5个美洲黑杨品种EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

【目的】利用新型分子标记EST-SSR,从分子水平上区分亲缘关系较近、形态上难以区分的5个美洲黑杨品种,并构建其指纹图谱。【方法】采用EST-SSR分子标记,从22对引物中筛选多态性引物,用以鉴别I-69杨、陕林3号、创新杨1号、南抗1号、北抗1号5个美洲黑杨品种,并根据多态性条带计算各品种间的遗传相似系数,构建各自的指纹图谱。【结果】从22对引物中筛选出的17对多态性引物共扩增出86条谱带,其中多态性条带69条,多态性比率为80.23%,有5对引物可以将5个美洲黑杨品种完全区分开;各品种间的遗传相似系数为0.444 4~0.717 2,平均相似系数为0.580 8;构建了各品种的EST-SSR特征指纹图谱。【结论】5个美洲黑杨品种间的遗传差异较小,其中创新1号与陕林3号遗传差异最大。     

基于ISSR标记的17个杨树品种的遗传多样性分析

目的研究安徽省主栽杨树品种间的亲缘关系。方法通过ISSR分子标记手段,结合NTSYS-pc2.10e分析软件,对17个杨树品种进行遗传相似性系数计算,并按UPMGA法进行聚类分析。结果 10条引物共获得扩增谱带67条,其中多态性条带54条,多态性百分比为80.6%,各品种之间的遗传相似系数在0.377 3~0.962 0,遗传距离为0.038 7~0.974 7。结论通过聚类分析将17个杨树品种分为4类,并运用特殊谱带建立杨树品种的分子检索表。由此可知ISSR分子标记技术能揭示材料间的遗传多样性,为杨树的分类、鉴别和选育提供依据。     

山东省主栽杨树品种的AFLP分析与鉴定

为了解山东省主栽杨树品种间的亲缘关系,为其分类、鉴别和良种利用提供依据,利用8对引物对23个供试品种进行了AFLP分析.结果表明,8对引物共得到扩增谱带1183条,平均多态性比例为77.3%,每对引物鉴别效率为100%;参试品种间遗传差异较大,遗传距离为0.14～ 0.51,平均遗传距离0.31;当相似系数为0.728,供试品种被分为8大类,聚类结果与其系谱关系一致;运用特殊谱带建立了分子检索表,用于参试品种分子水平上的鉴定.     

辽宁地区主栽杨树品种的SRAP标记遗传多样性分析

采用SRAP分子标记技术对17个采自辽宁不同地区的杨树材料进行了遗传多样性研究。结果表明:利用31对SRAP引物共扩增出685个多态性条带,平均每个引物扩增出23.2条带,多态性比率为95.3%,各品种之间的遗传相似系数在0.3622～0.9475,平均相似系数为0.6549。通过UPGMA聚类分析将17个杨树材料分为4个群,其划分结果与传统分类基本一致,证明SRAP标记是一种适于杨树遗传多样性研究的分子标记技术。聚类结果表明,品种间遗传差异最小是银中杨和毛白杨,差异最大的是意大利45杨和毛白杨;2个小胡杨的种内遗传差异最小,而2个意大利45杨的种内遗传差异较大。     

菜豆种质资源的ISSR分析及特异性标记的筛选

采用ISSR分子标记技术对吉林省各科研院所近年审定和主栽的36份菜豆种质的遗传多样性进行研究。从100个引物中筛选出可扩增出清晰稳定条带、重复性好的20个引物对36个菜豆品种的基因组DNA进行PCR扩增。采用NTSYSpc2.10软件计算遗传相似系数,利用UPGMA方法进行聚类分析。结果表明:20个引物共扩增出87条带,其中多态性谱带76条,多态性比率为87.36%,多态性较高。36个品种间遗传相似系数在0.65~0.89之间。利用UPGMA法可将供试菜豆分为4大类,聚类结果显示,菜豆种质资源间的亲缘关系与来源地的相关性较为紧密,20号菜豆与其他品种的遗传距离相对较远。引物840为20号品种的特异性标记,在1 100 bp处多出一条谱带;引物861为27号品种的特异性标记,在1 000 bp处有一条谱带缺失;引物846为31号品种的特异性标记,在1 050 bp处有一条谱带缺失。3个引物针对20、27、31号品种的特异性标记可将3个品种快速从所有供试的36个菜豆品种中鉴别出来。     

杨树新杂种的SSR分析及鉴定

以2个杨树杂交新品种(编号分别为:02-9-22,02-12-29)及其亲本和毛白杨无性系30号为材料,从36对SSR引物中筛选出在杂交新品种双亲之间多态性明显、重复性比较好的12对引物,用于杨树的遗传变异分析.共扩增出125个DNA片段,其中111个片段呈现多态性,占总扩增片段的88.8％,片段大小介于80～1 000 bp之间.基因型间的平均遗传相似系数为0.445 9.聚类分析结果表明,杂交种与亲本的亲缘关系较近,与毛白杨30号的亲缘关系较远.选用3对引物构建5个杨树品种的指纹图谱,在该图谱中,每个品种都有自身独特的片段.     

加洲鲈与罗非鱼群体的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对加洲鲈和罗非鱼种群间的亲缘关系进行分析。品种间带纹相似系数（共享度）根据Lynch的公式进行计算：F_（xy）=2N_（xy）/N_x＋N_y（N_（xy）是RAPD指纹图谱中品种X和品种Y的共有带纹数,N_x和N_y分别为品种X和品种Y各自可分辨带纹总数）。品种间的遗传距离（D）根据2个品种的共享度（F）来计算：D=1-F。根据遗传距离的D值,再用UPGMA法求出各类间距离后再聚类。结果显示：从20个随机引物中筛选出4个清晰,多态性丰富的引物用于分析。各种群平均每一引物所获得的带纹数为：加洲鲈7.8±2.45,罗非鱼5.1±1.87。4个引物共扩增出加洲鲈35条带其中特异性带16条,罗非鱼21条带其中特异性带8条,测得加洲鲈与罗非鱼之间的带纹相似系数为0.236,遗传距离为0.764,表明加洲鲈和罗非鱼之间的亲缘关系较远。     

应用RAPD标记技术研究大花蕙兰种质资源亲缘关系

利用RAPD标记技术对来自2个企业的18个大花蕙兰品种进行了检测。结果表明：从50个10碱基随机引物中筛选出15个多态性高、重复性好的引物,共扩增出92条DNA条带,其中90条为多态性带,占97.8%,平均每个引物扩增多态性带6条。18个种质之间的相似系数变化范围为0.1975～0.6704,平均相似系数为0.4761;遗传距离变化范围为0.3296～0.8025,平均遗传距离0.5239。基于RAPD的扩增结果建立了UPGMA亲缘关系聚类图,18份种质在遗传距离0.5239处被划分为4个类群。供试的18份种质间的遗传亲缘关系与其花色和花枝类型存在一定的相关性。     

5个树莓品种的DNA多态性分析及其亲缘关系

为了研究不同树莓品种的亲缘关系,为引种和栽培奠定基础,本文通过RAPD技术对5个树莓品种的DNA多态性进行了分析,并且对RAPD产物进行了相似系数统计和聚类分析。从20个随机引物中选出多态性效果好的7个引物,共获得65个DNA扩增片段(120 bp～2 000 bp),扩增表现出明显的多态性,多肽率高达92.3%。此外,5个树莓品种在遗传距离为0.75的位置上可以聚为3类:加拿大黑莓为第一类,南方黑树莓为第二类,其他3种树莓(海尔特兹、凯欧、莎妮)为第三类。相似系数统计结果显示,5个品种中凯欧和莎妮的亲缘关系最近,遗传相似系数为0.933,加拿大黑莓与其他两类树莓的亲缘关系较远,与海尔特兹的亲缘关系最远,遗传相似系数只有0.400。     

利用SSR标记评价甘蔗品种遗传多样性

[目的]探讨甘蔗品种的遗传多样性。[方法]利用15对多态性SSR引物对20个广西主栽甘蔗品种的基因组DNA进行分析,研究现代甘蔗品种的遗传亲缘关系及各品种间的遗传距离。[结果]利用15对多态性SSR引物对20个甘蔗品种的基因组DNA进行扩增,共获得185条谱带。平均每个引物扩增出12.33条谱带,其中多态性条带占87.6%。供试甘蔗品种之间的遗传相似系数为0.554～0.826,平均值为0.679。根据UPGMA聚类分析结果,20个供试甘蔗品种可分为2个类群。[结论]20个供试甘蔗品种具有丰富的遗传多态性。SSR标记能较好地揭示供试甘蔗品种之间的遗传差异和亲缘关系。     

4个白杨新品种和父母本及近缘种的SRAP遗传分析与指纹图谱构建

【目的】对外观相近、较难区分的4个白杨新品种及其父母本和3个近缘种进行遗传分析并构建指纹图谱,为这些品种在生产应用中的分子鉴定提供技术依据。【方法】采用SRAP分子标记技术,对03-4-9、03-4-22、03-5-17和03-6-11 4个白杨新品种及I-101杨、截叶毛白杨、84K、毛白杨30号、银毛杨共9个白杨品种开展遗传分析及指纹图谱构建。【结果】14对多态性高的SRAP引物对9个白杨品种共扩增出167条条带,平均每对引物扩增条带为11.93条。其中多态性条带143条,多态性比率为85.63%,多态性高。聚类分析表明,9个白杨品种之间的遗传相似系数为0.40~0.76,其中4个白杨新品种与父本截叶毛白杨和毛白杨30号亲缘关系较近,遗传相似系数平均值分别为0.65和0.63,与母本I-101亲缘关系稍远,遗传相似系数平均值为0.49。利用重复性好的3对引物(me5/em10、me7/em2和me7/em3)扩增图谱构建了9个白杨品种的指纹图谱,每对引物均可将9个白杨品种单独区分开。【结论】9个白杨品种在SRAP位点有较高的多态性,SRAP分子标记能很好地用于杨树品种的鉴定及指纹图谱构建。     

15个北方杨树栽培品种倍性检测与SSR遗传分析

为丰富杨树栽培品种的遗传信息,收集了中国北方地区广泛栽培的15个杨树栽培品种,在分析其倍性水平的基础上,利用毛细管电泳检测技术对这些品种进行了SSR遗传分析。结果表明:‘黑林1号杨’和‘白林3号杨’均为三倍体,表明在北方地区栽培的杨树品种中存在三倍体种质;利用筛选的12对引物共扩增出106个等位变异,多态性等位变异105个,特异性等位变异46个,多态性等位变异和特异性等位变异分别占99.06%和43.40%。依据各引物的等位位点特征,选择LG1926和LG1937这2对引物,可将15个品种进行有效区分,并为每个品种构建了SSR指纹图谱;采用非加权组平均法进行聚类分析,发现各品种间的相似系数为0.622 6～0.886 8,平均相似系数为0.733 7。     

中早熟马铃薯品种(系)遗传多样性ISSR分析

【目的】采用ISSR分子标记研究中早熟马铃薯品种(系)的亲缘关系及遗传多样性,为南方冬作区中早熟马铃薯育种亲本选择提供参考。【方法】利用筛选的8条ISSR引物,对33份广西各地应用的马铃薯品种(系)进行遗传多样性分析。【结果】8条引物共扩增出46条条带,其中有29条呈多态性,平均多态性带比率为63.0%。33份马铃薯品种(系)的遗传相似系数在0.63045~1.00000,平均相似系数为0.80967。聚类分析结果表明,在相似系数0.79000附近,33份马铃薯品种(系)可分为四大类,第一大类有4个品种(系),分别是DE03-34-6、JL03-786、中薯19号和中薯18号;第二大类仅有中薯6号;第三大类包括龙脊1号和DE03-79-1两个品种(系);余下的26份品种(系)聚为第四大类。在分类中,部分亲缘关系较近的品种如中薯13号和中薯14号、中薯18号和中薯19号可聚为较近的一类,说明ISSR分子标记能够正确地按马铃薯的亲缘关系进行分类。【结论】供试马铃薯品种(系)间存在较丰富的遗传多样性,可根据聚类分析结果中的遗传距离选择亲本,为南方冬作区中早熟马铃薯育种亲本的选择和杂种优势利用提供参考。     

13个大果油茶品种遗传与亲缘关系的ISSR分析

[目的]探讨广西大果油茶资源的遗传多样性及其亲缘关系,为其种质资源利用和品种选育等提供参考.[方法]采用ISSR分子标记技术对13个大果油茶品种（系）的遗传与亲缘关系进行分析.[结果]从99条ISSR引物中筛选出6条多态性引物,共扩增出56条带,其中54条为多态性带,多态性比例为95.2％,平均每个引物扩增的条带数为9.33条.供试大果油茶品种间的遗传相似系数范围为0.2222～0.7826,平均相对遗传相似系数为0.5293.UPGMA法聚类分析结果表明,供试的13个大果油茶品种（系）可分为3个类群.UPGMA法聚类分析结果表明供试的13个大果油茶品种（系）可分为3个类群.[结论]13个广西大果油茶品种资源间的遗传基础较宽.     

蛇龙珠葡萄品种亲缘关系的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对4个酿酒葡萄品种和11个鲜食葡萄品种的亲缘关系进行了研究。从30个随机引物中筛选出16个扩多态性引物,用于15个样品的正式扩增。共扩增出134条DNA带,其中多态性扩增带99条,占73.9%。根据DNA扩增结果计算出品种的遗传距离,并构建聚类树状图。分析结果表明,红地球、瑞必尔与其它13个品种的遗传距离最远,巨峰系列的葡萄品种间遗传距离值较小,蛇龙珠品种与其它3个酿酒葡萄品种在遗传基因上存在差异,与品丽珠的亲缘关系最近。     

杨树新杂种（无性系）ISSR指纹图谱的构建

【目的】构建2个白杨新杂交种无性系及其亲本的指纹图谱,为杨树林木的品种鉴定和白杨的育种提供理论依据。【方法】以2个白杨新杂种无性系(品种编号为02-9-22和02-12-29)及其母本银白杨I-101杨、父本84K杨为4个供试杨树品种,先以2个亲本为材料,从30个ISSR引物中选取多态性好的引物,再用筛选出的引物对4个杨树品种进行基因组多态性分析和遗传关系分析,并构建指纹图谱。【结果】利用筛选出的10个引物共扩增出95条条带,其中多态性条带70条,多态性条带率为73.68%,条带大小为100～1 000bp。聚类分析表明,2个杂交新品种与父本84K的亲缘关系较近,相似系数分别为0.737和0.874;与母本的亲缘关系稍远,相似系数分别为0.674和0.705。最终用807,834,836和841共4个引物构建了杨树新杂种的指纹图谱。【结论】用于构建指纹图谱的4个引物都可对试验中的4个杨树品种进行鉴别与区分。     

咸宁部分桂花品种亲缘关系的SRAP分析

利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记,对咸宁地区的32个桂花(Osmanthus fragrans)品种进行了亲缘关系研究.15对引物共扩增出210个谱带,其中182个为多态性谱带,多态性比率达86.67％;其中银桂品种群的Shannon's信息指数(0.339 3)和遗传多样性指数(0.2164)最高.遗传多样性分析表明供试桂花品种群间的遗传分化系数为57.89％,说明品种群间遗传分化高.根据扩增结果进行聚类分析,在遗传相似系数0.644水平上可将32个桂花品种分为5个类群.供试品种的地理分布与其分类学地位具一定的相关性.     

应用PCR技术研究四川小麦品种特异性位点遗传多样性

采用PCR技术对四川省近50年来年推广面积达66700hm2(100万亩)以上的40个小麦品种特异性位点(即STS-PCR标记)的遗传多样性进行了研究。13对STS-PCR引物和26种引物-酶组合中,92 3%的引物和88 5%引物-酶组合能揭示小麦品种间的多态性。在检测到的92条DNA片段中,86 96%具有多态性,平均每种引物-酶组合检测到3 08条(变幅为1～8条)。这些品种间遗传相似系数(GS)变幅为0 478～0 989,平均GS值为0 753。STS-PCR标记遗传距离聚类分析能将40个品种相互区分开,其结果与亲缘关系较一致。各年代品种间GS值变化趋势表明,从60年代后四川小麦品种的遗传多样性呈明显的下降趋势。     

36 个蝴蝶兰品种遗传关系的ISSR 分析

采用ISSR分子标记技术对36个蝴蝶兰栽培品种进行遗传多样性和亲缘关系的分析.结果表明,从100条ISSR引物筛选出11条引物共扩增出98条清晰的谱带,其中91条表现出多态性,多态比率为92.86％,品种间的相似系数在0.57～0.96之间,表明供试品种间具有丰富的遗传多态性.并检测到4条品种特异性条带,可用来鉴定供试蝴蝶兰种的3个品种.36个品种在遗传距离L=0.644处可分为7个组,3个最大的组分别代表了黄色系、白色系和红色系,而在同一色系的亲缘关系中又以唇瓣的颜色来聚类,可见聚类情况与花色特征比较一致.     

基于表型和ISSR标记的小株型荷花遗传多样性分析

采用表型性状和简单重复序列间扩增(ISSR)标记,对36个碗莲品种(系)进行遗传多样性分析。基于23个表型性状,品系间欧氏遗传距离系数平均值为7.78,范围在3.54～15.78间,聚类分析显示,以欧氏距离系数E=11.0,可将所有材料分为4组,其中32个聚在一个类群。基于10个ISSR引物,36个品系共获得62条扩增带,其中44条具有多态性,多态带百分率为71.0%,品系间的遗传相似性系数平均值为0.40,范围在0.10～0.71间,以遗传相似系数GS=0.60,可将所有材料分为3组。ISSR标记分析与表型性状分析都说明,碗莲资源遗传背景狭窄,互相间亲缘关系比较接近。