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1.
【目的】 筛选不同温度下烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染后枯斑三生烟(Nicotiana tabacum var. Samsun NN)差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),研究lncRNA在枯斑三生烟抗性反应中的作用。【方法】 N基因的温度敏感性使枯斑三生烟在25℃时具备对TMV的抗性、在31℃抗性丧失,在这两个温度条件下对枯斑三生烟接种TMV和磷酸盐缓冲盐水(phosphate buffered saline,PBS),48 h后提取系统叶总RNA,构建链特异性文库后进行深度测序。对测序结果进行过滤后利用HTSeq将有效数据与近缘品种TN90(N. tabacum var. TN90)基因组比对,筛选得到lncRNA后利用FPKM法估计lncRNA的表达水平。通过edgeR筛选差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),并利用qRT-PCR技术对这一结果进行验证。通过共定位及共表达分析预测DElncRNA的靶基因,通过参考基因组注释、GO和KEGG富集分析研究靶基因的功能。【结果】 4个处理共12个样本经lncRNA-seq各测得约8 000万条clean reads,共获得4 737条已知lncRNA、40 169条新lncRNA。其中64个lncRNA在不同温度条件下TMV侵染后存在差异表达,qRT-PCR测定结果显示这些lncRNA的测序正确率在80%左右,表明本研究所得测序数据具备较高的可信度。对DElncRNA进行靶基因预测,发现一些基因同时被25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶向。靶基因注释功能丰富,主要参与植物抗病、激素和代谢等生理过程。部分可能与激素通路相关的lncRNA,在25℃下TMV侵染时呈现下调趋势,而在31℃下TMV侵染则呈现上调趋势。GO富集分析显示靶基因主要参与构成膜、囊泡等组分,具备钙、钾离子通道抑制剂活性等分子功能,使相应离子得以转运引发随后的反应,同时也参与发病、抗原加工和呈现、细胞分裂素代谢等生理过程。KEGG分析发现靶基因显著富集在植物激素信号转导通路,25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶基因同时富集在激素信号传导、ABC运输蛋白、苯丙烷类生物合成等通路。【结论】 不同温度(25℃和31℃)条件下TMV侵染枯斑三生烟后,长链非编码RNA差异表达,DElncRNA通过作用于激素信号传导、物质转运等过程参与寄主系统获得性抗性反应。研究结果可为揭示植物系统获得性抗性中lncRNA的调控功能以及新型抗病毒技术开发提供依据。 相似文献
2.
3.
蓬勃发展的益阳农机化事业张超群改革开放的15年,益阳农机化事业犹如一匹奔腾的铁牛,在益阳农村这片肥沃的土地上一跃而起。以1980年与1994年相比较,益阳市农机总动力已由48万千瓦发展到162万千瓦,平均每年增长21.9%;农机从业人员已由5万多人发... 相似文献
4.
益阳是一个农业大市,益阳经济的发展,首先应该是农村经济的发展,农业机械的发展。而培育农机名牌产品,振兴益阳经济,是当前我市农机工作至关重要的问题,也是我市各级农机部门的职责所在和希望所在。本文就农机部门如何开发农机名牌产品并形成支柱产业谈一些肤浅看法。开发农机名牌产品的有利条件(1)农业机械推广力度大。改革开放以来,益阳市农民的“农机热”长盛不衰,年销售农机动力5万千瓦以上。到目前为止,全市农机总动力达168万千瓦,各类配套机具50多万台件,农机服务领域已涉及农业生产的各个环节。由我市研制和推广… 相似文献
5.
农机推广拓宽富民之路近几年来。我市农机部门把农业机械的推广作为奔小康的重要措施来抓,已研制和推广了水田耕整机、小型水稻联合收割机、化肥深施器等新机具150多种。每年新增农机科技产值14亿多元,增加收入2亿元。为了普遍提高机械化作业水平,市农机局于19... 相似文献
6.
我市农机部门把农业机械的推广作为农民奔小康的重要措施来抓,已研制和推广了水田耕整机、小型水稻联合收割机、化肥深施器等为代表的农机新机具150多种,其中5项被列入国家科委重点开发产品,110多项获市以上新产品开发奖,累计推广农机新机具60多万台件,获省、部级农机推广奖38项、每年新增农机科技产值14亿多元,为农民增加纯收入2亿 相似文献
7.
8.
为农民架起节本增效的金桥张超群金秋十月,湖南沅江市农机局化肥深施节本增效工程.经省、地、市企业、农机.统计等有关单位联.合调查验收,已确认25万亩机械化肥深施面积,为农民节约了碳该5000多吨,增产稻谷2000多吨,增加收入2000多万元。为农民架起... 相似文献
9.
<正>目前市售的猪肉品质良莠不齐,安全性令人担忧。2013年,我们在广东省广州市南沙区新辉园畜牧场进行了三安模式生猪养殖转化试验。三安模式是一整套由生物技术组成的技术操作模式,养殖方面有生物环境净化剂、生物饲料添加剂、处理粪便的生物制肥素,包含保证环境安全、生产过程安全、产品质量安全的三安理念。由三安模式生产的农产品,能达到有机产品标准,并超过欧、美进口标准。经广东省级检测单位检测,三安模式下猪肉品质达到并超过了国标有机食品的标准,出口销售完全达标。用普通方法烹饪,味香浓郁,消费者找到了20世纪70年代前的猪肉美味。 相似文献
10.
从江西省信丰、广昌和峡江3县采集呈典型症状的烟草青枯病株进行病原菌分离,得到3个具有致病性的细菌分离株,分别命名为RSXF-1、RSGC-1和RSXJ-1。采用细菌16S rDNA基因通用引物对3个分离株的16S rDNA基因进行PCR扩增,对扩增产物进行克隆和序列测定,各得到长为1 500 bp的核苷酸序列。经同源性分析,发现3个分离株均为茄科劳尔氏菌(Ralstonia solanacearum),且三者间具有高度的序列同源性。将此3个分离株的16S rDNA核苷酸序列与GenBank中R.solanacearum代表性株系的对应序列进行同源性分析并构建系统发育树,结果表明RSXF-1、RSGC-1和RSXJ-1均与我国广东省和云南省的分离株具有最近的亲缘发育关系。 相似文献