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31.
十字花科植物CYP86MF同源基因的克隆及特征分析 总被引:3,自引:0,他引:3
用保守的特异引物进行PCR扩增,并结合RACE技术,从大白菜(Brassicacampestris L.)品种黄芽14,萝卜(Raphanus sativus L.)品种圆白和诸葛菜(Orychophrogmus violaceus)3个材料中扩增到3个完整的cDNA全长,分别命名为Bc-CYP86MF,RsCYP86MF和OvCYP86MF,它们的cDNA全长分别为1854,1818和1876bp,分别编码524,526和534个氨基酸残基。将所推导的氨基酸序列与数据库中已知基因进行排序,发现它们与拟南芥CYP86家族所有成员的氨基酸相似性都大于38%,可将它们归为细胞色素CYP86基因家族。BcCYP86MF和RsCYP86MF与CYP86C4亚家族氨基酸同源性均大于55%,则可归为CYP86C4亚家族,而OvCYP86MF与CYP86C3的同源性最高,为86.5%,应归为CYP86C3亚家族。根据氨基酸序列的排序结果构建的系统树表明,CYP450基因的氨基酸序列进化程度与物种的亲缘关系的远近相吻合。对蛋白二级结构预测结果发现,它们都具有细胞色素P450典型的保守结构域FNAGPRLCIG,而且氨基酸组成也很相似。 相似文献
32.
SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
对SSAP(特异序列扩增多态性;sequence-specific amplification polymorphism)在部分柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中的应用进行了研究,并对每个SSAP引物单独用于柿属植物遗传分析的性能作了探讨。基于5个逆转座子引物的25对SSAP引物组合在供试28份柿属(Diospyros L.)基因型中共扩增出1300个位点(多态位点93.38%),每对引物平均产生52个位点(含48个多态位点),表明SSAP是一种高多重比例系数(multiplex ratio)和高多态性的标记系统;经SSAP数据的UPGMA聚类和主坐标分析,原产中国、日本的柿种质(D.kakiThunb.)及柿的近缘种各自单独成组,该聚类结果与部分已知亲缘关系的试材十分吻合,表明SSAP技术可用于柿属植物亲缘关系研究。此外,在25对SSAP引物组合中筛选出3对具高信息含量的引物组合,将在柿属植物遗传关系研究中广泛应用。 相似文献
33.
34.
35.
采用8对微卫星引物对长江中下游流域武汉江段和鄱阳湖黄颡鱼群体的基因流进行了初步分析,用以初步评估长江中下游和鄱阳湖黄颡鱼之间的亲缘关系。结果表明:黄颡鱼鄱阳湖群体和长江中下游群体共享等位基因占总检测等位基因数的46.2%,长江群体特有等位基因占19.2%,鄱阳湖群体特有等位基因占34.6%。这说明,鄱阳湖黄颡鱼群体大部分与长江中下游群体类似,另外少部分可能与赣江或其他支流群体类似。 相似文献
36.
雅罗鱼亚科鱼类(鳡鱼、草鱼及赤眼鳟)的ISSR分子鉴定 总被引:2,自引:0,他引:2
用3个ISSR引物对同为雅罗鱼亚科鱼类的鳡鱼、草鱼及赤眼鳟进行简单重复序列区间扩增(ISSR)的遗传分析.试验发现:(1)3种鱼类的种间遗传相似度以鳡鱼与草鱼之间最高(0.7157),鳡鱼与赤眼鳟之间最低(0.3041);遗传分化系数(Gst)>0.9,且鳡鱼与草鱼的遗传分化系数最大(0.9806);UPGMA系统树显示3种鱼类分为2支,鳡鱼与草鱼首先聚在一起,最后与赤眼鳟聚类.(2)3个引物均具有种的特异性扩增带.其中引物ISSR8扩增的1550 bp和760 bp带,引物ISSR62扩增的700 bp带,引物ISSR76扩增的790 bp带为赤眼鳟的特异性谱带;引物ISSR8扩增的2000 bp和1875 bp带,引物ISSR62扩增的1380 bp带,引物ISSR76扩增的1240 bp与520 bp带为鳡鱼与草鱼的共有特异性谱带;引物ISSR8扩增的1190 bp带为鳡鱼与赤眼鳟的共有特异性谱带;引物ISSR8扩增的1340 bp与1000 bp,引物ISSR76扩增的2000 bp带为草鱼与赤眼鳟的共有特异性谱带.结果表明,鳡鱼、草鱼及赤眼鳟的遗传差异显著,分类地位至少在种的水平上,这与3种鱼的形态分类在属的水平是一致的,同时揭示了鳡鱼与草鱼的亲缘关系较赤眼鳟与二者的亲缘关系近;找到了3个引物共17条ISSR种内特异性标记和种间共享标记,可用于分子辅助分类和种质鉴定. 相似文献
37.
《果树学报》2017,(6)
【目的】从分子水平探究南丰柑橘种质间的亲缘关系。【方法】应用SSR技术对28份南丰柑橘种质进行基因组的多态性分析。【结果】从91对引物中筛选得到13对SSR引物,可区分全部供试材料。共扩增得到64个等位基因,平均每个位点4.92个等位基因。以遗传相似系数0.18为界,金柑属金柑单独聚为1类,柑橘属27份供试样品聚为1类。以相似系数0.59为阈值,27份柑橘属供试种质分为5个类群,其中南丰蜜橘品种群(包含小果系、大果系、桂花蒂系、早熟系)所有20份供试种质与‘蜜广’聚为一类,‘小叶广’‘火广’‘火橘’聚为一类,‘红广’‘红橘’‘本地早橘’各为一类。【结论】南丰广橘品种群中‘蜜广’与南丰蜜橘品种群有较近的亲缘关系,而‘红广’与亲本南丰蜜橘和‘红橘’的亲缘关系均较远。‘小叶广’‘火广’和‘火橘’亲缘关系较近。 相似文献
38.
39.
不同来源花生品种的ISSR分析及亲缘关系研究 总被引:1,自引:0,他引:1
利用13对ISSR引物对28个栽培种花生品种进行PCR扩增,研究这些品种的DNA多态性及其亲缘关系。结果表明,有7对引物检测到明显的多态性,从28个花生品种中扩增出90条带,其中多态性带达到79条,多态性比率为87.8%,平均每个引物可扩增出12.86条带,11.29条为多态性条带。品种间的遗传相似系数值在0.411~0.800之间,平均为0.620。在UPGMA聚类分析简单匹配系数值为0.57处,可把28个花生品种分成3个品种群。由此表明,这些不同来源的花生品种具有较高的DNA多态性,亲缘关系不同。 相似文献
40.
根据曼陀罗属核糖体基因转录间隔区(ITS)序列设计通用引物,得到33个不同来源的曼陀罗属植物的ITS序列,并以小天仙子(Hyoscyamus bohemicus)为外群,应用遗传距离与系统树分析法对曼陀罗属植物之间的分类进行了初步探讨。结果表明:在供试样品中,紫花曼陀罗(Datura tatula)和曼陀罗(Daturastramonium)的ITS序列完全相同;多刺曼陀罗(Datura ferox)、栎叶曼陀罗(Datura quercifolia)和曼陀罗(Datura stramonium)之间的亲缘关系很近;紫花曼陀曼(Datura tatula)、曼陀罗(Datura stramonium)、无刺曼陀罗(Datura inermis)和光滑曼陀罗(Datura laevis)4个种间不存在遗传距离;传统分类中曼陀罗属的Dutra亚属内除光曼陀罗(Datura leichhardtii)和异色曼陀罗(Datura discolor)在ITS序列表现为比较独立的2个种外,其他各种间的亲缘关系也较近;在ITS序列上湿地曼陀罗(Datura ceratocaula)与曼陀罗(Daturastramonium... 相似文献