甘蔗野生近缘种遗传多样性的ISSR分析

[目的]评价甘蔗野生种质资源的遗传多样性,为甘蔗抗逆定向遗传改良挖掘具有育种潜力的种质资源.[方法]对44份甘蔗野生近缘种材料按照割手密种内、斑茅种内以及种间3个层次运用ISSR进行遗传多样性分析.[结果]44个种间材料利用13条ISSR引物扩增,获得261条条带,其中259条为多态性条带、占比为99％;种间多态性依次...     

基于EST-SSR荧光标记和毛细管电泳检测技术分析邵武碎铜茶群体遗传多样性与亲缘关系研究

利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术对29个邵武碎铜茶种质资源进行研究。结果表明:邵武碎铜茶种质资源观测等位基因数为4.94,有效等位基因数为2.93;观测杂合度和期望杂合度平均值分别为0.58和0.59;Shannon多样性指数为1.1298,遗传多样性丰富。邵武碎铜茶种质资源与参照品种未聚类在一起,初步说明碎铜茶种质资源具有一定的地域性。碎铜茶种质资源主要分为3个群体,每个群体的资源特点需要进一步鉴定与观察。     

胡桃、野核桃和胡桃楸木材解剖特征比较

对胡桃(Juglans.regia)、野核桃(J.cathayensis)和胡桃楸(J.mandshurica)的木材微观结构进行电镜观察,比较3个树种木材微观解剖特征,并探究树种间的亲缘关系。结果表明:3种木材微观特征较为相似,均为圆柱状导管分子、卵圆形或圆形小管孔、单管孔及少数复管孔组合、互列管间纹孔、离管带状轴向薄壁组织、同型单列及多列木射线。微观结构差异主要体现在:野核桃属环孔材,胡桃与胡桃楸属半环孔材。胡桃与胡桃楸在导管腔径和壁厚、早材木纤维腔径和壁厚、晚材木纤维腔径和腔径比6个性状间存在极显著差异,在早材管孔密度、双列木射线高度、早材宽度和晚材率4个性状间存在显著差异。聚类分析可知,胡桃楸和野核桃首先相聚,亲缘关系较近。     

应用FISH-AFLP技术分析105份樱桃种质资源的亲缘关系

为建立樱桃种质资源的FISH-AFLP技术体系并进行亲缘关系分析,本研究以国内外搜集的105份樱桃种质为对象,经DNA提取、EcoRⅠ/MseⅠ双酶切,再进行FISH-AFLP反应。扩增结果显示,筛选得到8对EcoRⅠ/MseⅠ多态性引物,可扩增出1 148条谱带,平均多态性比率98.61%。聚类分析和遗传多样性分析结果显示,105份樱桃栽培品种的遗传相似性系数为0.54～0.89,当阈值为0.68时,可分成7个AFLP群;有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.52、0.30、0.45,具有较高的遗传多样性。本研究结果可为今后樱桃品种鉴别和遗传多样性研究等提供理论指导。     

接骨木种质资源遗传多样性的ISSR分析

运用ISSR分子标记对24份接骨木属植物的遗传距离、亲缘关系进行分析。13条ISSR引物共扩增出3061条可统计条带,其中多态性条带3059个,多态位点百分率高达99.93%,表明接骨木属植物遗传多样性非常丰富。依据ISSR扩增结果,利用NTSYS-pc2.1e软件进行分析,24份接骨木样本的遗传相似系数在0.6772~0.8578。经UPGMA聚类分析,24份接骨木属植物分为2大类,国内接骨木优良单株聚类分析结果与其果实性状的相关性不显著;“金羽”接骨木与国内接骨木聚为一类,亲缘关系较近。     

基于ISSR标记的西南地区石斛资源亲缘关系分析

为石斛属种质资源保护与开发及新品种选育提供理论指导,采用ISSR分子标记技术对采自西南地区的23份石斛属植物和1份金石斛属植物资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,并采用非加权平均距离法(UPGMA)进行聚类分析。结果表明:从20条ISSR标记引物中筛选出11条扩增条带清晰的引物,共检测出151个扩增位点,平均每条引物扩增位点为13.7个;其中多态性位点148个,多态性条带比率为98.01%;24份石斛总扩增条带为1 084条,平均45.17条,其中多态性条带有1 012条,占比为93.4%;24份石斛材料遗传多样性指数为0.63～0.78;在相似系数0.68处将24份石斛材料分为7个类群。西南地区石斛资源的遗传多样性非常丰富。     

海南及粤西外来入侵植物假臭草染色体核型分析

对海南岛及粤西地区8个样区,3种生境（旷野、林缘和林中）假臭草（Praxelis clematidea）的染色体核型进行分析。结果表明,染色体均为二倍体,染色体数目2n=28。染色体核型表现为2A,2B,3B和3A。核型属较不对称类型,不同居群假臭草的居群亲缘关系与地理分布不完全一致,说明假臭草在入侵和传播过程中受到环境因子和人为干扰的影响较大。     

基于DNA条形码对粘虫四种近缘种的鉴定与亲缘关系分析

为开发快速、准确的粘虫Myth imna separata (Walker)近源种鉴定技术,通过线粒体COI基因DNA条形码技术对在野外采集的4种粘虫近缘种——白点粘夜蛾Leucania loreyi、淡脉粘夜蛾L.roseilinea、瘠粘夜蛾 L.pallidior和虚研夜蛾Aletia pseudaletiana的COI基因片段进行序列分析,并对4种粘虫近缘种同粘虫和GenBank中其它6种粘虫近缘种之间的亲缘关系进行了分析.结果表明,克隆得到白点粘夜蛾、淡脉粘夜蛾、瘠粘夜蛾和虚研夜蛾大小为658 bp的COI基因片段,与粘虫COI基因片段的核苷酸序列同源性依次为93.31％、92.86％、91.95％和90.88％,遗传距离分别为0.067、0.071、0.081和0.091;所编码的219个氨基酸序列同源性依次为100.00％、100.00％、99.09％和99.09％.与其它6种粘虫近缘种的COI基因片段序列分析中,白点粘夜蛾和淡脉粘夜蛾与粘虫、一点粘虫Mythimna unipuncta、仿劳粘夜蛾L.insueta、白脉粘夜蛾L.venalba聚为1个亚群,亲缘关系较近;瘠粘夜蛾和虚研夜蛾与白杖研夜蛾A.lalbum、角线研夜蛾A.conigera、秘夜蛾M.turca聚为1个亚群,亲缘关系较近.表明4种近缘种与粘虫的亲缘关系由远到近依次为白点粘夜蛾、淡脉粘夜蛾、粘瘠粘夜蛾和虚研夜蛾.     

42个苜蓿品种间亲缘关系的RAPD分析

应用RAPD标记,对42个不同苜蓿品种的亲缘关系进行研究。采用CTAB改良法可快速提取到较高质量苜蓿基因组总DNA用于RAPD扩增,并从RAPD反应中筛选出19个10碱基随机引物,总共扩增出220条带,其中138条呈多态性,占62.7%,82条为单态性带,占37.3%;利用MEGA2.1软件计算42个苜蓿品种遗传距离,进行UPGMA聚类分析,遗传距离在0.174~0.500之间,说明供试苜蓿品种间遗传距离较大,亲缘关系较远。遗传距离为0.435时,42个苜蓿品种可分为五类,不同苜蓿品种间的亲缘关系有较大的差异,表明RAPD标记可作为苜蓿品种亲缘关系判定的依据。这为苜蓿品种遗传改良、杂交亲本选配提供可靠的科学依据。     

利用FTIR和化学计量学对牛肝菌亲缘关系的研究

采用傅里叶变换红外光谱结合化学计量学对不同种牛肝菌亲缘关系进行研究,为该种群亲缘关系鉴定提供依据,同时为人工栽培牛肝菌奠定理论基础。采集12个种类72份牛肝菌样品的红外光谱,采用二阶导数(2D)、标准正态(SNV)变量和小波压缩(WC)等方法对牛肝菌的原始红外光谱进行优化处理,结合偏最小二乘判别分析(PLS-DA)建立鉴别模型。将PLS-DA得到的前8个主成分数据作为提取数据代入系统聚类分析(HCA),获得亲缘关系树状图。结果显示:12种牛肝菌的原始红外光谱较为相似,共有峰主要归属为蛋白质、多糖、纤维素和氨基酸等物质中OH、C=O、C-O-H、C=O、C-C等官能团的吸收峰。对比不同优化处理的鉴别结果,发现2D+WC预处理方法对不同种类牛肝菌区分效果较好。HCA亲缘关系树状图表明,按照物种层面划分,中华牛肝菌和远东疣柄牛肝菌亲缘关系最近,且2种牛肝菌与圆花孢牛肝菌亲缘关系较近;深褐牛肝菌和美味牛肝菌亲缘关系较近;小美牛肝菌和美柄牛肝菌亲缘关系较近,且2种牛肝菌与栗色牛肝菌亲缘关系较近。傅里叶变换红外光谱法可应用于牛肝菌的亲缘关系分析,能为野生食用菌的亲缘关系研究提供一种新方法。