秦巴山区野生山丹百合DNA提取与RAPD反应体系建立

以秦巴山区野生山丹百合幼嫩叶片为材料,采用常规CTAB法提取百合基因组DNA,得到的DNA基本能满足RAPD-PCR分析。通过单因素逐一递进优化,得到在20μL的PCR反应体系中,野生山丹百合RAPD分析的最佳反应体系为:40 ng的模板DNA,0.4μmol/L随机引物,2.25 mmol/L Mg2 ,0.2 mmol/LdNTPs,Taq DNA聚合酶1.5U,1×buffer缓冲液,ddH2O补足20μL。RAPD扩增反应程序为:94℃预变性4 min,94℃30 s,37℃45 s,72℃90 s,35个循环,最后72℃10 min,4℃保存。该反应体系具有较好的稳定性及可重复性。     

‘兰州百合’ISSR-PCR体系的优化

以‘兰州百合’为试材,采用CTAB法提取百合嫩叶DNA,对‘兰州百合’ISSR-PCR反应体系的Taq酶、dNTP、引物和模板DNA进行4个因素4个水平优化试验,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳结果分析,最终获得的最佳反应体系为:25μL反应体系中含Taq DNA聚合酶0.5U,dNTP 0.3mmol/L,引物0.5μmol/L,模板DNA 60ng,10×Buffer(20mmol/L Mg2+plus)2.5μL,不足部分用ddH2O补足.在获得最佳反应体系的基础上确定了引物最佳退火温度为53℃,最佳循环次数45次.该优化体系以UBC873作为引物对18份‘兰州百合’材料DNA进行ISSR-PCR扩增,结果显示该优化体系具有较高的扩增稳定性.     

贵州野生淡黄花百合RAPD反应体系的建立

以贵州林下野生淡黄花百合(Lilium sulphureum Baker)幼嫩叶片为材料,采用改良的CTAB法提取百合基因组DNA,得到了较高质量的DNA.并对影响随机扩增多态DNA性(RAPD)反应的主要因素进行了优化,建立并优化了野生淡黄花百合的RAPD反应体系及程序.优化的20μL反应体系中包含20 ng模板DNA,2.0 mmol/L Mg2+、0.25 mmol/L dNTPs、1.0 U Taq DNA聚合酶、10×Buffer 2μL、0.4 μmol/L随机引物、ddH2O补足至20μL.优化的RAPD扩增程序为94℃3 min;94℃50 s,37℃40 s,72℃80 s,40个循环;72 ℃ 10 min,4℃保存.该反应体系具有较好的稳定性及可重复性,适合贵州野生淡黄花百合遗传多样性研究.     

优化麝香百合RAPD反应体系的研究

[目的]建立适合百合种质的RAPD优化体系。[方法]从麝香百合中提取基因组DNA,进行RAPD反应。通过正交试验设计,优化麝香百合的RAPD反应条件和反应体系。[结果]优化的RAPD反应条件为:DNA 50 ng,Primer 0.3μmol/L,Taq酶1.0 U,dNTPs 200μmol/L,Mg2+3.0 mmol/L。在麝香百合的RAPD扩增程序中,各因素显著性程度依次为:循环次数>延伸时间>复性温度>复性时间。麝香百合的最佳RAPD反应程序为:37℃复性50 s,延伸60 s,循环35次。[结论]该研究建立了一套稳定的RAPD反应体系,具有较好的扩增效果。     

百合ISSR-PCR反应体系的优化

为优化百合ISSR - PCR反应体系,利用正交试验设计,对百合ISSR - PCR反应体系中的5种主要因素进行优化筛选.结果表明:优化的25μL百合ISSR - PCR反应体系为dNTP 0.2 mmol/L、Mg2+ 2.0 mmol/L、引物0.5 μmol/L、模板DNA 60 ng和Taq酶1.0U,最佳退火温度为52.2℃.该体系以38个品种(种)百合进行扩增验证,得到的条带清晰、多态性高,且具有良好重复性.说明优化的百合ISSR - PCR反应体系适用于百合资源的品种(种)鉴定及遗传多样性研究.     

罗汉果DNA的提取及RAPD—PCR反应条件的优化

本研究采用改良SDS方法提取罗汉果基因组DNA,得到的DNA质量较高,适合于RAPDPCR分析,在25 μl反应体系中,RAPD分析的优化反应体系:200μmol/LdNTP,0.4μmol/L随机引物,ExTaq DNA聚合酶1U,模板DNA50ng/应.     

龙牙百合DNA的提取及ISSR-PCR体系的建立

[目的]研究龙牙百合总DNA的提取方法,建立优化的ISSR-PCR反应体系和程序,为种质资源研究奠定基础。[方法]利用改良的CTAB法提取龙牙百合基因组DNA,并对影响ISSR扩增反应的各因素进行优化。[结果]获得了高质量的龙牙百合基因组DNA;优化的龙牙百合ISSR-PCR反应体系为,25μl体系中含60 ng模板DNA,0.4μmol/L ISSR引物,2.0 mmol/L Mg2+,1.5 UTaq酶,0.2 mmol/LdNTPs;反应程序为,94℃预变性5 min;然后进行40个循环:94℃变性50 s,52℃复性45 s,72℃延伸75 s;循环结束后72℃延伸8 min。[结论]建立了适合于龙牙百合的ISSR-PCR反应体系及程序,为种质资源研究奠定了基础。     

兰州百合DNA提取方法比较及RAPD体系的快速优化

以兰州百合鳞片和叶片为试材,采用改良CTAB法获得了高质量的基因组DNA。为优化兰州百合RAPD-PCR反应体系,利用正交试验设计,对兰州百合RAPD-PCR反应体系中的5种主要因素进行4水平共计16个组合设计,并选用3种反应程序,通过琼脂糖凝胶电泳结果分析,最终获得最佳反应体系为:20 u L反应体系中含30 ng模板DNA、0.5μmol/L随机引物、0.2 mmol/L d NTPs、2.25 mmol/L MgCl_2,及1.5U Taq DNA聚合酶。最佳反应程序:94℃预变性4 min;94℃变性1 min,36℃退火1.5 min;72℃延伸2 min;35个循环;最后72℃延伸7min。     

百合鳞片DNA提取及RGA-PCR体系的优化

以百合鳞片为材料,采用改良的CTAB法获得了高质量的基因组DNA.通过影响PCR反应各因子的优化,建立了适合百合的RGA-PCR反应体系:25μl体系中含30 ng模板DNA、2.5 mmol/L MgCl2、0.2 mmol/L d.NTPs、0.6 μmol/L引物及1.5 U Taq酶.扩增程序为:94 ℃预变性5 min,94℃变性1 min,44 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,40个循环;最后72 ℃延伸7 min.利用该体系对35个百合品种进行RGA-PCR,表明该反应体系具有较好的稳定性和可靠性.     

春兰基因组DNA提取及RAPD反应体系的优化

以春兰为研究材料,对春兰基因组DNA的提取以及RAPD-PCR反应体系进行了优化.结果表明,在提取液中加入PVP和β-巯基乙醇去除酚类物质,采用高盐沉淀DNA和多次洗涤去除糖类,可以得到高质量春兰基因组DNA.电泳检测表明,所获得的DNA完整,无降解,完全可以满足RAPD等分子标记分析的需要.同时对春兰RAPD-PCR反应体系中各个影响因素进行了优化,建立了适合春兰RAPD分子标记的最佳反应体系,即20μL反应体系中含1UTaqDNA聚合酶,60μmol/LdNTPs,2.25mmol/LMg2 ,1.0μmol/L引物,1.5ng/μL模板DNA.