BMPR-IB基因作为绵羊多胎性能候选基因的研究

利用BMPR-IB基因作为湖羊、小尾寒羊及中国美利奴(新疆型)多胎类型多胎性能候选基因,采用PCR-RFLP方法和聚丙烯酰胺凝胶电泳分析该基因在湖羊、小尾寒羊和中国美利奴(新疆型)多胎类型中的多态性,并与其产羔数进行相关性分析,结果3种羊在BMPR-IB基因编码序列746碱基处均检出与BooroolaMerino相同的A→G突变,可分为3种基因型(BB型、B 型和 型)。湖羊中几乎全部为BB基因型;小尾寒羊中以BB和B 基因型为主;中国美利奴(新疆型)多胎类型中以B 基因型为主;BMPR-IB基因与产羔数显著相关,是上述3种羊的多胎主效基因。     

小尾寒羊与湖羊遗传检测的比较

以我国特有的两大优良绵羊品种小尾寒羊和湖羊为检测对象，采用中心产区典型群随机抽样法，从小尾寒羊中心产区山东省梁山县和湖羊中心产区浙江省湖州市分别抽取小尾寒羊60只和湖羊63只，用水平板淀粉凝胶电泳检测11个结构基因座的频率，观测9项相对形态学特征标记的表型频率，测定其体尺，记录当地生态环境特征，从结构基因座、形态学特征和生态特征3个方面对两者间的遗传差异进行定量分析。结果表明：小尾寒羊在Al、Es-D、Ly座位上是单态性的，而湖羊仅在Al、Es-D上是单态性的；小尾寒羊的基因平均纯合度高于湖羊；两者除在角的有无和色斑上存在差异外，其他表型特征基本相似；在生态特征方面，湖羊产区与小尾寒羊产区相比，海拔低、年平均气温高、降水量充沛。     

绵羊微卫星OarJL36和FecB基因的多态及连锁分析

 【目的】阐明微卫星座位OarJL36与小尾寒羊高繁殖力主效基因FecB之间的连锁关系,为绵羊高繁殖力的标记辅助选择提供依据。【方法】分析与FecB基因最紧密连锁的微卫星座位OarJL36在高繁殖力绵羊品种（小尾寒羊和湖羊）与低繁殖力绵羊品种（特克塞尔和多赛特）中的遗传多态性,探讨该微卫星与小尾寒羊FecB基因的连锁不平衡关系。【结果】高繁殖力小尾寒羊和湖羊在骨形态发生蛋白受体IB（bone morphogenetic protein receptor IB,BMPR-IB）基因编码序列第746位碱基处发生了与Booroola Merino绵羊相同的FecB突变（A746G）,低繁殖力特克塞尔和多赛特绵羊则未发生这种突变;小尾寒羊BB、B+、++型频率分别为0.500、0.386和0.114,湖羊BB、B+、++型频率分别为0.800、0.200和0.000;微卫星座位OarJL36在4个绵羊品种463个个体中共检测到10个等位基因和31种基因型,最小等位基因为160 bp,最大等位基因为200 bp;182 bp等位基因在小尾寒羊（n = 308）和湖羊（n = 60）中处于优势等位基因,频率分别为0.696和0.925,在特克塞尔（n = 47）和多赛特绵羊（n = 48）中的频率分别为0.085和0.125,在BB型小尾寒羊（n = 154）和BB型湖羊（n = 48）中该等位基因频率更高,分别为0.916和0.938,而在++型小尾寒羊（n = 35）中的频率为0.129;OarJL36在小尾寒羊、湖羊、特克塞尔、多赛特以及BB、B+、++型小尾寒羊和BB、B+型湖羊中的多态信息含量分别为0.475、0.139、0.661、0.768、0.152、0.588、0.843、0.115和0.212;连锁不平衡分析显示小尾寒羊FecB基因B等位基因与OarJL36微卫星座位182 bp等位基因之间存在较强的连锁关系,但仍有一定的重组（D′=0.614）,而+等位基因与OarJL36微卫星座位上的160、192、196、200 bp等位基因完全连锁（D′=1.000）。【结论】OarJL36微卫星座位182 bp等位基因与小尾寒羊FecB基因B等位基因之间存在较强的连锁关系,是与小尾寒羊多羔主效基因紧密连锁的一个遗传标记。     

常年性和季节性发情绵羊品种HIOMT基因的PCR-SSCP分析

【目的】探讨季节性与常年性发情绵羊品种在HIOMT基因序列上的差异,为培育常年性发情绵羊品种提供辅助选择标记(MAS)。【方法】采用基因克隆测序及PCR-SSCP技术,分析小尾寒羊、新疆细毛羊、多浪羊和阿勒泰羊共计179个个体的羟基吲哚-氧-甲基转移酶(HIOMT)的3′非翻译区部分序列及其遗传多样性。【结果】在HIOMT基因的3′非翻译区存在PCR-SSCP多态,共发现AA、BB、CC、AB、AC和BC 6种基因型,在小尾寒羊群体中发现以上6种基因型,在新疆细毛羊群体中发现除CC基因型外的其他5种基因型,在阿勒泰羊群体中发现AA、BB、AB和BC 4种基因型,在多浪羊群体中只发现了AA、CC和AC 3种基因型。与AA基因型相比,BB基因型在第94,95,96和201 bp 4处发生了突变,CC基因型在第94,201和217 bp 3处发生了突变。Hardy-Weinberg平衡检验显示,小尾寒羊和多浪羊群体处于平衡状态,新疆细毛羊和阿勒泰羊群体处于非平衡状态。小尾寒羊、新疆细毛羊和阿勒泰羊群体多态信息含量为高度多态(PIC>0.5),多浪羊群体为中度多态(0.25相似文献   

兰州大尾羊血液蛋白多态性研究

为了探明兰州大尾羊的种质和遗传特性，采用聚丙烯酰胺凝胶水平板电泳，检测了131只兰州大尾羊血红蛋白、白蛋白、后白蛋白、转铁蛋白、慢-α2-球蛋白、血清淀粉酶、酯酶、苹果酸脱氯酶的多态性．结果发现，除白蛋白和慢-α2-球蛋白未表现出多态外，其他各蛋白质和酶均不同程度地呈现出多态，其中血红蛋白、后白蛋白、血清淀粉酶、酯酶、苹果酸脱氢酶各有2个等位基因，3种基因型；兰州大尾羊的平均基因杂合度为0．4802，等位基因有效数为1．924，多态座位百分比为0．75．对Nci氏标准遗传距离进行聚类，发现兰州大尾羊与滩羊最近，其次为大尾寒羊和小尾寒羊．青海细毛羊、滩羊、兰州大尾羊、青海藏羊、考湖羊、河北杂种细毛羊、新疆细毛羊、罗姆尼半细毛羊、大尾寒羊、小尾寒羊、兰州大尾羊等11个绵羊品种的基因分化系数为0．07936，这表叫中国的绵羊品种的遗传变异性的92．064％是由遗传多态现象引起的，而7．936％来自品种间差异，即中国绵羊在血液蛋白质水平上的遗传分化程度不高．     

PMSG诱导新疆军垦细毛羊、哈萨克羊、湖羊同期发情的研究

为了取得良好的同期发情效果和排卵率以提高母羊受孕率,在准噶尔盆地南部山地用PMSG诱导了新疆军垦细毛羊、哈萨克羊、湖羊的同期发情,观察了3个品种羊的排卵情况,并统计了卵巢黄体的平均数目。试验结果表明,哈萨克羊同期发情率最高(90.6%),显著高于新疆军垦细毛羊(84.7%)和湖羊(83.12%)(P<0.05);哈萨克羊、新疆军垦细毛羊和湖羊的排卵率分别为94.28%、95.08%和98.46%,其中,哈萨克羊和新疆军垦细毛羊间差异不显著,而湖羊的排卵率显著高于哈萨克羊和新疆军垦细毛羊(P<0.05);哈萨克羊、新疆军垦细毛羊和湖羊卵巢上黄体生成的平均个数分别为1.192、1.233和3.172个。相比而言,地理环境和气候条件对不同品种母羊发情的影响较大,对排卵率的影响并不明显。     

5个绵羊群体的BMPR-IB基因多态性分析

选择骨形态发生蛋白受体IB基因(BMPR-IB)作为一种侯选基因.采用PCR-RFLP方法检测其在杜泊绵羊、湖羊、小尾寒羊及杜湖、杜寒杂交F1代群体中的多态性分布规律.结果显示:在杜泊绵羊中只存在1种基因型,即野生型( );在湖羊和小尾寒羊中检测到两种基因型,纯合突变型(BB)和杂合突变型(B );湖羊中BB、B 基因型频率分别为0.909和0.091,小尾寒羊中BB、B 基因型频率分别为0.563和0.437;在杜湖和杜寒杂交绵羊中发现两种基因型(B 和 ),杜湖羊B 和 基因型频率分别为0.875和0.125;杜寒羊B 和 基因型频率分别为0.786和0.214.BMPR-IB分子标记可作为一种新颖的辅助技术用于评估杜泊绵羊与湖羊或小尾寒羊杂交后代的繁殖力.     

绵羊微卫星471U和FecB基因多态性及连锁分析

以高繁殖力(小尾寒羊和湖羊)及低繁殖力(特克塞尔和道塞特)4个绵羊品种为研究对象,分析与绵羊高繁殖力主效基因FecB紧密连锁的微卫星基因座471U在高繁殖力和低繁殖力绵羊品种中多态性,探讨该微卫星基因座与小尾寒羊FecB基因的连锁不平衡关系。结果表明:高繁殖力品种小尾寒羊和湖羊在骨形态发生蛋白受体IB(BMPRIB)基因编码序列第746位碱基处发生了FecB突变(A746G),而在低繁殖力的特克塞尔和道塞特绵羊中未检测到该突变;小尾寒羊BB、B+、的基因型频率分别为0.494、0.392和0.114,湖羊BB、B+的基因型频率分别为0.815和0.185。471U基因座在4个绵羊品种的466只个体中共检测到3个等位基因和5种基因型;小尾寒羊(316只)、湖羊(54只)、特克塞尔(48只)、道塞特(48只)和BB型(156只)、B+型(124只)、型(36只)小尾寒羊以及BB型(44只)、B+型(10只)湖羊群体中优势等位基因大小分别为200、204、200、200、200、200、200、204、204bp,其频率分别为0.767、0.926、1.000、0.625、0.808、0.730、0.722、0.943、0.850。连锁不平衡分析显示,小尾寒羊FecB基因B等位基因与471U基因座200bp等位基因以及+等位基因与471U基因座204bp等位基因均存在一定的连锁不平衡(D′分别为0.430、0.444)。     

绵羊Fsp27基因5'-UTR区碱基突变与 尾脂沉积能力的关联性

[目的]明确绵羊脂肪特异蛋白27基因(Fsp27)5'端非编码区(5'-UTR)g.16767527位点和g.16767779-16767780位点突变与其尾脂沉积能力的关联性,为低脂肪绵羊品种选育提供理想的分子标记,提高低脂肪绵羊品种改良选育效率.[方法]以5个不同尾脂沉积能力的绵羊品种为研究对象,包括脂尾型绵羊品种阿勒泰羊,短脂尾型绵羊品种小尾寒羊和湖羊,长瘦尾型绵羊品种中国美利奴细毛羊和萨福克羊,采用PCR-SSCP结合基因测序对绵羊Fsp27基因5'-UTR区碱基突变情况进行检测,并分析相关突变与绵羊尾脂沉积能力的关联性.[结果]绵羊Fsp27基因5'-UTR区g.16767527位点为C/A突变,在所检测的绵羊群体中均存在3种基因型(CC、CA和AA),但在不同尾脂沉积能力绵羊品种群体中的基因型频率存在明显差异:阿勒泰羊群体中以CC基因型为主,基因型频率为0.869;小尾寒羊和湖羊群体中以CA基因型为主,基因型频率分别为0.698和0.628;中国美利奴细毛羊和萨福克羊群体则以AA基因型为主,基因型频率分别为0.616和0.833.g.16767527位点的基因型分布在阿勒泰羊、小尾寒羊和湖羊群体中极显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(PHWE<0.01),在萨福克羊群体中显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(PHWE<0.05).g.16767779-16767780位点为双碱基突变,对应为GG/GG、GG/TC和TC/TC基因型;在尾脂沉积能力强的阿勒泰羊、小尾寒羊和湖羊群体中,g.16767779-16767780位点以TC为优势等位基因,对应的等位基因频率分别为0.862、0.954和0.927;在尾脂沉积能力差的中国美利奴细毛羊和萨福克羊群体中则以GG等位基因为主,其等位基因频率分别为0.980和0.983.这2个位点的突变均对绵羊Fsp27基因5'-UTR区二级结构产生明显影响.[结论]绵羊Fsp27基因5'-UTR区g.16767527位点的C/A突变和g.16767779-16767780位点的GG/TC突变与其尾脂沉积能力密切相关,可作为分子标记应用于低脂肪绵羊品种的辅助选育.     

孕酮受体基因多态性及其与小尾寒羊产羔数的关系

设计15对引物,采用PCR-SSCP技术检测孕酮受体(progesterone receptor,PGR)基因全部9个外显子在小尾寒羊、湖羊、特克塞尔和多赛特中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对小尾寒羊产羔数的影响.只有引物P9扩增片段具有多态性.对于P9扩增片段,在小尾寒羊、湖羊和多赛特中均检测到AA、AG和GG型,...     

7个绵羊微卫星DNA标记在绵(山)羊群体中的多态性检测

选择分别位于绵羊2,4,6,9,17和19号染色体上的7个微卫星标记OarFCB11,OarFCB128,MAF70,OarAE101,MAF33,OarFCB48和OarFCB304,对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的典型群随机样本相应位点进行了PCR检测。结果表明,每个微卫星座位发现7个以上等位基因,且均存在多态;湖羊、同羊、长江三角洲白山羊群体杂合度(H)分别为0.9092,0.9177和0.8867,相应的群体基因平均多态信息含量(PIC)分别为0.9024,0.9116和0.8774,有效等位基因数(Ne)分别为11.7723,12.4538和11.6104,均以同羊为最高;以产生有效条带为标志,随机样本的PCR扩增效率存在明显的群体间和座位间差异,以长江三角洲白山羊和OarFCB128座位为最高;以7个座位微卫星等位基因频率推算群体间标准遗传距离,山羊与绵羊群体间遗传距离远大于绵羊群体之间,湖羊、同羊间亲缘距离系数R为0.1998。研究结果提示:选择的7个微卫星DNA座位均为多态座位;以7个微卫星标记为测度,湖羊、同羊及长江三角洲白山羊具有丰富的遗传多态性;7个微卫星标记可进一步用于绵山羊近缘种间遗传分析研究。     

兰州大尾羊血红蛋白多态性的研究

采用聚丙烯酰胺凝胶水平板电泳检测了１３只兰州大尾羊的血红蛋白（Ｈｂ），结果表明，Ｈｂ位点存在 ＨｂＡ和 ＨｂＢ两个等位基因，频率分别为 ０．７９３９、０．２０６１，其中 ＨｂＡ为优势基因。存在ＨｂＡＡ、ＨｂＡＢ和ＨｂＢＢ３种基因型，频率分别为０．０５３４、０．３０５３和０．６４１３，其中ＨｂＢＢ为优势基因型。对６６只兰州大尾羊血红蛋白基因型与红细胞压积（ＰＣＶ）的相关分析表明：ＨｂＡＢ型的ＰＣＶ大于ＨｂＢＢ型，但差异不显著（Ｐ＞０．０５）。     

林肯杂交羊生长发育模型研究

 用Mitscherlich模型、Logistic模型和Compertz模型分别拟合林肯细毛杂种羊生长发育规律,其中以Compertz模型拟合的R²最大.由Compertz模型参数进-步估算出公羊和母羊两性别间其拐点体重分别为16.68和17.63kg,拐点日龄分别为121和145天;最大日增重分别为111.0和100.70g/天.估算公母羊的最大体重分别为47.95kg和45.37kg,瞬时相对生长率分别为0.20和0.17.     

波德代羊及其杂种一代二代血红蛋白多态性的研究

运用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对引入我国的肉用品种绵羊波德代及其杂种一代二代和本地土种羊(蒙古羊)的血红蛋白(Hb)多态性进行了检测分析.结果表明:波德代羊及其杂种存在3种基因型,HbAB型在3个群体中均占优势,频率分别为0.725 0,0.527 8,0.517 2,其中HbB基因为优势基因.在土种羊中HbBB为优势基因型,频率为0.724 1,优势基因为HbB.     

The characterization of acid and pepsin soluble collagen from ovine bones (Ujumuqin sheep)

Ovine bones are the major by-products after slaughtered. The present study was conducted to extract and characterize acid soluble collagens (ASC) and pepsin soluble collagens (PSC) from ovine bones (Ujumuqin sheep). Ovine bones collagen were identified by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) as type I collagen. The results of Fourier transform infrared (FTIR) spectra analysis testified the existence of triple superhelical structure in both ASC and PSC, showing pepsin did not disrupt the triple helical structure of ovine bones collagen. Glycine, accounting for one-third of total amino acids, was the major amino acid for ovine bones collagen. Higher imino acid content was responsible for higher thermal denaturation temperature of ovine bones collagen compared to fish collagens. The isoelectric point of ASC was lower than PSC due to the higher content of acidic amino acids. Therefore, this study provides the potential reference for collagen extraction and application of ovine bones by-procduct.     

湖羊羔羊早期断乳（7日龄）后代乳粉饲喂效果研究

选择早期断乳(7日龄)湖羊双羔,随机分成试验组A和B,分别饲喂高蛋白、高脂肪含量的代乳粉A和高蛋白、中等脂肪含量的代乳粉B。通过38 d羔羊代乳粉集中饲喂试验,结果显示,试验组A羔羊1~45 d平均日增重与对照组A1间差异不显著(P0.05),其中,30~40日龄日增重显著(P0.05)高于对照组A1;试验组B羔羊1~45 d平均日增重显著低于对照组B1(P0.05);在体尺指标中,两个组别的试验组羔羊体高与对照组间无显著差异(P0.05),体长、胸围和管围在20日龄时,试验组B羔羊显著低于对照组B1(P0.05),30日龄时,试验组A和B羔羊胸围分别显著(P0.05)低于对照组A1和B1;试验组A羔羊体尺生长速度快于试验组B,但生长速度回升转折点落后于试验组B。表明早期断乳(7日龄)湖羊羔羊选用高脂肪含量的代乳粉A的饲喂效果好于中等脂肪含量的代乳粉B。     

藏绵羊生长激素(GH)基因的克隆及序列分析

【目的】对藏绵羊生长激素(GH)基因进行了克隆和序列分析,以期为进一步开展藏绵羊GH基因与其生长发育性状的相关分析以及基因定位、表达调控等研究提供理论基础。【方法】用特定引物对藏绵羊GH基因进行PCR扩增、克隆和测序,使用DNAMAN4.0、BioEdit 7.0.0、DnaSP 4.10.1等生物信息学软件进行序列分析和比较基因组学研究。【结果】藏绵羊GH基因(GenBank登录号EF077162)由5个外显子和4个内含子组成,完整编码序列(Complete coding sequence,CDS)全长为654 bp。5个外显子大小分别为13,161,117,162和201 bp;4个内含子大小分别为246,227,229和275 bp;内含子与外显子的连接区序列遵循基因组成规则。信号肽由26个氨基酸组成,成熟肽由191个氨基酸组成。藏绵羊与已报道的其他绵羊GH基因编码区核苷酸序列及推导的氨基酸序列同源性均为99.0%~100%;而与山羊、普通牛、瘤牛、大额牛、牦牛、水牛各物种在GH基因编码区核苷酸序列上同源性分别为98.4%,98.0%,97.7%,97.5%,97.5%,98.1%;相应的氨基酸序列间同源性分别为100%,99.0%,99.0%,98.1%,98.6%,98.1%。【结论】成功地克隆了藏绵羊GH基因;牛科物种内,藏绵羊与已报道的其他绵羊以及与山羊、普通牛、瘤牛、大额牛、牦牛、水牛等物种在GH基因编码区核苷酸序列和推导的氨基酸序列上均具有较高的保守性。     

iTRAQ-based quantitative proteomic analysis reveals key pathways responsible for scurs in sheep (Ovis aries)

Scurs is a horn phenotype that exhibits as small corneous structures on the skull due to the deformed development of horn tissues. Previous genome-wide association analysis of scurs in Soay sheep showed a significant association to the polled locus, relaxin-like receptor 2(RXFP2). However, the molecular mechanism underlying the development of scurs remains largely unknown. In the present study, we performed an i TRAQ-based quantitative proteomic analysis of horn tissues from both scurs and normal two-horned and four-horned individuals among Altay sheep to identify the differentially expressed proteins(DEPs) responsible for the scurs phenotype. In total, 232 proteins showed significant differential expression, and the most significant Gene ontology categories were the adhesion processes(biological adhesion(P=4.07×10–17) and cell adhesion(P=3.7×10–16)), multicellular organismal process(single-multicellular organism process(P=2.06×10–11) and multicellular organismal process(P=2.29×10–11)) and extracellular processes(extracellular matrix organization(P=4.77×10–16) and extracellular structure organization(P=4.93×10–16)). Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG) analysis showed that extracellular matrix(ECM)-receptor interactions and focal adhesion pathways were the most significant pathways. This finding is consistent with the reduced formation of extracellular matrix in scurs and the development of deformed horn tissues. Our study helps to elucidate the inheritance pattern of sheep horn traits from the perspectives of downstream expressed proteins.     

兰州大尾羊血清淀粉酶酯酶及苹果酸脱氢酶同工酶的研究

采用聚丙烯酰胺凝胶水平板电泳,对131只兰州大尾羊的血清淀粉酶(Amy)、酯酶(Es)和苹果酸脱氢酶(MHD)的多态性进行检测和分析。结果发现,Amy2基因座2个等位基因Amy2A和Amy2O的基因频率分别为0.166 4和0.833 6,3种基因型Amy2AA*、Amy2AO和Amy2OO的频率分别为0.007 7、0.277 6和0.694 7;Es基因座2个等位基因Es+和Es-的基因频率分别为0.409 4和0.590 6,3种基因型Es++、Es+–、Es––的频率分别为0.169 6、0.483 6和0.348 8;MDH基因座2个等位基因MDSF和MDHS的频率分别为0.264 8和0.735 2,3种基因型FF、FS和SS的频率分别为0.142 9、0.207 7和0.649 4。