微卫星标记及其在遗传育种中的应用

微卫星是近年来常用的一种检测基因组DNA多态性的新型DNA标记，因其数量分布广，多态性丰富及检测快速方便等优点而备受青睐，本文就微卫星结构，践态性产生原理和微卫星的应用作一简明介绍。     

生态灌木蒙古莸的生物生态学特性及其经济价值评价

本文对饲料型优良生态灌木—蒙古莸的分布与生物学和林学特性,以及其快繁技术、饲用与药用价值等进行了研究和评价。从生态建设与经济发展角度,提出了蒙古莸资源的保护、开发与利用的途径。     

检测cDNA芯片中差异表达基因的非转换方法

cDNA芯片已经成为生物学试验中一种重要试验手段,与其相应的检测差异表达基因的统计方法也在快速地完善。目前通用的方法是将数据进行对数比转换,并相应进行标准化处理。鉴于对数转换的缺点,本研究提出一种非转换方法,即背景校正后直接进行数据标准化。研究表明:利用这种非转换方法,可以更有效地剔除试验中的“噪音,”提高检测的准确率。本研究利用Apo AI试验的芯片数据进行了效率验证,结果表明:与对数转换方法相比,非转换方法能检测出更多的差异表达基因,可以作为cDNA芯片数据分析的一种简便高效方法。     

cDNA微阵列的标准化方法研究

针对目前通用的cDNA微阵列数据的标准化处理方法(常称为对数比转换法)中存在的缺陷，提出了一种新的cDNA微阵列数据标准化方法－非转换法。该方法利用Huber等(2003)提出的芯片数据分析模型，在对芯片背景进行校正后，根据最小二乘估计原理，通过迭代的方式直接对样品中的基因转录水平进行估计，从而达到数据标准化的目的。利用计算机模拟，比较了在各种条件下(不同的芯片内探针重复数、不同的背景变异程度、不同的差异表达基因上下调比例等)该方法与对数比转换法的优劣。结果表明，在所有条件下，非转换法都优于对数比转化法，由非转换法得到的估计值的相对偏差都在5％以下，而由对数比转化法得到的估计值的相对偏差都在20％以上，而且对数比转化法对背景变异和差异表达基因上下调比例更敏感，随着背景变异程度的增大和差异表达基因上下调比例不对称性的提高，其估计值的偏差急剧上升，而非转换法则基本不受影响。因而非转换法可以作为cDNA微阵列数据标准化的一种替代方法。     

利用广义线性方法定位家畜抗性等级性状的QTL

在广义线性模型的框架内模拟研究了家畜抗性等级性状的QTL定位方法，QTL参数的估计采用最大似然方法，比较了阈模型方法与一般线性方法的QTL定位效率，并对影响等级性状QTL定位效率的主要因素（QTL效应、性状的遗传力）进行了模拟研究。试验为多个家系的女儿设计，资源群体大小为500头。结果表明：在QTL位置参数估计及检验功效方面，阈模型方法具有一定的优势，对抗性等级性状QTL定位的功效也高于线性方法。另外，性状遗传力和QTL效应的大小对QTL定位的准确度也有直接的影响，随着性状遗传力QTL效应的增大，2种方法QTL定位的效率均有不同程度的提高。     

分子标记AFLP及其在遗传分析中应用

AFLP是一种新的DNA标记,它是利用PCR技术对基因组DNA双酶切片段的选择性扩增.这种技术可经济、快捷、有效地产生大量分子标记,且多态标记丰富、均匀地遍布整个基因组、共显性遗传、重复性和可比性强.标记研究无需预先了解基因组的序列信息.     

利用微卫星标记分析5个山羊品种的遗传多样性和进化关系

文登奶山羊、辽宁绒山羊和安徽白山羊分别为奶山羊、绒山羊和板皮用山羊的典型代表,利用微卫星标记对其进行遗传多样性检测。同时以波尔山羊作为对照,分析北京本地山羊与上述3个山羊品种的进化关系。结果显示,上述4个中国山羊品种的有效等位基因数(NEA)、Nei's无偏基因多样性(H)和等位基因丰富度(AR)分别为5.16~6.72、0.80~0.85和7.30~7.89,表明中国4个山羊品种具有丰富的遗传多样性。然而,杂合子缺失的结果提示波尔山羊和北京本地山羊品种内可能存在一定程度的近亲交配或人工选择。上述5种山羊品种间存在一定程度的遗传分化(FST=0.063),与之前报道的其他国家或地区的山羊结果类似。进化树和主成分分析显示,北京山羊与辽宁绒山羊遗传关系最近,与安徽白山羊的遗传关系较远,与文登奶山羊的遗传关系最远,这4个品种为进化的一个分支,而波尔山羊为另一个分支。该进化关系与产区气候条件和育种目标一致。     

家畜遗传抗性多基因效应预测的广义线性方法

在广义线性混合模型（GLMM）的框架内模拟研究了抗性性状的遗传分析方法，初步比较了GLMM方法与一般线性方法（LM）的育种值估计效果。模拟研究的抗性表型为单阈值和3阈值2种类型，选用的连接函数分别为logist连接和log连接，试验设计为全同胞一半同胞混合家系，参数估计采用Fisher迹法。研究结果表明，GLMM方法能较准确地估计公畜的个体育种值，在个体的遗传评定效果方面要明显优于LM方法，其预测的个体育种值排序结果与真实育种值的排序之间存在显著的秩相关。     

生物多样性与马身猪的保种

本文针对生物资源遭到严重破坏、物种大量灭绝和生态平衡严重失调的状况 ,就生物资源的重要性和生物资源的保护利用 ,以山西地方品种马身猪为例 ,探讨生物保种的一般方法、措施及生物保种的最佳解决方法 ,即分子遗传学分析法。