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2.
《果树学报》2020,(1)
【目的】枇杷基因组数据尚未公布,限制了枇杷分子生物学的研究。当前很多研究集中在上游转录因子和下游基因启动子之间的调控关系上,所以获得目的基因的启动子显得尤为重要。传统方法使用PCR方式进行染色体步移来获得启动子区域,耗时且难出结果。【方法】对‘火炬’枇杷进行二代测序,二代测序为双端测序,片段含盖200到500bp的序列。根据下游基因序列通过测序片段来实现染色体步移。使用现有程序Magicblast和新开发的Promoter_Scan脚本程序来快速获取目的基因启动子区域。Promoter_Scan对每对Reads构建10 bp的索引序列,先使用索引匹配目的基因,匹配后使用目的基因前30 bp序列再次匹配目标Reads,最后完成拼接。【结果】通过二代测序共获得61.77 GB的‘火炬’枇杷基因组数据,测序深度约为85倍。使用Magicblast检索匹配Reads耗时长,难以二次开发,需要手动拼接延伸,每个基因启动子挖掘需要9.5 h。新开发Promoter_Scan脚本程序通过两次匹配,能够更快更准确地找到启动子序列。对枇杷中8个基因进行启动子查找,向上延长2 000 bp序列平均需要拼接11.7次,耗时21.3 min。根据步移后的序列设计引物进行验证,结果显示:Sanger测序结果和预测的序列高度一致。【结论】使用Magicblast检索方式能够达到实验要求,不需要编程技能,但是耗时长。Promoter_Scan能够实现自动延伸,显著缩短启动子挖掘时间。本研究中的两种方法不仅可以用于枇杷分子生物学的研究,对其他未公布基因组数据的物种同样适用。 相似文献
3.
枇杷喜光,亦能耐阴,其花、叶、皮、根均可入药,枇杷的叶片大而厚,病虫害相对较少。大五星枇杷是享誉当今的"枇杷之王",经过嫁接移栽的植株,主根被切断,多以须根为主,80%的吸收根为水平根,大多都分布在离地面10~50cm土层中。枇杷是常绿水果,成熟时果实色泽金黄,外观诱人,能够四季观赏,赏性优良。大五星枇杷树势中庸,早果性能好,易丰产。抗逆性强,适应性广,庭院种植更易成功。 相似文献
4.
本文通过观察‘早钟6号’和‘东湖早’两个红肉枇杷品种的嫁接苗幼树期,以及‘早钟6号’ב东湖早’的实生苗的童期,探索亲本幼树期长短对杂种后代童期的影响,结果表明,‘早钟6号’枇杷的嫁接树幼树期比‘东湖早’枇杷的嫁接树短10.3个月,‘早钟6号’枇杷的杂种后代实生苗的童期比‘东湖早’枇杷的实生后代童期短6-9.3个月。说明以幼树期短的‘早钟6号’枇杷为母本的杂种后代实生苗童期也短,早实性更强,与童期短的母本其杂种后代童期也短的枇杷育种规律一致。所以在枇杷育种中,幼树期长短可作为杂种后代童期长短的预测依据,幼树期短的母本其杂种后代实生苗童期也短。相同的杂交亲本组合应选择幼树期短的品种作母本,以缩短育种周期,提高育种工作效率。 相似文献
5.
枇杷的DNA为模板进行iPBS-PCR扩增,采用预实验中效果较好的iPBS分子标记引物2241,对枇杷iPBS-PCR反应体系中的dNTP、Mg2+、引物、模板用量进行优化,根据检测结果确定枇杷iPBS-PCR使用:10×Taq buffer 2μL,25mM Mg2+ 1.6μL,2.5mM dNTP 1.6μL,10μmol/L Primer 1μL,5U/μL Taq酶0.2μL,模板DNA 5ng 的20μL反应体系。反应程序中的退火温度可以参考iPBS引物理论Tm值。对33条iPBS引物扩增测试的结果显示在该反应体系下可以筛选到22谱带清晰、多态性好的引物,可用于枇杷的分子标记分析。 相似文献
6.
7.
【目的】探讨矮化紧凑型、矮化开张型和矮化疏散分层型等3种生长型枇杷种质的枝梢生长及空间分布,为枇杷矮生品种选育及矮化修剪提供参考依据。【方法】采用网格法,对国家果树种质福州枇杷圃中自然生长的3种矮化生长型种质不同冠层部位的枝梢数、花穗数、枝梢粗度、枝梢长度、叶片数和枝梢角度的空间分布进行测定分析。【结果】矮化紧凑型的'闽矮1号’树体矮小、枝梢短且细、枝梢密度大,抽穗率低且冠层内分布不均匀;矮化开张型的'大坡顶3号’表现树高、枝梢生长量和生长势中等,枝梢抽穗率高且在冠层内分布均匀;矮化疏散分层型的'多43号’树高较高,枝梢分布在冠层中上部且密度小。随冠层高度的增高,3种矮化种质资源的枝梢长度、粗度、叶片数均呈增加趋势,而枝梢角度呈下降趋势',闽矮1号’的枝梢抽穗率呈增高的趋势,而'多43号’呈降低趋势。【结论】矮化开张型的枝梢生长与空间分布的树形特点,更适合生产上应用推广。 相似文献
8.
农村饮水安全工程是一项惠民工程,目前在湖南省已建成运行上万处,基本解决了农村饮水困难的问题,但是工程建设的规范化管理还存在取水许可管理缺失的现象,无证取水、违规审批等违法违规行为普遍存在。如何做好农村饮水安全工程的取水许可管理工作,文章结合现状及管理要求做了一些思考。 相似文献
9.
10.
《蚕业科学》2020,(2)
采用单因素试验与正交优化试验,分析不同桑椹果浆含量、酵母接种量、初始总酸含量、初始糖度对发酵酿制枇杷-桑椹复合果酒的酒精度、残糖含量、抗氧化活性和总酸含量的影响,并优选最佳发酵工艺。正交试验直观分析结果显示,发酵工艺条件对复合果酒酒精度的影响程度从大到小依次为初始糖度、桑椹果浆含量、酵母接种量和初始总酸含量;对残糖含量的影响程度从大到小依次为桑椹果浆含量、初始糖度、酵母接种量和初始总酸含量;对抗氧化活性的影响程度从大到小依次为桑椹果浆含量、酵母接种量、初始糖度和初始总酸含量;对总酸含量的影响程度从大到小依次为初始总酸含量、桑椹果浆含量、初始糖度和酵母接种量。确定枇杷-桑椹复合果酒的最佳发酵工艺条件:桑椹果浆质量分数20%,酵母质量分数0.35%,初始总酸质量分数0.6%,初始糖度26%。在此条件下,枇杷-桑椹复合果酒的酒精度达到12.41%,总抗氧化能力达到2.68 U/mL,残糖质量分数为2.03%,总酸质量浓度7.78 g/L。 相似文献