IBV H52疫苗株主要结构蛋白基因信息解析

鸡传染性支气管炎(Infectious bronchitis，IB)对我国养禽业危害巨大。IB的病原为鸡传染性支气管炎病毒(IBV)，该病毒基因组为单股正链RNA，可编码纤突蛋白(S，可裂解为S1和S2)、膜蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)等3种主要结构蛋白；     

近年鸡传染性支气管炎病毒流行状况

1病原 鸡传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)为冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus)第三群成员,为单股正链、不分节段的RNA病毒,基因组长约2 716 kb.病毒主要有磷酸化的核衣壳蛋白(N)、糖基化的膜蛋白(M)、小膜糖蛋白(E)和纤突蛋白(S)4种结构蛋白组成.S蛋白转译后裂解成N端的S1和C端的S2,其中S1为重要的抗原蛋白,能诱导机体产生中和抗体,也是决定IBV血清型特异性的主要蛋白,由于高度易变,其点突变、插入、缺失或重组是新血清型、亚型或变异株产生的主要原因.     

猪繁殖与呼吸综合征病毒N蛋白与BCCIP蛋白相互作用的鉴定

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)核衣壳(N)蛋白在病毒粒子组装和释放过程中发挥重要的作用。为筛选N蛋白与宿主细胞相互作用的蛋白,本研究分离健康猪肺泡巨噬细胞(PAM),构建了PAM的酵母cDNA文库,利用酵母双杂交方法筛选其中与PRRSV N蛋白相互作用的蛋白,结果获得3个阳性克隆。经测序并利用Blast方法比对GenBank数据库,筛选得到克隆插入的cDNA均与BCCIP(BRCA2 and CDKN1A interactingprotein)基因的1 bp～396 bp核酸序列一致。经酵母回返验证试验、GST-pulldown和免疫共沉淀试验验证了N蛋白与BCCIP之间的特异性相互作用,共定位试验显示N蛋白与BCCIP共定位于细胞核和细胞浆中。本研究鉴定了新的与PRRSV N蛋白相互作用的宿主蛋白BCCIP,BCCIP是否通过与N蛋白的相互作用参与PRRSV复制还有待深入研究。     

流感病毒的核蛋白是一种多功能RNA结合蛋白

流感病毒核蛋白 (NP)的主要功能是使病毒基因组衣壳化 ,以便 RNA转录、复制和病毒子装配。本综述的目的是说明 NP不仅是一种RNA结合的结构蛋白 ,而且作为病毒与宿主细胞之间的一种关键的配体分子而起作用 ,通过病毒和细胞的大分子之间相互作用来发挥其功能 ,包括 RNA、NP、病毒 RNA依赖的 RNA聚合酶和病毒基质蛋白。 NP也与细胞多肽相互作用 ,细胞多肽包括肌动蛋白、细胞核输入和输出装置所需的成分和细胞核 RNA解旋酶     

猪繁殖与呼吸综合征病毒N蛋白磷酸化位点鉴定及其作用研究

为了探索猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)N蛋白磷酸化对于病毒复制和转录的影响,本研究利用Phos-tag和点突变技术实现了N蛋白磷酸化形式的分离并鉴定出磷酸化位点为第120位丝氨酸(Ser120)。通过反向遗传操作系统将N蛋白的磷酸化位点突变并拯救出病毒。空斑实验、IFA检测、病毒生长曲线结果显示,磷酸化位点突变对于病毒的感染性和N蛋白的核定位没有影响,但是病毒的复制能力减弱。进一步利用荧光定量RT-PCR方法检测突变病毒与亲本病毒在不同感染时间的基因组RNA和亚基因组RNA的转录水平,结果表明突变病毒的g RNA和长链sg RNAs转录水平明显低于亲本病毒,表明N蛋白Ser120磷酸化可能参与了病毒的转录调控过程。     

单股正链RNA病毒基因组非编码区结构与功能研究进展

单股正链RNA病毒基因组末端的非编码区(non-coding region,NCR)不仅参与RNA-RNA间相互作用,还可以通过与反式作用因子(trans-acting factor)结合,发挥对病毒基因组的复制、转录和组装等过程的调控作用.本文对近年来一些关于单股正链RNA病毒基因组非编码区的结构与功能研究进展情况进行综述.     

A型流感病毒核衣壳蛋白研究进展

A型流感病毒核衣壳蛋白参与病毒生活周期的多个阶段,影响病毒的转录、复制、装配及转运功能。另外,核衣壳蛋白是细胞毒性T淋巴细胞(CTL)识别的主要抗原,CTL通过识别MHC类分子递呈的核衣壳蛋白抗原肽而清除感染的流感病毒。与核衣壳蛋白有关的CTL免疫逃避的研究证实了CTL反应对于控制病毒感染的重要性。由于核衣壳蛋白诱导产生的细胞免疫反应能针对同型不同亚型的流感病毒株产生交叉反应,将核衣壳蛋白作为疫苗成分有可能提供更加广泛、有效的保护作用。因此,对流感病毒核衣壳蛋白的深入研究,将有利于理解流感的发病机理,并为设计有效的流感疫苗奠定理论基础。     

反转录PCR扩增鸡传染性支气管炎病毒核衣壳蛋白基因

以两个人工合成引物进行聚合酶链(PCR)反应,成功地扩增了鸡传染性支气管炎病毒(IBV)核衣壳蛋白基因(N)。PCR 扩增的模板 DNA 分别为含有 IBV N 基因cDNA 的重组质粒和病毒基因组 RNA 反转录产物.PCR扩增产物的大小与预期的相同,同时核酸序列分析的结果也与已发表的序列一致.     

猪细小病毒VP区遗传元件在病毒复制效率中发挥关键作用

猪细小病毒(PPV)是引起猪繁殖障碍疾病的非外膜20面体病毒,和其他细小病毒的亲缘病毒类似,PPV非结构蛋白NS1与基因组复制、转录调控和细胞毒性相关,而NS2参与衣壳的组装和转运。     

疱疹病毒ICP22蛋白研究进展

疱疹病毒(herpesvirus)是一类有囊膜结构的双链DNA病毒,典型结构由双链DNA基因组、衣壳(capsid)、皮层(tegument)和囊膜(envelope)组成。其家族庞大,迄今共发现了100多种,分为甲型(α)、乙型(β)、丙型(γ)疱疹病毒亚科。疱疹病毒宿主分布极其广泛,可感染两栖类、禽类、哺乳类、灵长类和人类,主要侵害皮肤、黏膜以及神经组织,严重影响着人类及其他动物的健康。感染细胞蛋白22(infected cell protein 22,ICP22)是US1或其同源基因编码的多功能蛋白,可与细胞和/或病毒成分相互作用而广泛发挥作用,如参与病毒潜伏感染期的建立、与RNA聚合酶Ⅱ(RNA polymeraseⅡ, RNA PolⅡ)相互作用影响病毒和宿主基因转录、影响病毒诱导分子伴侣富集域(virus-induced chaperone-enriched, VICE)区域的形成以及子代病毒粒子的核出芽、涉及细胞凋亡、自噬与抗病毒反应等。本文就疱疹病毒US1及同源基因编码蛋白ICP22的研究进展作一综述,以期为深入开展ICP22与病毒和宿主蛋白相互作用参与病毒复制和致病过程中的机制研究提供参考,对动物疱疹病毒、特别是以ICP22作为靶标的新药研究具有一定的参考价值。     

猪生殖——呼吸综合征病毒蛋白的结构与功能

猪生殖－－呼吸道综合征（ＰＲＲＳ）病毒是新发现的ＲＮＡ病毒，其基因组有８个开放阅读框架（ＯＲＦ），ＯＲＦ１编码病毒的ＲＮＡ聚合酶，ＯＲＦ２－７分别编码糖蛋白ＧＰ２－５、Ｍ蛋白和Ｎ蛋白。本文概括了近几年来国际上对其病毒蛋白的研究成果，对这些病毒蛋白的结构，功能及其免疫学地位进行了分析和讨论。     

家蚕质型多角体病毒研究的若干新进展

家蚕质型多角体病毒(BmCPV)分为9个株系,可使20种昆虫感染发病。本文阐述了近年来BmCPV在交叉感染、结构、基因组、结合蛋白与功能等方面的一些研究新进展。据报道BmCPV-1的两个毒株(H株与I株)的基因组全序列已被测定公布,由10个节段的双链RNA构成;众多研究认为BmCPV具有5种结构蛋白(VP1-5),推测VP1为依赖于RNA的RNA聚合酶,VP2、VP5分别为核衣壳蛋白、外壳蛋白,VP3、VP4各为三磷酸核苷酸结合蛋白、非特异性的核酸结合的关键蛋白,5种结构蛋白在BmCPV病毒复制包装过程中发挥着不同的功能。     

新城疫病毒M蛋白与宿主蛋白相互作用的研究进展

新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)是单股负链不分节段的RNA病毒,其基因组大小约为15.2 kb,编码6种结构蛋白和2种非结构蛋白.由于NDV基因组较小,不能编码病毒复制需要的所有蛋白,因此必须借助宿主蛋白来完成NDV的生活周期.M蛋白是一种非糖基化膜相关蛋白,在抑制宿主细胞基因转录、...     

宿主蛋白ANP32A对流感病毒功能影响的研究进展

流感病毒是一类危害人和动物健康的RNA病毒,其在宿主细胞内的有效复制离不开宿主蛋白酸性核磷蛋白32家族成员A （ANP32A）和病毒RNA聚合酶的协助和支持。病毒RNA聚合酶由3种蛋白PB1、PB2和PA组成,且ANP32A与病毒RNA聚合酶的最强相互作用需要这3种蛋白的共同参与。ANP32A是酸性富含亮氨酸的核磷蛋白32（ANP32）家族成员,其被确认为支持细胞核中病毒RNA聚合酶活性的关键宿主因子,对流感病毒的复制具有重要的作用。ANP32A的物种特异性差异决定了病毒RNA聚合酶的宿主范围：独特的33个氨基酸序列存在于禽类ANP32A （avANP32A）,而在哺乳动物ANP32A中缺乏此氨基酸序列。avANP32A中特有的33个氨基酸序列能增强ANP32A的功能,从而增加禽源特征流感病毒聚合酶活性。禽流感病毒（Avian influenza virus,AIV）不能有效利用较短的ANP32A （即缺乏独特33个氨基酸序列的ANP32A）,因而哺乳动物ANP32A无法支持禽源特征聚合酶活性,然而在人ANP32A （huANP32A）中插入这33个氨基酸能促进其对AIV聚合酶的支持作用。此外,流感病毒的适应性突变也能增强AIV在哺乳动物中的传播力和致病性。AIV适应哺乳动物时往往会发生E627K突变,以增强其在哺乳动物中的复制能力。作者主要介绍了宿主蛋白ANP32A对流感病毒复制、转录的影响和流感病毒发生适应性突变的作用机制,简要论述了ANP32A与聚合酶的相互作用对流感病毒跨物种感染的分子机制。     

疱疹病毒ICP22蛋白研究进展

疱疹病毒(herpesvirus)是一类有囊膜结构的双链DNA病毒,典型结构由双链DNA基因组、衣壳(cap-sid)、皮层(tegument)和囊膜(envelope)组成.其家族庞大,迄今共发现了100多种,分为甲型(α)、乙型(β)、丙型(γ)疱疹病毒亚科.疱疹病毒宿主分布极其广泛,可感染两栖类、禽类、哺乳类、灵...     

PRRSV, the virus

Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is a positive-strand RNA virus that belongs to the Arteriviridae family. PRRSV grows in primary alveolar macrophages and in monkey kidney cell lines. The genomic RNA is approximately 15 kb. The genome encodes the RNA replicase (ORF1a and ORF1b), the glycoproteins GP2 to GP5, the integral membrane protein M, and the nucleocapsid protein N (ORFs 2 to 7). A comparison of nucleotide sequences of different strains indicates that European and North American strains represent two distinct antigenic types. Various PRRSV-specific monoclonal antibodies and recombinant structural proteins have been produced. Well-defined PRRSV mutants can be generated with the recently developed infectious cDNA clone of PRRSV.     

African horse sickness virus structure

African horse sickness virus (AHSV), of which there are nine serotypes (AHSV-1, -2, etc.), is a member of Orbivirus genus within the Reoviridae family. Both in morphology and molecular constituents AHSV particles are comparable to those of bluetongue virus (BTV), the prototype virus of the genus. The two viruses have seven structural proteins (VP1–7) organized in two layered capsid. The outer capsid is composed of VP2 and VP5. The inner capsid, or core, is composed of two major proteins, VP3 and VP7, and three minor proteins, VP1, VP4 and VP6. Within the core is the virus genome. This genome consists of 10 double-stranded (ds)RNA segments of different sizes, three large, designated L1–L3, three medium, M4–M6, and four small, S7–S10. In addition to the seven stuctural proteins that are coded by seven of the RNA species, four non-structural proteins, NS1, NS2, NS3 and NS3A, are coded by three RNA segments, M5, S8 and S10. The two smallest proteins (NS3 and NS3A) are synthesized by the S10 RNA segment, probably from different in-frame translation initiation codons. Nucleotide sequences of eight RNA segments (L2, L3, M4, M5, M6, S7, S8 and S10) and the predicted amino acid sequences of the encoded gene products are also available, mainly representing one serotype, AHSV-4. In this review the properties of the AHSV genes and gene products are discussed. The sequence and hybridization analyses of the different AHSV dsRNA segments indicate that the segments that code for the core proteins, as well as those that code for NS1 and NS2 proteins, are highly conserved between the different virus serotypes. However, the RNA encoding NS3 and NS3A, and the two segments encoding the outer capsid proteins, are more variable between the AHSV serotypes. A close phylogenetic relationship between AHSV, BTV and epizootic haemorrhagic disease virus (EHDV), three Culicoides-transmitted orbiviruses, has been revealed when the equivalent sequences of genes and gene products are compared. Recently, the four major AHSV capsid proteins have been expressed using recombinant baculoviruses. Biochemically and antigenically these proteins are similar to the authentic proteins. Since the AHSV VP7 protein is highly conserved among the different serotypes, it has been utilized as a diagnostic reagent. The expressed VP7 protein has also been purified to homogeneity and crystallized for three-dimensional X-ray analysis. The expressed outer capsid proteins, VP2 and VP5, have been purified and used to raise antisera in rabbits. The VP2 antisera neutralize virus infections in vitro indicating the importance of this protein for vaccine development.