辽宁绒山羊随机扩增多态DNA的研究

利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析，用37个随机引物和55个两两组合的随机引物组合进行筛选，筛选出了5个多态性较为丰富的随机引物（组合）。用这5个随机引物（组合）对35个个体进行扩增，据它们的RAPD指纹图计算了遗传变异度（0．2475）。     

绒山羊随机扩增多态DNA研究

利用RAPD技术对西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析比较 ,用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用其对 3个品种 ,每个品种 2 8个个体进行扩增。由RAPD指纹图计算出西藏绒山羊同内蒙绒山羊的遗传距离为 0 0 876 ,西藏绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 16 0 1,内蒙绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 0 80 3,西藏绒山羊、内蒙绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异分别为 0 32 6 6 ,0 2 6 2 2 ,0 2 4 75。     

内蒙古3个绒山羊RAPD的初步研究

利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，研究了内蒙古地区3个绒山羊品种的DNA多态性，由此推导它们之间的遗传距离和系统发育关系。在所使用的12种随机引物中，有8种随机引物扩增出多态谱带，共检测到32个RAPD标记，其中有21个发生变异。用Nei的片段公享度公式计算了品种间的遗传距离，用UPGMA聚类法构建了系统发育树。结果表明：内蒙古白绒山羊的3个类群彼此亲缘关系较近，分化不明显；内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊聚为一个大类，辽宁绒山羊和乌珠穆泌白绒山羊聚为一个大类，说明内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊有较近的亲缘关系，乌珠穆沁白绒山羊与辽宁绒山羊的亲缘关系较近。     

3种分子标记分析罗非鱼选育群体 的多态性效率比较

应用RAPD、AFLP、SSR等3种分子标记,对吉富品系尼罗罗非鱼选育群体的多态性进行了分析.在40条RAPD引物、19对SSR引物、64对AFLP引物中,具有多态性、重复性好的引物分别为17条、19对和8对,扩增出多态性条带数分别为35、92、181条.结果表明,RAPD、AFLP、SSR多态性条带比例分别为20.35％、79.64％和58.77％,平均每个(对)多态性引物可以扩增出多态性片段数目分别为2.06、4.84和22.63.说明SSR和AFLP是研究吉富罗非鱼选育群体更为有效的分子标记.     

波尔山羊对徐淮山羊改良效果研究

通过对饲养一年的同批次的波杂一代山羊(F1)和本地山羊(徐淮山羊)共36只的生长发育性能进行测定比较,研究了波尔山羊对徐淮山羊的改良效果。波尔-徐淮山羊的杂交一代山羊除管围与本地山羊的差异不大外,体重从初生起就与本地羊保持着显著差异,同时在体长、体高以及胸围等方面也得到了显著的改善。结论表明,用波尔种羊对盐城地区的本地徐淮山羊进行杂交改良,可明显提升山羊的生产性能。     

Boer山羊与山西地方山羊品种聚类分析

应用RAPD技术对Boer山羊与山西地方山羊品种的遗传多态性进行了研究,利用基因频率进行了聚类分析,结果表明:1)四个品种的RAPD标记具有丰富的多态性,多态性带占总带数的63.81%,单个引物获得RAPD带数在3～10之间,各片段分子量大小在200～3252bp之间,所得多态性位点频率的变化范围在50%～81.8%。2)聚类分析表明:黎城大青羊与阳城白山羊首先聚为一类,具有较近的亲缘关系,吕梁黑山羊具有独特的遗传特性。山西主要地方山羊聚为一类,与国外品种波尔山羊亲缘关系较远。3)根据对4个品种遗传差异的分析,认为波尔山羊与吕梁黑山羊进行杂交组合,可望获得较高的杂种优势。     

应用RAPD技术分析绒山羊DNA的多态性

本实验应用RAPD技术,对辽宁多绒山羊、辽宁绒山羊、内蒙古阿尔巴斯白绒山羊和杂种多绒山羊的22个DNA模板进行了多态性比较和遗传距离分析,根据聚类分析构建了系统发生树状图.36条引物中筛选出11条引物具有多态性扩增片段.得到多态性位点59个,占总位点数的90.77%,分析显示杂种多绒山羊和辽宁绒山羊的亲缘关系较近.     

波尔山羊随机扩增多态DNA标记与公羊繁殖力的关系

用 10个随机引物对 11个波尔山羊精液样本DNA进行随机扩增 ,得到 113个标记 ,其中多态标记 31个。分析DNA多态标记与公羊总采精量、平均每次射精量、冻前活力、冻后活力、稀释倍数等的关系 ,发现OPK0 9 4标记阳性组山羊总采精量和平均每次射精量显著高于阴性组山羊 (P <0 0 5 ) ,而OPH14 3标记阳性组山羊平均每次射精量和OPH14 5标记阳性组山羊冻后活力均显著低于阴性组山羊 (P <0 0 5 )。     

RIP140基因多态性及其与济宁青山羊产羔数关系的研究

根据牛RIP140基因mRNA序列,设计5对引物(P1～P5),利用每对引物分别扩增随机选取的济宁青山羊和辽宁绒山羊各5个个体,PCR产物克隆测序,获得山羊RIP140基因全部CDS序列。通过序列比对在此序列822位发现C→T的沉默突变。根据获得的山羊RIP140基因的CDS序列设计引物P6,采用PCR-RFLP技术检测C822T多态位点在高繁殖力品种(济宁青山羊、贵州白山羊)和低繁殖力品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、内蒙古绒山羊)中的单核苷酸多态性,并研究该基因对山羊产羔数的影响。结果发现,引物P6扩增片段在济宁青山羊、贵州白山羊、辽宁绒山羊和波尔山羊中均检测到CC、CT和TT 3种基因型,内蒙古绒山羊中只检测到CT和TT两种基因型。济宁青山羊CC、CT和TT基因型频率分别为0.056、0.309和0.635,CC型和CT型母羊平均产羔数分别比TT型多0.81只(P0.05)和0.65只(P0.05),CC型比CT型多0.16只(P0.05)。研究结果初步表明,RIP140基因的C等位基因是提高山羊产羔数的一个潜在有效的DNA标记。     

运用荧光标记微卫星分析6个肉山羊品种遗传多样性

为了研究安徽白山羊、贵州白山羊、陕南白山羊、宜昌白山羊、马头山羊和波尔山羊6个肉山羊品种DNA分子水平上的遗传多样性,利用10个微卫星引物,分析6个肉山羊品种分子水平上的遗传变异和群体关系。10个微卫星位点均呈现高度多态,其多态信息含量(PIC)在0.531～0.812之间。F统计结果显示群体间存在极显著的遗传分化,遗传分化系数(Fst)为0.082。系统进化树NJ图把中国5个肉山羊和波尔山羊分为2支;中国肉山羊又被分成2个分支。系统进化树UPGMA图和主成分的二维坐标图进一步证实上述聚类结果的可靠性。此研究结果显示6个肉山羊品种遗传多样性丰富,具有很大的选育潜力,特别是中国地方品种,是将来开发利用的宝贵原始材料。     

孕酮受体基因多态性及其与济宁青山羊产羔数关系

 【目的】寻找与产羔数相关的遗传标记,为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。【方法】设计15对引物,采用PCR-SSCP技术检测孕酮受体（progesterone receptor,PGR）基因全部9个外显子在济宁青山羊、波尔山羊、辽宁绒山羊和安哥拉山羊中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对山羊繁殖力的影响。【结果】只有引物P1、P8与P9扩增片段具有多态性。对于P1扩增片段,济宁青山羊中检测到AA、AB和BB型,其余山羊中均检测到AA和AB型;测序表明BB与AA型相比有一处突变（31G→A）,并导致丙氨酸变为苏氨酸;BB基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型多0.52只（P＜0.05）,比AA基因型多0.98只（P＜0.001）,AB基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AA基因型多0.46只（P＜0.05）。对于P8扩增片段,济宁青山羊中只检测到CC型,波尔山羊中检测到CC和CD型,其余山羊中检测到CC、CD和DD型;测序表明DD型和CC型相比有一处突变（2810C→G）,未导致氨基酸改变。对于P9扩增片段,济宁青山羊和波尔山羊中检测到FF和FG型,其余山羊中检测到FF、FG和GG型;测序表明GG型和FF型相比有一处碱基突变（60128T→A）,未导致氨基酸改变;FF基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比FG基因型多0.32只（P＞0.05）。【结论】本试验结果初步表明,PGR基因可能是控制济宁青山羊多羔性的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的一个标记。     

Polymorphism of Exon 2 of FSHβ Gene and Its Relationship with Reproduction Performance in Two Goat Breeds

The objectives of the present study were to detect the polymorphism in follicle stimulating hormone beta （FSHβ） gene and investigate the relationship between FSHβ gene and high prolificacy in goats.According to the sequence of ovine FSHβ gene,two pairs of primers were designed to detect single nucleotide polymorphism of exon 2 of FSHβ gene in two goat breeds,Xinong Saanen dairy goat and Boer goat,by PCR-SSCP.The least square mean and genetic variance of different genotypes at polymorphic locus were analyzed,and the selection reaction was forecasted by genetic correlation between marker locus and genetic variance of litter size traits.There was one polymorphic locus occurring in exon 2 （P2） with three genotypes （EE,EF and FF）.In Xinong Saanen dairy goat,EE genotype had significantly higher （P 〈 0.05） litter size than EF and FF genotype in the first to fourth parity and average parity;EF genotype had significantly higher （P 〈 0.05） litter size than FF genotype in the second and average parity.In Boer goat,EE genotype had significantly higher （P 〈 0.01） litter size than EF and FF genotype in the second to fourth parity and average parity;EF genotype had significantly higher （P 〈 0.05） litter size than FF genotype in average parity.In Xinong Saanen dairy and Boer goat,the heredity of litter size was mainly influenced by genetic additive effect and the EE genotype is a favorable marker genotype for litter size in these two breeds.     

利用微卫星标记分析5个山羊品种的遗传多样性和进化关系

文登奶山羊、辽宁绒山羊和安徽白山羊分别为奶山羊、绒山羊和板皮用山羊的典型代表,利用微卫星标记对其进行遗传多样性检测。同时以波尔山羊作为对照,分析北京本地山羊与上述3个山羊品种的进化关系。结果显示,上述4个中国山羊品种的有效等位基因数(NEA)、Nei's无偏基因多样性(H)和等位基因丰富度(AR)分别为5.16~6.72、0.80~0.85和7.30~7.89,表明中国4个山羊品种具有丰富的遗传多样性。然而,杂合子缺失的结果提示波尔山羊和北京本地山羊品种内可能存在一定程度的近亲交配或人工选择。上述5种山羊品种间存在一定程度的遗传分化(FST=0.063),与之前报道的其他国家或地区的山羊结果类似。进化树和主成分分析显示,北京山羊与辽宁绒山羊遗传关系最近,与安徽白山羊的遗传关系较远,与文登奶山羊的遗传关系最远,这4个品种为进化的一个分支,而波尔山羊为另一个分支。该进化关系与产区气候条件和育种目标一致。     

内蒙古绒山羊产绒量和体重性状RAPD标记的初步研究

利用12条随即引物对27只内蒙古绒山羊基因组DNA进行预扩增,筛选出具有多态性扩增产物的4条引物进行RAPD分析,共得到51个标记,其中可变标记43个,标记条带多态性频率为0.84,扩增片断长度在176~2940bp之间。RAPD标记条带与经济性状关系分析表明:CY0816引物扩增产物的ABCFHO组合、F09引物的INR组合为内蒙古绒山羊产绒量的优势组合型;CY0816引物扩增产物的GIJOPQR条带组合为体重性状标记的优势组合型。     

5个山羊品种PRKAG3基因5’调控区和外显子13杂合度分析

以3个中国地方山羊品种和2个引入山羊品种为研究对象,采用PCR-RFLP方法检测山羊PRKAG3基因5’调控区和外显子13的多态性。结果在5个山羊品种PRKAG3基因的5’调控区发现C-525A和C-225T多态位点,在外显子13发现T90C和C102T多态位点,分别存在一对等位基因。5个山羊品种在C-525A、C-225T和C102T位点均为低度多态,但在T90C位点存在中度多态(0.25相似文献   

重庆本地山羊群体遗传关系的RAPD分析

采用RAPD技术分析了重庆本地的板角山羊、川东白山羊和重庆黑山羊基因组池DNA的多态性及其亲缘关系。通过100种随机引物扩增筛选。12种多态引物共获得了16个多态标记。各群体间的遗传距离指数和SPSS分层聚类树形图表明：板角山羊与川东白山羊之间的遗传距离较远;重庆黑山羊和板角山羊的遗传距离较近,2者有着密切的亲缘关系。结果还发现,板角山羊、川东白山羊和重庆黑山羊群体都具有一定的遗传稳定性。     

山羊SKIP基因的分离、鉴定及与生长性状的关联分析

为研究SKIP基因对山羊生长发育的影响,并寻找与山羊生长性状相关的分子标记,利用绵羊与牛SKIP基因的同源序列设计引物,RT-PCR扩增得到一段长1 350bp的山羊SKIP基因表达序列,包括其完整编码区序列,编码449个氨基酸的蛋白。通过序列Blast比较和系统发育树的构建,发现山羊SKIP与绵羊SKIP序列相似性最高(99.52%)。利用生物信息学分析SKIP蛋白的理化性质,预测SKIP蛋白分子质量为52ku,等电点为5.18,包含典型的疏水区域和磷脂酰肌醇5-磷酸磷酸酶结构域,定位在细胞质(60.9%)和细胞核(26.1%)中。间接免疫荧光试验验证了SKIP的细胞定位,并发现位于细胞核中的SKIP在成肌细胞分化过程中转移到细胞质。通过波尔山羊和麻城黑山羊的DNA混池测序,发现SKIP内含子2有一处G/A突变,利用PCRRFLP方法对波尔×麻城黑山羊F2代杂交后代进行基因分型,性状关联分析发现该单核苷酸多态性位点(SNP)与出生体质量、胸围、管围、身高等性状显著相关,等位基因G与生长呈正相关。     

甘蓝型油菜细胞质雄性不育恢复基因的分子标记及定位

以甘蓝型油菜恢复系CP015和不育系77A构建的F2群体为供试材料,运用RAPD,SSR和AFLP 3种标记技术,对甘蓝型油菜恢复基因进行分子标记和图谱定位。在260条RAPD引物、185对SSR引物、58对AFLP引物中,在两亲本间筛选多态性高的RAPD引物121条,SSR引物128对,AFLP引物组合26对,进一步通过BSA法筛选,获得了与甘蓝型油菜恢复基因Rf连锁的1个RAPD标记S1009-750和1个AFLP标记E5M11-150,标记与基因Rf之间的遗传距离分别为4.9cM和8.6cM。     

波尔山羊随机扩增多态DNA标记与体重和体尺的关系

应用19个波尔山羊个体间多态性较强、重复性好的随机引物对20只5－6月龄波尔山羊公羊组织样DNA进行扩增，共得到156个标记，其中可变标记47个。t检验表明，OPE15．1阳性组腰角宽显著高于阴性组，OPH15．8、OPE15．4阳性组臂端宽显著高于阴性组；而PH13．6、OPH13．8等标记阴性多个体尺、体重性状显著高于阳性组。这说明这瞟标记与特定性状可能存在相关，其遗传基础可能是该标记与控制性状的QTL或主基因连锁。     

FSHβ基因外显子2的多态性及其与两个山羊品种繁殖性能的相关性研究

 【目的】寻找与产羔数相关的遗传标记,为山羊高繁殖力标记辅助选择提供依据。【方法】根据绵羊FSHβ基因序列设计2对引物,采用 PCR-SSCP技术检测山羊FSHβ基因外显子2的多态性,利用最小二乘均数法对其与产羔数的关系进行分析,同时对多态位点的遗传方差进行分析,通过标记位点与产羔性状的遗传相关预测选择反应。【结果】在引物（P2）扩增片段中检测到1个多态位点,出现3种基因型（EE、EF和FF）。对于西农萨能奶山羊,在1～4胎和平均产羔数中,EE型个体产羔数显著高于EF和FF型个体(P＜0.05),EF型个体的第2胎和平均产羔数显著高于FF型个体(P＜0.05);对于波尔山羊,在2～3胎和平均产羔数中,EE型个体产羔数极显著高于EF和FF型个体(P＜0.01),EF型个体平均产羔数显著高于FF型个体(P＜0.05)。在西农萨能奶山羊和波尔山羊两个群体中,产羔性状的遗传主要受基因加性效应的影响。【结论】对于西农萨能奶山羊和波尔山羊,多态位点EE基因型可作为产羔性状上的标记基因型。