浅谈异境保存对热带作物种质资源的影响

异境保存是目前热带作物种质资源的主要保存形式.本文在介绍异境保存概念及其对种质资源遗传多样性影响的基础上,提出见解和建议:对生长不良的种质资源采取人为主动淘汰;对生长良好的种质资源可以采集种子播种,通过自然选择建立稳定种群;对于我国野生的资源,宜保存进化显著单元.     

基于ISSR分子标记的海南凤仙花种群遗传多样性

运用ISSR分子标记技术,分析海南岛石灰岩地区海南凤仙花自然种群的遗传结构,比较3个海拔梯度对种群遗传结构的影响。结果显示,13个ISSR引物的扩增结果显示其多态性位点百分率为97.7%。AMOVA分析表明:海南凤仙花自然种群的变异主要来自种群内(92%),而种群间变异较少(8%);中海拔种群的遗传多样性最为丰富;而高海拔种群的遗传多样性则较低;种群的遗传距离和地理距离表现出显著的高度相关性。说明海拔是影响种群基因流的重要因素,高海拔种群可以向中低海拔种群进行传播花粉和种子等基因流动,而中低海拔种群向高海拔种群进行类似的基因流动则较为困难,海南凤仙花数量较少的主要原因可能来自于其生境的限制。因此在以后的保护工作中要特别注重其生境的保护,避免人为因素的破坏。     

分子标记研究野生大豆遗传多样性进展

野生大豆是栽培大豆的近缘野生种,是大豆遗传改良的重要基因源。野生大豆的遗传多样性研究对野生大豆资源的收集、保存、保护和利用具有重要意义。本文从种质库资源的多样性,不同国家野生大豆资源的多样性,野生大豆种群的多样性和野生大豆种群间的遗传分化几个方面,总结了利用RAPD、AFLP和SSR等DNA分子标记技术对野生大豆资源和种群进行遗传多样性研究的进展。     

不同生境条件下的狗牙根形态变异研究

通过野外调查和田间测定,对海南岛狗牙根(Cynodon dactylon[L.]Pers.)不同野生种群的形态学变异,以及同一种群在不同生境条件下的形态变异进行了研究。结果表明:狗牙根不同种群在野外原生境与田间栽培两种条件下外部形态性状均发生了较大的变异,说明狗牙根种质资源有较丰富的遗传多样性。对形态学测定结果进行聚类分析,将16个种群分为3大类,聚类结果与材料的生境基本一致,IC类种群可望作为优良的草坪草选种育种材料。     

海南岛蝗虫的遗传多样性分析

蝗虫遗传多样性的变化可用以监测其种群的动态变化,进而有利于研究其发生规律和成灾机理,有效预防蝗灾发生和治理蝗害。对海南岛10种易成灾蝗虫10种酶13个位点的遗传多样性比较分析表明:①10种蝗虫的遗传多样性水平均不高(A=1.5～2.0,P=38.5%～61.5%,Ho=0.005～0.070),且表现出一定程度的杂合体缺乏现象。②生存于热带岛屿海南的蝗虫种类,可能因其与岛外蝗虫种群存在很少或几乎不存在基因交流,也可能因其地处热带,丰富的食料、无滞育、无越冬、田间频繁杀虫剂的选择压力等导致其发生了不同程度的遗传分化,致使其进化关系与以往研究结果不相符。③Est、Mdh-1、Me、Pgi和Pgm在10种蝗虫中均具多态性,等位基因数目变化较大,说明其进化速率快,可通过检测其基因型或等位基因频率的变化来监测种群的动态变化,研究其发生规律和成灾机理,亦可监测其抗药性状况,进而为蝗灾防治提供参考,以降低用药量,提高防治效率。     

甘肃陇南地区小麦条锈菌群体遗传多样性分析

为了解甘肃陇南地区小麦条锈菌群体的遗传多样性,采用TP-M13-SSR荧光标记技术,对该地区8个种群202个小麦条锈菌分离株基因组DNA进行SSR标记分析。结果表明,甘肃陇南地区小麦条锈菌群体遗传多样性比较丰富。在物种水平上,观察等位基因数(Na)为1.88,有效等位基因数(Ne)为1.50,Nei’s基因多样性指数(H)为0.30,Shannon信息指数(I)为0.46,多态位点百分率(P)为87.5%;种群之间遗传多样性有显著差异。中梁种群、秦安种群的遗传多样性相对较高,武都种群、文县种群、齐寿种群和平南种群次之,礼县种群、西和种群遗传多样性相对较低。AMOVA分析结果表明,小麦条锈菌群体间和群体内都存在着一定的遗传分化,群体间的遗传变异占总变异的4.05%,群体内遗传变异占95.05%。     

云南大理茶资源遗传多样性的AFLP分析

采用AFLP标记对仅在云南南部及周边地区狭域分布的茶树近缘植物大理茶11个居群204个个体的遗传多样性进行了研究。分析结果表明:(1)大理茶遗传多样性水平低。在物种水平上,He=0.099,Ho=0.178;在居群水平上,He=0.083,Ho=0.137;(2)居群间的遗传分化较低。基于Nei’s遗传多样性分析得出的居群间遗传分化系数Gst=0.1606;Shannon’s居群分化系数为16.04%。AMOVA分析显示:大理茶的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的80.97%,居群间的遗传变异占19.03%;(3)两两居群间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.971～0.997。经Mantel检测,居群间的遗传距离和地理距离之间不存在显著的正相关关系(r=0.1127,P<0.001)。推测人类活动的干扰和生境的片断化是导致大理茶濒危现状的主要因素。基于观察到的居群遗传信息,建议采取就地保护和迁地保护的保护策略。     

乌龙茶种质资源种群遗传多样性AFLP评价

以银染法AFLP分子标记技术用5对引物组合对来自福建武夷山市、安溪县、台湾省和广东潮安县45份乌龙茶品种资源进行遗传多样性分析。结果表明,5对引物扩增出208条多态性条带,多态性为92.03%;最大遗传距离为0.481,最小遗传距离为0.124,种质资源间遗传多样性估值较高,达0.311。按照地理分布分组分析表明,种群内遗传多样性以武夷山最高,其次为安溪乌龙茶种质资源,以台湾的乌龙茶种质资源遗传多样性最小;种群间遗传相似性,以武夷山与安溪种群间最高,达0.9505,以台湾和潮安县类型间的相似性最低,相似性系数为0.77。构建的种间和种群间进化树表明,可将45份乌龙茶品种划分为二大类型,福建类型和广东潮安类型。结合种群间相似系数,提出乌龙茶种质资源与其加工工艺的演化路径是一致的,也是由武夷山向安溪再向台湾传播。     

吉林省龙井原位保护区野生大豆遗传多样性分析

利用GPS对吉林省龙井原位保护区野生大豆定点采种,种群L(取样距离设计为50 m)覆盖整个龙井原位保护区。按天然地理分布人为分成A、B、C 3个小种群;同时,在小种群B中取小种群B’(包括32份材料,取样距离设计为18m)。聚类结果表明,90份材料主要划分为两大类群,其它材料亲缘关系较远。龙井原位保护区的野生大豆呈斑块分布,而且小种群间的遗传多样性与地理位置有一定的相关性。25个SSR位点的Simpson指数分布范围是0.3072～0.8393,平均值为0.6788;Shannon-weaver指数分布范围是0.5856～1.9348,平均值为1.3663,表明龙井原位保护区的野生大豆具有较高的遗传多样性。3个小种群的Simpson和Shannon-weaver指数趋势一致,均为A相似文献   

基于COI基因的橡胶树六点始叶螨遗传多样性分析

六点始叶螨是橡胶树上的重要害螨之一,具有分布范围广、危害重等特点。为了研究其遗传多样性和遗传分化,本研究利用线粒体COI（mitochondrial cytochrome oxidase subunit I）基因序列对采自海南、云南、越南河内等地区橡胶树上的11个不同地理种群的165头样本进行了种群的遗传多样性分析。获得的六点始叶螨线粒体COI基因片段长度均为658 bp,分析发现可变位点30个,其中简约信息点15个,单变异位点15个,单倍型15种;种群间F_ST值为0.34698,Nm值为0.47,G_ST值为0.19660,表明11个种群的六点始叶螨存在一定的遗传分化。     

云南古茶树（园）遗传多样性的ISSR分析

云南省保存有20多万亩古茶园,这些古茶树（阿萨姆变种Camellia sinensis var. assamica）种质资源可能含有各种优良基因,对未来茶树良种选育有重要意义。本研究采用ISSR分子标记技术对云南省十个有代表性的古茶园遗传多样性进行分析,十个居群的多态位点百分率（P）为56.5%~90.9%;Nei’氏遗传距离（He）居群平均是0.281,阿萨姆变种水平内是0.461;Shannon多样性指数(Ho)居群平均是0.418,阿萨姆变种水平内是0.653。而居群间遗传分化系数Gst=0.391,和Shannon多样性指数分析（36.0%）和AMOVA分析结果（39.7%）相一致,说明阿萨姆变种60.9%的遗传变异来自居群內的个体间,39.1%的遗传变异来自居群间。研究结果揭示阿萨姆变种居群遗传多样性高,居群间遗传变异存在中度的遗传分化,这可能是由于茶树种内高度异交的特性和生境片段化所致。基于观察到的居群遗传信息,建议采取就地保护和迁地保护的保护策略。     

Conservation and Utilization of Genetic Resources of Wild Rice in China

The abundant genetic resources of wild rice in China represent a key gene pool for modern rice breeding, contributing to food production and agricultural development in China and worldwide. Between the 1970s and the 2010s, two national wild rice surveys were carried out in China. More than 20 000 accessions of three species Oryza rufipogon, O. officinalis and O. meyeriana have been conserved ex situ. An in situ conservation system has also been set up to protect notable and endangered populations. This review summarized the geographical distribution of wild rice in China, the current status of conservation, the discovery of elite genes, and the application of research into the origin and domestication of rice.     

Genetic diversity, population structure and relationships of Tunisian Thymus algeriensis Boiss. et Reut. and Thymus capitatus Hoffm. et Link. assessed by isozymes

The genetic diversity and population structure of two Tunisian Thymus species (Thymus algeriensis and Thymus capitatus), from 46 natural populations growing in six bioclimates, were analysed by starch gel electrophoresis using eight isozymes. The genetic diversity within populations varied at species level. Variation in T. algeriensis was higher than that observed for T. capitatus, and exclusive alleles were detected for the two studied species. A high differentiation among populations, for each species, estimated by Wright's F-statistics was revealed. In each species, a high level of inbreeding within populations induced by Wahlund effect was observed. A relatively high level of differentiation associated with a restricted gene flow among species was revealed. The PCA and UPGMA analysis, performed on all populations, showed two distinct groups with respect of specific differentiation level. The high genetic divergence between the two species corroborates their taxonomic status, as previously reported using morphological traits. The strategy for the management and conservation of populations should be made for each taxa according to its level of diversity and bioclimate.     

极小种群植物洛氏蝴蝶兰所处群落结构特征

洛氏蝴蝶兰（Phalaenopsis lobbii）野生资源珍贵,种群数量十分稀少,被列入我国优先拯救保护的极小种群野生植物。本研究对广西龙虎山自然保护区洛氏蝴蝶兰所在的群落1及广西大新县宝圩乡的海南风吹楠-凹脉金花茶的保护小区内所在的群落2进行了生境调查与样地调查,分析生境特征、物种组成、群落区系特点及群落结构。结果显示,调查群落1样地内共有维管束植物32科45属50种,群落生物多样性较为丰富,其中百合科为该群落的优势科;群落2样地内共有维管束植物26科35属38种,无优势科现象;所在群落属的地理成分中泛热带和热带亚洲成分占绝对优势,具有热带向亚热带过渡的性质;群落中均以高位芽植物为主,又以藤本植物的比例最大,林下郁闭度增大,表明洛氏蝴蝶兰对环境湿度和光照有一定的要求;洛氏蝴蝶兰在群落1、2草本层中重要值较低,仅作为伴生种,与常绿阔叶林群落植物共生。目前蝴蝶兰属野生植物资源的群落结构的野外调查与保育研究等方面的系统性研究较少,建议加强就地保护,结合迁地保护,研究濒危机理,通过人工栽培繁殖再进行引种回归野外,缓解洛氏蝴蝶兰野外濒危现状,并为合理开发利用提供技术支撑。     

Current models broadly neglect specific needs of biodiversity conservation in protected areas under climate change

Background  

Protected areas are the most common and important instrument for the conservation of biological diversity and are called for under the United Nations' Convention on Biological Diversity. Growing human population densities, intensified land-use, invasive species and increasing habitat fragmentation threaten ecosystems worldwide and protected areas are often the only refuge for endangered species. Climate change is posing an additional threat that may also impact ecosystems currently under protection. Therefore, it is of crucial importance to include the potential impact of climate change when designing future nature conservation strategies and implementing protected area management. This approach would go beyond reactive crisis management and, by necessity, would include anticipatory risk assessments. One avenue for doing so is being provided by simulation models that take advantage of the increase in computing capacity and performance that has occurred over the last two decades.     

Genetic Diversity of Wild Rice Species in Yunnan Province of China

Yunnan Province of China is one of the important centers for origin and evolution of cultivated rice worldwide.Wild rice is the ancestor of the cultivated rice.Many elite traits of wild rice have widened the genetic basis in cultivated rice.However,many populations of wild rice species have disappeared in the past few years.Therefore,the current status of wild rice resources should be updated and the genetic diversity of wild rice species should be examined for further germplasm preservation and utilization.Our investigations showed that the number of natural wild rice populations declined sharply in Yunnan Province during the past few years due to various reasons.Fortunately,one population of Oryza rufipogon,three of O.officinalis and ten of O.granulata have been newly found in different ecological sites,which were confirmed by inter-simple sequence repeat(ISSR) marker analysis in this study.ISSR analysis and investigation of some important traits of nutritional values indicated that the genetic diversity of the currently existing wild rice resources in Yunnan is still rich.The demonstration of genetic diversity of wild rice by a combined use of geographical distribution,morphological traits,nutrition contents and ISSR markers would be helpful for the conservation and exploration of these important wild rice resources.     

利用SSR分析普通野生稻自然居群交配系统

采用SSR标记技术检测了6个自然居群的遗传多样性和交配系统参数,旨在了解其居群交配系统,为有效原位保护、异位保存提供指导。结果表明,6个居群遗传多样性水平存在差异(基因多样性指数变幅为0.3166～0.6075),居群间分化明显(Fst=0.4220)。广东高州大岭居群和广东高州朋山居群有过剩的杂合子(F0),而另外4个居群有过剩的纯合体(F0)。普通野生稻6个取样居群交配系统为混合交配类型,居群之间的异交率相差较大(多位点异交率变幅为15.1%～41.8%,单位点异交率变幅为10.1%～28.5%)。6个居群的多位点异交率都高于单位点异交率,而且位点亲本相关度比较大,说明居群内存在一定程度的近交。同时,各居群单位点相关度与多位点相关度差值较大,表明居群内存在亚结构。还讨论了进一步改善普通野生稻原位和异位保护的措施。     

千家寨不同海拔野生茶树的EST-SSR遗传多样性研究

利用5对EST-SSR引物对千家寨内7个海拔梯度的野生茶树居群进行遗传多样性和遗传结构的研究。在物种水平上,Shannon信息指数（I）和Nei基因多样性（He）分别为1.33和0.66,表现出很高的遗传多样性;千家寨不同海拔梯度上野生茶树居群的遗传多样性有差异,且随着海拔梯度的递增,居群的遗传多样性呈现出低—高—低的分布,并在海拔2β100βm处达到最大值;野生茶树居群间的基因流（N_m）为1.84,群体分化系数（F_st）为0.12,且基于AMOVA软件分析结果显示有16.32%的变异发生在居群间,表明野生茶树群体间属于中度分化,且大部分变异存在于居群内。野生茶树本身的遗传特性和不同海拔居群所处生境的异质性是其现有遗传格局的主要原因。