12个亲缘关系密切的辣椒品种的AFLP鉴定

利用AFLP分子标记对12个亲缘关系密切,形态相近的辣椒品种进行品种鉴定。10对带型完整清晰的引物共扩增出762条带,多态性带的比例为12．5％,有4对引物扩增得到的图谱可以将12份辣椒品种完全区分开来。其中‘采风1号’等8个品种可以通过不同的单对引物鉴别,‘弄口早椒’等4个品种需要4对引物相互组合才可以鉴别。     

利用同工酶和RAPD技术分析辣椒杂种优势

采用POD同工酶和RAPD技术对辣椒7个亲本和6个杂交组合进行遗传差异和亲缘关系的研究,结果表明：不同辣椒品系扩增出4～7条POD同工酶带,其中相同酶带在部分材料间表现的强弱有所不同;经聚类分析,可把13个不同辣椒品系分为6个大类。经RAPD扩增,10条引物共扩增出103条带,平均每个引物10．3条;13个不同辣椒品系可分为7个大类,其中有4组与同工酶的分类相同。因此,POD同工酶技术和RAPD技术都可进行辣椒杂种优势的划分且可以互补,但RAPD标记检测的多态性要高于POD同工酶标记。     

辣椒种质资源的遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术对90份辣椒种质资源遗传多样性进行分析,从200个RAPD引物中筛选出10个引物分别对供试材料的DNA进行扩增,共扩增出70个位点,其中多态性谱带38条,多态性程度为54.3％.平均每个引物产生7条多态性谱带,每个引物可扩增出4～9条,谱带大小为100～2000 bp.对RAPD结果进行聚类分析...     

扁桃品种的SSR分析

利用SSR方法对16个扁桃品种、1个榆叶梅品种和1个晚熟毛桃进行了基因组多态性分析，从15对引物中筛选出12对多态性、稳定性较好的引物用于正式试验，12对引物在18个供试品种中共扩增出80条DNA谱带，平均每对引物扩增出5～6条，用W0622106、W0622114、W0622094、W0622116等4对引物可以鉴别18个供试品种中的17个品种，根据SSR分析结果，应用NTSYS软件进行相似性系数计算，利用UPGMA法构建聚类树状图。供试扁桃品种可分为5个类群，与传统的系谱有一定的误差。     

海南逸生辣椒遗传多样性的ISSR分析

为了探明海南7个逸生辣椒品种的亲缘关系,为地方辣椒种质资源的合理利用与科学保护提供依据,采用ISSR分子标记技术对采自海南农村的7个逸生辣椒品种进行多态性和聚类分析。结果表明:1)从19对ISSR引物中筛选出12对进行PCR扩增,共扩增出50条DNA条带,多态性条带45条,多态率达87.22%。2)聚类分析将海南7个逸生辣椒品种分为2大类,簇生椒归为一类,其余6个品种的遗传距离相近,归为小米椒+朝天椒类。3)按海拔进行聚类分析发现,低海拔对辣椒的遗传多样性表现出规律性的变化。     

辣椒抗疫病相关基因的RGA STS标记的开发

利用西北农林科技大学园艺学院辣椒课题组克隆的辣椒抗疫病相关的全长基因RGA1(GenBank登录号:GQ386945)设计一对引物,上游引物为BY32,下游引物为RBQC-R。以对辣椒疫病高抗的品种CM334和感病品种EC为试材,利用PCR技术分析辣椒抗疫病的Sequence Tagged Sites(STS)标记。结果表明,在高抗品种CM334中得到700 bp大小的STS700标记,而在感病品种EC中未扩增出相应大小的片段。在多个不同抗疫病辣椒品种中验证说明,STS700标记鉴定辣椒疫病抗性可靠、稳定。     

采用AFLP技术分析17个荷花(Nelumbo nucifera)品种的系统关系

【目的】采用AFLP技术,对17个荷花品种进行亲缘关系分析。【方法】从64个AFLP引物组合中筛选出10对多态性较高的引物,以17个荷花DNA为模板,进行PCR扩增,并对产物进行聚丙烯凝胶电泳分析。【结果】共获得条带523条,其中多态性条带370条,多态性比例达到70.75%;根据扩增条带信息进行聚类,可将17个品种分为2组;其中有5对引物,每对引物单独使用均可将17个品种完全区分开。【结论】AFLP用于鉴别荷花品种,具有较高的可行性;本研究为荷花分类和杂交育种的亲本选择提供参考信息。     

三倍体毛白杨无性系的AFLP分子标记鉴定

利用AFLP标记技术采用MseⅠ+3/EcoRⅠ+2引物组合,对12个三倍体毛白杨和二倍体毛白杨无性系进行了分析鉴定. 从38对引物组合中选出12对扩增条带较多的引物组合,多态性比例最高的是M-CAT/E-TC,多态性水平达到32.4%,最低的M-CTT/E-TT只有15.7%,证明供试材料之间的亲缘关系较近;UPGMA聚类分析结果与供试材料的系谱关系以及形态鉴别结果一致,表明凡亲本相同或形态差异小的无性系具有较高的相似系数;利用3个引物组合的8条多态性条带构建了12个供试材料的指纹图谱,可以作为三倍体毛白杨无性系鉴别以及品种保护的依据.      

黄瓜品种RAPD指纹图谱的构建及遗传相似性分析

利用RAPD技术对22个具有广泛遗传基础的黄瓜品种进行了指纹图谱构建及遗传相似性分析,从240条RAPD随机引物中筛选出27条具有稳定多态性的引物.27条引物共扩增出163条带谱,其中多态性带70条,平均多态性比例为43.10%.9条RAPD引物产生的12个特异性标记可以单一地鉴别9个品种,利用不同引物的组合可将其他品种鉴别出来.通过UPGMA法进行聚类分析,当GSC=0.688 8时,可将22个黄瓜品种分为4个群.22个品种间的平均遗传相似系数为 0.800 4,说明黄瓜的遗传变异较低,遗传基础狭窄.     

不同来源辣椒疫霉菌的遗传多样性分析

[目的]探索来自辣椒寄主和土壤的辣椒疫霉的遗传多样性。[方法]通过利用12个10碱基随机引物对来自我国4个不同地理区域的22个辣椒疫霉菌株的亲缘关系进行RAPD分析。[结果]受试22个菌株共产生101条谱带,其中多态性为99条,占98.02%,说明受试辣椒疫霉菌具有丰富的遗传多样性。根据引物扩增的DNA指纹图谱,运用UPGMA分析法,以遗传相似系数0.5为阈值,将供试22个菌株划分为3个遗传聚类组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)。RAPD标记技术分析表明,来辣椒寄主和土壤的菌株的全基因组DNA扩增图谱差异很大。[结论]供试菌株具有丰富的遗传多样性,来自不同遗传背景的菌株差异显著,聚类组的划分与菌株的来源有一定的相关性。     

辣椒AFLP技术体系的建立与优化

以辣椒细胞质雄性不育系21A及其相应的保持系21B为材料,通过对影响辣椒AFLP技术体系的若干关键因素,如提取DNA的方法、酶切与连接、预扩增和选择性扩增以及电泳和染色条件等的研究,建立了经优化的适合于辣椒的AFLP分子标记技术体系。采用该体系,对辣椒进行AFLP分析,能够得到清晰稳定的分子标记图谱,为今后利用AFLP技术进行辣椒细胞质雄性不育基因的定位奠定了技术基础。     

梨栽培品种荧光AFLP分析

利用荧光AFLP技术,对梨属6个栽培种84个品种进行研究.从64对引物组合中筛选出9对用于选择性扩增,共获得859条带,其中多态性带795条,多态性为92.5%,平均每对引物组合产生95条带.扩增结果显示,9对引物组合在16个品种中扩增出23条特征带;每对引物组合均能将所有品种鉴别开,表明荧光AFLP技术用于梨品种鉴定的效率很高.通过聚类,从分子水平对梨品种的亲缘关系进行分析,为梨属植物的分类、品种鉴定和亲缘关系分析提供了分子水平的依据.     

辣椒材料亲缘关系的RAPD初步分析

为明确 1 6个辣椒种质资源的亲缘关系 ,利用RAPD技术对不同类型的辣椒种质资源亲缘关系进行了初步分析。从 4 0个随机引物中筛选 1个A2用于PCR反应 ,6 0 %的扩增条带表现多态性 ,聚类结果表明 ,1 6份辣椒种质资源可以分为 8大类 ,DNA分子水平上辣椒亲缘关系的分析和传统研究结论基本一致     

水稻AFLP指纹图谱的引物选择研究

 通过对适合制作水稻品种AFLP指纹图谱的引物进行研究 ,初步建立了一套快速有效地制作AFLP指纹的引物选择法 :第 1步 ,选择亲缘关系相近的 3组以上材料 ,保证组内材料遗传差异较小 ,组间有一定差异 ;第 2步 ,利用两端相同的 16对 2 +2引物组合选择扩增 ,初步选出具有一定多态性的引物 ;第 3步 ,对具有一定多态性的引物重新组合 ,构成两端不同的 2 +2引物组合 ,选出多态性较高的引物组合 ;第 4步 ,将多态性较高的 2 +2引物的一端增加 1个选择碱基 ,构成 2 +3或 3+2引物组合 ,筛选多态性更强、谱带较多、质量较好的引物组合 ;第 5步 ,随机选择部分品种验证所选引物的有效性。选出了M2 1P87和M73 P17等多态性高、谱带多、带纹清晰的引物组合 ,为水稻品种AFLP指纹图谱制作奠定了基础     

应用AFLP分析广东稻瘿蚊不同生物型DNA指纹

应用AFLP技术对采自广东稻区7个地点不同生物型稻瘿蚊DNA进行指纹分析,并用DPS软件进行聚类分析,结果表明,AFLP可对稻瘿蚊DNA扩增出丰富的指纹带,不同稻瘿蚊种群和生物型DNA带型存在共同性,也有特异性;不同引物扩增数据用DPS软件分析得出不同的聚类结果。对4组引物的分析结果表明,只有1组引物所扩增的广东7个地点4个稻瘿蚊生物型DNA指纹可以进行较清晰聚类,说明鉴定稻瘿蚊生物型需要找到适合的引物组合,并指出利用DNA指纹技术分析稻瘿蚊生物型时存在一定的不确定性。     

辣椒杂交种纯度鉴定的SSR核心引物筛选（英文）

[目的]该研究旨在筛选一套适于辣椒杂交种纯度鉴定的核心SSR引物。[方法]利用17对SSR引物对100份已知辣椒杂交种进行DNA指纹分析。[结果]根据多态性和杂合率两个指标,确定Hpms1-214、Es395和Hpms1-5为辣椒杂交种纯度鉴定的首选核心引物。利用这3个引物进行筛选,97个品种(占97%)能够找到具有杂合带型的鉴定引物,确定5个引物Es330、Es363、Epms923、Es120和Es64为辣椒杂交种纯度鉴定的备选核心引物。筛选出14个品种的特异性引物,可进一步筛选每个辣椒杂交种的双亲互补型引物。[结论]该研究为构建辣椒杂交种纯度鉴定标准DNA指纹图谱奠定基础。     

不同核桃品种的SSR分析

应用SSR技术对21个核桃品种和1个枫杨品种的基因组DNA进行遗传多样性的研究。用筛选出的10对引物对供试材料进行SSR分析,共扩增出67条清晰的谱带,不同引物扩增出的DNA条带数量在4～24条之间,分子量大小在85～300 bp之间,依据特征谱带,可直接鉴别出供试品种,其中引物WGA32的鉴别效率最高。对扩增出的67条带进行聚类分析,结果表明,普通核桃和枫杨亲缘关系较远,不同地域起源的品种界限不明显。     

应用AFLP标记分析枣品种亲缘关系

从分子水平研究宁夏红枣品种系统发育和亲缘关系,为宁夏枣种质资源的保护和利用提供科学依据。利用AFLP标记方法对原产宁夏地区7个枣品种和6个从区外引种的枣品种基因组DNA进行分析。筛选出的5对AFLP引物组合对13个供试材料共扩增出351条DNA带,其中301条为多态带(占85.75%),平均每个引物扩增多态性带70条。13个材料间的遗传相似系数为0.376～0.957。UPGMA聚类表明,13个材料在相似系数0.85处被划分为5个类。宁夏地域相对狭小,品种交流频繁,从而造成该产区枣品种间亲缘关系较近,演化关系复杂。枣虽然品种资源丰富、分布范围广泛,但遗传多样性相对较小。     

利用AFLP技术鉴定玉米自交系及杂交种

AFLP技术是一种非常有效的分子标记技术，但由于在品种鉴定方面的研究较少，限制了该技术在品种产权保护和真实性鉴定中的应用。本文对适合玉米自交系及杂交种鉴定的引物组合进行了筛选，通过对42种引物组合的试验，选出MGA EGAG和MGAA EGA两组引物组合多态性强、谱带多、质量高，能有效地区分不同材料。研究中还发现随引物选择碱基的增加，扩增的谱带数有降低的趋势，多态性有增加趋势。3 2引物组合比2 3引物组合扩增谱带数有明显降低。这些变化趋势可以作为其它作物引物组合选择的参考。     

半番鸭羽色性状AFLP和RAPD标记分析

利用RAPD和AFLP技术对半番鸭2个羽色池DNA进行检测,探讨两种技术对半番鸭羽色性状标记的效果。结果显示：(1)RAPD方法扩增带和特异性条带都较少,37个引物共扩增到297个清晰条带(平均每个引物4条)；在37个引物中,7个引物含有羽色特异性条带,共15条,其中自羽半番鸭特有的条带为10条。(2)AFLP方法荧光图谱清晰度高,扩增带丰富,16对引物组合共检测1000多条扩增带(平均每个引物组合30多)；在16引物中,4个引物组合检测到羽色特异性条带,共90条,仅白羽半番鸭特有的条带可达37条。可见,采用AFLP技术对半番鸭羽色标记效果更佳。