烟草EST数据库构建及cDNA阵列技术建立

一组容量为5 927条烟草(Nicofiana tabacum)EST的数据(GenBank登录号为CV015900～CV021826),包含521个重叠群和3 079个独立EST.EST数据分析显示:高丰度表达基因主要涉及光合代谢、蛋白合成等植物基本的生理功能;而低丰度表达基因则占假定独立转录本(TUTs)总数的85.5%.在此基础上,制备完成cDNA阵列,并应用于盐胁迫下烟叶的基因表达谱分析,结果表明,盐胁迫即可使烟草叶片的基因表达谱发生显著改变,并涉及多个重要的植物生理过程.包括水通道蛋白PIP2a、乙烯应答蛋白酶和mRNA剪接因子prp31等42个基因的检出,为阐明植物胁迫反应的调控机制提供新的线索.     

模块表达序列标签技术的建立及相关水稻cDNA阵列的应用

 提出了一种新的表达序列标签制作技术——模块表达序列标签（M EST）技术，利用该技术短时间内分离完成1985条水稻cDNA片段，制备完成相应的水稻cDNA阵列。实验证实：该技术体系能成功分离目的基因，正确检测基因表达丰度的改变，并具备通过对基因群体表达模式的监测以实现对生物学事件的精确描述。M-EST概念是对EST技术的完善和重要补充，运用M-EST技术能有效利用生物信息学知识，加快基因克隆速率，为基因功能的研究提供手段和工具。关键词:     

稻瘟病菌发育cDNA文库构建与表达序列标签分析*

利用稻瘟病菌(Magnaporthegriesa)连续6个发育时期的材料构建了一个混合cDNA文库。文库滴度,重组率和插入片段长度等质量分析表明,构建的文库包含完整的稻瘟病菌基因,可用于病菌基因表达分析。利用该文库获得了7456条5′端表达序列标签(ESTs)(GenBank收录号:(CK909944￣CK913666和CK928583￣CK932582),生物信息分析表明:EST序列拼接出2975个假定独立转录本(TUTs),冗余度为60.1%;从cDNA文库中筛选出大量的低丰度表达基因,约占TUT总数的79.8%,说明在文库中基因组成类型的复杂性较高;在所有TUTs中,功能未知基因约占85.5%,编码ECM33蛋白和疏水蛋白等病菌致病相关的注释基因高丰度表达,进一步表明该cDNA文库反映了病菌侵染和发育过程中基因表达的状况。     

牛樟芝研究开发的专利分析

概述了近17年来牛樟芝研究开发的专利情况,从时间、地域、技术领域等方面对专利进行统计,对各项专利进行归类比较,并探讨了牛樟芝研究开发中存在的问题及对策。     

冻融法纯化水稻胚乳RNA及稻米品质重要相关基因表达谱研究

 提出了一种从水稻胚乳组织中快速分离总RNA的方法，可以简便地去除RNA中存在的淀粉等多糖类杂质，所获的胚乳总RNA其质量可满足Northern印迹、微阵列制备等分子生物学实验要求。将从966个水稻品种的胚乳中分离所得的RNA制备RNA阵列，用于稻米品质重要基因Wx基因的表达谱分析，结果证实：水稻Wx基因表达丰度总体上与水稻胚乳的直链淀粉含量呈正相关；应用于Northern印迹实验，表明在水稻胚乳组织中，淀粉分支酶Rbe1具有两个长度不同的同源基因，其中一个分子量大的为胚乳特异表达，分子量小的则在水稻各组织中共表达。     

水稻GBSS与淀粉分支酶基因转录本丰度对直链淀粉含量的影响

为探讨水稻胚乳淀粉合成相关酶基因表达丰度与直链淀粉含量(AC)的相关性,为稻米品质改良提供指导,以127份早籼稻,143份晚粳稻和19份粳糯稻为材料,应用水稻胚乳RNA阵列分析了供试品系的直链淀粉含量和Wx(包括成熟转录本和非成熟转录本)、Sbe I基因mRNA丰度之间的相关性。结果表明,Wx基因非成熟转录本的剪接及修饰对AC值的大小起着十分重要的决定作用。而sbeI基因在不同品系间的相对表达丰度与相对应的AC值无直接相关性。     

疏水表面诱导稻瘟病菌侵染结构发育过程的基因表达谱分析

本文在制备完成高通量稻瘟病菌cDNA阵列的基础上，平行检测孢子受疏水性表面诱导0、2、8、20和30 h时间点的基因表达谱。结果显示：在附着胞形成的不同阶段，均存在大量的差异表达基因，显示出这一过程中基因表达网络的复杂性。其中，附着胞在成熟阶段的差异表达基因数要明显高于其诱导和形成阶段，表现在8 h、20 h时间点相近的基因表达谱至30 h时间点发生剧烈变化。这种动态的基因表达谱的分析可以为稻瘟病菌致病的分子机理研究提供有意义的信息。