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相似文献
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1.
江苏3个秀丽白虾野生群体遗传多样性的AFLP分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用AFLP分子标记技术对江苏省内3个秀丽白虾野生群体的遗传多样性水平及遗传结构进行了分析.采用3个引物组合(E-AAC/M-CAA、E-AAC/M-CAG、E-AAC/M-CAT),共扩增出102个清晰位点,其中93个为多态性位点.结果显示,3个秀丽白虾野生群体在物种水平和群体水平上均蕴含着较为丰富的遗传多样性.在物种水平上,秀丽白虾多态性位点百分率(PPL)为91.18%,Nei's基因多样性指数(h)为0.391,Shannon信息指数(I)为0.562.群体水平上的PPL为58.82%~70.59%,平均为65.4%,其中骆马湖群体最高,为70.6%;长江群体最低,为58.8%.群体间Nei's多样性指数为0.268~0.320,平均为0.292;Shannon信息指数为0.381~0.454,平均为0.417.长江南京段群体与太湖群体间的分化系数较低(0.141),长江南京段群体与骆马湖群体间的遗传分化系数较高(0.234).建议加强秀丽白虾引种、育种工作中的管理力度,建立详实的引育种档案,推动秀丽白虾养殖工作的发展.  相似文献   

2.
太湖日本沼虾的遗传多样性分析   总被引:8,自引:0,他引:8  
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对太湖湖区不同水域(无锡、宜兴、苏州及湖州水域)野生日本沼虾群体进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的50个随机引物中筛选出16个有效引物,共检测到117个清晰稳定的位点,大小为200bp~2000bp,其中92个位点具有多态性。四个群体的多态位点比例分别为49.57%、60.68%、53.85%、57.26%,杂合度为0.2077~0.2163,Shannon信息指数为0.2967-0.3053,群体间遗传分化指数Gst值为0.1644-0.2002。AMOVA分析结果显示,群体的遗传变异有16.67%是由群体间遗传变异引起的,显著性检验表明群体间遗传变异对总遗传变异影响显著。遗传距离显示四个群体有一定遗传分化,其中苏州和宜兴群体间遗传距离最大(0.1481),无锡与宜兴群体间遗传距离最小(0.1141)。利用UPGMA进行聚类分析表明,无锡与宜兴群体首先聚在一起,湖州与苏州群体随后聚在一起,再与无锡、宜兴群体聚在一起。  相似文献   

3.
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对太湖湖区不同水域(无锡、宜兴、苏州及湖州水域)野生日本沼虾群体进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的50个随机引物中筛选出16个有效引物,共检测到117个清晰稳定的位点,大小为200bp~2000bp,其中92个位点具有多态性。四个群体的多态位点比例分别为49.57%、60.68%、53.85%、57.26%,杂合度为0.2077~0.2163,Shannon信息指数为0.2967-0.3053,群体间遗传分化指数Gst值为0.1644-0.2002。AMOVA分析结果显示,群体的遗传变异有16.67%是由群体间遗传变异引起的,显著性检验表明群体间遗传变异对总遗传变异影响显著。遗传距离显示四个群体有一定遗传分化,其中苏州和宜兴群体间遗传距离最大(0.1481),无锡与宜兴群体间遗传距离最小(0.1141)。利用UPGMA进行聚类分析表明,无锡与宜兴群体首先聚在一起,湖州与苏州群体随后聚在一起,再与无锡、宜兴群体聚在一起。  相似文献   

4.
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对西藏拟溞Daphniopsis tibetana4个群体(新疆赛里木湖、西藏色林错、纳木卡错和班戈湖)的遗传多样性进行了初步研究,用21个随机引物对4个群体80个样本进行了随机扩增,从中筛选出5个扩增效果比较稳定的引物,共得到多态位点为25个。利用POPGENE32分析表明,西藏拟溞各群体遗传变异由高向低依次为色林错(SLC)〉赛里木湖(SLM)〉纳木卡错(NMKC)〉班戈湖(BGH)。根据遗传距离结果,采用UPGMA和NJ方法分别进行聚类分析,结果表明,赛里木湖(SLM)和色林错湖(SLC)两群体亲缘关系较近,纳木卡错(NMKC)与班戈湖(BGH)两群体之间的亲缘关系比较近。  相似文献   

5.
中国沿海管角螺4个自然群体遗传多样性的RAPD分析   总被引:2,自引:0,他引:2       下载免费PDF全文
利用RAPD技术对管角螺(Hemifusus tuba Gmelin)4个自然群体(广西北海、广东湛江、浙江温州、江苏连云港)的遗传多样性进行了分析。所选择的19条有效引物在4个自然群体200个个体中总共产生182个扩增片段,片段数量为19 983个,片段大小在250~2 500 bp之间。其中每条引物可产生4~17条带,平均5.28个位点。4个自然群体共检测到149个多态位点,多态位点比例为81.87%,其中北海群体的多态位点比例最高,占66.48%,其次是湛江群体为47.25%,温州群体为44.51%,连云港群体为36.81%。4个群体中均未检测到各群体特有的扩增带。4个自然群体管角螺的Nei’s指数和Shannon指数表现为一致性,表明遗传多样性在4个自然群体的大小为北海群体>湛江群体>温州群体>连云港群体。4个自然群体的遗传距离在0.054 2~0.137 4之间。基于群体间遗传距离的值进行聚类分析,结果表明, 4个群体中,北海与湛江群体首先聚在一起,温州与连云港群体随后聚在一起,最后4个群体聚在一起。  相似文献   

6.
秦巴地区乌头类群的遗传多样性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用随机扩增多态性(RAPD)标记技术对秦巴地区的3个乌头群体的遗传多样性水平进行了检测,在筛选的9条引物中检测出564个多态位点,各类群的多态位点百分率为24.95%(JP)、50.63%(YY)、50.46%(YC)。类群间的遗传一致度和遗传距离存在较大的差异,聚类分析发现野生圆头与家培类群前缘关系较近。Shannon多样度指数结果表明乌头群体遗传多态性丰,也说明本研究所选的引物用于乌头种质鉴定是可行的,这为乌头的遗传资源评价和鉴定提供了新的方法和理论基础。  相似文献   

7.
研究了太湖秀丽白虾抱卵群体生物学特征,并对其肌肉营养价值进行评价.于2008年4-5月在太湖三山岛水域采集秀丽白虾(Exopalaemon modestus)抱卵虾样本,对生物学指标进行了测量,并对肌肉营养成分进行了测定分析.抱卵群体平均全长、平均体长和平均体重分别为59.1 mm、47.5 mm和1.57 g,绝对怀卵量介于95~389粒之间,平均为212粒,相对怀卵量介于91~145粒/g之间,平均为113粒/g.胚胎发育各阶段卵径差异显著,囊胚期、无节幼体期和溞状幼体期分别为1.01 mm、1.07 mm和1.16 mm.抱卵虾肌肉水分含量为79.63%,粗蛋白、粗脂肪和粗灰分含量分别为16.57%、1.49%和1.40%,能量密度为4.597 KJ/g.肌肉干样赖氨酸和牛磺酸含量分别为6.70%和0.52%,必需氨基酸指数为65.81;不饱和脂肪酸含量为65.52%,其中单不饱和脂肪酸含量显著高于多不饱和脂肪酸含量,比值为1.49.钙磷比、锌铜比和锌铁比分别为0.84、3.26和2.87.太湖秀丽白虾抱卵群体表现出明显的小型化趋势,其主要营养指标均低于生长期.  相似文献   

8.
日本沼虾4个地理群体遗传变异的RAPD分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对取自六安、龙感湖、淮南和高淳等4个地理群体的日本沼虾(Macrobrachium nipponense)各30个个体进行遗传多样性分析。在事先优化的反应条件下。所使用的OPP、OPX2个系列40个随机引物中,有16个引物扩增出清晰稳定的片断。共产生173个位点。大小在250~2000bp,利用PopGen1.32进行分析,日本沼虾多态位点为75个(多态性片断的比例为43.4%),Shannon信息指数为0.1771~0.2466。遗传距离显示日本沼虾群体间有一定遗传分化。其中高淳群体和龙感湖群体之间遗传距离最大(0.1712).六安群体和淮南群体之间最小(0.1146)。用UPGMA对4个地理群体进行聚类分析,六安和淮南群体首先聚在一起。高淳和龙感湖群体最后。  相似文献   

9.
野生银杏资源群体遗传多样性的RAPD分析   总被引:2,自引:1,他引:1  
用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对浙江西天目山、贵州务川、湖北大洪山区、重庆金佛山区和福建武夷山区等5个群体150个银杏Ginkgo biloba个体进行了遗传多样性分析。12个寡核苷酸引物共检测到194个位点,多态位点130个,多态位点百分率66.67%。用PopGen 32软件对数据进行了分析,结果显示:Nei’s基因多样性指数(h)的群体水平是0.4317,Shannon信息指数(I)的群体水平是0.6211,基因分化系数(Gst)是0.2882。Shannon信息指数(I)分析揭示的银杏群体遗传分化水平[(Isp-Ipop)/Isp]=0.1903,AMOVA分析结果得出银杏群体间的分化占36.7%。RAPD数据显示.5个银杏群体遗传多样性较高,其中浙江西天目山、贵州务川和湖北大洪山区有可能是野生银杏冰川期避难所。图4表5参22  相似文献   

10.
江苏地区日本沼虾种质资源的RAPD分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
用RAPD技术研究了江苏地区10个日本沼虾群体的遗传多样性和亲缘关系。以40个随机引物(10个碱基)对沼虾基因组DNA进行扩增,选取其中18个扩增产物多态性好的引物进行分析。结果共扩增出234个DNA片段,大小在250~2000 bp之间;126个位点表现为多态位点,多态位点比例为53.85%。常州湖繁保区的日本沼虾遗传多样性最高,遗传多样性指数为0.1742;宿迁骆马湖池塘养殖的日本沼虾遗传多样性最低,遗传多样性指数为0.1263。UPGMA聚类分析表明,常州湖繁保区的日本沼虾和苏州太湖胥口镇渔洋山西南侧水域的日本沼虾亲缘关系最近,总体上亲缘关系和地理位置呈正相关。  相似文献   

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