两株H5N1亚型禽流感病毒的基因分析及其在不同宿主中致病性的比较

为了解两株高致病性禽流感病毒(HPAIV)的分子特征及其对不同宿主的致病性,本研究对DK/HuN/4/08和CK/GX/2/09进行全基因组序列的测定,分析结果表明:两个病毒分离株HA基因的裂解位点均具有HPAIV特有的基序(341RRR(R)KR345/346),并且均属于Clade2.3.2分支,基因组同源性在97.4%～98.3%之间。致病性试验显示,两个病毒分离株均能够以106EID50感染量在3 d内引起鸡全部死亡,并且各脏器均检测到高滴度的病毒含量;两者在SPF鸭中呈现不同的致病性,CK/GX/2/09在4 d内可以使感染鸭100%死亡,而DK/HuN/4/08只引起25%的死亡率;同样在小鼠试验中,两者致病力差异与在鸭体中的反应一致,其MLD50分别为1.63 log10EID50和6.2 log10EID50。本研究表明,这两株遗传背景相似的HPAIV在鸡、鸭和小鼠中的致病性不同,为进一步利用反向遗传技术研究这两株病毒对水禽和哺乳动物致病力差异的分子机制奠定了基础。     

鸭瘟病毒ZJ2016强毒株部分基因序列的测定与分析

2016年,浙江省一鸭场发生疑似鸭瘟病例,经鉴定,病鸭感染鸭瘟病毒,命名为ZJ2016病毒株。实验应用二代基因测序方法对该病毒核酸进行全基因测序,鉴定分析鸭瘟病毒ZJ2016株抗原与毒力相关基因序列特征。对测序病毒主要囊膜糖蛋白基因gB、gC、gG、gH、gI、gK、gL、gM、gN与致病力基因LORF11、UL2、UL12、UL41、UL47、US10进行核酸与氨基酸序列分析,并与已发表毒株序列及疫苗株(VAC株、clone-03株)序列比较。结果显示,与疫苗免疫保护抗原相关的ZJ2016株囊膜糖蛋白序列与疫苗毒株序列相比未发生明显的变异,而ZJ2016株的LORF11、UL2、UL12、UL41、UL47、US10基因结构及同源性与疫苗株氨基酸序列差异明显,且与中国其他分离强毒株LH2011株、CHv株、CV株同源性较高,表明该毒株具有强毒株的基因型特征。     

14株H9N2亚型禽流感病毒分离株的HA和NA基因序列分析

为了解浙江省H9N2亚型禽流感病毒(AIV)血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的分子特征和遗传变异情况，本试验对2012—2021年分离到的14株H9N2亚型AIV分离株进行HA和NA基因序列测定和分析。结果显示：14株分离株的HA和NA基因均属于Y280分支，HA核苷酸同源性为91.5%～99.4%,NA核苷酸同源性为89.0%～98.7%,其与疫苗株CK/SS/94、CK/F/98、CK/6/96和CK/1/00的HA核苷酸同源性为86.0%～91.1%。14株分离株HA蛋白裂解位点氨基酸组成均为RSSR↓GLF;受体结合位点主要表现为K141N、A142T、T155N、H183N和V190T突变，其中第226位和第228位全部为L和G,可与α-2,6唾液酸受体结合，具有感染人的特性；蛋白潜在糖基化位点均为6个，主要变异表现在第200～202位1个位点缺失和第295～297位1个位点增加；抗原相关位点主要表现为G82E、S137D、D145G、N159G、A160D、T192R和N193D突变，此外，有5株出现D160N突变。14株分离株NA蛋白存在6个潜在糖基化位点，其中1株...     

两种H7N9流感病毒荧光RT-PCR试剂盒的敏感性和特异性评价

为评价两种（A、B）H7N9流感病毒荧光RT-PCR试剂盒的检测性能，对50份疑似感染H7N9流感病毒的禽拭子样品进行H7N9流感病毒核酸检测，使用TG-ROC分析方法筛选荧光RT-PCR最适Ct值（阈值），通过2×2列联表分析两种试剂盒的敏感性和特异性，并用Kappa检验评估其一致性。结果显示：以国家禽流感参考实验室的鸡胚病毒分离鉴定结果为“金标准”，A和B两种试剂盒的敏感性、特异性分别为90.9%（10/11）、56.4%（22/39）和54.5%（6/11）、94.9%（37/39）；两种试剂盒检测结果差异较大，Kappa值为0.28。TG-ROC分析得出：A试剂盒的检测阳性最适阈值为33，对应的敏感性和特异性为90.91%和92.31%；B试剂盒的检测阳性最佳阈值为37，对应的敏感性和特异性分别为81.82%和87.18%。通过调整阈值，A试剂盒的敏感性和特异性均达到90%以上，B试剂盒均达到81%以上，Kappa值为0.85，检测结果一致。结果表明，虽然不同H7N9流感病毒荧光RT-PCR试剂盒的检测性能有差别，但通过调整阈值，可以达到检测所需的最适敏感性和特异性，从而增加临床检测结果的可靠性。本研究为H7N9流感病毒检测试剂盒的应用提供了指导。