贵州地方山羊BMPR-ⅠB基因启动子区多态性及生物信息学分析

为探究骨形态发生蛋白受体ⅠB（bone morphogenetic protein receptor ⅠB，BMPR-ⅠB）基因启动子区多态性及其与繁殖性状的相关性，本试验以贵州3个地方山羊品种（黔北麻羊、贵州黑山羊及贵州白山羊）为研究对象，通过构建混合DNA池PCR产物直接测序技术筛选SNPs位点，并采用多种生物信息学软件预测SNPs位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响。结果显示，BMPR-ⅠB基因启动子区存在4个SNPs位点：g.29893005 T > C、g.29893016 C > T、g.29893729 C > G和g.29894370 C > T。生物信息学软件预测得到BMPR-ⅠB基因核心启动子区和CpG岛，SNPs位点导致转录因子结合位点发生改变，g.29893005 T > C和g.29893016 C > T突变使原来的转录因子结合位点Sp1消失；g.29893729 C > G突变使原来转录因子结合位点AP-1消失，从而产生新的转录因子结合位点USF；g.29894370 C > T突变产生新的转录因子结合位点C/EBPalp，使原来的转录因子结合位点Sp1改变为C/EBPalp和Sp1。由此推测，SNPs位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。     

黔北麻羊FABP3基因多态性及其与生长性状的相关性研究

旨在探究脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因在黔北麻羊中的遗传多态性,进一步揭示FABP3基因与黔北麻羊生长性状间的关联性,为今后运用分子标记辅助育种方法提高黔北麻羊的生长性状提供理论依据。本研究以120只6月龄黔北麻羊为试验对象,采用PCR产物直接测序技术检测FABP3基因全部外显子区的遗传多态性,并与体重、体高、体斜长、胸围、管围等生长性状进行关联性分析。结果:在黔北麻羊FABP3基因第5外显子和3′非翻译区筛选出2个SNPs位点,分别为g.13665051C>T和g.13664737G>A,其中g.13665051C>T位点为同义突变,产生3种基因型:CC、CT和TT,g.13664737G>A位点产生3种基因型:GG、AG和AA,卡方(χ²)检验结果显示,这2个SNPs位点处于中度多态且在黔北麻羊群体中均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。关联分析显示,g.13665051C>T位点中CT基因型个体的体高、体斜长、胸宽和管围显著高于CC和TT基因型个体(P<0.05);CT基因型个体的胸深、胸围显著高于TT基因型个体(P<0.05),g.13664737G>A位点中不同基因型的生长性状指标均未达到差异显著(P>0.05)。因此,推测黔北麻羊FABP3基因外显子5的g.13665051C>T突变位点可能是影响个体生长性状的重要位点。     

贵州高原草甸冬季放牧山羊的主要采食植物种类及营养价值

为贵州高原草甸冬季放牧山羊营养研究和科学补饲提供参考依据,对贵州高原草甸冬季放牧山羊主要采食植物种类及其营养成分进行测定,采用灰度理论综合分析方法分析评价山羊主要采食植物的营养价值。结果表明：冬季山羊采食植物种类为33种,主要采食植物有白三叶、光叶紫花苕,平枝栒子、扁核木、小果蔷薇、覆盆子叶、一年蓬、大籽蒿、千里光、细柄草、鸭茅、繁缕、马桑、密蒙花等14种;营养价值相对较高的植物有野油菜、萝卜菜、光叶紫花苕、羊奶子、鸭茅、大籽蒿、马桑、白三叶、一年蓬、野棉花、繁缕、牛奶子、扁核木、大橿子树叶、千里光、鸡树条、无刺橿子树叶和密蒙花。贵州高原草甸冬季山羊采食的牧草种类丰富,营养价值较高,可适度放牧利用。     

贵州本地山羊POLRMT 基因启动子区 SNP 的生物信息学分析

为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为 试验对象,探究肉质相关基因POLRMT 启动子区SNP 位点对肉质品质的影响。通过构建DNA 池筛选出SNP 位点, 并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG 岛及转录因子。结果表明,POLRMT 基因启动子区存在2 个 SNP 位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT 基因核心启动子范围发生改变,SNP 位点导致部分转录因子结合位点消 失,MethPrimer预测到CpG 岛增加1 个。     

紫花苕+稻草添加尿素与有益微生物的混贮效果

试验用新鲜紫花苕Vicia villosa与稻草(比例1:1)分别添加尿素和尿素 有益微生物进行混贮,并测定了混贮料在30,45,60 d的感官性状、营养成分和有机酸含量.结果表明,2种方法处理都能使混贮饲料的CF,NDF和ADF含量有降低趋势,有机酸、乳酸、乙酸、延胡索酸、柠檬酸含量提高;添加尿素 有益微生物混贮料与单一添加尿素混贮相比,pH值明显降低(60 d混贮料pH值分别为4.3,4.8),总有机酸、乳酸、乙酸、延胡索酸、柠檬酸含量明显提高(青贮60 d分别提高7.29%,0.66%,0.48%,0.41%和0.51%).说明添加有益微生物有加速混贮料发酵产酸,加快青贮饲料酸化,缩短青贮发酵过程的作用.结果表明,添加尿素 有益微生物更有利于提高紫花苕 稻草混贮料的青贮效果.     

黔北麻羊体尺与体重的相关分析

为黔北麻羊的品种选育和种质资源鉴定提供理论依据。通过黔北麻羊体尺和体重相关回归分析,建立了体尺和体重的最优回归模型。结果表明:胸围作为黔北麻羊体重预测和选择的主要指标。其胸围和体重最优回归模型为y=0.794X4。     

贵州黑山羊独立生长因子1B基因cDNA克隆与生物信息学分析

选择与羊同源性较高的牛独立生长因子1B(GFI1B)基因序列设计特异性引物,提取贵州黑山羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对GFI1B基因进行克隆测序及序列分析。结果表明:首次克隆了贵州黑山羊GFI1B基因cDNA序列996 bp,GenBank登录号为JN662390,编码331个氨基酸。贵州黑山羊GFI1B基因与牛的同源性高达97.0%。聚类分析显示:哺乳动物、禽类和两栖类各为一类。生物信息学分析表明:山羊GFI1B分子包括1个低组分复杂性区域、6个锌指结构域ZnF-C4。同时,预测结果还表明GFI1B分子不包含信号肽序列且没有跨膜螺旋结构域,26个磷酸化位点,蛋白糖基化位点有7个。     

利用DNA池对3个山羊品种CXCL10基因多态性的研究

为了研究3个山羊品种(黔北麻羊、内蒙古绒山羊、关东奶山羊)CXCL10基因多态性,试验采用构建DNA池并直接对其测序的方法进行分析。结果表明:快速筛查到2个与繁殖性能相关的单核苷酸多态性(T-131-C,G-661-A)。进一步利用测序图中的SNP等位基因峰高的比值估算各山羊品种等位基因的频率。