微卫星DNA在动物亲子鉴定中的应用及研究进展

本文概述了微卫星DNA进行亲子鉴定的基本原理与方法,将其用于亲子鉴定的优点以及研究进展,最后对未来的应用进行了展望。     

微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性

为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.006~3.176,平均多态信息含量变化为0.559~0.612,平均期望遗传杂合度为0.610~0.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。     

一个水稻三倍体×二倍体杂交F2群体的微卫星杂合性丧失

DB102为一田间发现的三倍体水稻,利用它做母本与二倍体水稻中作59杂交,得到一个早世代(F2)稳定群体,通过微卫星分析发现,该群体中有一些微卫星位点发生了杂合性丧失,且至少6条染色体上发生微卫星位点杂合性丧失(loss of heterzygoisity LOH)可能有DNA序列变化。而微卫星位点的杂合性丧失又可能与该杂交组合早世代稳定有关。     

微卫星标记与丝羽乌骨鸡产蛋性能的关系研究

从鸡的遗传图谱中选择9个与产蛋性能相关的微卫星基因座,对在产蛋性能上有明显差异的丝羽乌骨鸡个体共170只进行标记基因型与产蛋性状的最小二乘分析,结果表明：有4个标记G31913、X82867、Z95315、G01672与丝羽乌骨鸡的4个月连产蛋量、开产蛋重及500日龄产蛋量间存在显著的关系。标记G31913中基因型AB所对应的开产体重最小二乘均值与其它基因型的对应值间的差异达显著或极显著,开产蛋重间无显著差异。标记Z95315的基因型CC所对应开产蛋重、开产体重最小二乘均值最高,并且均显著高于其余8种基因型所对应的开产蛋重、开产体重最小二乘均值。标记G01672基因型为EE、AE所对应开产蛋重最小二乘均值与基因型为CE、CC的对应值间差异显著;等位基因E与开产蛋重有显著正相关,等位基因C与开产蛋重有显著负相关。标记X82867基因型CD所对应500日龄产蛋量最小二乘均值显著低于AB型,4个月连产蛋量、300日龄产蛋量也低于基因型为AB个体。研究表明,标记G31913的基因型AB和标记Z95315的基因型CC有望作为开产蛋重、开产体重早期选择的辅助标记。     

肉牛经济性状关联的微卫星标记研究进展

微卫星序列是以1～6个短核苷酸为基本重复单位的重复序列,呈共显性、重复性好、多态性丰富和操作简单,在基因定位与QTL分析、亲权分析、分子标记辅助选择等方面应用广泛.本文综述了与肉牛部分经济性状(生长发育性状、胴体性状、肉质性状、多胎性状和出生重)相关的微卫星标记研究进展.     

草原红牛肉用性状微卫星标记研究

本研究选用草原红牛、草原红牛与利木赞牛杂交后代共计42头作为试验牛群体，以体尺、体重作为衡量其生长发育指标，进行肉牛肌肉度线性评分，并屠宰测定其肉用性能，利用SPSS软件分析了3个微卫星位点基因标记与生长性状、屠宰肉用、肌肉度线性评分性状的关系。结果表明，IDVGA46等位基因D（211bp）对3个肌肉度评分性状肩部、腰厚、大腿肌有负相关；等位基因B（205bp）在腰厚方面有正相关。等位基因F（249bp）对牛的胸深、坐骨端高等生长性状有正相关。BM1824等位基因C（211bp）对腿围性状、净肉率和净肉重性状均有正相关。IDVGA2等位基因C（209bp）对牛的肉用性能有负相关。     

草原红牛及其杂交群体中微卫星DNA多态性研究

选用草原红牛及其与利木赞牛的杂交后代66头作为试验牛群体,提取血液及肝脏基因组DNA,设计8对微卫星引物进行PCR扩增,从分子水平上对草原红牛及其杂交群体8个位点的遗传多态性进行微卫星分析。结果表明,在草原红牛中,ETH225、IDVGA2、IDVGA46和IDVGA44等位基因数分别为5、4、3和4,多态信息含量(PIC)分别为0．5420、0．6736、0．5218和0．5750,这4个位点均为高度多态。而另4个位点BM2113、BM1824、IDVGA55和TGLA44等位基因数分别,2、2、2和5,多态信息含量分别为0．3698、0．3604、0．3538和0．4708,属于中度多态性位点。在杂交牛群体中,BM2113、ETH225、IDVGA2、IDVGA46、ID- VGA44、BM1824、IDVGA55和TGLA44这8个位点的等位基因数分别为4、5、4、4、5、4、4和6,多态信息含量(PIC)分别为0．6432、0．5943、0．6593、0．5794、0．7259、0．6121、0．6120和0．6204,杂合度为0．7034,均属于高度多态性位点。这些微卫星位点作为遗传标记应用于草原红牛遗传育种研究之中是可行的。     

用微卫星标记研究樱桃品种间的亲缘关系(英文)

从来自不同地理区域的36个樱桃基因型中筛选了33对不同樱桃品种的微卫星引物,以鉴定和描述他们的基因型并确定亲缘关系。33对微卫星引物中,29对获得了预期的扩增片段,17对引物在所研究的36个基因型中产生了多态性高、稳定扩增片段,17个位点共检测到71个等位基因。微卫星分子标记技术可以准确的鉴别所有樱桃品种的基因型,为微卫星序列的通用性提供强有力的证据,可以用蔷薇科李属的序列来区分樱桃品种的不同基因型,根据不同品种的地理起源及其亲缘关系用UPGMA聚类分析法对其基因型进行分类。     

朝鲜鹌鹑遗传多样性微卫星标记分析

选用鹌鹑上的12个微卫星位点,对随机选取朝鲜鹌鹑的40个个体进行多态性检测,共检测到55个等位基因,每个座位平均等位基因数为4.583个。该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.6945和0.7111,表明朝鲜鹌鹑属多态性较丰富的群体。     

Microsatellite markers based assessment of genetic diversity in Iranian olive (Olea europaea L.) collections

To study the genetic variation in Iranian olive collections and some foreign olive cultivars, 47 accessions of 18 local cultivars from 6 olive collections of Iran (Roudbar, Zanjan, Ahvaz, Dezful, Kazeroon and Shiraz), were analyzed along with 30 imported cultivars using 16 microsatellite primer pairs. All the used microsatellite loci revealed polymorphism in the studied genotypes, except GAPU14 and GAPU113 markers. Fourteen microsatellite primers amplified 126 polymorphic alleles in the 87 selected olive accessions. The average number of alleles per locus was 9, ranging from 3 to 14. Polymorphic information content (PIC) was 0.85. The genetic similarity based on Jaccard coefficient ranged from 0.15 to 1. The genetic relationships among accessions were investigated using cluster analysis and principal component analysis (PCA). Most of the accessions with the same name were grouped together; some exceptions were also observed. As expected, close relationship was observed among accessions within same cultivar. Most of the Iranian olive accessions were clustered to a main distinct group. Two-dimensional scatter plot of principal component analysis revealed a clear separation of most of the Iranian olives from Syrian and other introduced cultivars. These suggest that Iranian cultivars have different origin related to West Mediterranean basin cultivars and have evolved independently from the others. Between and within Iranian and foreign cultivars (cultivars including three or more accessions) genetic diversity was analyzed using analysis of molecular variance (AMOVA). AMOVA revealed higher within cultivar genetic variation (62.76%) as compare to that between cultivar variations (37.24%). The intra- and inter-cultivar variance tested by permutation test showed significant genetic variation at both levels. The high level within cultivar genetic variance could be due to mislabeling and presence of homonyms in cultivars produced by vegetative propagation from original plants.