绒山羊随机扩增多态DNA研究

利用RAPD技术对西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析比较 ,用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用其对 3个品种 ,每个品种 2 8个个体进行扩增。由RAPD指纹图计算出西藏绒山羊同内蒙绒山羊的遗传距离为 0 0 876 ,西藏绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 16 0 1,内蒙绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 0 80 3,西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异分别为 0 32 6 6 ,0 2 6 2 2 ,0 2 4 75。     

应用RAPD技术分析绒山羊DNA的多态性

中国是世界上最大的山羊绒生产国，具有绒质好、价格高的特点。原绒产量和贸易占全世界的50%。20世纪80年代以来，国内外有关绒山羊的研究进展很大，分析和了解绒山羊群体间的遗传亲缘关系是获得杂种优势的重要途径之一，本实验研究应用RAPD技术，对辽宁绒山羊、辽宁多绒山羊、内蒙古阿尔巴斯白绒羊和杂种多绒山羊（辽宁多绒山羊与库布齐阿尔巴斯绒山羊杂交选育的高代杂交群体）进行基因多态性比较分析，为今后探测控制绒山羊性状的主效基因提供理论基础和科学依据。     

辽宁绒山羊随机扩增多态DNA的研究

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析.用37个随机引物和55个两两组合的随机引物组合进行筛选,筛选出了5个多态性较为丰富的随机引物(组合).用这5个随机引物(组合)对35个个体进行扩增,据它们的RAPD指纹图计算了遗传变异度(0.2475).     

内蒙古绒山羊产绒量和体重性状RAPD标记的初步研究

利用12条随即引物对27只内蒙古绒山羊基因组DNA进行预扩增,筛选出具有多态性扩增产物的4条引物进行RAPD分析,共得到51个标记,其中可变标记43个,标记条带多态性频率为0.84,扩增片断长度在176~2940bp之间。RAPD标记条带与经济性状关系分析表明:CY0816引物扩增产物的ABCFHO组合、F09引物的INR组合为内蒙古绒山羊产绒量的优势组合型;CY0816引物扩增产物的GIJOPQR条带组合为体重性状标记的优势组合型。     

内蒙古3个绒山羊RAPD的初步研究

利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，研究了内蒙古地区3个绒山羊品种的DNA多态性，由此推导它们之间的遗传距离和系统发育关系。在所使用的12种随机引物中，有8种随机引物扩增出多态谱带，共检测到32个RAPD标记，其中有21个发生变异。用Nei的片段公享度公式计算了品种间的遗传距离，用UPGMA聚类法构建了系统发育树。结果表明：内蒙古白绒山羊的3个类群彼此亲缘关系较近，分化不明显；内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊聚为一个大类，辽宁绒山羊和乌珠穆泌白绒山羊聚为一个大类，说明内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊有较近的亲缘关系，乌珠穆沁白绒山羊与辽宁绒山羊的亲缘关系较近。     

辽宁绒山羊随机扩增多态DNA的研究

利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析，用37个随机引物和55个两两组合的随机引物组合进行筛选，筛选出了5个多态性较为丰富的随机引物（组合）。用这5个随机引物（组合）对35个个体进行扩增，据它们的RAPD指纹图计算了遗传变异度（0．2475）。     

24份葡萄种质亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR标记对24份葡萄材料进行了基因组多态性分析,从50条引物中筛选出6条扩增稳定且多态性丰富的引物用于葡萄的ISSR扩增。共扩增出59条条带,其中多态性条带53条,多态性百分率为90%。根据ISSR扩增结果,利用NTSYSpc2.10e软件进行Jaccard相似性系数分析,24份葡萄材料的遗传相似系数为0.42～0.88,平均遗传相似系数为0.6495。在遗传相似系数为0.55处,24份葡萄材料明显分为2大类群。第1类包含10个欧美杂种、7个欧亚种、1个华欧杂种,第2类包含3个美洲杂交种、1个河岸葡萄、1个冬葡萄、1个东亚葡萄。由此可见,美洲杂交种与欧美杂种、欧亚种葡萄的亲缘关系较远,欧美杂种与欧亚种葡萄之间亲缘关系较近。此外,引物BC820与引物BC847分别在我国自主选育砧木品种华佳8号与抗砧3号中扩增出一条特异条带,可为利用ISSR标记鉴定葡萄品种或品系提供参考依据。     

SSR分子标记在花生杂种鉴定中的应用

以24份花生材料为亲本,配制22个杂交组合,并利用40对SSR引物对24份亲本材料进行多态性筛选,运用多态性引物鉴定92个F1代杂种的真伪.结果表明,不同组合亲本间多态性差异较大,差异最大的两亲本(GT-C20-D和Tamrun OL07)的多态性引物比例为65%.SSR标记法鉴定出49个单株为真杂种;而田间表型鉴定出62个单株为真杂种,与标记鉴定结果差异较大.本研究证实利用分子标记鉴定真假杂种非常必要,且准确可行.同时,本试验证明40对SSR引物具有较高的多态性,可直接用于花生遗传多样性、杂种鉴定以及遗传图谱构建等的研究.     

RIP140基因多态性及其与济宁青山羊产羔数关系的研究

根据牛RIP140基因mRNA序列,设计5对引物(P1～P5),利用每对引物分别扩增随机选取的济宁青山羊和辽宁绒山羊各5个个体,PCR产物克隆测序,获得山羊RIP140基因全部CDS序列。通过序列比对在此序列822位发现C→T的沉默突变。根据获得的山羊RIP140基因的CDS序列设计引物P6,采用PCR-RFLP技术检测C822T多态位点在高繁殖力品种(济宁青山羊、贵州白山羊)和低繁殖力品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、内蒙古绒山羊)中的单核苷酸多态性,并研究该基因对山羊产羔数的影响。结果发现,引物P6扩增片段在济宁青山羊、贵州白山羊、辽宁绒山羊和波尔山羊中均检测到CC、CT和TT 3种基因型,内蒙古绒山羊中只检测到CT和TT两种基因型。济宁青山羊CC、CT和TT基因型频率分别为0.056、0.309和0.635,CC型和CT型母羊平均产羔数分别比TT型多0.81只(P0.05)和0.65只(P0.05),CC型比CT型多0.16只(P0.05)。研究结果初步表明,RIP140基因的C等位基因是提高山羊产羔数的一个潜在有效的DNA标记。     

辽宁绒山羊抑制素A基因遗传变异与双羔性状的关联分析

以抑制素A基因(Inhibin alpha subunit gene,INHA)作为辽宁绒山羊双羔性状的候选基因,以便为绒山羊育种工作中分子标记选择提供理论依据。运用测序法寻找辽宁绒山羊INHA基因单核苷酸多态性,筛查到一个新的多态位点-446TC,该位点位于INHA基因的启动子区域。运用PCR-RFLP法验证并分析该位点在辽宁绒山羊双羔群体和单羔群体间的多态性。结果表明,在辽宁绒山羊中双羔和单羔群体中分布A、B两个等位基因,处于中度多态。经χ2检验,样本在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05),不同基因型在辽宁绒山羊单、双胎群体上差异达到显著水平(P0.05)。     

AFLP and RAPD Analysis of the Boer and Indigenous Breeds of the Goat in Jiangsu

Blood and tissue samples were collected from 105 goats including 60 Boer goats (30 for eachsex), 30 Xuhuai goats (15 for each sex) and 15 Haimen goats (7 stud and 8 does). DNA was extracted andDNA pools were constructed on the basis of goat breeds. In 36 selective primer combinations, 29 combinationsamplified totally 3 253 markers including 92 polymorphic markers by amplified fragment length polymor-phism (AFLP). On average, 3.17 polymorphic markers were amplified per combination, with a polymorphicfrequency of 2.8%. The primer combinations amplifying more polymorphic markers (showed in brackets)were involved in E00+ACG/M00+CAA (13), E00+ACG/M00+CAG (10), E00+AAC/M00+CAC (8)and E00+AAC/M00+ACT (7). A total of 183 markers including 60 polymorphic markers were amplified byRAPD from the pooled DNA of three breeds using 22 primers with strong polymorphism and high reproduc-ibility selected from 93 RAPD primers. On average, 2.73 polymorphic markers were amplified per primer,with a polymorphic frequency of 32.8%. The results of AFLP and RAPD coincidently suggested that the ge-netic distance is the closest between Xuhuai and Haimen goat, next between Xuhuai and Boer goat, and the far-thest between Haimen and Boer goat. According to the UPGMA method, Haimen and Xuhuai goats can begathered together as a cluster, then Boer goat. Both methods can be used to implicate the genetic difference ofthese three breeds, in particular AFLP has more polymorphic markers.     

雷州山羊和隆林山羊遗传多样性的微卫星分析

为了调查中国热带、亚热带主要山羊品种的遗传资源现状,应用14对微卫星引物,检测了隆林山羊和雷州山羊不同分布地区的群体遗传多样性水平。隆林山羊(柳州)、隆林山羊(百棚)、雷州山羊(徐闻)、雷州山羊(海南)各群体平均多态信息含量(PIC)分别为0.645、0.600、0.483、0.518;平均杂合度(H)分别为0.281、0.421、0.121、0.157;平均等位基因数(k)分别为5.17、4.93、4.64、4.5,3组数据综合说明两个山羊品种遗传多样性相对匮乏,群体遗传变异较低;NJ法聚类显示,隆林山羊两个群体聚为一类,再与雷州山羊(徐闻)聚在一起,最后为雷州山羊(海南),这与两个品种的来源及地理分布基本一致。研究结果为中国热带、亚热带山羊品种资源开发利用提供了基础资料和科学数据。     

利用微卫星标记分析5个山羊品种的遗传多样性和进化关系

文登奶山羊、辽宁绒山羊和安徽白山羊分别为奶山羊、绒山羊和板皮用山羊的典型代表,利用微卫星标记对其进行遗传多样性检测。同时以波尔山羊作为对照,分析北京本地山羊与上述3个山羊品种的进化关系。结果显示,上述4个中国山羊品种的有效等位基因数(NEA)、Nei's无偏基因多样性(H)和等位基因丰富度(AR)分别为5.16~6.72、0.80~0.85和7.30~7.89,表明中国4个山羊品种具有丰富的遗传多样性。然而,杂合子缺失的结果提示波尔山羊和北京本地山羊品种内可能存在一定程度的近亲交配或人工选择。上述5种山羊品种间存在一定程度的遗传分化(FST=0.063),与之前报道的其他国家或地区的山羊结果类似。进化树和主成分分析显示,北京山羊与辽宁绒山羊遗传关系最近,与安徽白山羊的遗传关系较远,与文登奶山羊的遗传关系最远,这4个品种为进化的一个分支,而波尔山羊为另一个分支。该进化关系与产区气候条件和育种目标一致。     

山西4个地方山羊品种的遗传多样性分析

利用5个微卫星标记分析了山西省4个地方山羊品种的遗传多样性.结果表明:4个地方山羊品种共检测到等位基因数(Na)为67个,平均有效等位基因数(Ne)为4.94～6.05个,平均多态信息含量(PIC)在0.7053～0.7982之间,平均遗传杂合度(H)在0.7592～0.8316之间,4个地方山羊品种间的遗传分化系数为0.0461;聚类分析表明,黎城青山羊与阳城白山羊先聚类,再与吕梁黑山羊聚类,最后与洪洞奶山羊聚类;山西省4个地方山羊品种遗传变异大,遗传多样性丰富,品种间遗传分化小,4个地方山羊品种分子系统发生关系与其地理位置和生产特性相一致.     

中国绒山羊群体形态及生态特征的多元统计分析

应用主成分分析法,对我国6个绒山羊群体的22项数量指标进行了多元统计分析;并用构造的主成分值进行了系统聚类,结果在一定程度上揭示了这些绒山羊群体间的遗传分化。对22项数量指标的R型系统聚类结果显示,海拔和年降水量是影响绒山羊分布的重要指标。因此,在绒山羊品种分类中生态因子亦是一个相对重要的方面。     

运用荧光标记微卫星分析6个肉山羊品种遗传多样性

为了研究安徽白山羊、贵州白山羊、陕南白山羊、宜昌白山羊、马头山羊和波尔山羊6个肉山羊品种DNA分子水平上的遗传多样性,利用10个微卫星引物,分析6个肉山羊品种分子水平上的遗传变异和群体关系。10个微卫星位点均呈现高度多态,其多态信息含量(PIC)在0.531～0.812之间。F统计结果显示群体间存在极显著的遗传分化,遗传分化系数(Fst)为0.082。系统进化树NJ图把中国5个肉山羊和波尔山羊分为2支;中国肉山羊又被分成2个分支。系统进化树UPGMA图和主成分的二维坐标图进一步证实上述聚类结果的可靠性。此研究结果显示6个肉山羊品种遗传多样性丰富,具有很大的选育潜力,特别是中国地方品种,是将来开发利用的宝贵原始材料。