紫色叶用莴苣遗传多样性及亲缘关系的TRAP分析

利用TRAP标记对47份紫色叶用莴苣种质进行亲缘关系及遗传多样性分析。20对引物组合共扩增出多态性条带430条,多态性比率(PPB)为67.08%。47份紫色叶用莴苣材料的遗传相似系数在0.7063~0.9828之间,Nei’s基因多样性指数(He)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.2553和0.3976,遗传多样性水平较低。聚类分析结果表明,47份紫色叶用莴苣材料分为2大类群,第Ⅱ类群又分为5个亚类,叶片形态相似的种质基本上聚在一起,亲缘关系较近。     

芥菜种质资源的RAPD和ISSR分析

利用RAPD和ISSR标记对28份芥菜种质资源进行遗传多样性分析,20个RAPD引物共扩增出162条清晰的谱带,其中140条显示多态性,平均每个引物扩增出7.0条多态性谱带.18个ISSR引物共扩增出143条清晰的谱带,其中多态性谱带124条,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于RAPD和ISSR两种标记,利用UPGMA分别构建了28份芥菜资源的聚类树状图.结果表明,RAPD和ISSR分别聚类以及两种标记混合聚类均将28份芥菜种质分为3类:第Ⅰ类群中包括了15份种质;第Ⅱ类群中包括了9份种质;第Ⅲ类群中包括了4份种质.     

冬瓜和节瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD分子标记技术对41份冬瓜和节瓜种质资源进行遗传多样性分析。从455条随机引物中筛选出23条能产生稳定多态性扩增谱带的引物用于RAPD分析,共产生143条扩增谱带,其中多态性谱带81条,多态性检测率为56.6%,表明冬瓜和节瓜种质资源在分子水平上具有丰富的遗传多样性。用NTSYSpc软件处理RAPD数据,41份材料间的遗传相似系数在0.60～0.99之间。聚类分析结果可将供试材料分为6大类群9个亚类,主坐标分析可将供试材料分为6大类群10个亚类。两种分类方法的结果基本一致。     

利用ISSR分析澳洲坚果的亲缘关系

 从100条ISSR引物中筛选出19条重复性好,扩增条带清晰的引物对17份澳洲坚果种质进行亲缘关系分析。19条引物共扩增出369个位点,多态性位点249个（67.5%）。利用UPGMA法得到的聚类的结果表明17份种质分为4个类群,所有夏威夷选育出的品种在最大的一个类群中归于两个亚类,而在澳大利亚选育出的品种则分别聚为独立的类群,因此推测夏威夷选育出的品种很可能起源于两个遗传多样性不同的群体;而澳大利亚选育的品种其遗传背景和选育史与夏威夷的品种不同。     

丝瓜种质资源遗传多样性的形态和RAPD标记分析

应用形态标记和RAPD标记对26份丝瓜种质材料进行遗传多样性和亲缘关系分析。所观察的44个形态性状变异系数为5.27 %～107.00 %,平均变异系数为32.75 %。从200个随机引物中筛选出16个引物,共扩增出145条带,多态性带有125条,多态性比率为86.21 %,平均Shannon多样性信息指数为 0.325。基于形态标记的聚类分析将26份丝瓜种质分为普通丝瓜和有棱丝瓜两大类。基于RAPD标记的聚类分析将26份丝瓜种质也分为两大类,但有2份有棱丝瓜种质和普通丝瓜聚为了一类,与形态标记聚类结果不一致。     

辣椒种质遗传多样性的RAPD分析

采用11个RAPD随机引物对37份辣椒材料进行PCR扩增。共扩增出51条谱带,其中多态性条带36条,多态性检测率占70.6%,不同引物扩增的条带在3~7条不等。结果表明:通过聚类分析37份辣椒种质供分为5个类群,每类群的种质亲缘关系较近,但遗传关系与地域距离并无明显的相关性。     

茄子耐盐种质亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD标记对14份耐盐茄子种质资源进行遗传多样性分析。结果表明：从100个引物中筛选出10个多态性较好的引物,共扩增出102条带,多态性条带所占的比例为77.45%。聚类分析结果显示：14份耐盐茄子材料的遗传相似系数在0.316～0.975之间|在遗传相似系数0.47处可将14份耐盐茄子材料分为3大类,大部分种质资源（85.71%）都聚在第3类（栽培种）,表明收集到的茄子耐盐种质亲缘关系较近。     

31份野生树莓资源的RAPD分析

用RAPD技术分析了31份野生树莓资源的亲缘关系,从100个A系列随机引物中选出了15个多态性高、分辨能力强的引物。将这15个引物应用于31份野生树莓材料,共扩增出182条谱带,其中170条为多态性标记(占93.41%),平均每个引物扩增多态性谱带12.13条,表明不同树莓资源基因型间存在着极为丰富的遗传多样性。基于RAPD的扩增结果建立UPGMA聚类分析树状图,31份野生树莓资源在遗传距离0.5100处被划分为4个类群。从分子水平研究了树莓属资源的亲缘关系,为树莓种质资源的保存和利用及其杂交亲本的选配提供了依据。     

24个大果沙棘品种的RAPD分析

为了解沙棘种质资源的遗传多样性和品种间的亲缘关系,以24个大果沙棘品种为材料,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法进行沙棘的遗传多样性分析。从120个随机引物中筛选出多态性丰富的18个引物用于扩增反应,在24个大果沙棘品种中检测到171个RAPD位点,其中多态性DNA带112条,多态位点百分比为65.5%,表明大果沙棘品种具有丰富的遗传多样性;在RAPD分析的基础上,对大果沙棘品种进行了聚类分析,结果表明,以相似系数0.58处作为分界,可将供试的24份大果沙棘种质分为4类。     

芫荽遗传多样性RAPD分析

以96份芫荽为试材,采用RAPD分析方法,研究了芫荽种质资源遗传多样性。结果表明:从300条随机引物中筛出23条扩增性强、清晰度高和稳定性好的引物,扩增出53条带,其中34条为多态性带,多态性比例64.2%。通过聚类分析,生成96份芫荽亲缘关系树状图,在遗传距离0.50处,试材划分为6类。RAPD分析揭示了芫荽的遗传背景并为其分类提供了依据。     

豆瓣菜种质资源遗传多样性的RAPD和ISSR分析

以8个豆瓣菜的品种为试材，用筛选出的79个RAPD引物和34个ISSR引物对这8个品种的基因组DNA进行扩增，分别扩增出361条和179条谱带，每个引物扩增出的带在3～10条之间，平均每个引物扩增出约5条带。根据所得的条带进行聚类分析，两种标记产生的聚类图存在一些差异，但它们都可以较好地将8个品种按亲缘关系的远近划分为3个不同的类群。Mantel测试得出相关系数r=0．58155，表明RAPD和ISSR两种分子标记技术的相关度很低。     

不同生态类型西瓜种质资源遗传多样性的SSR分析

采用SSR分子标记技术对96份不同生态型西瓜种质资源的遗传多样性进行研究。从398对引物中筛选出38对扩增条带清晰、多态性高的引物分析供试材料,共得到7043条清晰可辨条带,其中多态性条带826条,占11.7%。平均每对引物对96份材料扩增出185.34条带,其中21.74条具有多态性。96份材料间的相似系数为0.42～0.99。聚类分析结果表明,野生西瓜与栽培西瓜的亲缘关系较远。在栽培品种内华北生态型、华南生态型和西北生态型西瓜的亲缘关系较近,说明我国西瓜种质资源同源性较高,遗传基础狭窄,有必要引入更多种质资源以拓宽西瓜育种背景。     

30份莲种质资源的RAPD遗传多样性分析

采用RAPD分子标记技术对30份莲(Nelumbo nueifera Gaertn.)种质资源的遗传多样性进行鉴定.筛选出14对有效引物进行PCR扩增,共产生2 146条带,其中有1 516条为多态性条带,各对引物的平均多态性条带为108.29条,扩增条带的多态率达70.64％.对所得到的30份莲种质资源的RAPD图谱...     

南瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析

 应用RAPD技术对70份南瓜种质进行遗传多样性分析, 从100条随机引物中筛选出21条引物, 共扩增出168条带, 其中157条为多态带, 比率为93.5%。系统聚类分析将70份南瓜种质分为3大类: 中国南瓜、美洲南瓜、印度南瓜, 与传统分类学的结果相符。同时在3大类群内又将种质进行细分,第1类分为3组, 第2类分为6组, 第3类分为5组, 其结果与地域来源和形态特征有一定的相关性。主成分分析与系统聚类分析结果基本一致, 但系统聚类分析在揭示密切相关的个体间的关系上能提供更丰富的信息。     

甜瓜种质资源遗传多样性的SSR 分析

利用SSR 分子标记技术对72 份甜瓜种质资源及育种材料进行DNA 指纹分类及亲缘关系研
究,20 对SSR 引物共扩增产生76 个多态性位点,平均每对引物产生3.8 个多态性位点。聚类结果将72 份
甜瓜种质资源分为7 个类群,其中类群I 包括新疆本地资源及几乎全部自育甜瓜种质资源64 份材料,这
说明本试验所选用的新疆厚皮甜瓜种质资源遗传背景比较狭窄。     

应用SSR标记进行部分黄肉桃种质鉴定和亲缘关系分析

以116份黄肉桃种质和19份其它桃或桃近缘种种质为试材,利用定位于李属参考图谱上的SSR标记,进行遗传多样性评价及亲缘关系分析。SSR扩增结果表明,筛选出的28对SSR引物共扩增出206个等位基因,其中多态性等位基因159个（占76.56%）。聚类结果表明,在相似系数为0.82时,黄肉桃资源在聚类图上呈两组：美洲、欧洲和亚洲育成黄桃品种聚为一组（Ⅰ）,中国地方黄桃品种中唯‘西安杏瓤桃’和‘天津黄肉’出现在这一组;来源于云南、华北、西北地区的中国地方黄桃品种聚为另一组（Ⅱ）。在相似系数为0.87时,育成黄桃品种（Ⅰ）分为8个亚组,美洲育成品种分布在所有8个亚组中,欧洲育成品种分布在Ⅰ-2、Ⅰ-3和Ⅰ-4亚组,而亚洲育成品种仅分布在Ⅰ-3和Ⅰ-4亚组;亲本相同的育成品种在聚类图中临接或出现在较近的位置,育成品种的聚类结果与品种的系谱关系基本吻合。在相似系数为0.87时,中国地方黄桃品种分为7个亚组,西南黄桃和西北黄桃存在一定的组群界限,来自西南的黄桃地方资源主要分布在Ⅱ-1和Ⅱ-5亚组,而来自西北的黄桃地方品种主要出现在Ⅱ-2、Ⅱ-4和Ⅱ-7亚组。品种群的聚类结果表明,亚洲育成品种与美洲育成品种间亲缘关系最近,其次为欧洲育成品种;中国地方黄桃品种与育成品种间亲缘关系较远。     

利用甜瓜SSR标记分析常见葫芦科作物亲缘关系

试验以18种葫芦科作物为材料,用SSR法对其亲缘关系进行分析。结果显示：57对SSR引物共检测到240个多态性位点,平均每种引物扩增出位点4．4个,变化范围1～8个。18种葫芦科作物的遗传距离变化范围在0．1065～0．4537之间,平均遗传距离为0．227。等位基因变异的多态性信息含量（PIG）在0．2392～0．8171之闻,平均为0．6326。西葫芦中的金香蕉与白西葫芦遗传距离最小,亲缘关系最近;鲍鱼瓜和W1998遗传距离最大,亲缘关系最远。甜瓜基因组SSE标记引物在南瓜、西葫芦、西瓜和丝瓜等葫芦科作物上具有一定的通用性。