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81.
为系统评价中国地方鸭品种或遗传资源的遗传多样性,对其进行有效保护,并使保种经费得到最为有效的分配和使用,采用边际多样性方法,并结合STR分型的DNA遗传距离、灭绝概率等对中国21个地方鸭品种或遗传资源的品种贡献率、边际多样性及保护潜力进行分析。结果表明:中山麻鸭、广西小麻鸭、吉安红毛鸭的灭绝概率最高,分别达到0.67、0.59和0.59;临武鸭、金定鸭、高邮鸭的灭绝概率最低,分别为0.15、0.18和0.19;群体现实多样性为7.718 6,500年后群体期望多样性为5.138 4±1.150 2;中国番鸭的边际多样性最大(-2.189 6),占期望多样性的42.61%;广西小麻鸭次之(-0.484 9),占期望多样性的9.44%;金定鸭的边际多样性最小(-0.119 2),占期望多样性的2.32%。番鸭的保护潜力最大(0.612 0),广西小麻鸭次之(0.287 6),金定鸭的保护潜力最小(0.021 0)。该研究计算的保护潜力可为制定中国地方鸭品种或遗传资源的保护顺序提供了理论参考。 相似文献
82.
利用16个微卫星标记分析6个鸭品种的遗传多样性 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】为系统评价润州凤头白鸭、连城白鸭、北京鸭、樱桃谷鸭、吉安红毛鸭和于田麻鸭6个鸭品种的遗传多样性。【方法】利用16个微卫星位点(STR分型技术)对6个鸭品种(各30只)的遗传多样性参数进行检测并进行聚类分析。【结果】16个微卫星位点共检测到141个等位基因,多态信息含量(PIC)介于0.25~0.60之间,其中,9个座位为高度多态位点(PIC0.50),7个座位为中度多态位点(0.25PIC0.50);6个鸭品种在微卫星座位的平均杂合度在0.385 4~0.518 7;聚类分析结果表明,润州凤头白鸭先与于田麻鸭聚为一类,再与连城白鸭聚为一类;北京鸭先与樱桃谷鸭聚为一类,再与吉安红毛鸭聚为一类。【结论】6个鸭品种遗传多样性丰富,反映了中国地方鸭品种间遗传多样性的差异。 相似文献
83.
84.
中国南方地区7个山羊群体的遗传分化与基因流分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用23对微卫星标记分析了中国南方7个山羊群体的遗传分化、基因流、遗传分化程度与地理距离之间的关系,同时利用DC遗传距离构建系统树和STRUCTURE进行动态聚类。结果表明:7个山羊群体总近交系数(Fis)为-7.73%,群体内近交系数(Fis)为-26.5%,群体间基因分化系数(Fis)为14.84%,3个指标均达到极显著水平(P〈0.001),说明这7个山羊群体总体上和群体内杂合度较高,群体间遗传分化较明显,14.84%的遗传变异来自于群体间,85.16%遗传变异来自于群体内个体间的差异。7个山羊群体每世代两群体间有效迁移个体数(Nem)变化范围为0.8313(宜昌白山羊与黄淮山羊)到3.4103(马头山羊与湘东黑山羊),平均为1.5770。7个山羊群体间的基因分化程度与地理距离和遗传距离相关不显著(P〉O.05)。宜昌白山羊、马头山羊、湘东黑山羊、福清山羊、戴云山羊、黄淮山羊、长江三角洲白山羊群体中属于各自采样群体的概率分别为99.1%、98%、96.2%、96.6%、98.7%、98.7%和98.7%。同时,STRUCTURE软件通过变化的分群数体现的聚类情况与用DC遗传距离所构建的系统聚类图结果一致。研究结果表明:这7个山羊群体间的遗传分化主要是自然选择作用的结果。 相似文献
85.
以鲁西黄牛和渤海黑牛(各30头)12个微卫星座位数据为基础,利用系统树分析法、最大似然法及Bayes方法,比较不同方法对个体识别效率的影响。结果表明:当利用12个微卫星座位和6个低杂合度位点数据时,3种个体识别方法鉴定的准确性均为100%。但利用6个高杂合度座位时,Bayes方法的准确性最高(83.33%),最大似然法次之(76.67%),系统树分析法最低(71.67%)。结果表明,基于Bayes理论的个体识别方法最准确,是进行同类研究的首选工具,而系统树分析法和最大似然法可以作为其补充加以应用。 相似文献
86.
试验旨在进一步完善高邮鸭基因组结构信息,探索高邮鸭双黄蛋产蛋性能的调控机制。通过高通量测序技术对高邮鸭双黄蛋高、低产组卵巢组织转录组进行RNA-Seq测序,对测序数据进行质控和注释,筛选与高邮鸭双黄蛋产蛋性能相关的SNP位点。测序获得的初始数据(raw reads)进行系列质控筛选,6个高邮鸭卵巢组织分别获得84 540 140~87 479 660个有效数据(clean data),70.79%以上的测序数据被已注释的鸭基因组数据覆盖;在所覆盖的基因组数据中,检测到位于基因外显子区域的108 260~116 478个SNP位点(转换和颠换类型),转换类型总数极显著高于颠换类型总数(P<0.01)。利用KEGG数据库对筛选出的SNP位点所在基因进行信号通路分析,筛选出前20条信号通路,其中包括核糖体信号通路、碳代谢信号通路和氨基酸生物合成信号通路等。试验对双黄蛋高、低产组高邮鸭的卵巢进行了RNA-Seq测序分析,为发掘高邮鸭双黄蛋产蛋性能相关SNP位点提供了基础,为进一步研究高邮鸭双黄蛋产蛋性能的调控机制提供了新的数据支撑。 相似文献
87.
88.
野生鹌鹑与家鹑群体遗传共适应性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究以野生鹌鹑和家鹑两个群体中的四个多型中性结构基因:乙醇脱氢酶(Adh)、酯酶-D(Es-D)、α-乙二醇磷酸脱氢酶(α-Gpd)和酯酶(Es)进行遗传共适应研究。结果表明:①在野生鹌鹑群体中,遗传共适应系数占遗传不平衡系数的42.9%~79.6%;在家鹑群体中,遗传共适应系数占遗传不平衡系数的35.7%~99.4%;②在家鹑群体中,α-Gpd-Es两位点之间的遗传共适应起着与连锁不平衡相反的作用;③起源于野生鹌鹑的家鹑与野生鹌鹑已经产生了一定的遗传分化;④遗传共适应是影响中性结构基因遗传不平衡的一个重要因素。 相似文献
89.
为了探讨连城白鸭不同组织中主要矿物元素的沉积规律及相关基因mRNA的表达水平,本研究利用原子荧光光度计,分别测定了0、21、35、49和63日龄连城白鸭胸肌、腿肌、肝脏、背皮和胫骨组织中的镁、钾、铁、锌和硒等矿物元素含量,采用qRT-PCR法分析不同日龄肝脏组织中各矿物元素相关基因表达水平及其与矿物元素沉积之间的关系。结果表明:镁与钾元素的沉积规律在所有组织中基本一致,且两者呈显著性正相关(P<0.05),在胸肌、腿肌和肝脏组织中,几乎所有矿物元素的含量在49~63日龄达到峰值(P<0.05)。镁元素相关基因TRPM6和TRPM7在21日龄时的表达水平最高(P<0.05);钾元素相关基因ATP1A1和ATP1B1在0日龄时的表达水平最高(P<0.05);铁元素相关基因FTH1的表达规律表现为先显著性下降再显著性升高的趋势,在35日龄时的表达水平最低(P<0.05);锌元素相关基因ATP6和ATP8分别在0和21日龄时的表达水平最高(P<0.05);硒元素相关基因GPX1和GPX4均在0日龄时的表达水平最高(P<0.05)。此外所有元素相关基因的表达水平与元素在肝脏组织中的沉积量呈负相关,但不显著(P>0.05)。综上,镁元素和钾元素可作为联合指标用于连城白鸭优质品系的精准选育;49~63日龄可作为连城白鸭最佳出栏日龄的参考日龄。 相似文献
90.
为探讨鸡Pax3基因在胚胎阶段以及不同生长阶段的时空表达规律,试验选取同一批鸡胚(8、16、20 d和21 d)以及2、4、6、8、10、12周龄的如皋鸡各6只,公、母各半,采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR技术分析了Pax3基因在胸肌、腿肌中的表达规律。结果表明:胸肌和腿肌组织中公、母鸡表达水平变化趋势一致,无性别效应;在胸肌组织中,Pax3基因在8 d的鸡胚中表达水平最高,随后降到最低,出雏前缓慢上升,出雏后随着周龄的增加表达水平保持在较低状态。但在腿肌组织中,Pax3基因的表达高峰在出雏前(20 d和21 d),出雏后随周龄的增加表达量持续降低,并保持在较低的水平。表明Pax3基因表达存在组织特异性,且集中在胚胎期大量表达,出雏后表达水平较低,揭示该基因可能对鸡肌纤维生长发育存在调控作用。 相似文献