家蚕微卫星标记的筛选及其在遗传多样性分析中的应用

利用插入片段长度在 7kb以上的家蚕基因组文库 ,采用目标重复序列杂交法筛选微卫星位点 ,获得了 8个微卫星标记。用这 8个微卫星标记对 6个家蚕品种 (菁松、兰 10、C10 8、P5 0、5 4A、法 5 0B)进行多态性研究 ,共产生 2 3个等位基因 ,平均每个位点近 3个等位基因 ,杂合度范围 0～ 0 .75 0 ,平均杂合度为 0 .5 0。表明微卫星标记能反映各品种之间丰富的多态性 ,品种间的聚类结果较好地反映了家蚕品种的化性和地理分布特性。     

高邮鸭微卫星DNA标记遗传多样性的研究

利用9个微卫星标记分析了高邮鸭群体遗传多样性。结果9个微卫星座位共检出42个等位基因，基因频率分布在0．0135—0．6216之间，平均每对引物可检测4.7个等位基因，9个微卫星座位的平均杂合度为0．7375，平均多态性含量为0．6707，表明高邮鸭群体遗传变异大，遗传多样性丰富。     

10个绵羊品种的微卫星DNA多态性研究

本研究利用FAO和ILRI推荐的21个微卫星引物,结合荧光标记PCR,检测了中国9个地方绵羊（Ovisaries）品种和1个外来绵羊品种的遗传多样性。21个微卫星座位均呈现出高度多态,多态性信息含量和杂合度均表明我国地方绵羊品种有着丰富的遗传多样性。本研究共检测到342个等位基因,有效等位基因数在2．1752～9．4997之间,座位平均杂合度在0．5248～0．8551之间,品种平均杂合度在0．633-0．761之间。聚类关系和主成分分析结果与其起源、育成历史及地理分布基本一致。     

利用微卫星标记分析溧阳鸡的群体遗传变异

选用30对微卫星引物分析了溧阳鸡的等位基因组成,计算了各座位的基因杂合度和多态性信息含量。结果30个微卫星座位共检出156个等位基因,基因频率分布在0.0088-0.5之间,平均每对引物可检测5.2个等位基因,30个微卫星座位的平均杂合度为0.681,平均多态性含量为0.623,表明溧阳鸡群体遗传变异大,遗传多样性丰富。     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用 9对微卫星引物对 170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增 ,结果表明 ,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性 ,所有扩增结果都能重复。微卫星标记平均每个座位检测到 4 .5 6个等位基因 (3～ 7个 )。 9对微卫星引物平均多态信息含量为 0 .6 0 72 ,标记平均杂合度为 0 .74 2 3。本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考     

塞北兔群体遗传变异的微卫星标记

检测了125只塞北兔在6个微卫星座位的基因型,分析了等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量等参数值,并对塞北兔在6个微卫星座位Hardy-Weinberg平衡检验。结果显示:塞北兔在6个微卫星座位共检测到的等位基因30个,每个基因座位为4~6个,等位基因大小在129~244bp之间,塞北兔除了在SOL03基因座位呈中度多态性变异以外,在SOL33、SOL44、7L1B10、L7C11和SAT12等5个微卫星座位呈高度多态性变异;除了在基因座位SOL33和SAT12以外,塞北兔在其他4个基因座位SOL03、SOL44、7L1B10、L7C11均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

利用微卫星血液DNA标记分析延边圈养黑熊遗传多态性

为了掌握圈养黑熊的相关遗传信息,试验采用微卫星血液DNA标记法研究圈养黑熊的遗传多态性,试验选择延边地区3个熊场175头圈养黑熊,对其进行遗传多态性检测,计算其等位基因频率、多态信息含量(PIC)等。结果表明:圈养黑熊的6个微卫星座位总共检测到39个等位基因,每个位点的等位基因数量为4.000~8.000个,每个微卫星的平均位点为6.500个,基因频率分布在0~1之间;6个微卫星基因座的平均PIC为0.571 7,且PIC值在0.453 4~0.742 2之间,延边3个黑熊养殖群体的平均PIC均高于0.5,表明6个微卫星标记均具有高度多态性,因此可以分析圈养黑熊的遗传多态性。     

长毛兔微卫星标记与生产性状的相关研究

为在长毛兔群体中实施标记辅助选择,试验检测了200只长毛兔的Sat13、Sol33、Sat4、So144、Sat2、Sat5、Sat7与Sat12 8个微卫星座位,结果表明:8个微卫星座位在长毛兔群体中共检测到61个等位基因,平均每个座位的等位基因数是7.63个。等位基因数最多的座位是Sat4和So133,具有10个等位基因,等位基因数最少的座位是Sat12,只有5个等位基因;长毛兔群体内的平均多态性信息含量和平均杂合度的值分别为0.798和0.826,大小顺序依次为Sat4>So133>Sat5>Sat13>So144>Sat2>Sat7>Sat12,说明长毛兔群体内在这8个微卫星座位上基因型纯合度较低,遗传变异较大。同时分析了微卫星座位对长毛兔产毛量、体重性状的效应,本研究结果表明8个微卫星座位与不同日龄产毛量、不同日龄体重之间存在相应的显著相关性。     

利用微卫星标记分析长毛兔遗传多态性及其与产毛量相关性

利用微卫星标记技术，分析了皖系长毛兔的遗传多样性和4个微卫星座位与1岁时产毛量之间的关系。结果表明：皖系长毛兔4个微卫星座位上平均检测到4．5（3～6）个等位基因，平均杂合度为0．680（0．630-0．721），平均多态信息含量为0．642（0．559—0．705）；Sol33微卫星座位与1岁时产毛量呈显著相关（P〈0．05），其中基因型为AD和BD的个体1岁时产毛量与其他3种基因型个体间均存在显著差异（P〈0．05）；其他3个微卫星座位（Sat4、Sat13、Sol44）与1岁时产毛量相关不显著（P〉0．05）。     

苏系长毛兔的遗传多样性分析

为了从DNA分子水平揭示苏系长毛兔遗传多态性和遗传结构,选用6个多态性较好的微卫星标记,对96只宜兴拉必得种兔场发育良好的苏系长毛兔群体进行了检测分析。利用等位基因频率计算苏系长毛兔群体的期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、等位基因数、有效等位基因数。6个微卫星座位全部呈现出高度多态性(PIC0.5),共检测到36个等位基因,每个座位的等位基因数在5~7个之间,平均等位基因数6.00±0.8944个,平均有效等位基因数为3.74±0.8159,该长毛兔群体期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分别为0.7257±0.0589和0.6758±0.0721。研究结果表明:苏系长毛兔的微卫星座位有丰富的遗传多样性。通过选育可以使该苏系长毛兔群体进一步纯化,从而使其生产性能稳定。     

济宁百日鸡群体遗传多样性的微卫星标记分析

采用微卫星标记技术,在分布于家鸡的22条染色体的25对微卫星引物中,筛选出10对多态性丰富的微卫星位点,对60个个体的DNA多样性进行了检测。结果共检测到29个等位基因,每个微卫星座位的等位基因数目为2~5个,平均等位基因数为2.90,该鸡群的平均基因杂合度(H)为0.348,多态性信息含量(PIC)为0.511。表明所检测的济宁百日鸡群体的遗传多样性较丰富,具有一定的选择潜力,可以做进一步的选择利用。     

陇东绒山羊微卫星DNA遗传多样性的研究

利用9个微卫星座位,8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR扩增产物,对120只陇东绒山羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测,对其群体遗传学特性进行分析。结果表明：陇东绒山羊在9个微卫星座位中共检测到90个等位基因,其中微卫星座位LSCV24等位基因数最多,为14个;BMS1248多态信息含量最高,PIC为0．88;DB6座位多态信息含量最低,PIC为0．79。在所标记群体中平均有效等位基因数为7．69±1．65个,平均多态信息含量为0．84±0．03;遗传杂合度均值为0．86±0．03,均高于国内外部分研究结果。说明陇东绒山羊品种遗传多样性丰富,群体遗传变异程度高,育种潜力大。     

西安荷斯坦奶牛群5个基因座位遗传多态性的PCR-RFLP分析

应用PCR-RFLP方法对西安荷斯坦牛的κ-en、β-lg、β-lg5′侧翼区、CSN1S2、IGFBP-3共5个基因座位进行了多态性分析。结果表明，在西安荷斯坦牛群中，没有发现携带CSN1S2^P等位基因的个体，其多态信息含量为0。κ-en基因座位呈现低度多态(PIC=0．2366)，β-lg、β-lg5′侧翼区、IGFBP-3基因座位的多态信息含量分别为0．3168、0．3689、0．4439，均呈现中度多态。κ-en、β-lg、β-lg5′侧翼区、IGFBP-3、CSNIS2基因座位的杂合度和DNA多态度分别为0．2742、0．3947、0．4879、0．4891、0和0．0255、0．0116、0．0333、0．0112、0。而且，在西安荷斯坦牛群中，κ-en、β-lg、β-lg5′侧翼区、IGFBP-3共4个基因座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态，CSN1S2基因座位处于纯合状态。     

微卫星DNA在牦牛亲权鉴定中的应用研究

为了探讨微卫星DNA在牦牛亲权鉴定应用的可行性,选用FAO推荐的17个微卫星座位,检测其在天祝白牦牛群体中的多态性水平,计算这17个微卫星座位用于亲权鉴定的累积排除率。结果表明,17个微卫星座位平均等位基因数为6.235;多态信息含量介于0.191~0.824之间,平均为0.608,为高度多态;一个候选亲本的累积排除概率为0.997,2个候选亲本的累积排除概率为0.999 999 97,各个微卫星座位零等位基因频率均在0.05以下,微卫星DNA可以应用于牦牛的亲权鉴定。     

皖西白鹅微卫星DNA遗传多样性分析

从9对微卫星引物中筛选出6对引物对49只皖西白鹅的DNA多态性进行检测，分析等位基因组成，计算各座位的基因杂合度和多态性信息含量。结果表明，6对微卫星引物共扩增出16个等位基因，基因频率分布在0．0392-0．9608之间。6个微卫星位点的平均杂合度为0．3809，平均多态性信息含量为0．3285。     

昆山麻鸭微卫星DNA标记监测选种效果的研究

利用12个微卫星标记分析了昆山麻鸭高产系F0代和F1代遗传多样性,监测选种效果。结果表明12个微卫星座位共检出83个等位基因,基因频率分布在0.0077～0.5859,平均每对引物扩增出8.3个等位基因。F0代微卫星的平均杂合度为0.7489,平均多态性含量0.7125;F1代为0.7668和0.6901。表明昆山麻鸭种群的群体遗传变异已趋于稳定。     

长江三角洲白山羊群体遗传结构研究

应用结构基因座和微卫星DNA两种遗传标记探讨长江三角洲白山羊群体遗传结构。结果表明，检测的9个结构基因座位上7个存在多态性，座位的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0．1767、0．1457和1．2837；7个微卫星位点上共检测到110个等位基因，位点的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0．8867、0．8774和11．2907。群体内的遗传变异程度相对较高，反映出丰富的遗传多样性，而且微卫星DNA标记揭示的遗传变异高于结构基因座。     

微卫星标记与猪部分肉质性状相关分析

选取位于猪1、4、6号染色体上的15个微卫星座位,以湘黄猪、湘黄×长白×大白(黄长大)、大白×大围子(大围)、大围子等猪群为研究材料,进行了微卫星标记与部分肉质性状的相关性研究。微卫星座位的群体遗传学特性分析表明,各座位等位基因数在2～8个之间,平均等位基因数为5.33个;杂合度在0.504～0.839之间,平均杂合度为0.756;多态信息含量在0.375～0.808之间,平均多态信息含量为0.705。微卫星座位基因型间方差分析结果表明,微卫星ESTMS1与失水率呈极显著相关,SW1841与失水率呈显著相关;ESTMS1与熟肉率呈显著相关;SW286与水分呈显著相关;ESTMS1与粗蛋白质呈极显著相关,SW752与粗蛋白质呈显著相关;SW1311、SW1462与肌内脂肪呈极显著相关,SW871与肌内脂肪呈显著相关。其他微卫星座位未达到显著水平。     

微卫星座位与超细型细毛羊羊毛性状的关联性分析

本研究选取了绵羊基因组1号和3号染色体上的8个微卫星座位,对超细型细毛羊的232个个体的遗传多样性进行了检测。计算了各微卫星座位的等位基因频率（p）、杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（N）。同时检测了研究样本的羊毛纤维直径（WFD）,毛纤维直径离散度（FD-D）,单纤维绝对强力（WAS）,单纤维相对强力（WRS）,强力离散（WSD）,单纤维自然长度（WNL）,单纤维伸直长度（WEL）和单纤维弯曲度（FW）等羊毛性状的8个表型数据。微卫星座位与羊毛性状表型数据的关联性分析结果表明,微卫星 BL-4和KRT2-13两个座位与WEL之间极显著相关（P<0.01）。微卫星Oarcp43座位与WSD之间、微卫星座位Bms1248与羊毛单纤维直径之间极显著相关（P<0.01）。座位Fcb5和OarDB6分别与FW和WAS表现出显著性关系（P<0.05）。     

特克塞尔羊和地方绵羊品种微卫星DNA多态性分析及群体间杂种优势预测

文章宗旨是利用5个微卫星标记分析5个绵羊品种的遗传结构变异,了解特克塞尔羊和地方绵羊品种的遗传多样性及亲缘关系,以期为种质资源合理利用和保护提供理论依据.根据5个绵羊品种在5个微卫星位点的等位基因组成及频率进行群体遗传统计分析.5个微卫星座位在5个绵羊品种中共检测到78.0个等位基因,各位点的等位基因数(Na)11.0～19.0个;5个绵羊品种平均多态信息含量(PIG)为0.615 2～0.7373,平均基因杂合度(He)为0.671 1～0.7820.特克塞尔羊与晋中绵羊的标准遗传距离(DS)为最大(1.6668),其余依次为广灵大尾羊(1.3062)、小尾寒羊(1.095 9)、乌珠穆沁羊(0.8308).表明5个微卫星座位均为高度多态位点,可作为有效遗传标记用于绵羊品种的遗传多样性及品种间遗传关系分析;5个绵羊品种在5个微卫星位点遗传变异大、多态性丰富.据DS推测,特克塞尔羊(Texel)与晋中绵羊(Jinzhong sheep)杂交可望获得较大的杂种优势,与广灵大尾羊(Guangling Large-tailed sheep)、小尾寒羊(Small-tailed Han sheep)的杂种优势次之,与乌珠穆沁羊(U jumqin sheep)杂种优势稍小.