番鸭随机扩增多态性DNA及遗传多样性研究

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术分析番鸭的遗传多样性,20个引物共扩增出164条带,分子量约在200 ～2 000 bp之间,番鸭20个个体间遗传距离为0．4572～0．0177,群体内个体间遗传相似度(F)为0．9823～0．5428,遗传多样性指效(Ho)平均为0．1639．结果表明番鸭DNA的同源性高,品种的纯度保持较好．     

大口黑鲈养殖群体遗传多样性的分析

用RAPD技术对养殖的大口黑鲈M icropterus salm oides群体的遗传多样性进行了分析,即用20个随机引物对30个个体的基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出2790条DNA片段,平均每个个体扩增出93条带。在检测到的93个位点中,多态位点数为49个,占52.7%,标记的分子量为0.2~3kb。个体间最大的遗传距离为0.4533,最小的遗传距离为0,其中有27个样品间的遗传距离较小(0.16~0),部分样品之间的遗传距离为0;有3个样品的遗传距离较大,表明大口黑鲈间的相似度较高,遗传多样性较少,但也有少数变异个体。30个个体的平均遗传距离为0.0796±0.1265,与胭脂鱼、黄颡鱼、鳑鮍、鲢、草鱼等其它淡水鱼类相比,它们的遗传多样性水平相仿。     

大、小兴安岭两个不同东北松鼠群体遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD技术，分析了采自于我国大、小兴安岭地区的东北松鼠不同群体间的遗传多样性。结果表明：大兴安岭群体内个体间平均遗传距离为0．2823，小空安岭群体个体间平均遗传距离为0．3198，而大、小兴安岭不同个体间的平均遗传距离为0．4918，表明群体间遗传变异程度较高。     

黔北麻羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份黔北麻羊个体基因组进行RAPD分析．结果共扩增出253条带,其中多态带为141条,多态频率在30．00%～75．00%之间,平均多态频率为55．73%．单个引物获得的扩增带数在2～14条之间,平均每条引物扩增出9．37条带．扩增带分子量范围在210～2700bp．Nei氏公式计算品种内个体间遗传相似性指数在0．7290～0．9377之间,平均值为0．8634．遗传距离指数在0．0623～0．2710之间,平均值为0．1367．结果表明黔北麻羊具有较丰富的遗传结构．     

雅江报春天然居群RAPD遗传多样性

用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记检测3个雅江报春天然居群的遗传多样性。结果表明,28个引物共扩增出173条片段,平均每个引物扩增出6条,其中多态性带纹为82条(47·4%)。材料间的平均遗传距离为0·4584,17个植株可被聚为四类。居群间随海拔差异的增大,遗传距离增大,遗传关系较远。居群内木格措居群遗传多样性较高,木格错居群与理塘居群遗传关系较近,康定居群与木格错居群分离出差异较大的个体。     

花椒种质资源的RAPD分析

利用30条RAPD引物对21份花椒种质资源的DNA进行了扩增,计算了样品间的遗传距离并进行了聚类分析。共扩增出257条谱带,其中多态性谱带186条(占72.37%),平均每条引物扩增多态位点6.2个。21份种质材料间均存在遗传差异,其中韩城红葡萄椒和韩城大红袍遗传距离最近,平均遗传距离为0.290 4;凤县野生构椒和韩城白葡萄椒的遗传距离最远,平均遗传距离为0.833 6;同一种质资源内个体间存在不同程度的差异,其中山东大红袍个体间差异最大,个体间平均遗传距离为0.087 2,但临夏一号和凤县大红袍2份种质内个体间均未检测到差异。当遗传距离取0.529 7~0.576 3时,21份花椒种质资源可以聚类为3组,当遗传距离取0.496 3~0.503 7时,可聚类为7组。RAPD多态性分析从分子水平上反映出了花椒种质资源复杂的遗传背景;为花椒品种的鉴定与分类研究提供了依据。     

巨桉种源遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记方法对巨桉11个种源80个个体进行了遗传变异的比较分析，通过20个10bp随机引物的扩增，共检测到149个位点，其中89个为多态性标记位点，总的多态位点百分率为59．73％，各个种源多态位点百分率较高、为42．86％～55．89％，多态位点最多的是8号种源，最低的是6号种源，Shannon表型多样度估测值的统计表明，遗传多样性主要存在种源内部，遗传变异在种源间占28.74％。在种源个体间占71．26％，Shannon表型多样度估测值在种源间为0．172O～0．2650，平均为0．2373，8号种源的遗传多样性最高，6号种源的遗传多样性最低；种源间的遗传距离为0．039l～0．1344。平均为0．0817，这些遗传变异为巨桉优良种源的早期选择提供了科学依据。     

荣昌猪与新荣昌猪Ⅰ系遗传变异的RAPD标记分析

利用60个随机引物对荣昌猪与新荣昌猪Ⅰ系的基因组DNA进行RAPD分析,其中35个引物可扩增出清晰的RAPD带型,1个引物A1表现出明显的遗传多态性。结果表明：荣昌猪和新荣昌猪Ⅰ系群内平均相似系数分别为0．787,0．80;平均遗传距离为0．213,0．198,两品系间平均相似系数为0．795;平均遗传距离为0．206,两品系内及品系间都存在着DNA分子水平上的差异。     

我国引进萨罗罗非鱼群体的AFLP遗传指纹

应用AELP技术初步分析了我国引进的萨罗罗非鱼群体的遗传指纹特征，8对选择性引物在25个个体中共检测到247个扩增片段，每对引物扩增出的片段数目为27～34，平均扩增片段数目为30．9。群体的平均多态位点比例为16．6％。共检测出25个基因型，每个个体含有独自的基因型。群体内个体间的遗传相似度为0．929～0．995，群体遗传变异较小。本研究结果可为我国萨罗罗非鱼的种质保存与管理提供科学依据。     

我国引进萨罗罗非鱼群体的AFLP遗传指纹

应用AELP技术初步分析了我国引进的萨罗罗非鱼群体的遗传指纹特征，8对选择性引物在25个个体中共检测到247个扩增片段，每对引物扩增出的片段数目为27～34，平均扩增片段数目为30．9。群体的平均多态位点比例为16．6％。共检测出25个基因型，每个个体含有独自的基因型。群体内个体间的遗传相似度为0．929～0．995，群体遗传变异较小。本研究结果可为我国萨罗罗非鱼的种质保存与管理提供科学依据。     

槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析

 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值，以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况，研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析，从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果15条引物共产生105种扩增片段，多态片段95条，平均每条引物的扩增带数为7，各引物多态性片段范围在2～12之间，多态频率在40%～100%之间，多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。     

神农架4个珙桐居群遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对神农架地区4个居群28个珙桐（Davidia involucrate Baill.）个体进行了遗传多样性分析.16个10 bp寡核苷酸引物共检测到87个位点,多态位点49个,多态百分率56.3％,而居群平均多态位点百分率为30.2％.用POPGENE对数据进行了分析,结果显示:居群的平均Nei’s基因多样性为0.111 8,Shannon’s遗传多样性信息指数为0.165 1,总的居群基因多样性为0.169 2,基因分化系数为0.339 2.这表明神农架地区珙桐的遗传多样性较低,其遗传变异以居群内遗传变异为主.      

结球甘蓝体细胞无性系变异的RAPD分析

以结球甘蓝强力50原生质体再生植株和无菌苗下胚轴再生植株为材料,利用RAPD分子标记技术对结球甘蓝再生过程中产生的体细胞无性系变异进行了分析检测。结果表明：从50条随机引物中筛选出条带清晰、多态性丰富、表现稳定的引物14条,在此基础上共扩增出DNA片段253条,其中具多态性的73条,表现为新增加带和缺失带,多态率为28.85%,每对引物平均扩增的多态位点为5.21个。各植株间遗传相似系数的计算使用聚类分析软件NTSYS210e完成,采用非加权类平均法（UPMGA）对统计数据进行聚类分析,结果表明：各再生植株与母本间平均遗传相似系数为0.9304,植株之间存在遗传变异。     

杂交兰种质资源遗传多样性的SRAP分析

采用SRAP技术对24份杂交兰种质资源的遗传多样性进行分析。筛选出的11对引物组合共扩增出119条谱带,其中102条为多态带,多态性比率86.1%,平均每对引物组合产生9.3个多态性位点。各种质之间的相似系数变化范围为0.43~0.98,平均为0.67。UPGMA聚类分析表明:在遗传相似系数0.69处将24份供试材料划分为5个类群,较好地揭示了杂交兰种质间的遗传多样性与亲缘关系,可为杂交兰种质资源利用、杂交育种亲本选择及杂种后代鉴定提供科学依据。     

中国芸芥遗传多样性RAPD标记分析

 选择我国不同生态地区有代表性的芸芥材料 ,利用RAPD标记技术进行分子标记差异分析 ,根据遗传相似系数计算不同材料RAPD数据的遗传距离矩阵 ,按UPGMA方法对研究材料进行了聚类。研究结果表明 ,我国芸芥具有比较大的遗传多样性 ,12个引物共扩增出 131条DNA带 ,其中 10 5条表现出多态性 ,占总带数的 80 .15 % ,不同生态类型地区来源的材料有各自的特征带。 2 0个材料的遗传距离在 0 .1178～ 0 .4 994之间 ,其中以和田芸芥与其它材料的遗传距离最大 ,而神池芸芥与朔州芸芥遗传距离最小。聚类分析表明 ,2 0个材料可分为 4组 ,其中和田芸芥和四川芸芥各自列为一组 ,和田芸芥可能是我国芸芥的一种新类型。组别划分与材料的地理亲缘关系及植物学形态特征相似性有关     

四种耐寒植物的RAPD分析

用RAPD分子标记对4种耐寒植物进行了基因组DNA遗传多样性分析,从35个随机引物中筛选出了扩增谱带清晰并呈现多态性的20个随机引物,每个引物能产生1-10条RAPD片段,多态性条带占67.61%.利用UPGMA聚类法对4种卫矛属植物的176条谱带进行聚类分析,结果表明,北海道黄杨和扶芳藤聚类成一组,大叶黄杨和金心黄杨聚类成另一组,可见,RAPD技术对卫矛属植物的分类鉴定和遗传多样性评价是有效可行的.     

米心水青冈遗传多样性研究

采用RAPD分子标记技术分析9个自然居群米心水青冈的遗传关系和多样性。20条随机引物共扩出260个条带,平均每条引物扩增出13个条带,其DNA带的分子量在200～3000 bp。其中多态性条带有180条,多态位点比率(PPL)为69.2%。种内Shannon多样性指数为0.302 1,群体内所占比例为72.10%,群体间所占比例为27.90%。种内Nei’s基因多样性为0.204 5,群体内平均基因多样性为0.150 2,基因分化系数GST为0.263 1。米心水青冈的遗传多样性水平处于中等,遗传分化也处于中等水平。     

我国油松主要分布区种质资源遗传多样性

利用随机微卫星扩增多态性DNA(RMAPD)分子标记技术,对全国范围内的12个天然居群245个个体进行遗传多样性分析,用筛选出的18对引物组合共扩增出303个条带,其中多态性条带229个,多态条带百分率为77.58%.用NTSYS-PC软件中的SIMQUAL程序计算Jaccard遗传相似性系数(genetic similarity,S_G)并聚类.结果表明:245份油松材料间的S_G值变化范围为0.5238～0.9682,平均为0.8141.采用UPGMA法在0.68水平上可将供试材料聚为4类.内蒙古宁城油松、山西地区油松各自聚为一类外,甘肃小陇山地区油松分别于陕西的洋县、留坝、周至、洛南、柞水的油松聚为一类,黄龙、黄陵、府谷的油松聚为一类.表明各居群间存在较高遗传多样性.     

基于荧光SSR标记的10个白杨派种质资源遗传多样性分析

为分析白杨派优良无性系之间的遗传关系，采用毛细管电泳荧光SSR分子标记技术，构建10个白杨派优良无性系DNA指纹图谱，并进行遗传分析。结果表明，从20对引物中筛选出7对位点多态性高且重复性好的引物，共扩增出41个多态性位点，平均每对引物扩增5.9个，每个引物扩增多态位点在4~8之间。无性系间遗传相似系数区间为0.415~0.902，平均遗传相似系数为0.657，遗传变异性丰富。Shannon指数和基因多样性指数分别为1.433 4和0.694 3，表明无性系间具有较高的遗传多样性。聚类分析表明，10个白杨派无性系中，秦白杨1号、秦白杨3号、秦白杨5号与84K聚为一类，07-17-18、07-23-23与07-30-11与I-101聚为一类，与实际亲缘关系相符。利用2对多态性SSR引物PMGC-2020和PMGC2607构建了白杨派无性系指纹图谱，该图谱可将无性系全部区分开。     

利用SRAP标记分析春兰种质资源遗传多样性

利用SRAP分子标记对42份春兰品种及1份多花兰、1份春剑及3份杂交兰进行遗传多样性分析。筛选出的15对引物组合共扩增出185个位点,其中多态性位点184个,平均每对引物组合产生12.27个多态性位点。引物组合Me8-Em16的Nei’s基因多样性数H（0.3993）、shannon信息指数I值（0.5794）和有效等位基因数Ne（1.7280）都是最高值。47份材料的遗传相似系数变化范围为0.63~0.80,UPGMA 聚类分析表明,在遗传相似系数为0.662处,将47份材料划分成五大类群.本研究较好地揭示了47份材料亲缘关系的远近,为春兰各品种间的分类和杂交亲本的选择提供重要理论依据。