盱眙水牛遗传多样性及系统地位的研究

对江苏省盱眙县183头水牛外形特征及体尺指标进行了调查和测量,同时随机抽取48头母牛,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）和水平淀粉凝胶电泳（SGE）对编码血液蛋白18个基因座的基因频率进行检测,同时引用相同方法所得东南亚21个水牛群体5个座位的研究资料,进行聚类分析,结果表明：成年公牛体高、体长、胸围和管围分别为129.16,147.69,198.66和23.12 cm,成年母牛分别为128.43,143.81,193.11和21.62 cm,估计体重公母牛分别为516.39和479.83 Kg.在所检测18个基因座中,有5个存在多型,多态位点百分比为27.78%.群体内遗传变异水平较低,平均杂合度和平均有效等位基因数分别为0.0793和1.1355.聚类分析表明：盱眙水牛与台湾和泰国水牛亲缘关系较近,孟加拉国为沼泽型水牛和河流型水牛的分界线,不同水牛群体的聚类结果基本与其地理分布吻合.     

青海高原牦牛血液蛋白基因座群体遗传学分析

以中心产区简单随机抽样在青海省西宁市共抽取青海高原牦牛76头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白(酶)结构基因座的多态性,并进行中性检验及连锁不平衡分析。结果表明:在所检测的21个基因座中,有6个存在多型,多态位点百分比为28.57%,群体内遗传变异水平相对较低,21个基因座平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为1.118、0.0665、0.0729和0.0603。CA、LDH1和ADH 3个基因座杂合子缺失达到极显著水平(P<0.001),而Alp杂合子呈极显著增加状态(P<0.001)。除Alp外,其余5个多态基因座均为中性基因。除Alp-CA和LDH1-ADH 2对基因座组合处于连锁不平衡状态外,其余13对基因座组合和群体水平上均处于连锁平衡状态(P>0.05)。     

闽南牛遗传多样性及其系统地位的研究

以中心产区简单随机抽样法在福建省漳州市漳浦县霞关乡抽取闽南牛64头,采集血样,按常规方法分离血浆和血细胞,冷冻后带回实验室-20℃保存备用。用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白(酶)的结构基因座的基因频率,同时引用国内外13个群体7个相同座位的研究资料,进行聚类分析,结果表明:在所检测的21个基因座中,有10个存在多型,多态位点百分比为47．62％,群体内遗传变异水平相对较高,平均杂合度为0．1593;闽南牛与东南亚牛种亲缘关系较近,证实了闽南牛是由南方黄牛和瘤牛的混血种,但可能不含有斑腾牛或巴厘牛的血统。目前应扩大保种群的数量,以维持群体内遗传传多样性。     

青海高原牦牛遗传多样性研究

以中心产区简单随机抽样在青海省西宁市共抽取青海高原牦牛76头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白(酶)结构基因座及12个微卫星位点的多态性,并进行中性检验及连锁不平衡分析.结果表明:在所检测的21个血液蛋白基因座中,有6个存在多型,多态位点百分比为28.57%,12个微卫星位点全部为多态,共检测出63个等位基因;两层次标记所反映的群体内遗传变异水平均较低,21个血液蛋白基因座平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为1.118、0.0665、0.0729和0.0603,12个微卫星位点相应指标分别为2.9005、0.4138、0.5325和0.4903;除Alp外,其余5个血液蛋白多态基因座和12个微卫星位点均为中性基因.除Alp-CA、LDH1-ADH两对血液蛋白基因座和8对微卫星显著(P＜0.05)或极显著(P＜0.01)处于连锁不平衡状态外,其余13对血液蛋白基因座和58对微卫星均处于连锁平衡状态(P＞0.05);另外,6个血液蛋白多态基因座、12个微卫星位点或是两者的合并数据从群体水平上均处于连锁平衡状态(P＞0.05).     

渤海黑牛结构基因座多型性的研究

以中心产区典型群简单随机抽样在山东省滨州市渤海黑牛原种场随机抽取渤海黑牛45头,应用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测了16个编码血液蛋白(酶)的结构基因座,实验结果表明:在所检测的16个座位中有9个存在多型现象,多态位点百分比为56.25%,群体内遗传变异水平相对较高,平均杂合度为0.2319。证实了渤海黑牛是由北方牛和南方牛的混血种。     

东北黑熊养殖群体6个微卫星基因座遗传多态性研究

利用微卫星标记研究东北黑熊养殖群体的遗传多态性,及时掌握养殖群体的相关遗传信息,为今后黑熊的人工繁殖及育种、保种工作奠定基础。本研究选取了黑熊的6个微卫星基因座(MSUT2、MSUT4、UT3、UT35、UT36、UT38)对115头东北黑熊进行了遗传检测,利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行DNA分型以及ABI 3730遗传分析仪进行基因大小的判读,计算了6个微卫星位点的等位基因频率、多态信息含量(PIC)、杂合度等值。结果表明:东北黑熊养殖群体的6个微卫星座位共检测到51个等位基因,平均为8.5个;6个微卫星基因座的平均多态信息含量为0.641 9,其中5个微卫星基因座的PIC>0.5,6个微卫星基因座的平均观察杂合度、平均期望杂合度分别为0.529 9、0.641 7。数据证明,6个微卫星标记均具有高度多态性,可用于东北黑熊的遗传多样性分析。     

青海高原牦牛遗传多样性研究

以中心产区简单随机抽样在青海省西宁市共抽取青海高原牦牛76头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白（酶）结构基因座及12个微卫星位点的多态性,并进行中性检验及连锁不平衡分析。结果表明：在所检测的21个血液蛋白基因座中,有6个存在多型,多态位点百分比为28．57％,12个微卫星位点全部为多态,共检测出63个等位基因;两层次标记所反映的群体内遗传变异水平均较低,21个血液蛋白基因座平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为1．118、0．0665、0．0729和0．0603,12个微卫星位点相应指标分别为2．9005、0．4138、0．5325和0．4903;除Alp外,其余5个血液蛋白多态基因座和12个微卫星位点均为中性基因。除Alp-CA、LDH1-ADH两对血液蛋白基因座和8对微卫星显著（P〈0．05）或极显著（P〈0．01）处于连锁不平衡状态外,其余13对血液蛋白基因座和58对微卫星均处于连锁平衡状态（P〉0．05）;另外,6个血液蛋白多态基因座、12个微卫星位点或是两者的合并数据从群体水平上均处于连锁平衡状态（P〉0．05）。     

利用微卫星分析中国家兔的遗传多样性

利用10个微卫星DNA标记对七个家兔品种进行了遗传检测.利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算了七个家兔品种(9个家兔群体)样本在10个微卫星基因座上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量(PIC)、各群体遗传杂合度、群体间的遗传距离、并根据遗传距离对这几个群体进行了聚类分析.结果表明:所选择的10个微卫星位点在所检测群体中均表现了较好的多态性,平均多态信息含量为0.569905.平均杂合度范围在0.5885～0.6826.表明所研究的家兔品种的遗传多样性较丰富,还可以做进一步的选择利用.根据遗传距离所做的聚类分析图表明吉戎-Ⅰ系和吉戎-Ⅱ系、哈尔滨大白兔、塞北兔的亲缘关系依次较近,与它们的培育历史相吻合.     

利用微卫星DNA标记分析槟榔江水牛群体遗传特征

槟榔江水牛是近年在我国云南西部发现的第一个本土河流型水牛.为了揭示其群体遗传多样性、群体遗传组成、其与河流型和沼泽型水牛的遗传关系及沼泽型水牛对该水牛的基因渗入等重要遗传背景信息,本研究采用30个微卫星DNA标记对141份槟榔江水牛样品和对照群体24份河流型水牛(摩拉水牛)样品、41份沼泽型水牛(滇东南水牛)样品进行了检测分析.结果,在槟榔江水牛群体中共检测到253个等位基因,其中,54个为3个群体所共享的等位基因,58个为只在槟榔江水牛与摩拉水牛间共享的等位基因,73个为只在槟榔江水牛与滇东南水牛间共享的等位基因,其余68个等位基因为该群体所独有.槟榔江水牛平均等位基因数、平均表观杂合度、平均期望杂合度和多态信息含量等参数均显著高于对照组群体,分别为8.433 3、0.640 5、0.600 9和0.594 7.该水牛群体近交系数FIS值为0.061 9.槟榔江水牛与摩拉水牛间的DA遗传距离为最小(0.114 4),在NJ树上聚为一支;而滇东南水牛与槟榔江水牛和摩拉水牛间的遗传距离较大(分别为0.382 9和0.555 3),其在NJ树上单独聚为一支.群体遗传结构分析显示,槟榔江水牛遗传组分为河流型与沼泽型2种类型水牛混合的模式(当K=2时),整个群体中有相当数量的个体存在沼泽型水牛的遗传渗入(群体中沼泽型水牛遗传组分为0.067 2).结果揭示,槟榔江水牛遗传资源独特,群体遗传多样性丰富,但该群体杂合子缺乏,且存在一定沼泽型水牛的基因渗入.     

波德代羊及其杂种羊血液蛋白多态性研究

运用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对首次引入我国的肉用品种绵羊波德代及其杂种一、二、三代和当地蒙古羊的血液蛋白(酶)多态性进行了检测分析。结果表明:波德代羊及其杂种和蒙古羊在Hb、Tf、Es三个基因座上存在多态性。其中Hb和Es的基因座均由两个等位基因控制,而Tf的基因座则由三个等位基因控制。从三个基因座的Nei氏平均基因杂合度估计绵羊品种内遗传变异,发现以蒙古羊为最低,其杂合度为0.3903。品种聚类分析也符合群体遗传学原理。     

Genetic relationship and diversity analysis of Indian water buffalo (Bubalus bubalis)

The water buffalo (Bubalus bubalis) is an important dairy animal on the Indian subcontinent and in Southeast Asian countries. The diversity and differentiation among 12 populations or breeds of buffalo were studied. Data were generated and analyzed from 527 animals belonging to 10 recognized breeds and 2 additional populations of Indian buffalo by using 22 microsatellite loci. Relationships among buffalo breeds and populations were estimated based on genetic distances. The Bayesian analysis grouped 12 populations into 8 distinctive clusters. Geographically close breeds clustered together, except for the Jaffarabadi and Murrah, which were not in geographic contiguity. The Mantel test revealed nonsignificant correlations between genetic and geographic distances. This supports the hypothesis that buffaloes have been domesticated at different places for specific purposes. The phylogenetic relationship based on microsatellite loci supported the breed classification based on body size. The Toda breed, which is considered to be endangered, had genotypes similar to those of the surrounding buffalo populations.     

胡枝子属野生居群遗传多样性的等位酶分析

利用采自北京及其周边地区14个野生胡枝子属植物居群的种子培育出的幼叶材料,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,用改进的Tris-HCl复杂提取缓冲液(0.1%巯基乙醇和20%PVP 40 000)开展等位酶分析,成功地获得了7种酶的清晰谱带,共获得18个等位酶位点。对这18个位点等位基因的统计分析表明,野生胡枝子属群体多态位点的百分数为P=54.62%,等位基因平均数为A=1.743 7,平均每个位点等位基因的有效数目Ae=1.493 9,实际杂合度为Ho=0.384 5,预期杂合度为He=0.259 8,Shannon’s information Index的平均值I=0.378 2;杂合性基因多样度比率FST的平均值为0.446 7;居群每代迁移数Nm的平均值为0.309 6;以上数据说明胡枝子属植物各居群间存在较高的遗传分化程度。以Nei的遗传距离得到的聚类分析结果与形态学性状获得的结果基本一致。     

江淮水牛遗传资源调查报告

2006年到2008年我们在调查安徽省地方黄牛、水牛资源中,发现了一个新的水牛类群江淮水牛,为役肉兼用型,体型中等偏大,性情温顺,可以放牧也可以舍饲,适应性和抗病力强,肉用性能较低,但肉质较好.成年公、母牛平均体高、体重分别为140.6 cm、137.2cm和550 kg、483 kg.肉用性能较低,公、母牛屠宰率分别...     

摩拉水牛改良滇东南水牛的效果研究

[目的]探索摩拉水牛改良滇东南水牛的杂交效果。[方法]采用直肠把握输精法,用摩拉水牛冻精冷配滇东南水牛。[结果]表明,摩本杂F1代成年公牛的各项体尺体重指标与滇东南水牛的差别不大,而摩本杂F1代成年母牛的体重、体高、体斜长、十字部高、髋宽、胸围、管围等比滇东南水牛有不同程度的提高(P0.05或P0.01),而其他体尺二者间差别不大(P0.05)。至一岁前的摩本杂F1代生长速度较快,1岁公母牛的体重分别为274.08±36.40kg和278.25±55.05kg,较国内其他地方水牛品种的杂交一代高。摩本杂F1代成年公母牛的体重分别为474.54±63.00kg和459.39±68.12kg,摩本杂F1代母牛的体格得到明显的改善,体重增大。[结论]用摩拉水牛与滇东南水牛杂交,可以提高滇东南水牛摩本杂F1代的体格、早期生长速度、生长性能及泌乳性能。     

Biodiversity in Mediterranean buffalo using two microsatellite multiplexes

The present study was carried out to investigate genetic diversity in Nile-Delta and Southern-Egypt buffalo populations in comparison with the Italian buffalo utilizing two microsatellite multiplexes. A total of 104 animals classified into three groups were used, 28, 38 and 38 representing the Nile-Delta, Southern-Egypt and Italian buffalo, respectively. The 15 studied microsatellites were CSSM38, CSSM70, CYP21, CSSM42, CSSM60, MAF65, BM0922, CSSM19, INRA006, ETH02, BM1706, BMC1013, CSSM47, INRA026 and CA004. All studied microsatellites showed allelic polymorphism. Number of polymorphic alleles ranged between 4 alleles (CSSM38, CSSM70 and CYP21) and 11 alleles (CA004). Pairwise Chi-square test for Nile Delta and Southern Egypt showed significant differences in allelic distribution at five loci, CSSM70, CSSM38, BM0922, ETH02 and BM1706. Italian buffalo showed the lowest percentage of observed heterozygotes (65%), while the Southern Egypt showed the highest (71%). Both the Italian and the Delta populations deviated significantly (P < 0.05) from HW equilibrium. Italian buffalo is relatively the most inbred population while the Southern-Egypt buffalo is the only outbred population. High level of genetic differentiation (F_ST estimates) between the Italian group and each of the Delta and Southern-Egypt group (0.083 and 0.076, respectively) was observed while Southern-Egypt group showed a lower level of genetic differentiation with the Delta group (0.014). Italian buffalo had the greatest genetic distance values with the two Egyptian groups (0.25 and 0.23) while much lower values between the Southern-Egypt and the Delta groups (0.06) was observed. Genetic variation between the Italian buffalo and the Egyptian buffalo was detected in 14 (out of 15) microsatellite loci. While a lower level (than that between Egyptian and Italian) of genetic variation between Southern-Egypt and Delta buffalo populations was expressed by 5 loci. It was concluded that the Southern-Egypt buffalo could be considered as distinct population from the Delta buffalo. In addition, Southern-Egypt group, being the only group with non-significant global deviation from HW equilibrium, the most heterozygous, and the only outbred population as well, is expected to respond more favorably to selection.     

云南保种山羊血液同工酶遗传多样性研究

采用水平式淀粉胶电泳技术 ,对云南龙陵黄山羊、宁蒗黑头山羊、马关无角山羊和路南圭山羊等 4个保种山羊的 1 2 0个个体共 3 9个基因座位的基因多态性进行了研究。结果显示 ,云南 4个保种山羊品种在AKP、CES - 1、ESD、GOI、LAP、MDH、ME和NP基因座位出现多态。多态座位基因在不同保种山羊中分布不同。多态基因座位百分比 (P)在 4个保种山羊中分别为 0 .2 0 51 ,0 .1 53 8,0 .1 2 82和 0 .1 53 8。平均杂合度 (H)分别为 0 .0 95,0 .0 61 4 ,0 .0 4 67和 0 .0 662。用UPGMA法对由基因频率计算得到的Nei氏标准遗传距离进行聚类分析 ,结果表明云南保种山羊具地理分布及品种特点 ,龙陵黄山羊和其它 3个品种的遗传距离最远。     

微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性

为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.006~3.176,平均多态信息含量变化为0.559~0.612,平均期望遗传杂合度为0.610~0.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。     

福安水牛生理生化指标的测定

选择福安水牛品种资源保护区临床健康的福安水牛公、母牛各10头进行福安水牛生理生化指标的测定。结果表明：福安水牛的呼吸频率、心率、体温都比滨湖水牛的都低;福安水牛的白细胞计数、血红蛋白比滨湖水牛略高,但在《奶牛疾病学》和《家畜生理学》的正常值范围内;福安水牛母水牛的红细胞数平均值比滨湖、摩拉、尼里、三元杂种、广西本地五种母水牛都低;福安水牛白细胞总数比湖南滨湖母水牛、摩拉水牛高,比尼里母水牛、广西灵山当地母水牛低;而福安母水牛的白细胞总数仅比广西灵山当地水牛低。福安水牛的生理生化指标在性别上没有显著性差异。     

福安水牛的分子遗传多样性研究

福安水牛是福建省地方优良品种之一,为了进一步阐明其群体遗传结构和遗传多样性,采用8对微卫星引物对福建福安、闽清、古田及南靖等4个福安水牛群体,共计130头样本进行检测分析。结果表明:福安水牛4个群体8个微卫星座位共有78个等位基因,其中4个群体共享的等位基因为50个,非共享等位基因28个。各等位基因频率介于0.015 2~0.527 8之间;共检测到基因型6~29种;4个群体的平均多态信息含量、杂合度、有效等位基因数分别为0.817 2±0.023 0、0.820 4±0.029 4和5.85±0.84;根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明:遗传距离最远的是闽清群体与南靖群体(0.351 8),遗传距离最近的是福安群体与闽清群体(0.183 2)。     

新麦草遗传多样性等位酶分析

采用不连续系统的聚丙烯酰胺垂直板凝胶电泳(VPAGE)对新疆新麦草的5个天然居群和1个栽培种遗传多样性和居群结构进行了分析.测定的6个酶系统中,确定了9个等位酶位点,多态位点百分率平均值为90.48%,平均等位基因数为2.920 7,平均预期杂合值为0.542 7.总的基因多样性中,86%存在于居群内,14%来自居群间.聚类分析以遗传距离D=0.14为分界线将6份材料明显地分为2组.研究表明,新麦草具有丰富的遗传多样性,其多样性可能与生境、人工驯化、风媒异交等因素有关.