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采用正交设计优化胡椒属药用植物SCoT-PCR反应体系,并运用SCoT分子标记对7种胡椒属药用植物31份样品进行遗传多样性研究。结果表明,胡椒属药用植物SCoT-PCR最佳反应体系:总体积20μL,其中10×Buffer 2.0μL,dNTPs 0.20 mmol/L,Mg2+ 1.5 mmol/L,引物0.4μmol/L,模板DNA 100 ng,Taq聚合酶2.5 U。扩增总条带数为68条,其中多态性条带为64条,多态性比率为94.12%。31份胡椒属药用植物个体间聚类分析结果显示,31份胡椒属样品划分为2个类群,6个亚群。SCoT可适用于胡椒属药用植物遗传多样性研究。 相似文献
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【目的】开发厚朴新型分子标记,分析广东乐昌龙山林场厚朴资源的亲缘关系,以方便后续进行
厚朴优株选择和优良品种选育等研究工作。【方法】以 14 个由广东乐昌龙山林场种植的、种源来自江西省各
地的药用植物厚朴为材料,根据 GenBank 中厚朴 cDNA 序列信息,利用 NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)上
Primer BLAST 工具设计厚朴靶区域扩增多态性(Target Region Amplified Polymorphism, TRAP)标记固定引物,与
SRAP(Sequence Related Amplified Polymorphism)随机引物配对,扩增厚朴基因组 DNA,开发厚朴 TRAP 标记。
统计 TRAP 标记与厚朴 SSR(Simple Sequence Repeat)标记扩增产物的电泳带型图谱,用 NTSYSpc2.10e 软件进
行聚类分析,分析 14 个厚朴资源的遗传多样性及其亲缘关系。【结果】 从 14 条固定引物与 5 条随机引物配组
形成的 70 对引物中共开发出 7 个扩增产物电泳条带清晰、带型丰富、多态性好的厚朴 TRAP 标记;构建了厚朴
资源的亲缘关系树状图,结果表明龙山林场厚朴资源遗传相似系数在 0.75~0.88 之间,母株与对应子代之间遗传
相似系数并不是最高。【结论】厚朴群体内基因交流频繁,遗传多样性丰富,新开发的 TRAP 标记将为厚朴优
株鉴别、优良品种选育、分子标记辅助选择等后续研究工作提供便利。 相似文献
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