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1.
【目的】鉴定番茄DIR基因家族所有成员,并对其基因结构、编码蛋白的理化性质、系统进化、染色体定位、共线性、启动子元件、表达模式、互作转录因子及内源竞争RNA预测等进行了解析,为探究DIR在番茄生长发育和逆境胁迫中的作用提供参考。【方法】采用生物信息学方法,基于全基因组数据对番茄DIR基因家族成员进行鉴定,运用Phytozome、MEME、PlantCARE、opsRNATarget和plantcircnet等在线网站获取染色体位置、保守基序、顺式作用元件、存在互作的转录因子、miRNA和circRNA等信息。利用Mapteace、TBtools、Cytoscape、OmicShare等作图软件及工具绘制染色体定位图、进化树、DIR与转录因子关系图、ceRNA网络等。采用NCBI的基因数据库结合转录组测序及qRT-PCR试验研究DIR基因家族在逆境下的表达情况。【结果】共鉴定到番茄中27个DIR基因,将其命名为SlDIR1SlDIR27,分别位于12条染色体上,且大部分基因位于染色体末端,其基因结构、基序和结构域相对保守,其中22个SlDIR具有一个外显子的经典结构。番茄DIR基因家族同拟南芥的共线性关系远高于水稻和大豆。基于系统进化关系将27个番茄DIR成员分为3个不同的亚家族。转录组数据表明大部分DIR基因在番茄根部具有较高的表达量。此外,DIR基因的启动子区域含有多个与干旱、低温等非生物胁迫,以及MeJA、ABA、SA等激素诱导相关的顺式作用元件,且预测到与激素、生长发育、非生物胁迫相关的ERF、E2F/DP、MYB等互作转录因子。结合转录组数据分析,分别有5、10、10和13个SlDIR在农药、干旱、盐和冷胁迫后显著上调表达,其中,SlDIR23受到以上4种胁迫的诱导表达,而SlDIR8、SlDIR13SlDIR20特异性响应冷胁迫的诱导,SlDIR17特异性响应盐胁迫。番茄DIR的ceRNA调控表明,miR-156与靶基因SlDIR8可能共同作用调控番茄的逆境胁迫。【结论】共鉴定出番茄DIR家族基因27个,不均匀地分布在12条染色体上,在根部有较高的表达量。SlDIR1SlDIR13SlDIR14等具有MeJA、ABA、SA等激素响应元件,其中,SlDIR6仅具有MeJA元件,SlDIR27仅具有SA响应元件。另外,SlDIR2SlDIR14、SlDIR23等参与干旱、盐、低温等多种逆境胁迫,其中SlDIR23在不同胁迫处理下均可被激活。此外,DIR基因和转录因子、非编码RNA相互作用,共同参与调控番茄植株的逆境胁迫。  相似文献   
2.
为了筛选可以有效缓解菜用大豆低温胁迫伤害的外源试剂,并明确其对菜用大豆低温胁迫的调控效应。本试验以菜用大豆品种辽鲜1号为供试品种,以赤霉素、乙烯利、阿魏酸、γ-氨基丁酸、壳聚糖和绿原酸为供试试剂,比较外源试剂对低温胁迫下菜用大豆的抗氧化系统、渗透调节物质和氮代谢的影响,筛选能够增强菜用大豆低温胁迫耐性的外源试剂。结果表明:外源GA3、GABA处理显著提高了低温胁迫下菜用大豆的抗氧化酶活性,尤其是SOD和CAT活性,并显著提高了AsA和GSH含量,显著降低了超氧阴离子(O-2)含量,缓解了菜用大豆受到的氧化损伤。此外,外源GA3、GABA处理使菜用大豆可溶性糖和蔗糖含量显著增加,增强其细胞保水能力;同时显著提高了菜用大豆氮代谢酶活性,尤其是硝酸还原酶(NR)、谷氨酸合酶(GOGAT)和谷氨酸脱氢酶(GDH)活性,促进菜用大豆氮代谢作用,增强其低温胁迫耐性。由此可知,外源GA3和GABA处理通过调节抗氧化性、渗透调节物质和氮代谢来缓解菜用大豆的耐冷能力。  相似文献   
3.
<正>南板蓝作为常用抗病毒中草药不仅可用于人类抗病毒等疾病防制,而且在防制禽畜疾病方面更能充分体现其药用及经济价值。目前,禽畜疾病的防制主要依靠人工合成抗生素,但过量使用抗生素不仅导致药物残留量剧增,影响禽畜繁衍,甚至严重影响人类健康及生命安全。  相似文献   
4.
浅析影响罗平蜂产品质量的因素及对策   总被引:1,自引:0,他引:1  
对影响罗平县蜂产品质量的主要因素进行了分析,认为解决影响罗平蜂产品质量的主要因素的相应对策是建立蜜蜂疾病防治体系;控制农药污染;狠抓收购、加工、流通环节,净化市场等。  相似文献   
5.
蜜蜂为油菜授粉效果初步研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
通过设计不同授粉处理比较蜜蜂为油菜授粉效果。结果表明:意蜂自由授粉处理能显著提高油菜籽产量,与对照相比(隔离无蜂授粉处理)增产率为32.78%,其次为中蜂强制授粉,与对照相比增产率为16.89%,而意蜂强制授粉油菜籽产量与对照差异不显著;从千粒重和出油率看,各处理间差异均不显著。因此,组织意蜂在油菜花期进行自由授粉,是提高油菜籽产量的一条重要途径。  相似文献   
6.
为研究外源褪黑素处理对菜用大豆残留杀菌剂降解的影响,以菜用大豆品种浙鲜12为材料,以多菌灵和百菌清为杀菌剂,通过测定外源褪黑素处理对菜用大豆农药残留量、抗氧化系统、解毒系统的影响,探讨外源褪黑素处理在菜用大豆农药降解中的作用。结果表明:外源褪黑素处理提高菜用大豆中抗坏血酸和谷胱甘肽含量以及抗氧化酶(超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶、抗坏血酸过氧化物酶)活性,有效清除菜用大豆体内活性氧,并且诱导了菜用大豆解毒相关基因的表达,增强其对残留多菌灵和百菌清的解毒代谢,从而促进残留农药的降解,降低菜用大豆中多菌灵和百菌清的残留量。  相似文献   
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