不同方法提取野生龙眼基因组DNA的效果比较

以广东、海南的3种野生龙眼幼嫩叶片为试验材料,采用常规SDS法、常规CTAB法、改良SDS法和改良2xCTAB法提取龙眼叶片基因组DNA,探索从富含单宁、多酚、多糖和色素等次生代谢物质的野生龙眼叶片中获得高质量DNA的提取方法.结果表明:采用改良的2xCTAB法提取的龙眼叶片基因组DNA纯度最高、质量最佳,可直接用于龙眼RAPD分析和叶绿体DNAtrnL-F基因的PCR扩增分析,且扩增后条带清晰.说明改良的2xCTAB方法获得的DNA纯度和产率较高,提取效果较好.     

川续断基因组DNA的提取研究

川续断叶片中很有较多的蛋白质、多糖、酚类以及其他一些次生代谢物,采用传统的CTAB法很难得到高质量的DNA。试验以川续断叶片为材料,提出一种改良的CTAB法提取叶片基因组DNA,对提取的基因组DNA进行琼脂糖电泳检测及紫外分光光度计分析。利用中药材条形码ITS2序列的引物对提取的基因组DNA进行PCR验证。结果表明,改良的CTAB法得到的DNA质量较好,其OD260/OD280的值介于1.8~2.0之间,ITS2序列的引物PCR扩增成功率达到100%。改良的CTAB法为较为理想的川续断基因组DNA提取方法,获得的总DNA能够满足下游的PCR试验要求。     

黄芩高质量DNA提取方法研究

采用4种方法对富含多酚、多糖和小分子杂质的黄芩新鲜叶片进行了基因组DNA的提取,通过比较得到了一种以改良的SDS法为基础的分离高质量完整DNA的简便方法.结果表明.使用该方法从黄芩新鲜叶片中提取的基因组DNA可直接用于RAPD分析,可有效地从富含多酚和多糖的药用植物组织中分离出高质量DNA.     

黄芩高质量DNA提取方法研究

采用4种方法对富含多酚、多糖和小分子杂质的黄芩新鲜叶片进行了基因组DNA的提取,通过比较得到了一种以改良的SDS法为基础的分离高质量完整DNA的简便方法。结果表明,使用该方法从黄芩新鲜叶片中提取的基因组DNA可直接用于RAPD分析,可有效地从富含多酚和多糖的药用植物组织中分离出高质量DNA。     

美味猕猴桃基因组DNA的高效提取

为了从富含多糖和多酚等次生代谢物质的猕猴桃叶片及野外采集保存的叶样中分离出高质量的基因组DNA,以美味猕猴桃幼叶为试材,对4种不同的DNA提取方法与3种不同的样品保存处理的DNA提取效果进行了试验研究,并首次采用CTAB区室法提取猕猴桃基因组DNA。结果表明,CTAB区室法与硅胶脱水干样保存处理所提取的DNA效果最佳,其OD260/OD280值为1.8以上,能完全被EcoRI酶切消化,1%琼脂糖凝胶电泳谱带明亮清晰,并能获得条带清晰、多态性好的PCR扩增图谱。     

芦笋DNA提取方法的比较研究

以芦笋植株叶片为材料,比较了改良SDS法、改良CTAB法和试剂盒法3种提取DNA的方法,并利用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR检测DNA质量,探索最佳的芦笋DNA提取方法。结果表明：上述3种方法都适合于芦笋DNA的提取,提取的DNA均能够满足ISSR分子标记等试验的需要。     

改良CTAB法提取益智基因组DNA

益智叶片中多酚和多糖等杂质的含量较高,为获得高质量的益智基因组DNA,试验在传统CTAB法的基础上加以改良,提取益智基因组DNA,并对所得DNA的质量和浓度进行了检测。结果表明,改良后的方法较之传统方法简单高效,所获得的基因组DNA质量较好,OD260/OD280在1.7~2.0之间,RNA消化彻底,DNA无明显降解,进行ISSR分析条带清晰,多态性好。适合于进行以PCR为基础的DNA多态性的研究。     

2种CTAB法对干燥方法不同的平邑甜茶叶片DNA的提取

分别采用S.Wilkie的CTAB提取方法及在此基础上进行了改良的CTAB法,以硅胶干燥、标本干燥和新鲜的平邑甜茶叶片为材料,提取出平邑甜茶基因组DNA,并进行DNA质量的检测。结果表明,利用改良的CTAB法能够获得较高质量的DNA,新鲜叶片中提取的DNA量最多,经过硅胶干燥的叶片提取的DNA比标本干燥的叶片多。     

刺山柑(Capparis spinosa L.)基因组 DNA提取方法的比较

[目的]为获得野生刺山柑DNA 提取的最佳方法.[方法]以野生刺山柑叶片为材料, 采用 CTAB 法、SDS-CTAB 法、SDS法和尿素法提取了3个不同地方采集的野生刺山柑DNA.[结果]通过A260/A280、琼脂糖电泳法对所提取的DNA质量进行检验,将其纯度、完整性、得率及耗时等方面进行比较.[结论]4种方法提取DNA结果比较显示,CTAB 法是野生刺山柑 DNA 提取的最佳方法.     

野外保存对益智叶片基因组DNA的影响

为获得高质量的益智基因组DNA寻找一种简单可行的野外益智鲜叶保存方法,利用植物基因组提取试剂盒法提取益智基因组DNA,以新鲜叶片为对照及DNA的纯度、浓度、琼脂糖凝胶电泳和ITSPCR扩增效果为评价指标,比较室温阴干、室外晒干、硅胶干燥和液氮保存4种鲜叶保存方法对提取益智基因组DNA效果的影响。结果表明:4种保存方法均可获得益智基因组DNA且ITS-PCR均获得约700bp的PCR产物,其中液氮保存5d的叶片提取DNA条带清晰明亮,室温阴干、硅胶干燥和室外晒干保存方法提取的基因组DNA分别在4d、3d和2d后开始发生降解,不同保存方法效果依次是液氮保存室温阴干硅胶保存室外晒干。在远距离野外资源调查和收集时,采用室温阴干保存新鲜益智叶片是经济简单可行的野外保存方法。     

雷公藤叶片基因组DNA不同提取方法比较

[目的]比较雷公藤叶片中基因组DNA的提取方法。[方法]采用常规CTAB法、改良CTAB法、常规SDS法、高盐低pH值法和一步法分别提取雷公藤叶片基因组DNA,利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法测定样品OD260与OD280的比值以及RAPD扩增结果,判断所得DNA样品的纯度,并根据OD260值计算不同提取方法的DNA得率。[结果]改良CTAB法提取效果最佳,所提DNA的平均得率为219.3μg/g,OD260/OD280比值在1.869～1.903,用于RAPD-PCR均有较好的扩增结果。[结论]改良CTAB法是雷公藤叶片基因组DNA提取的最佳方法。     

大豆不同组织材料的DNA提取

以大豆叶片、愈伤组织和干种子为材料进行大豆基因组DNA提取的比较试验.结果表明:从以上3种组织材料中均能提取到较高质量的DNA,利用愈伤组织为材料提取的DNA质量比叶片和种子略好,从愈伤组织中可以提取到质量较高的模板DNA.     

牡丹·芍药DNA提取方法研究

[目的]筛选一种适合牡丹、芍药基因组DNA的提取方法。[方法]以新鲜的牡丹、芍药叶片为材料,采用CTAB法和SDS法提取基因组DNA,通过紫外光谱分析法、琼脂糖凝胶电泳及PCR扩增等检测方法对牡丹、芍药基因组DNA的提取方法进行筛选。[结果]在牡丹、芍药基因组DNA的提取过程中,叶片内的酚类、色素、丹宁、糖类等物质与DNA结合,影响DNA的提取质量。在这两种DNA提取方法中,SDS法略好于CTAB法。SDS法DNA得率虽低,但其纯度高,去糖去蛋白等杂质比较干净,且在未加RNA酶的情况下,RNA污染较少,在进行PCR扩增时,能得到比较理想的产物。[结论]取材时间是影响DNA提取质量的关键因素之一。在提取牡丹、芍药基因组DNA时应该取完全展开的幼嫩叶片。     

快速提取玉米DNA方法的研究

[目的]为了探索一种快速、简便,能够用于SSR分析的玉米DNA提取法。[方法]采用改进的常规DNA提取法和DNA快速提取法提取玉米种子胚和黄化苗叶片中的DNA,进行SSR分析,通过琼脂糖电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳对SSR产物进行检测。[结果]用常规法提取时,用氯仿∶异戊醇(24∶1)抽提1次就可获得质量好和浓度高的DNA;无须抽提,直接吸取上清液,可得到高浓度的DNA,也能满足SSR分析的需要;同样的提取法,SDS的提取效果比CTAB好。对快速提取法进行分析表明,相同的提取液和提取方法,采用种子胚提取的DNA浓度和质量明显高于叶片DNA。[结论]该研究为SSR在玉米种质及纯度鉴定上的应用提供了技术上的保证,有利于该项技术的普及和推广。     

不同方法提取吴茱萸叶片基因组DNA和RNA的比较

分别研究对比了3种不同方法提取吴茱萸叶片基因组DNA和RNA的质量,以确定适合吴茱萸叶片基因组DNA和RNA的提取方法。采用紫外分光光度法和普通电泳检测法比较了常规CTAB法、SDS法和改良CTAB法提取吴茱萸叶片基因组DNA的效果;采用紫外分光光度法和非变性电泳检测法比较了酚-SDS法、Trizol法和改良异硫氰酸胍法提取吴茱萸叶片RNA的效果。结果表明,分别采用不同方法提取的吴茱萸叶片基因组DNA和RNA的质量差异较大。常规CTAB法和SDS法无法提取出高质量的吴茱萸叶片基因组DNA,而改良CTAB法提取效果较好;酚-SDS法和Trizol法不适合高质量吴茱萸叶片RNA的提取,而改良异硫氰酸胍法的提取效果良好。     

七叶树叶片的DNA提取

[目的]探索能用于RAPD分析的七叶树叶片DNA的提取方法。[方法]以七叶树嫩叶为材料,使用聚乙烯吡咯啉酮(PVP)和巯基乙醇方法从七叶树叶片中提取DNA。[结果]聚乙烯吡咯啉酮被用于去除多酚,巯基乙醇是强烈的还原剂和蛋白质变性剂,提取过程中聚乙烯吡咯啉酮和巯基乙醇的使用促进了DNA质量和提取效率的提高。遵循这种程序提取的DNA需通过检查,质量好的方可用于RAPD分析,PCR扩增次数可达500次左右。应该根据实际情况调整聚乙烯吡咯啉酮和巯基乙醇的用量。[结论]使用聚乙烯吡咯啉酮和巯基乙醇方法得到的七叶树叶片DNA完全能满足随机扩增多态性DNA分析的要求。     

槟榔基因组DNA的高效提取方法

以槟榔叶片为植物材料,采用改良的SDS-CTAB方法提取其基因组DNA。结果表明,以水饱和酚代替Tris饱和酚对样品进行抽提的SDS-CTAB法可以获得纯度高(OD260/OD280在1.7~1.9、OD260/OD230大于2)、一级结构完整、分子量大于23 kb的DNA,产率在50~120μg/g。该法所提DNA成功用于后续的分子生物学研究,并在花生、香蕉等植物上得到应用。     

黄瓜基因组DNA提取及AFLP体系优化研究

［目的］提取黄瓜基因组DNA,并对AFLP体系进行优化。［方法］以黄瓜嫩叶为材料,利用改进的CTAB法提取高质量的黄瓜叶片总DNA,通过优化酶切连接、预扩增、选择性扩增等试验条件建立适合黄瓜的AFLP银染体系,得到清晰的黄瓜AFLP指纹图谱。［结果］DNA 模板的质量影响酶切以及后续的连接扩增反应,改良的CTAB 提取法可用于黄瓜AFLP 分析,形成清晰的AFLP 指纹。优化的酶切连接体系为：以37 ℃酶切连接12 h为宜,酶切连接的基因组DNA用量为200 ng,预扩增时Taq酶用量为0.5 U/20 μl体系,预扩增产物稀释40倍作为选择性扩增的模板。在此优化的体系下引物E41M47扩增出清晰的条带。［结论］为黄瓜品种的分子标记和黄瓜品种间亲缘关系等研究奠定了基础。     

大麦高分子量基因组DNA提取的优化

高分子量(HMW)DNA的制备是进行生物基因组物理作图等相关基因组学研究至关重要的基础工作。为建立一种高效的提取大麦高分子量DNA的方法,对琼脂糖包埋原生质体和琼脂糖包埋细胞核分离基因组DNA的方法进行了改良和优化。限制酶消化,脉冲电场凝胶电泳(PFGE)和Southern杂交等检测表明,应用优化的实验方法所分离的大麦基因组HMW DNA质量好,数量多。与原方法相比,新改进的方法实验流程缩短,效率提高,所分离HMWDNA能更好地满足后续相关研究的需要。这两种优化的分离大麦HMW DNA技术亦可应用于其它禾谷类植物基因组DNA的制备。