAPD分析

[目的]从分子水平上了解不同地区荸荠地方品种的亲缘关系及遗传多样性,为荸荠品种资源研究和选育提供理论依据.[方法]利用RAPD分子标记技术,对24个不同地区荸荠地方品种进行遗传多样性及聚类分析.[结果]从100条RAPD引物筛选出条带清晰、多态性理想的引物15条,共扩增出83条清晰带,其中多态性带为61条,多态性比例为73.5%.24个荸荠地方品种间的遗传距离为0.0976~0.6757,平均为0 3048;UPGMA聚类分析可将24份荸荠品种分为5组,其中第4组又可分为两个亚组,野生荸荠单独归为一亚组.[结论]24份荸荠品种的遗传基础相对较狭窄,亲缘关系较近,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异性.     

寒兰品种类型的SRAP分子鉴定

 【目的】从分子水平分析寒兰品种的遗传多样性和亲缘关系,为寒兰种质资源的有效利用和开发提供依据。【方法】利用SRAP标记对37个中国寒兰和14个日本寒兰品种类型的基因组DNA进行分析。【结果】筛选出的11对引物组合对51份供试材料共扩增出586条带纹,其中504条为多态性(86.01%),平均每个引物扩增46条多态性带。聚类分析表明,51份材料根据起源和生物学特性划分为中国寒兰和日本寒兰两大类群。【结论】SRAP标记技术能很好地用于兰花植物遗传多样性和亲缘关系研究。     

贵州天门冬种质资源遗传多样性的ISSR分析

为了给合理地保护、利用与开发天门冬种质资源提供科学依据,采用ISSR分子标记技术对分布于贵州省不同生态环境的24份天门冬材料进行了遗传多样性分析。结果表明,8个引物共扩增出多态性带158条,多态性位点百分率为98%;材料间遗传相似系数在0.670 8～0.993 8,平均值为0.765 7。ISSR技术适合分析天门冬的遗传多样性,贵州天门冬具有较丰富的遗传多样性,可分为4个大类,野生种基本符合地域性分布规律。     

15个果桑无性系指纹图谱的构建

用改良的CTAB法提取15份果桑无性系的基因组DNA,通过RAPD分子标记技术,构建不同果桑无性系的指纹图谱。结果表明:每条引物扩增出8～15条清晰地条带,其中多态性条带数为4～15条,多态性比例为50.0%～100.0%。20条随机引物共得到232条清晰的条带,多态性条带为178条,平均多态性比例为76.7%;利用随机引物OPA-09和OPD-05的扩增产物电泳图为基础构建的指纹图谱可以鉴定出15个果桑无性系。     

罗田板栗种质资源ISSR分子标记初步鉴定

试验以湖北省罗田县的15个板栗主要栽培品种为材料,利用ISSR分子标记对15个板栗品种进行初步认证及亲缘关系分析.结果表明,从35条ISSR引物中筛选出17条能够扩增出清晰、稳定条带的引物;17条引物共扩增出392条带,其中多态性条带有344条,多态性条带比率为87.8％.应用NTSYS 2.10e软件进行UPGMA法聚类分析,15个板栗品种大致被分为三类.其中普通八月红和特殊八月红基本无遗传差异,玫瑰红与乌壳栗,六月暴和桂花香亲缘关系较近.初步鉴定结果可为板栗品种鉴别、分类及种质资源的有效利用提供理论依据.     

长白山区3种百合种内ISSR基因标记研究

采用ISSR分子标记技术对长白山地区的3种(61份)百合试材的遗传多样性进行了研究。其中包括轮叶百合(L.distichum)16个居群,43个个体;毛百合(L.dauricum)4个居群,12个个体;松叶百合(L.cernuum)2个居群,6个个体。从35个ISSR引物中筛选出9条引物用于3种百合的扩增。轮叶百合、毛百合、松叶百合扩增出条带分别为135,128,111;多态性条带分别为134,115,100;多态性比率分别为99.2%、89.8%、90.1%。应用NTSYSpc-2.10e软件对扩增结果进行UPGMA法聚类分析,结果表明:长白山地区3种百合的遗传多样性均较丰富,而且3种百合种群种内的遗传多样性与居群地理位置远近表现出明显的相关性。     

悬钩子属野生种和栽培种资源SSR引物筛选与评价

[目的]分析悬钩子属植物的遗传多样性,研究现存悬钩子SSR引物的通用性。[方法]通过简单重复序列标记(SSR)用12份悬钩子属野生和栽培种类资源对40对引物进行筛选。[结果]共筛选出8对引物对全部12个样品扩增良好,多态性比率为100%,可用于遗传多样性的分析。[结论]该试验筛选的8对引物可为下一步研究提供依据。     

利用SSR标记分析部分烟草种质的遗传多样性

应用SSR分子标记技术,分析了32份代表性烟草种质的遗传多样性.从38对SSR引物中筛选出8对多态性引物,并对32份烟草材料的基因组DNA进行扩增,共获得93条DNA扩增片断带,其中,多态性带70条,平均多态检出率为75.27%.运用DPS软件进行聚类分析,32个烟草品种被分为4类;其遗传距离变幅在0.31551～1.51978,聚类结果与理论上所期望的结果基本一致,SSR分子标记技术能较好地从分子水平上揭示烟草种质资源遗传背景和亲缘关系.     

杧果品种亲缘关系的CDDP分析

利用保守DNA衍生多态性(CDDP)分子标记技术,对广西亚热带作物研究所保存的31个杧果品种进行遗传多样性分析,为杧果种质资源的鉴定及分子辅助育种提供理论依据。筛选出8条CDDP引物对供试的杧果品种进行PCR扩增,分析电泳图,并进行聚类分析和主成分分析。从31个杧果品种中共扩增出107条清晰条带,其中多态性条带(NPB)100条,多态性比率(PPB)达到93.57%。平均每条引物可扩增出13条带和12条多态性带。每个位点的平均等位基因数(N_a)、有效等位基因数(N_e)、Nei's基因多样性(H)、Shannon信息指数(I)分别为1.847 1、1.636 8、0.410 8、0.84,表明杧果品种间具有丰富的遗传多样性。供试杧果品种间相似性系数范围为0.620 6~0.920 8。UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数0.690 6处可以将供试杧果划分为7类,主成分分析结果与聚类分析结果基本一致,划分结果与杧果来源地无密切关系。筛选获得的CDDP引物对杧果种质资源有较高的多态性检测率,适用于资源鉴别及亲缘关系分析。