DNA芯片技术研究进展

DNA芯片技术是近年来发展迅猛的生物高新技术，它是利用光刻合成、高速打印或电定位等技术，在支持物硅、玻璃或尼龙膜上胺照特定的排列方式有序地固化大量的基因探针，形成DNA微阵列。生物样品DNA／RNA通过PCR／RT－PCR扩增和荧光标记后与DNA微阵列杂交，通过荧光扫描器及计算机分析，即可获得样品的基因序列及表达的信息。     

PVP在桑叶总DNA提取中的应用

采用CTAB（Cetyltrimethyle Ammonium Bromide,十六烷基三乙基溴化铵）缓冲液,附加1%PVP（Polyvinylpyrrolidone,聚乙烯吡咯烷酮）,用平衡酚-氯仿-异戊醇-核糖核酸酶法提取桑叶总DNA,经全自动分光光度计SmartSpec^TM检测,结果表明附加PVP的CTAB缓冲液提取的桑叶总DNA纯度高,A260/A280比值在1.80～1.90之间,多糖、蛋白质、RNA去除较彻底,能满足对总NDA质量要求较高的试验,如AFLP分析。     

鉴别丁香假单胞菌丁香致病变种和豌豆致病变种的 DNA 探针的制备

把引起豌豆枯萎病的丁香假单胞菌丁香致病变种 Pseudomonas syringae pv.syringae 菌株3319和丁香假单胞菌豌豆致病变种 P.syringae pv.pisi 的模式菌株2452的染色体 DNA 分别用限制性核酸内切酶 HindⅢ完全消化,再用 T_4DNA 连接酶把消化好的 DNA 片段连接到用HindⅢ内切酶消化的质粒载体 pUC19上,然后把重组的质粒载体转化到大肠杆菌(E.coli RR1)中去克隆.把菌株3319和2452的 DNA 用 p~(32)标记做成探针,分别与克隆菌落杂交,筛选出只对菌株3319的 DNA 有特异性的1个重组 DNA 的克隆和对菌株2452的 DNA 有特异性的2个重组 DNA 克隆.再把这3个重组质粒 DNA 分别用 P~(32)标记做成探针,与菌株3319和2452的 DNA 杂交,也显示只对各自 DNA 来源的菌株具有特异性.这3个重组质粒中,有2个携带有菌株2452的 DNA 片段,1个为0.82 kb。另1个略小于0.58 kb,还有1个质粒携带有菌株3319的 DNA 片段,为0.85 kb.     

DNA指纹技术的发展及其在真菌分类上的应用

ＤＮＡ指纹技术是从分子水平区别不同类群生物之间差异的重要手段,该技术发展迅速,使用广泛。本文对ＤＮＡ指纹技术的概念、分类及其应用进行了评述。对同一名称可能指不同技术,或同一技术有不同名称的混乱状况进行了归并或说明。简述了ＤＮＡ指纹技术以及相关技术进展和该技术在真菌系统分类及其他相关领域取得的成就。     

茄子雄性不育株和可育株的胞质DNA和核DNA差异分析

以茄子(Solanum melongenaL)雄性不育株“正兴1号”(S)和可育株(F)的总DNA为模板,对60个随机引物进行了筛选,找到5个其RAPD(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)扩增产物在茄子雄性不育系和对照材料间存在稳定差异的引物．将该5个引物同时扩增总DNA、核DNA和线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)．以总DNA为模板时得到多态性片段9个,以核DNA为模板时得到5个,以mtDNA为模板时得到9个．以总DNA为模板时得到的9个扩增片段中,有5个在总DNA和mtDNA中同时出现,而在核中没有出现,即认为来自mtDNA,这5个片段中,有4个来自可育株,1个来自不育株,说明不育株和可育株在mtDNA上存在差异;有4个片段同时出现在以总DNA和核DNA为模板的扩增中,但在以mtDNA为模板的扩增中却没有出现,认为是来自核DNA,这4个片段中,有3个来自不育株,一个来自可育株,说明可育株和不育株在核DNA上也存在差异．结果初步表明：新发现的茄子雄性不育可能是核质相互作用所引起．     

一种快速的植物DNA制备方法

介绍一种DNA提取方法，该方法具有快速，简便，高效的优点，可在60 min内提取出纯净无RNA的DNA，获得的DNA纯度高，DNA质量可满足酶切及PCR等分子生物学实验要求。     

烟草雄性不育的分子机理研究进展

综述了烟草雄性不育分子机理研究的最新进展，包括：线粒体DNA与雄性不育；叶绿体DNA与雄性不育；核DNA与雄性不育等研究。     

用Digoxigenin标记重组质粒DNA探针特异性的改良

鸡马立克病病毒基因组DNA的BanHI-K_3片断克隆的重组质粒DNA及从质粒上切下的经电泳和电洗脱提纯的BamHI-K_2DNA片断,在用非放射性Digoxigenin([dig])标记后,分别用作检测马立克病病毒DNA的探针。对两种探针特异性的比较表明,BamHI-K_3克隆的全质粒DNA探针对其它质粒来源的NDA仍表现出很强的交叉反应性,而用经电泳电洗脱提纯的BamHI-K_3DNA片断制备的探针,则仅对含同源DNA片断的质粒提取物或菌苔裂解物产生明显呈色反应,但对不含同源DNA的其它质粒DNA提取物几乎完全不呈现交叉反应。     

绞股蓝叶片DNA提取方法的比较研究

研究5种提取绞股蓝(Gynostemmna pentaphullum(Thumb)Makino)基因组DNA的方法,分别是简易法、高盐沉淀法、高盐低pH法、改良的SDS法和改良的CTAB法。提取结果经过琼脂糖凝胶电泳以及RAPD检测,5种方法均能提取出绞股蓝基因组DNA,提取的DNA数量多少依次是简易法、高盐沉淀法、高盐低pH法、改良SDS法和改良CTAB法,其中高盐低pH值法提取的DNA的RAPD图谱条带最亮、最清晰。从DNA的产量、质量以及实验耗时等方面综合比较,高盐低pH法为绞股蓝叶片DNA提取的最适方法。     

不同保藏处理的蜘蛛标本基因组DNA提取

DNA的提取是分子生物学研究的基础技术,提取的DNA的纯度及结构的完整性是进行基因工程各项研究所必须的条件。采用SDS法,对75%乙醇浸泡标本、无水乙醇浸泡标本、-70°C冷冻标本及活体蜘蛛进行了基因组DNA提取。经比较,活体蜘蛛、-70°C冷冻标本和无水乙醇浸泡标本提取效果较好,75%乙醇浸泡标本提取效果最差。     

适于ISSR-PCR扩增的松毛虫基因组DNA的提取

为了方便稳定地获得松毛虫基因组DNA,寻找适合于松毛虫ISSR-PCR扩增的DNA的提取方法,分别用SDS-蛋白酶K法和CTAB法对松毛虫雌成虫进行基因组DNA的提取。结果显示:用SDS-蛋白酶K法提取的基因组DNA带型整齐,无降解,DNA得率和纯度都较高,操作简单无需纯化,用于ISSR扩增时其稳定性和重复性都很好;而用CTAB法提取出的DNA浓度低,杂质较多,琼脂糖凝胶电泳甚至检测不出,此方法提取的DNA作为ISSR反应模板时需要进行纯化。     

稻飞虱基因组DNA提取方法的比较

 以褐飞虱（Nilaparvata lugens Stal）为材料,分别采用SDS法,CTAB法,冰KAc法和饱和NaCl法提取褐飞虱的基因组DNA。通过电泳、紫外光谱分析和ISSR-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA数量与质量。结果表明： CTAB法和SDS法提取的DNA质量明显优于冰KAc法和饱和NaCl法,适于PCR扩增。并且SDS法提取的DNA经过PCR扩增后得到较多的多态性位点。因此,SDS法是实验室提取稻飞虱基因组有效,经济实用的方法。     

利用微卫星DNA标记进行黄牛的亲子鉴定*

 亲子鉴定在畜牧业生产中具有重要实际应用价值,常见其用于建立准确的系谱档案和家畜归属的诉讼案件。其中标准的三联体（即在母子关系是已知的情况下,鉴定假设父亲与子畜是否有亲生关系）和单亲［即父子（女）或母子（女）亲生关系的确定］两种情况下的亲子鉴定在畜牧生产中具有普遍意义。以云南文山黄牛为试验材料,采用10对常染色体微卫星DNA标记对这两种情况下的亲子关系进行了检测分析。结果表明,常染色体微卫星DNA标记在标准的三联体和单亲两种情况下都能用来进行亲子鉴定,结果较准确,但标准三联体情况下的亲子鉴定更准确。确定的不同模式下亲子鉴定的方法,可为家养动物亲子鉴定标准方法和流程的建立提供依据。     

4种思茅松总DNA提取方法的比较

以思茅松(Pinuskesiyavarlangbianensis)针叶为材料,分别采取了简易提取法、高盐沉淀法、CTAB沉淀法和高盐低pH法提取基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、限制性内切酶处理和RAPD3种方法对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA产量、质量等方面的优缺点进行总结,并根据群体分子遗传学研究工作的实际特点确定了高盐沉淀法为最佳方法     

猪毛干部位基因组DNA的三种提取方法比较

通过比较三种猪毛干基因组DNA提取方法,改进了提取猪毛干基因组DNA的技术方法。将DNA提取物进行琼脂糖凝胶电泳、紫外可见分光光度计及PCR扩增分析,结果表明,在毛干中能成功提取到基因组DNA,其浓度和纯度足以满足分子生物学技术试验的要求,该技术还可以减少对动物的伤害,在样品不易获得的濒危动物研究中尤为适用。     

利用微卫星DNA标记进行黄牛的亲子鉴定

亲子鉴定在畜牧业生产中具有重要实际应用价值,常见其用于建立准确的系谱档案和家畜归属的诉讼案件。其中标准的三联体(即在母子关系是已知的情况下,鉴定假设父亲与子畜是否有亲生关系)和单亲[即父子(女)或母子(女)亲生关系的确定]两种情况下的亲子鉴定在畜牧生产中具有普遍意义。以云南文山黄牛为试验材料,采用10对常染色体微卫星DNA标记对这两种情况下的亲子关系进行了检测分析。结果表明,常染色体微卫星DNA标记在标准的三联体和单亲两种情况下都能用来进行亲子鉴定,结果较准确,但标准三联体情况下的亲子鉴定更准确。确定的不同模式下亲子鉴定的方法,可为家养动物亲子鉴定标准方法和流程的建立提供依据。     

一种改良的水稻细胞质基因组制备方法

 水稻叶绿体和线粒体基因组较小,且均被测序清楚,可以作为研究细胞质遗传的良好材料,而如何快速有效地分离纯化获得高产量和高质量的细胞质基因组是从DNA水平上研究细胞质遗传变异的前提条件。本研究结合了蔗糖密度梯度离心法-全基因组DNA扩增法(whole genome amplification,WGA),对细胞质基因组的制备进行了改良。改良后的方法仅使用20g的水稻叶片,即可在2d时间内得到浓度达300ng/μL以上,总量达40μg以上的高纯度(OD260/280值为18~20)、完整的叶绿体DNA (chloroplast DNA,cpDNA)和线粒体DNA (mitochondrial DNA,mtDNA)。该法制备的细胞质基因组可以满足多种细胞质基因组实验的要求,包括Solexa全基因组测序技术的要求。     

三种试剂盒提取粪便隐孢子虫微量DNA的效果比较

[目的]筛选一种高效、简单、快速、价格合理的粪便微量DNA提取试剂盒。[方法]用3种不同的试剂盒提取粪便DNA,通过比较所提取DNA的浓度、纯度、提取率及巢式PCR产物等评价提取效果。[结果]Genmed试剂盒提取的DNA浓度最高、PCR产物条带最亮,但提取时间相对较长,成本相对较高。天根试剂盒提取的DNA纯度最高,DNA浓度适中,成本适中,提取时间最短。碧云天试剂盒提取的DNA纯度、浓度均不高且提取时间最长,但成本最低。[结论]Genmed试剂盒提取粪便微量DNA最灵敏。天根试剂盒提取DNA适于DNA纯度要求较高的分子生物学研究。     

红掌基因组DNA提取方法的优化

[目的]采用改良的SDS法提取红掌基因组DNA。[方法]以4种不同花色的红掌品种为材料,分别采用改良SDS法和CTAB法提取红掌基因组DNA,用紫外分光光度计测定英DNA在A260nm和A280nm下的吸光值,根据A260nm/A280nm的比值检测DNA的纯度和浓度。[结果]用改良SDS方法提取的DNA透明且无杂质,A260nm/A280nm比值在1．6—2．0,DNA纯度较高,可满足红掌分子生物学试验的要求;用CTAB法提取的DNA呈褐色或淡黄色,A260nm/A280nm,比值小于1．6,DNA纯度较低并且浓度低,舍有大量蛋白,此方法不适于提取红掌基因组DNA。[结论J采用改良SDS法可以提取到高质量的红掌基因组DNA,所提取的DNA的纯度和浓度可以满足红掌分子生物学研究的要求。