三江黄牛全基因组数据分析

【目的】研究三江黄牛群体遗传多样性,从基因组层面讨论其群体遗传变异情况。【方法】提取50个体基因组总DNA,等浓度等体积混合,构建混合样本DNA池,利用CovarisS2进行随机打断基因组DNA,电泳回收长度500 bp的DNA片段,构建DNA文库。应用Illumina HiSeq 2000测序,最终得到测序数据。利用BWA软件将短序列比对到牛参考基因组(UMD 3.1),来检测三江黄牛基因组突变情况。SAMtools、Picard-tools、GATK、Reseqtools对重测序数据进行分析,Ensemb1、DAVID、dbSNP数据库对SNPs和indels进行注释。【结果】全基因组重测序分析共计得到77.8 Gb序列数据,测序深度为25.32×,覆盖率为99.31%。测序得到778 403 444个reads和77 840 344 400个碱基,比对到参考基因组(UMD 3.1)的reads为673 670 505,碱基为67 341 451 555,匹配率分别为86.55%和86.51%,成对比对上的reads数为635 242 898(81.61%),成对比对上的碱基数为63 512636 924(81.59%);共确定了20 477 130个SNPs位点和1 355 308个indels,其中2 147 988个SNPs(2.4%)和90 180个indels(6.7%)是新发现的。总SNPs中,鉴定出纯合SNPs989 686(4.83%),杂合SNPs19 487 444(95.17%),纯合/杂合SNP比为1:19.7。转换数为14 800 438个,颠换为6 680 058个,转换/颠换(TS/TV)为2.215。剪切位点突变SNP727个,开始密码子变非开始密码子SNP117个,提前终止密码子的SNP 530个,终止密码子变非终止密码子SNP88个。检测到非同义突变数为57 621,同义突变为83 797,非同义/同义比率为0.69。检测到非同义SNPs分布在9 017个基因上,其中发现567个基因与已报道的重要经济性状相符,肉质、抗病、产奶、生长性状、生殖等相关基因的数量分别为471、77、21、10、8个,其中包括功能相重叠的基因;indels数据中,缺失数量为693 180(51.15%),插入数量为662 148(48.85%),纯合indels数量为161 198(11.89%),杂合indels数量1 194 110(88.11%),大部分的变异都位于基因间隔区和内含子区;三江黄牛全基因组杂合度(H)、核苷酸多样性(Pi)及theta W分别为7.6×10~(-3)、0.0 039、0.0 040,说明其遗传多样性较为丰富。三江黄牛群体Tajima'D为-0.06 832,推测可能由于群体内存在不平衡选择所致。【结论】本研究为进一步分析与经济性状相关的遗传学机制和保护三江黄牛品种遗传多样性提供了基因组数据支持。     

高寒草地羯羊适宜育肥出栏年龄研究

目前高寒草地载畜量普遍超载，羯羊在羊群中占到２０％～４０％。为此必须探索羯羊适宜育肥出栏年龄，以缩短羯羊饲养时间，减少草料消耗，提高养羊经济效益。通过对不同月龄羯羊进行放牧育肥与出栏试验的结果表明：羯羊在６、９、１８、３０月龄屠宰，胴体重分别为：１１０２、１５２４、２１６２、２５５４ｋｇ；只平盈利分别为：３３０、７０３７、１０７９、３６５５元。羯羊最佳出栏年龄为１８月龄。     

阿坝州畜禽遗传资源现状分析

通过对麦洼牦牛、藏系绵羊、藏山羊、河曲马、麦洼马、阿坝驴、藏猪、藏鸡、三江黄牛、板角山羊、阿坝蜜蜂等11个品种和2个新种群(昂科牦牛和贾洛绵羊)的数量分布、生产性能纵横向的比较研究,掌握了各品种的数量消长及性能变化状况,有针对性地提出了各品种的保种选育、开发利用规划及对策措施.     

辽宁绒山羊与壤塘藏山羊的杂交效果

应用辽宁绒山羊与壤塘藏山羊杂交 ,结果表明 :辽藏 F1 生长发育快 ,初生、半岁、周岁、成年各阶段体重均显著优于壤塘藏山羊。成年公母羊平均产绒量分别比同龄藏山羊高 2 10 .2 0 g和 16 2 .15 g,即提高 5倍多 ,且绒毛品质优于藏山羊。按 1994年市场价计算 ,饲养一只辽藏 F1 公母羊比饲养一只藏山羊分别增加经济收入 2 0 8.6 3元和 170 .6 1元 ,具有推广价值。     

藏绵羊选育进展

从藏绵羊主产区选择藏绵羊优秀个体,组建选育核心群,通过采取综合选育措施,得出选育效果显著。     

能量水平对舍饲育肥牦牛肌肉理化指标和氨基酸、脂肪酸组成及含量的影响

本研究旨在探讨能量水平对舍饲育肥牦牛肌肉理化指标和氨基酸、脂肪酸组成及含量的影响。选取60头体况良好、平均体重为（192.66±3.64）kg的3周岁左右的舍饲育肥麦洼公牦牛,采用完全随机试验设计,每组20个重复,每个重复1头牦牛。饲喂粗蛋白质（CP）水平为14.81%,增重净能（net energy for gain,NE_g）分别为4.17（低能量组,LE）、4.48（中能量组,ME）、4.79 MJ/kg（高能量组,HE）的3种日粮。试验期共97 d,其中预试期7 d,正试期90 d。结果显示,各处理组牦牛肌肉的pH、熟肉率和滴水损失3个理化指标均无显著差异（P>0.05）;各处理组牦牛肌肉常规营养成分的水分、粗蛋白质、粗脂肪、钙和磷含量无显著差异（P>0.05）;除ME组牦牛肌肉中的脯氨酸（Pro）和组氨酸（His）含量显著高于其余两组外（P<0.05）,总氨基酸和其他种类的氨基酸含量差异不显著（P>0.05）;ME组单不饱和脂肪酸、多不饱和脂肪酸及总不饱和脂肪酸相对含量显著高于LE、HE组（P<0.05）,HE组总饱和脂肪酸显著高于LE、ME组（P<0.05）。对于各种类脂肪酸,ME组的C15：1 n-3、C16：1 n-2和C18：1 n-8 3种单不饱和脂肪酸含量均显著大于其余两组（P<0.05）;而HE组的C17：0含量则有显著高于其余两组的趋势。在本试验条件下,舍饲育肥牦牛日粮中适宜的NE_g水平为4.48 MJ/kg（日粮DM）,适宜日粮NE_g水平能提高牦牛肌肉中脂肪酸的含量。     

阿坝州蛋鸡养殖调查与分析

阿坝州位于四川省西北部,紧邻成都平原,辖13县,其中纯牧区5个县,半农半牧区8个县。8个半农半牧区80%都是半高山或高山,蛋鸡养殖是该区域的重要产业。本次对阿坝州蛋鸡养殖现状的调查,主要在这个区域进行。1调查方法调查由阿坝州畜牧兽医局组织,制定统一的蛋鸡养殖调查表,以文件形式下发至8个县,各县派专门人员进行入户调查,调查表由调查人员和养殖户共同签字确     

麦洼牦牛选育情况调查

以麦洼牦牛原种场建设为重点，组建选育核心群和扩繁群，对麦洼牦牛进行选育，提纯复壮。通过5年的艰苦工作，选育核心群一世代牛：1岁公母牛体尺体重达到1．5岁一级品种标准；2岁公母牛体尺体重达到2．5岁一级品种标准；3岁公母牛体尺体重达到2．5岁特级品种标准。选育效果非常显著。