芥菜遗传多样性的RAPD分析(英文)

随机扩增多态性DNA (RAPD)是一种新的分子标记技术 利用RAPD标记对芥菜 (BrassicajunceaCoss .) 16个变种的遗传多样性进行了分析 从 60个 10bp随机引物中筛选出 2 7个有效引物 这 2 7个有效引物共扩增出 336条DNA带 ,其中 2 75条为多态性带 ,占总数的 81 85% 平均每个引物扩增出的DNA带数为 12 4 4 不同引物扩增出各自不同的DNA指纹图谱 ,大部分图谱均有特征或特征带型 芥菜的RAPD多态性百分率和平均每个引物扩增的DNA带数均明显高于已     

薹菜种质资源的RAPD和ISSR分析

【目的】对29份薹菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis Makino var.tai-tsai Hort) 种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为薹菜的种质资源保护和利用奠定基础。【方法】利用优化的RAPD和ISSR标记体系,对采自山东、江苏和北京的29份薹菜品种进行DNA多态性分析,并采用类平均法对29份薹菜品种的RAPD和ISSR扩增结果进行聚类分析。【结果】从273条RAPD引物中筛选的33个RAPD引物,共扩增出了336条清晰的谱带,其中293条显示多态性,平均每个引物扩增出10.2条多态性谱带,多态性比率为87.2%。利用RAPD标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.63～0.79。从100条ISSR引物中筛选的45个ISSR引物,共扩增出了522条清晰的谱带,其中414条显示多态性,平均每个引物扩增出9.2条多态性谱带,多态性比率为79.3%;利用ISSR标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.70～0.86。【结论】基于RAPD和ISSR标记构建的29份薹菜品种的聚类树状图虽有一定差异,但总体趋势一致,1、20、21号薹菜与其他品种的遗传距离相对较远。     

四川不同地区硬头黄竹RAPD和ISSR分析

以四川不同地区硬头黄竹为研究对象.通过随机扩增多态性DNA标记(RAPD)和简单序列重复区间(ISSR)标记进行扩增,探讨硬头黄竹的遗传多样性.研究表明,6个RAPD引物扩增出了42条条带,多态性高达69.05%;5个ISSR引物扩增出了47条条带,多态性为61.70%.利用Popgen32进行聚类分析,聚类结果可将不同地区的硬头黄竹类型区分开来.其遗传距离分别为0.182 3～0.602 2和0.043 5～0.672 1,说明RAPD和ISSR分子标记为硬头黄竹的遗传改良提供了理论依据.     

乳白石蒜17份种质资源的RAPD分析

为分析不同种源乳白石蒜材料的亲缘关系,利用RAPD标记对乳白石蒜的17份样品的遗传多样性进行了分析。结果表明:从200个随机引物中筛选出33个多态性较高的引物,扩增出623条DNA带,其中527条为多态带,占84.6%,平均每个引物扩增的DNA带数为18.88条。根据RAPD扩增结果,将乳白石蒜各样品进行聚类,在阈值为0.352时划分为3类。分子聚类结果与原产地和花形态特征具有一定的联系。     

草地早熟禾种质资源遗传多样性的RAPD鉴定与分类研究

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记,筛选出69个随机引物对32份草地早熟禾品种遗传谱带进行分析,46个引物共扩增出了197条扩增片断,其中多态性带数为195条,每个引物扩增出1～9条多态性带,平均每条引物扩增出4.3条。根据Jaccard相似系数分析RAPD结果,并利用NTSYS软件,按UPGMA平均法进行聚类。结果表明,第一大组群包括18个品种,第二大组群包括3个品种,第三大组群包括2个品种,第四大组群包括8个品种,第五大组群仅1个品种,为C_2。     

福建若干荔枝古树资源的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从104个十聚体随机引物筛选出13个引物对福建荔枝著名的古树以及相关品种等12份材料的基因组DNA进行扩增,共得到78条扩增谱带,其中2条为共同带,多态性程度达97.44%,平均每条引物扩增的谱带数目为6条.采用遗传标记计算遗传资源相似性系数,进行聚类分析,并构建树状分析图.结果表明:现在栽培的陈紫品种与宋家香的亲缘很近,可能来源于宋家香;而元红与西禅寺“宋荔”亲缘关系较远.应用RAPD技术为荔枝古树遗传资源的鉴定和分类提供了新的途径.     

辣椒种质资源的遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术对90份辣椒种质资源遗传多样性进行分析,从200个RAPD引物中筛选出10个引物分别对供试材料的DNA进行扩增,共扩增出70个位点,其中多态性谱带38条,多态性程度为54.3％.平均每个引物产生7条多态性谱带,每个引物可扩增出4～9条,谱带大小为100～2000 bp.对RAPD结果进行聚类分析...     

利用RAPD分子标记分析东北地区杂草稻的亲缘关系

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对东北地区杂草稻生态型以及普通水稻共15个样品进行亲缘关系的分析.所分析的10个随机引物共扩增出了93条DNA片段,其中多态性条带为36条,多态性比例为38.71%,利用93个RAPD标记,在MEGA2.1软件中,计算遗传距离,建立UPGMA聚类图.结果表明:RAPD分子标记可以将杂草稻与普通稻、杂草稻不同生态型之间分开;杂草稻之间形态相似、地理分布相近的物种聚类在一起.     

苹果梨分类地位的RAPD鉴定

利用RAPD技术对15个梨品种及类型的遗传变异进行了研究。从100个10bp随机引物中筛选出12个多态性引物用于正式扩增，共扩增出89条DNA带，其中多态性DNA带84条，占93．6％，平均每个引物扩增的DNA带的数目为8条。利用DNA扩增结果进行聚类分析，初步认为延边苹果梨应该归属于白梨系统。     

几种药用西红花与观赏西红花的RAPD分析

[目的]为分析不同种源西红花的遗传多样性和亲缘关系,利用RAPD标记技术对8种西红花基因组DNA的多态性进行分析。[方法]应用22个随机引物对8个西红花品种进行RAPD分析,并根据RAPD的扩增结果,应用NTSYS-pc 2.10e软件进行聚类分析。[结果]从22个随机引物中筛选出18个多态性较高的引物,共扩增出143条DNA条带,其中108条为多态带,占总数的75.5%,平均每个随机引物扩增的DNA带数为7.9条;在遗传相似系数0.62处将8个样品分为2类,一类为药用西红花,另一类为观赏西红花。[结论]RAPD法能有效鉴别药用西红花和观赏西红花,分子聚类结果与地理因素未见确定联系。     

一串红品种（系）遗传多样性RADP分析

用RAPD分子标记技术分析了8个一串红品种(系)DNA的多态性,从200个10碱基随机引物中筛选出多态性高的30个引物,扩增出162条DNA谱带中,119条是多态的,多态性占73.5%,通过聚类分析,获得品种(系)聚类树状图;聚类分析的结果,按照株高可将供试的8个一串红品种(系)分为两大类。     

绿竹7个种源的遗传多样性ISSR分析

为了探明绿竹7个种源间的亲缘关系,利用ISSR分子标记技术进行了遗传多样性分析,结果表明：从30条ISSR引物中筛选出20条有效引物,共扩增出273个位点,其中176个位点表现多态性,占总数的64.5%,并通过聚类分析将绿竹7个种源分成3组,不同种源间的遗传距离为0.015～0.465。绿竹栽培种之间的亲缘关系较近,花秆绿竹和花绿竹的原产地应为瑞安和苍南。     

应用RAPD标记对桃品种间亲缘关系的分析

以普通桃的36个品种为试材，应用RAPD标记进行品种间亲缘关系的分析，探讨应用RAPD标记划分桃品种的可行性，试验结果表明，利用筛选的20个引物在36个桃品种中共扩增出111条带，其中多态性带86条，占标记总数的77．5％，可用于样品间亲缘关系的分析．利用这些多态性带构建二元数据矩阵，计算样本间的遗传距离，并用UPGMA法对36个样品进行聚类分析，以遗传距离0．14为接合线，将供试类型分为五类．若进一步在遗传距离0．13处划分，可明显将水蜜桃、黄肉桃、油桃区分开，认为RAPD标记可用于桃品种分类，以肉质类型划分桃品种是可行的。     

基于RAPD技术的韭菜品种间遗传多样性分析

为了研究韭菜种质资源的多样性和品种间的相似问题,利用RAPD分子标记技术分析了我国11个地区15个韭菜品种间的遗传多样性。结果表明,采用20条RAPD引物,共扩增出136个条带,其中多态性位点98个,平均多态性比率为72%。依据15个韭菜品种间的Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.34处将15个韭菜品种分为4个类群:第1类群包含独根红、兰州白根和南京马鞭韭3个品种;第2类群包含汉中冬韭、上海强韭-3和上海强韭-6 3个品种;第3类群包含四季青、桂林小红根、天津大青苗、新疆白根和嘉兴雪莲5个品种;第4类群包含天津大金钩、环韭、平丰苔韭和抗寒薹韭4个品种。韭菜品种间遗传相似性和来源地之间没有必然的联系。     

新疆引进扁桃品种与当地品种间种质资源的RAPD分析

利用7个多态性稳定的引物,对18个扁桃品种进行遗传多样性和亲缘关系RAPD分析.共扩增出54条DNA片段,其中多态性DNA带30条,占总扩增片段的55.6;.根据RAPD扩增结果,应用DPS(V3.01)软件进行Jaccard相似系数和遗传距离计算,并利用UPGMA法构建聚类树状图,结果表明,供试的18个扁桃品种可分为2个大类,聚类结果与种质分布结果基本一致.     

基于RAPD标记进行水稻籼粳分类研究

应用RAPD标记方法对30个水稻栽培品种进行了籼粳分类研究。从80个随机引物中筛选出了扩增出具有多态性的谱带的18个引物,并从中选出重复性高、稳定性好的S1004,S1012,S1019,S1048,S1049,S1053,S1063,S1070,S1075共9个引物进行反应。依据随机引物对不同品种水稻总DNA扩增出的特异性扩增条带,用Ne i’s公式计算30个水稻品种间的相似系数,并以UPMGA法进行聚类分析,其结果与品种系谱基本吻合,证明RAPD标记可应用于水稻的分类。     

雷竹不同栽培类型RAPD 分子标记的研究

对雷竹的19 个栽培类型及2 个近缘种进行了RAPD 分析。从4 组80 个引物中筛选出10 个引物, 产生随机扩增位点66 个, 其中多态性位点54 个(占81.8 %)。利用POPGEN 32程序进行聚类分析, 结果表明:①聚类结果可将雷竹的不同栽培类型及其近缘种区分开来,以前认为是雷竹一栽培型的永嘉雷竹不属于Ph .praecox 种系;②细叶雷竹与阔叶雷竹的产量高低主要取决于经营管理;③RAPD 分子标记对竹类植物种以下等级进行分类有一定的可靠性。图2 表3 参8     

汉江上游鲫鱼RAPD遗传多样性研究

采用RAPD技术从26个随机引物中筛选出8个引物对汉江上游汉中段野生鲫鱼群体的遗传多样性进行研究,结果共检测出512个位点,其中多态位点347个,其多态位点比例(P)为67.77%;利用POPGEN软件获得汉江上游汉中段野生鲫鱼群体11个个体间的遗传距离,个体间遗传距离(D)在0.008 6~0.535 0,个体间遗传相似系数(S)在0.585 6~0.991 5,Shannon遗传多样性指数(H0)为0.652 5。试验表明,汉江上游汉中段野生鲫鱼群体仍保持着较丰富的遗传多样性,应加以保护。     

不同产地冬枣的RAPD分析

冬枣是中国优良的鲜食枣品种,但生产中常将晚熟枣品种与冬枣相混淆,严重影响了冬枣产业的发展。利用筛选的17个随机引物对6个不同产地冬枣材料进行了RAPD分析,共扩增出144条谱带,有95条为多态性带,比例为65.09%。利用UPGMA进行聚类分析,结果表明,在遗传距离为0.095时,供试材料可分为2类,即成武冬枣与其他产地冬枣并非一类,不同产地间冬枣也存在一定的遗传变异。