4个品系西藏拟溞12S rRNA基因序列及其分子进化研究

应用线粒体12SrRNA基因序列对4个地理品系的西藏拟溞(纳木卡错品系、色林错品系、班戈湖品系、赛里木湖品系)进行分子系统发育研究,并结合GenBank中7种相近溞类的12S rRNA基因序列探讨了西藏拟溞的分子系统进化关系.结果表明,在4个品系西藏拟溞的4条12S rRNA基因序列中,A、T、G、C的平均含量分别为31.9％、32.45％、17.33％和17.95％,A+T的含量64.35％,G+C的含量为35.28％,A+T的含量明显高于G+C的含量,符合节肢动物A、T含量高的特点.聚类分析结果表明,西藏拟溞和其他溞属枝角类动物有着明显的遗传差异,说明西藏拟溞在枝角类生物学研究中有其独特的地位.遗传多样性计算结果表明:在4个品系的西藏拟溞中,纳木卡错品系与色林错品系以及纳木卡错品系与班戈湖品系的遗传相似性均较高,达98％左右;班戈湖品系与纳木卡错品系间的遗传距离最小,仅为0.0126,班戈湖与赛里木湖间的遗传距离最大,为0.0199;与其他溞属枝角类相比较,4个品系西藏拟溞种内差异相对不明显,而与其他溞种间的差异显著,西藏拟溞有着较高的遗传多样性水平.研究表明,12S rRNA基因序列包含有可靠的进化信息,可作为西藏拟溞种类鉴定良好的分子标记,同时利用这种分子标记法从分子系统进化方面证明了Daphnia tibetana和Daphniopsis tibetana Sars应分属于不同的种.     

5种裸腹溞群体遗传变异及亲缘关系的初步分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对5种裸腹溞(蒙古裸腹溞Moina mongolica、多刺裸腹溞M.macrocopa、直额裸腹溞M.rectirostris、微型裸腹溞M.micrura和近亲裸腹溞M.affinis)的亲缘关系及群体遗传变异程度进行了研究。在优化反应条件下,对21个引物进行了扩增,从中筛选出6个带型清晰且重复性好的引物用于分析,共扩增出161条多态性谱带,片段长度为421~19 329 bp。根据遗传距离结果,利用Mega 2.1软件包中的UPGMA和NJ程序进行聚类分析,结果表明:5种裸腹溞种间、群体间的遗传分化程度较大,进化地位的高低顺序为近亲裸腹溞>直额裸腹溞>多刺裸腹溞>蒙古裸腹溞>微型裸腹溞。     

3个细基江蓠繁枝变种（Gracilaria tenuistipitata var.Liui）群体亲缘关系的分析

为了从DNA水平上了解不同地理位置的细基江蓠繁枝变种种群间在遗传相似性上的差异,运用RAPD标记技术对来自深圳、北海、防城港的3个细基江蓠繁枝变种群体进行亲缘关系分析。结果表明,筛选的30个RAPD引物共扩增出252个位点,片段大小在200～3000 bp之间;3个群体的多态位点比例由高到低依次为：防城港（66.27%）〉北海（40.48%）〉深圳（31.35%）;而3个群体间遗传相似率由高到低依次为：深圳-北海（83.71%）〉防城港-北海（78.77%）〉深圳-防城港（77.73%）。可见,深圳、北海群体间亲缘关系较近,防城港群体与北海、深圳群体间的亲缘关系较远。     

中国五大湖三角帆蚌群体遗传多样性的RAPD分析

用OPJ和OPM两组40条10碱基随机引物,对中国五大湖三角帆蚌地理群体及诸暨养殖蚌进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,其中12个引物的扩增结果具有丰富的群体多态性,多态率为55.6%～80%。群体内遗传相似度大小依次为:鄱阳湖(0.8889),太湖(0.8694),洞庭湖(0.8111),诸暨(0.7746),洪泽湖(0.7348),巢湖(0.7185)。依据群体间遗传距离指数及分子系统树,表明洞庭湖群体和洪泽湖群体亲缘关系最近,鄱阳湖群体则与巢湖群体的亲缘关系最近,并且诸暨人工养殖群体与鄱阳湖和巢湖的群体比较接近。     

中国五大湖三角帆蚌群体遗传多样性的RAPD分析

用OPJ和OPM两组40条10碱基随机引物,对中国五大湖三角帆蚌地理群体及诸暨养殖蚌进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,其中12个引物的扩增结果具有丰富的群体多态性,多态率为55.6%～80%。群体内遗传相似度大小依次为:鄱阳湖(0.8889),太湖(0.8694),洞庭湖(0.8111),诸暨(0.7746),洪泽湖(0.7348),巢湖(0.7185)。依据群体间遗传距离指数及分子系统树,表明洞庭湖群体和洪泽湖群体亲缘关系最近,鄱阳湖群体则与巢湖群体的亲缘关系最近,并且诸暨人工养殖群体与鄱阳湖和巢湖的群体比较接近。     

江苏地区日本沼虾种质资源的RAPD分析

用RAPD技术研究了江苏地区10个日本沼虾群体的遗传多样性和亲缘关系。以40个随机引物(10个碱基)对沼虾基因组DNA进行扩增,选取其中18个扩增产物多态性好的引物进行分析。结果共扩增出234个DNA片段,大小在250~2000 bp之间;126个位点表现为多态位点,多态位点比例为53.85%。常州湖繁保区的日本沼虾遗传多样性最高,遗传多样性指数为0.1742;宿迁骆马湖池塘养殖的日本沼虾遗传多样性最低,遗传多样性指数为0.1263。UPGMA聚类分析表明,常州湖繁保区的日本沼虾和苏州太湖胥口镇渔洋山西南侧水域的日本沼虾亲缘关系最近,总体上亲缘关系和地理位置呈正相关。     

5种裸腹潘群体遗传变异及亲缘关系的初步分析

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对5种裸腹溢（蒙古裸腹潘Moina mongolica、多刺裸腹潘M.macrocopa、直额裸腹涵M.rectirostris、微型裸腹泾M.micrura和近亲裸腹溢M.affinis）的亲缘关系及群体遗传变异程度进行了研究。在优化反应条件下，对21个引物进行了扩增，从中筛选出6个带型清晰且重复性好的引物用于分析，共扩增出161条多态性谱带，片段长度为421—19329bp。根据遗传距离结果，利用Mega2．1软件包中的UPGMA和NJ程序进行聚类分析，结果表明：5种裸腹溢种间、群体间的遗传分化程度较大，进化地位的高低顺序为近亲裸腹潘〉直额裸腹溢〉多刺裸腹泾〉蒙古裸腹滋〉微型裸腹潘。     

松材线虫和拟松线虫种间及种下群体的RAPD指纹分析

利用ＲＡＰＤ技术对松材线虫（Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ｘｙｌｌｐｈｉｌｕｓ）和拟松材线虫（Ｂ．ｍｕｃｒｏｎａｔｕｓ）的分离物基因组ＤＮＡ进行了ＤＮＡ片段的随机扩增,以确定种间及种内群体的亲缘关系和筛选具有种鉴定特征的分子标记。通过对４０个１０聚体随机引物的筛选,应用８个引物对两种线虫种间种内分离物扩增片段的遗传分析显示：两种间群体ＲＡＰＤ扩增片段的共享度为４０％￣５６％,百在松材线虫的不同分     

不同种植密度对积雪草光合特性、产量及品质的影响

【目的】开发厚朴新型分子标记,分析广东乐昌龙山林场厚朴资源的亲缘关系,以方便后续进行 厚朴优株选择和优良品种选育等研究工作。【方法】以 14 个由广东乐昌龙山林场种植的、种源来自江西省各 地的药用植物厚朴为材料,根据 GenBank 中厚朴 cDNA 序列信息,利用 NCBI（https://www.ncbi.nlm.nih.gov）上 Primer BLAST 工具设计厚朴靶区域扩增多态性（Target Region Amplified Polymorphism, TRAP）标记固定引物,与 SRAP（Sequence Related Amplified Polymorphism）随机引物配对,扩增厚朴基因组 DNA,开发厚朴 TRAP 标记。 统计 TRAP 标记与厚朴 SSR（Simple Sequence Repeat）标记扩增产物的电泳带型图谱,用 NTSYSpc2.10e 软件进 行聚类分析,分析 14 个厚朴资源的遗传多样性及其亲缘关系。【结果】 从 14 条固定引物与 5 条随机引物配组 形成的 70 对引物中共开发出 7 个扩增产物电泳条带清晰、带型丰富、多态性好的厚朴 TRAP 标记;构建了厚朴 资源的亲缘关系树状图,结果表明龙山林场厚朴资源遗传相似系数在 0.75~0.88 之间,母株与对应子代之间遗传 相似系数并不是最高。【结论】厚朴群体内基因交流频繁,遗传多样性丰富,新开发的 TRAP 标记将为厚朴优 株鉴别、优良品种选育、分子标记辅助选择等后续研究工作提供便利。     

景天属药用植物遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD技术对景天科景天属（Sedum）的凹叶景天、江南景天、宽叶景天、佛甲草和垂盆草等6种药用植物进行分子水平鉴定,并初步分析其相互间的亲缘关系。CTAB法提取各药用植物总DNA,以45条随机引物进行随机扩增,筛选出10条随机引物很好地区分了11个试样,扩增出208个位点,其中多态性位点173个（83.2%）。用Popgen32计算出各种间的Nei’s（1978）遗传距离和遗传相似性矩阵,采用UPGMA绘出了亲缘关系聚类图。结果表明RAPD法能有效地鉴别景天属6种药用植物,探讨其种间亲缘关系和种内遗传多样性,其结果还为同属待定种鉴定提供了DNA分子水平依据。     

4个罗非鱼群体遗传多样性的RAPD分析

采用50个随机引物对奥利亚罗非鱼（Oreochromis aureus）和3个尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）群体即无锡品系、埃及品系和吉富品系进行RAPD分析,共筛选出13个重复性好的引物,其中引物S1255扩增的2500bp片段具有群体特异性,可作为区分奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼的分子标记;用PopGen1．32软件进行遗传多样性分析,结果表明：奥利亚罗非鱼、无锡品系、埃及品系和吉富品系罗非鱼群体内的多态位点率分别为22．03％、52．54％、58．47％、62．71％,基因多样性指数分别为0．0912、0．2166、0．2448、0．2705,Shannon信息指数分别为0．1323、0．3136、0．3537、0．3881。无锡品系、埃及品系和吉富品系罗非鱼群体内遗传相似性指数分别为0．8194、0．7886和0．7704,遗传变异水平较高,遗传多样性丰富。奥利亚罗非鱼的群体内遗传相似性指数为0．9279,群体的遗传纯度高,遗传变异水平较低。无锡、埃及、吉富品系尼罗罗非鱼与奥利亚罗非鱼之间的遗传距离分别为0．1370、0．2235,0．1986,说明奥利亚罗非鱼和埃及品系尼罗罗非鱼杂交可能产生更强的杂种优势。     

秭归空心李RAPD反应体系的建立及其遗传多样性分析

采用RAPD分子标记技术对湖北省秭归县杨林桥镇秭归空心李4个居群的21个样品进行了多态性分析,从100个随机引物中筛选出6个引物对秭归空心李进行了扩增并对扩增结果进行了聚类分析.结果表明:当遗传距离取 0.266 2～0.346 2 cM时,所有的群体聚为一类;当遗传距离取 0.059 5～0.063 9 cM时,4个居群各为一类;4个居群的相似性系数为 0.707 3～0.942 3,说明杨林桥镇4个居群的秭归空心李遗传背景比较一致,亲缘关系很近.     

西藏色季拉山野生西南草莓(Fragariamoupinensis)遗传多样性的初步研究

采用RAPD分子标记技术,从42个引物种筛选出10个引物对11份西藏色季拉山野生西南革莓的遗传多样性进行评价.结果表明,草莓植株的相似系数变化范围为0.91 ～0.99,平均相似系数为0.95,说明色季拉山野生西南草莓亲缘关系比较近,遗传分异程度较低.利用RAPD技术所获得西藏不同海拔的遗传相似性较高,很难在它们之间划分出明显的类群.     

4个暗纹东方鲀群体的遗传多样性分析

采用10对暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)和16对红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)微卫星引物对4个暗纹东方鲀群体(1个长江常熟江段捕捞群体,1个江苏扬中放流群体和2个养殖群体)的遗传多样性进行分析。结果显示,20个微卫星位点能成功扩增出片段并且具有一定的多态性,在4个群体中共检测到113个等位基因。每个群体的平均等位基因数为4.95～5.50,平均观测杂合度为0.686 7～0.761 7,平均期望杂合度为0.653 0～0.700 0,平均多态信息含量为0.601 3～0.638 4。各个群体都有一些微卫星位点偏离Hardy-Wein-berg平衡(P<0.05),主要表现为杂合子不足。群体间遗传分化系数为0.040 6,基因流值为5.905 6,群体间遗传分化程度较小,群体间基因流水平较高。4个群体间的遗传相似系数为0.859 0～0.915 8,遗传距离为0.088 0～0.151 9,采用UPGMA法对4个群体进行聚类,可分2类:上海养殖群体单独为一类,扬中放流群体、常熟江段捕捞群体和南通养殖群体为另一类。     

云南松口蘑的 ＩＳＳＲ遗传多样性研究

本文利用 １６条 ＩＳＳＲ引物,对来自云南香格里拉、大理、楚雄和昆明的 ４个松口蘑居群共 ４２个个体的遗传多样性进行研究。结果表明,ＩＳＳＲ ＰＣＲ共扩增出 ７６条条带;总多态性位点百分率 ＰＰＢ＝６１０４％,多态位点百分率依次为 ５６７６％,６７７５％,７０２７％和 ５０００％;总的基因多样度指数 （Ｈｔ）为０３２１５,居群内的 Ｎｅｉ遗传多样度指数 （Ｈｓ）为０２４４７,Ｓｈａｎｎｏｎ多样性指数 （Ｉ）为 ０４７１７,居群间的遗传分化系数Ｇｓｔ为０２４７１,基因流 Ｎｍ为１５２３４,这说明云南松口蘑具有较高的遗传多样性,且主要存在于居群之间,居群内的变异较小;遗传距离表明 ４个居群中香格里拉和昆明的亲缘关系最远,大理和楚雄的亲缘关系最近。     

应用RAPD技术时引物数量和统计方法的研究

在研究应用RAPD技术对矮臀鳃金龟、华北大黑鳃金龟的文登种群、南京种群及东北大黑鳃金龟的分类地位时 ,采用 5、1 0、1 5、2 0、30和 36条引物的扩增谱带进行聚类分析。结果表明 ,在进行种间分类时 ,1 0条引物 ( 1 0 0条左右谱带 )便可得到稳定的树状图 ;在进行种下各阶元分类地位研究时 ,2 0条引物 ( 2 0 0条左右谱带 )即可。分别采用Nei的遗传距离 (D值 )和距离指数 (P值 )两种不同算法建立距离矩阵 ,研究结果表明 ,当引物数量足够多时 ,两种算法会得到相同的结果 ;但当引物数量较少时 ,遗传距离要优于距离指数     

应用RAPD对我国栽培核桃不同地理生态型的研究

用 8 0个 10bp随机引物对我国新疆核桃、华北山地核桃、秦巴山地核桃和西藏高地核桃 4个不同地理生态型的 2 0个样本进行RAPD扩增反应 .选用了清晰度高、重复性好的 2 4个引物用于进一步的分析 ,共扩增出 2 2 7个RAPD片段 ,具多态性的片段有 16 8个 ,占总扩增片段的 74% ,平均每个引物扩增片段为 9 46个 ,扩增片段长度为2 2 0～ 40 72bp .其中 ,西藏核桃类群的特有RAPD片段占有很大比例 .依据扩增结果 ,计算遗传距离 ,采用UPGMA方法构建聚类树状图 .结果表明 :新疆核桃为我国栽培核桃的一个地理生态型 ;华北山地核桃和秦巴山地核桃应属一个地理生态型下的两个不同亚群 ;西藏高地核桃不仅在聚类树状图上被划为另一大类 ,而且遗传距离与其它地理生态型也相差很远 .西藏高地核桃是作为一个地理生态型 ,还是作为一个独立的植物种有待进一步深入研究     

Genetic Diversity Analysis Among Populations of Mink from China by Inter-simple Sequence Repeat （ISSR） Markers

Inter-simple Sequence Repeat （ISSR） analysis was applied to assess the genetic diversity within and among five populations of mink from Liaoning Province. A total of 20 primers were screened, five selected primers produced 35 discernible bands, with 30 （85.71%） being polymorphic, indicating high genetic diversity at the species level. The highest genetic diversity was observed in the brown mink population, whereas the lowest diversity was found in the standard-pitchy mink population. Based on genetic distance （1972）, a dendrogram was constructed by using UPGMA algorithm, and five populations were divided into two major groups. Group I consisted of only the standard-pitchy mink population, and Group II included other four populations, in Group II, sapphire mink was close to brown mink population. The results of genetic differentiation indicated that the genetic differentiation degree between populations was lower and the genetic variation primarily came from within populations. This paper showed that ISSR technique was a reliable tool that could be used to study genetic diversity in the mink.     

克氏原螯虾4个地理群体遗传差异的RAPD分析

[目的]对克氏原螯虾4个地理群体的遗传多样性状况进行调查,为克氏原螯虾遗传育种、资源保护和利用提供一定的理论依据。[方法]应用RAPD技术对怀远县（HY）、盱眙县（XY）、潜江市（QJ）、升金湖（SJH）4个地理群体的克氏原螯虾各30个个体进行了遗传多样性分析。[结果]在优化的反应条件下,所挑选的上海生工200个随机引物中,共有20个引物扩增出清晰稳定的片段。遗传距离显示克氏原螯虾群体间有一定遗传分化,其中怀远群体和潜江群体之间的遗传距离最大（0.3333）,潜江群体和升金湖群体之间的遗传距离最小（0.2203）。怀远群体内的遗传相似系数最高（0.9187）,盱眙最低（0.8900）。[结论]淮河水系的怀远群体和盱眙群体聚为一支,长江水系的潜江群体和升金湖群体聚为一支。     

基于SSR标记的山西省油松山脉地理种群遗传结构与地理系统

目的分析油松种源区的遗传结构能够为油松起源探索和引种地人工林种群溯源等提供理论依据。方法本文利用SSR分子标记分析了山西油松5个山脉地理种群的遗传结构和地理系统。试验方法分别用了8对多态性较高引物和4对卡方检测差异显著性引物进行分析。结果结果显示:关帝山遗传变异最丰富,中条山遗传变异最低;8对引物分析显示5个山脉地理种群分化较小(F_ST=0.0328),4对引物分析显示5个山脉种群存在中等程度分化(F_ST=0.0519);5个山脉种群遗传距离和地理距离存在显著相关性;遗传多样性参数与1月均温有负相关趋势,年均降水与1月均温比值和遗传多样性参数有正相关趋势。结论研究发现山西省主要山脉油松地理种群间有相对较小的遗传分化和种群内有丰富的遗传多样性;SSR标记可以有效显示各种群的遗传结构特点,而筛选得到的有限差异显著标记能更有效的用于油松的种群遗传分析;生境气象因子的水热相对水平对种群遗传多样性有主导影响,相对较高的水热比利于种群保持较高的遗传多样性。