石斛的分子生物学鉴定--基于RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了15种石斛属药用植物,选用10个有效引物(10bp)扩增出99条DNA片段,用于遗传多样性分析、构建UPGMA聚类图。分析结果表明：RAPD方法能有效鉴别所试石斛属植物,其多态位点百分率为84．85％,表现出丰富的遗传多样性。     

石斛的分子生物学鉴定--基于RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了15种石斛属药用植物,选用10个有效引物(10 bp)扩增出99条DNA片段,用于遗传多样性分析、构建UPGMA聚类图.分析结果表明:RAPD方法能有效鉴别所试石斛属植物,其多态位点百分率为84.85%,表现出丰富的遗传多样性.     

内蒙古3个绒山羊RAPD的初步研究

利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，研究了内蒙古地区3个绒山羊品种的DNA多态性，由此推导它们之间的遗传距离和系统发育关系。在所使用的12种随机引物中，有8种随机引物扩增出多态谱带，共检测到32个RAPD标记，其中有21个发生变异。用Nei的片段公享度公式计算了品种间的遗传距离，用UPGMA聚类法构建了系统发育树。结果表明：内蒙古白绒山羊的3个类群彼此亲缘关系较近，分化不明显；内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊聚为一个大类，辽宁绒山羊和乌珠穆泌白绒山羊聚为一个大类，说明内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊有较近的亲缘关系，乌珠穆沁白绒山羊与辽宁绒山羊的亲缘关系较近。     

常见桃属植物RAPD多态性及亲缘关系分析

用RAPD技术对桃属植物常见的4个种（普通桃、新疆桃、山桃、甘肃桃）及部分品种、变种进行多态性分析，共选用27个10bp随机引物，扩增出178个DNA片段，其中多态性片段142条。对这178条DNA片段进行亲缘关系分析。结果表明，供试的21个试材可以分为3类：普通桃、山桃和甘肃桃。新疆桃被归入普通桃中，推论它可能起源于普遍桃，这与采用形态学、同功酶、核型分析等结果一致。     

5个树莓品种的DNA多态性分析及其亲缘关系

为了研究不同树莓品种的亲缘关系,为引种和栽培奠定基础,本文通过RAPD技术对5个树莓品种的DNA多态性进行了分析,并且对RAPD产物进行了相似系数统计和聚类分析。从20个随机引物中选出多态性效果好的7个引物,共获得65个DNA扩增片段(120 bp～2 000 bp),扩增表现出明显的多态性,多肽率高达92.3%。此外,5个树莓品种在遗传距离为0.75的位置上可以聚为3类:加拿大黑莓为第一类,南方黑树莓为第二类,其他3种树莓(海尔特兹、凯欧、莎妮)为第三类。相似系数统计结果显示,5个品种中凯欧和莎妮的亲缘关系最近,遗传相似系数为0.933,加拿大黑莓与其他两类树莓的亲缘关系较远,与海尔特兹的亲缘关系最远,遗传相似系数只有0.400。     

芥菜遗传多样性的RAPD分析(英文)

随机扩增多态性DNA (RAPD)是一种新的分子标记技术 利用RAPD标记对芥菜 (BrassicajunceaCoss .) 16个变种的遗传多样性进行了分析 从 60个 10bp随机引物中筛选出 2 7个有效引物 这 2 7个有效引物共扩增出 336条DNA带 ,其中 2 75条为多态性带 ,占总数的 81 85% 平均每个引物扩增出的DNA带数为 12 4 4 不同引物扩增出各自不同的DNA指纹图谱 ,大部分图谱均有特征或特征带型 芥菜的RAPD多态性百分率和平均每个引物扩增的DNA带数均明显高于已     

花椰菜自交不亲和性的RAPD分析

应用随机扩增多态性DNA（RAPD）分析方法，分别对3组花椰菜自交不亲和系和自交系的基因组DNA进行差异分析。筛选出20个10bp随机引物进行RAPD反应，扩增片段分子量在0．3－3kb之间。其中分别有3、2、3个引物在各组中扩增出差异片段5、4、5条。结果表明，花椰菜自交不亲和系与自交系基因组DNA之间存在明显差异，扩增出的差异片段与花椰 菜自交不亲和性相关。初步探讨了花椰菜自交不亲和性的遗传机制及RAPD技术在自交不亲和系选育过程中的应用前景。     

濒危植物天目铁木遗传多样性的RAPD分析

濒危植物天目铁木Ostrya rehderiana现仅在天目山残存5株野生植株,是国家一级保护植物。为研究该物种繁殖与复壮的有效途径,利用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记,对这5株天目铁木的遗传多样性和遗传分化进行基因组DNA多态性分析,统计18个扩增较为稳定的引物在5个DNA样品中扩增的电泳带总数与多态带的数目。结果显示：共扩增出176个DNA片段,片段大小为200~2 800 bp,其中多态性谱带为88条,占50%,表现出了丰富的RAPD多态性。根据遗传距离,利用UPGMA构建了个体亲缘关系树状图。结果表明,4号和5号植株间亲缘关系最近,遗传距离为0.133 5,1号和3号植株间亲缘关系最远,遗传距离为0.461 0,1号植株与其他4株的亲缘关系均较远,遗传距离为0.366 5~0.461 0,聚类时被聚在其他4株之外。这一结果与5株间物理距离分布的位置差异相符。     

7种菊科药用植物的RAPD分析

[目的]利用RAPD技术研究7种菊科药用植物的遗传多样性及亲缘关系。[方法]从50条10 bp随机引物中筛选出10个多态性好的引物进行RAPD扩增,扩增DNA片段数据用UPGMA聚类法构建系统发育树。[结果]10条引物共扩增出337条带,多态性带337条。聚类结果显示,RAPD分子标记构建的系统发育树在族内属间与传统分类系统一致。[结论]该研究可为菊科药用植物的鉴别提供参考,并为针对性地进行菊科植物的保护提供依据。     

利用RAPD分析花椰菜遗传多样性及预测杂交优势组合

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）方法，对24个花椰菜品种的基因组DNA进行多态性分析。选用20个10hp随机引物共扩增出180条DNA片段，其中多态性片段123条，占68．3％。结果表明，花椰菜品种间具有丰富的遗传多样性。遗传相似分析表明，品种间的亲缘关系远近与地理分布有一定的相关性；品种熟性的差异与其遗传基因差异相关。根据花椰菜不同品种的遗传距离差异，结合其生物学特性、地理距离，预测试验材料中的5个杂交组合可能获得理想的杂交优势。     

白魔芋种质资源的RAPD分析

白魔芋原产于中国,是魔芋属中品质最优的种,种内资源类型丰富,为进一步分析各类型或产地间的亲缘关系,应用RAPD分子标记技术,用40个随机引物(10-mer)对34份白魔芋种内资源基因组DNA进行PCR扩增,有11条引物能够在34份材料中扩增出112条稳定的带,其中有93呈多态性。用dps软件对扩增产物进行聚类分析,根据聚类结果将34份材料划分为5类,通过与叶柄斑纹比较分析,发现各类与叶柄斑纹关系不紧密,而有较为明显的地域相关性,该结果为深入了解白魔芋种内资源的亲缘关系,提供了分子水平的依据。     

甘肃枸杞属植物的RAPD分析

[目的]研究甘肃枸杞属植物种间亲缘关系。[方法]提取甘肃省内分布的枸杞属植物的基因组DNA,用RAPD方法检测其DNA多态性,并用UPGMA聚类法对其种间关系进行分析。[结果]从80条10碱基的随机引物中筛选出了28条适用于枸杞属植物RAPD分析的引物。在6份种质材料中共扩增出了171条带,其中118条为多态性条带,多态性条带的比例为69.0%;遗传相似性系数在0.39～0.70之间,平均值为0.59。[结论]聚类分析显示6份甘肃枸杞属种质材料中宁夏枸杞、北方枸杞和截萼枸杞亲缘较近,中国枸杞和新疆枸杞亲缘较近,黑果枸杞与其他种质间遗传距离较远。     

基于水稻内含子长度多态性开发禾本科扩增共有序列遗传标记

 通过在多态位点两侧的保守编码序列上设计引物，可以开发出在不同物种间通用的基于PCR的分子标记，称为扩增共有序列遗传标记（ACGM）。【目的】探讨利用已公布的水稻籼、粳两亚种的基因组序列开发禾本科ACGM的可行性。【方法】根据水稻两亚种间的内含子长度多态性，开发了38对ACGM引物。用这些引物对玉米、粟、大麦、小麦、竹子、旱稗草和大米草6个属共12个不同材料进行PCR实验。【结果】几乎所有引物都可在至少1种材料中扩增出特异条带，而1/3以上的引物可以在全部供试材料中获得特异扩增产物。在每一种供试材料中，平均大约有2/3的引物可以成功扩增出目的条带。这些引物在各属内不同种、亚种或品种（系）之间的多态性比例在24.1%～90.3%之间，平均为44.6%。【结论】利用水稻基因组序列信息开发禾本科通用型ACGM是可行的。     

万寿菊属品种资源遗传关系的ISSR分析

【目的】通过ISSR分子标记研究品种资源遗传关系,探讨其种群遗传多样性水平和遗传结构,为了解品种间遗传多样性、品种间亲缘关系、育种及科学合理保存和利用现有万寿菊属种质资源提供理论依据和技术支持。【方法】对29份万寿菊材料及2份孔雀草材料利用ISSR分子标记进行遗传关系分析。【结果】用11个引物对31份万寿菊属材料进行PCR扩增,每个引物扩增的ISSR条带数在5—11条,平均每条引物能扩增出6.8条带,多态位点百分率为40%—100%。聚类分析结果表明,ISSR分类结果与传统分类的结果基本一致,31份材料按照万寿菊及孔雀草分为两大类,并且同系列万寿菊品种被划为同一亚组。【结论】利用ISSR标记技术可较准确分析万寿菊属材料间的亲缘关系及遗传多样性。     

Analysis of the Germplasm Resources and Genetic Relationships Among Hybrid Cymbidium Cultivars and Native Species with RAPD Markers

The random amplified polymorphic DNA （RAPD） marker was assessed to detect the genetic relationships among 48 hybrid Cymbidium cultivars from Japan, Korea, China, and USA, and 2 species of native Cymbidium. Twenty primers were screened from 100 random decamer primers, and a total of 258 DNA bands were amplified, 253 of which （98.1%） were polymorphic. The average number of polymorphic DNA bands amplified by each primer was 12.6. All cultivars were distinguishable when a number of primers were considered. Genetic similarities among the cultivars and species were estimated based on the amount of band sharing ranging from 0.364-0.817 with an average of 0.581. According to the data, a dendrogram of genetic relationship, which was constructed using the UPGMA method, showed that all the tested cultivars and native species were classified into five cluster groups with the similarity coefficient of 0.592. It revealed that the genetic relationships among tested accessions were to some extent related with their origin, flower colour, branch type, and genealogy. It further indicated that the RAPD technique is a useful tool for studying the genetic relationships among hybrid Cymbidium cultivars.     

应用RAPD技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系

为了对红叶李Prunus cerasifera cv.Atropurpurea,李P.salicina和杏P.armeniaca的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据,也为了验证传统的形态学分类方法,从132个随机引物中筛选出20个引物对红叶李、李和杏的8个材料进行了基因组DNA扩增,均具有多态性,共扩增出264条带,平均每个引物产生13.2个RAPD片段.RAPD带型及聚类分析表明:RAPD技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开,红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系,各属品种之间都有不同的遗传距离,证明RAPD技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA指纹,可将参试的各品种鉴别出来,从而说明了RAPD技术能够用于种或品种之间的鉴定.图2表2参12     

国产菱属植物亲缘关系的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对国产菱属(Trapa L.)植物10个种16个样品的遗传变异进行了研究.从50个10碱基随机引物中筛选出18个多态性引物用于正式扩增,共扩增出205条DNA带,其中多态性带为165条,占79.5%.根据DNA扩增结果计算了菱属各种间的Nei's遗传一致度和遗传距离,并采用UPGMA构建了聚类树状图.根据RAPD分析的聚类结果,结合野外观察和形态学性状的聚类分析我们建议:(1)将国产菱属植物划分为3个种,即欧菱(T.natans L.)、野菱(T. incisa Sieb. et Zucc.)和细果野菱(T. maximowiczii Korsh.);(2)除细果野菱外,其余2个种中果实角的数目均有从四角转变为二角的,所以把角刺数目作为菱属种间划分的主要依据这一点值得商榷;(3)欧菱、丘角菱可能是栽培菱的野生种或近缘种;(4)细果野菱为现存菱属中最原始的种.     

烟草种质资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR聚类分析

 【目的】深化烟草种质资源遗传多样性研究,为种质利用改良烟草提供科学依据。【方法】应用ISSR分子标记方法,以烟草属6个种共96份有代表性的种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】（1）从90个ISSR引物中筛选出18个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得314条稳定的条带,其中多态性条带299条（占95.2%）。（2）应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数（GS）,其GS在0.28～0.97之间,遗传多样性丰富。其中普通烟草栽培品种间的GS在0.62～0.98之间,平均为0.78,品种间的遗传基础相对狭窄,普通烟草栽培种与野生种及黄花烟的GS在0.28～0.58之间,平均为0.42,种间遗传差异较大;（3）对91份普通烟草栽培品种的分子系统聚类分析表明：地理来源相同的部分品种有相对聚合现象或少部分国内外品种和类型出现交叉聚类,与其亲缘关系较近有关;个别品种自行一类,与其特异的遗传基础差异较大有关。【结论】ISSR是一种较有效、稳定和可靠的分子标记,本研究可为烟草育种的亲本利用及开展烟草遗传连锁图的构建和核心种质指纹图谱的绘制提供重要的科学依据。     

应用RAPD 技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系

为了对红叶李Prunus cerasifera cv .Atropurpurea , 李P .salicina 和杏P .armeniaca 的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据, 也为了验证传统的形态学分类方法,从132 个随机引物中筛选出20 个引物对红叶李、李和杏的8 个材料进行了基因组DNA 扩增,均具有多态性, 共扩增出264 条带, 平均每个引物产生13.2 个RAPD 片段。RAPD 带型及聚类分析表明:RAPD 技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开, 红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系, 各属品种之间都有不同的遗传距离, 证明RAPD 技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA 指纹, 可将参试的各品种鉴别出来, 从而说明了RAPD 技术能够用于种或品种之间的鉴定。图2 表2 参12     

百合种质资源遗传多样性及亲缘关系的RAPD分析

以百合新鲜鳞叶为材料,利用RAPD分子标记技术对16份不同生态型的百合种质的遗传多样性和亲缘关系进行了分析.研究结果表明,从120条随机引物中筛选出35条有效引物,共得到769个扩增位点,其中628个位点具有多态性,占81.7%.UPGMA聚类分析结果表明.16份百合种质在阀值为0.9407处分为2个聚类群,即百合科两个不同属的植物:百合属和大百合属;阈值为0.5790处,百合属被分为3个不同的种:百合、卷丹和细叶百合.聚类结果和亲缘关系分析表明不同供试百合之间的遗传多样性较高,亲缘关系较远,且各种质遗传距离与地理距离具有一定的相关性.