梨RAPD分析技术体系的建立及遗传多样性研究

以梨叶为试材,从DNA提取入手,通过优化扩增程序和反应条件,建立起梨的RAPD分析技术体系,并对15个梨材料进行了遗传多样性分析。结果表明：用改良SDS法提取DNA能有效抑制酚的氧化,所提DNA模板呈无色透明状,A260／A280为1.70以上,DNA（鲜重）平均产率为365.7μg/g,所提模板DNA能成功用于RAPD分析。经过梨遗传多样性分析表明,梨的DNA多态性高,多态带百分率达到81．7％,证明梨的遗传基因广泛、种质资源丰富。根据相似系数用UPGMA法聚类,将起源不同的东方梨和西洋梨明显分成两大类,证明RAPD技术能在DNA分子水平上较好地揭示梨的遗传背景及其亲缘关系。     

一种橡胶树叶片基因组DNA快速PCR扩增方法

为解决现有的橡胶树基因组DNA提取方法步骤繁琐、耗时长等问题,摸索出一种橡胶树叶片基因组DNA快速PCR扩增方法。通过比较分析快速提法与CTAB法,结果显示快速提取方法提取的基因组DNA完整性很高,同时也适用于RAPD分型分析。相比传统的基因组DNA提取、PCR扩增等其它分子生物学流程,快速PCR扩增方法操作简单、简单快速、成本低廉,尤其适用于大批量样品的基因分型分析。     

适合RAPD分析的三种玉米基因组DNA提取方法比较

本文通过对3种玉米基因组DNA提取方法的比较得出，DNA提取时采用一次氯仿／异戊醇抽提方法，得到的DNA质和量都较为理想，并且能够达到RAPD实验的要求。     

3种制备猪肺炎支原体DNA模板方法的探讨

为了筛选出一种快速、高效、廉价提取猪肺炎支原体模板DNA的方法,本研究分别对试剂盒法、双蒸水煮法、酚-氯仿法进行比较,从中选出最佳提取方法。结果显示：这3种方法均适合由菌液中提取基因组DNA;水煮法不能由组织中提取出基因组DNA,试剂盒法可由组织中提取出基因组DNA且得到的目的DNA较纯,但每次提取量少;酚-氯仿法能大批量提取组织基因组DNA,但操作繁琐,易污染且稍有杂带。针对不同的模板,选择合适的DNA制备方法,有利于做出准确检测、提高检测效率,为疾病的早期诊断提供保障。     

黄秋葵基因组DNA提取及鉴定

黄秋葵细胞内含有丰富的果胶类多糖等次生物质,降低了从中提取总DNA的产量和质量。为了获得高质量的基因组DNA,采用改进的十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）法进行提取,并对总DNA进行了纯度和浓度的鉴定。结果表明,改良的CTAB法可有效去除次生物质对DNA的干扰,降低DNA的粘稠度,样品DNA的质量和纯度较高,可用于随机扩增多态性DNA（RAPD）扩增等分子标记分析。     

大白菜基因组DNA快速提取方法的研究

快速高效的DNA提取是作物大规模分子育种的关键一步。旨为构建一种快速提取大白菜基因组DNA的方法,以大白菜叶片为试验材料,比较了CTAB法、二步CTAB法以及4种碱裂解法提取DNA的质量,分析了不同方法提取的DNA为模板的PCR扩增效果,还对不同方法提取的基因组DNA的保存时间和保存条件进行了比较,选择最优的方法在抗根肿病基因分子标记辅助选择中进行了应用。结果表明,CTAB法和3种碱裂解法提取的基因组DNA作为模板的PCR扩增产物,都可以通过8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测到清晰的条带。其中碱裂解法Ⅲ,不仅提取质量好,而且提取过程简单、快速,能够满足大白菜高通量DNA提取的需要,提取的DNA在4℃和-20℃的条件下保存,将保存至30 d的基因组DNA作为模板进行PCR扩增,产物仍然可以通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测到清晰的条带,说明这种方法保存时间较长,经验证,该方法在抗根肿病基因分子标记辅助选择中的应用效果也较好。碱裂解法Ⅲ显著提高了大白菜分子标记辅助筛选的效率,可广泛应用于大白菜分子标记辅助选择育种。     

盾叶薯蓣基因组DNA的提取及RAPD鉴定研究

盾叶薯蓣是中国特有的植物,是甾体激素的重要来源。试验采用CTABⅠ,CTABⅡ,SDSⅠ和SDSⅡ等方法对盾叶薯蓣基因组DNA的提取进行了研究,并且结合核酸测定仪、琼脂糖凝胶电泳法以及RAPD鉴定等方法对DNA质量进行了鉴定。试验结果表明,采用CTABⅠ法可提取高质量DNA供分子标记使用。     

雷公藤叶片DNA提取及RAPD反应体系建立

摘要］目的：筛选并建立雷公藤叶片基因组DNA的RAPD（Random Amplified Polymorphic DNA）技术最优反应体系。方法：采用改良的CTAB法提取叶片总DNA,然后通过对RAPD反应体系中最主要的退火温度、引物浓度、dNTP浓度、DNA模板浓度以及Tag DNA聚合酶浓度等5个因子逐个进行单因子优化。结果：20μl PCR反应体系中,雷公藤叶片基因组DNA RAPD最优反应体系为,最佳温度36℃,引物浓度为1.1μmol/L,dNTP浓度1.25mmol/L,DNA模板浓度3790 ng/L,Tag DNA聚合酶用量为5.625 U/L。     

亚洲百合DNA的提取及RAPD-PCR反应体系的优化

为了促进亚洲百合分子水平的研究,以亚洲百合幼嫩叶片为材料,采用改良CTAB法提取亚洲百合基因组DNA,得到的DNA质量较高,适合于RAPD -PCR分析。通过单因素优化得到在25μl反应体系中,亚洲百合RAPD 分析的最佳反应体系：160μmol/ L dNTPs,0.3μmol/L随机引物,Taq DNA聚合酶1.5U,Mg2＋浓度2.0mmol/L。     

从甘蔗种茎茎汁中提取基因组DNA的方法

摘 要： 为探索从甘蔗种茎茎汁中提取基因组DNA的有效方法,分别采用CTAB法、SDS-Ⅰ法和SDS-Ⅱ法进行提取,并以叶片为对照。对所提取的DNA质量进行了检测,结果表明：从茎汁中提取DNA时,SDS-Ⅰ法的产率最高。整体而言,种茎中提取到的DNA产率不如叶片高,但其浓度和纯度足以满足下游分子实验的要求,且其操作过程较叶片简便。     

4种补血草属植物种子萌发期抗旱性研究

为了研究4种补血草属植物种子之间的抗旱性差异及大小,为干旱荒漠区选择出抗旱性较强的补血草植物,笔者用不同浓度PEG-6000溶液模拟干旱胁迫条件,对二色补血草（Limonium bicolor）、大叶补血草（Limonium gmelinii）、耳叶补血草（Limonium otolepis）和乡土种黄花补血草（Limonium aureum）4种补血草种子的发芽率、发芽势、发芽指数、幼苗鲜重、活力指数进行了测定,并将处理7天后未萌发的种子移入蒸馏水中,测定了种子萌发恢复率。结果表明：在蒸馏水中,种子萌发率最高;随着PEG-6000溶液浓度的增加,种子的发芽率、发芽势、幼苗鲜重和发芽指数呈递减趋势。PEG-6000溶液处理后,未发芽的种子在复水后可恢复萌发。黄花补血草的抗旱耐性指数最大,其次依次为二色补血草、大叶补血草和耳叶补血草。结合发芽势、发芽率、幼苗长度、发芽速率、种子幼苗鲜重等指标分析表明,黄花补血抗旱性最强,二色补血草和大叶补血草居中,耳叶补血草最差。     

五味子的DNA提取及RAPD鉴定研究

采用CTAB、SDS、改良CTAB法对五味子总DNA提取进行研究,并对总DNA进行电泳分析和含量测定,结果表明以改良CTAB法提取五味子叶片DNA纯度最好,以此DNA为模板可获得条带清晰、重复性好的RAPD扩增结果。从14条重复性好的引物中共扩增出67条带,平均每个引物4.8个片段,多态性位点数为58,比例为86.6%。UPGMA聚类分析的结果与五味子形态学分类结果相似,10份五味子优系在遗传相似系数0.69处可划分为3个类群,该RAPD技术体系可以很好地用于10份五味子种质资源的鉴定。     

黄花黄花补血草营养器官结构解剖学研究

为了探讨黄花补血草的耐盐机制,利用石蜡切片法和光学显微镜法,从植物解剖学角度对黄花补血草营养器官结构进行研究。结果表明叶片和茎表皮细胞排列紧密整齐,分布着典型的耐盐结构盐腺。此外,其外切向壁增厚,表皮外有很厚的角质层,有利于减少蒸腾,根部维管组织比较发达,这些加强的输导组织、机械组织和同化组织间接地提高植物的抗盐能力;黄花补血草在长期适应过程中,盐腺的分布和发达的输导组织、机械组织和同化组织是提高其抗盐能力的基础。     

Analysis of genetic variability in various tissue culture-derived lemon plant populations using RAPD and flow cytometry

Five populations of lemon plants [Citrus limon (L.) Burm] obtained from undeveloped ovules through different tissue culture procedures were examined for the presence of somaclonal and irradiation-induced genetic variation. Tested groups were: (1) nucellar seedlings; (2) organogenic, regenerated via adventitious buds from nucellar seedling internodes; (3) embryogenic population, regenerated from non-irradiated nucellar callus via somatic embryogenesis; (4) embryogenic population, regenerated from irradiated nucellar callus via somatic embryogenesis; and (5) protoplast-derived, regenerated via somatic embryogenesis. Genomic DNA samples from 360 plants (72 from each group) were screened for polymorphism among RAPD fingerprints amplified by 10 decamer primers. Among all tested plants, genetic variation was detected only within the group of plants recovered from irradiated embryogenic calli. Out of 72 plants from that group, three had RAPD fingerprints different from the rest of the population, and fourth plant was found to be cytochimeric, consisting of diploid and tetraploid cells as revealed by flow cytometry. In all other populations of regenerated plants, we did not come across any plants with changed ploidy level.     

Heterogeneity of random amplified polymorphic DNA sequences in individual seedlings and bulked samples of four cultivars of Brassica napus

Using four different random amplified polymorphic DNA (RAPD) primers, a qualitative and quantitative assessment was made of the level of DNA sequence heterogeneity present in the seedlings of four representative Australian rapeseed cultivars. It was found that, depending upon the primer/cultivar combination, the seedlings diverged from total homogeneity to almost complete heterogeneity. The increase or decrease of sample-specific RAPD sequences was evaluated in proportional mixtures of DNA from individual seedlings. These results were then compared with those obtained from bulked DNA samples containing DNA from all the seedlings of a cultivar. From these comparisons, it was found that for a specific RAPD to be detectable in a bulked sample, the particular polymorphism had to be present in at least 15% of the individual seedlings. Even so, the bulked samples produced cultivar-specific RAPD banding patterns with all four primers, showing that any of these primers could be used to identify the different rapeseed cultivars. In contrast to the cultivars ‘Oscar’, ‘Dunkeld’ and ‘Narendra’, the cultivar ‘Rainbow’ was found to be highly heterogeneous—as shown by a diversity of RAPD combinations rather than the presence of differing length RAPDs—and it is suggested that this heterogeneity may be related to the improved tolerance of this cultivar to blackleg infection.     

RAPD-SCAR在鱼类种质鉴定中的应用及前景

种质是利用和改良动植物、微生物的物质基础,更是实施各个育种途径的原材料,因此优良种质鉴定是一个很关键的问题。种质鉴定方法已由形态水平发展到蛋白质和DNA分子水平。RAPD技术具有敏感、快速、简便、产量高、重复性好及检测容易等突出优点,广泛应用于种质鉴定中,但也有不足之处。基于RAPD标记技术建立起来的SCAR（Sequence Characterized Amplified Region）标记克服了RAPD标记的不足,操作简捷,特异性和重复性较高,是一种有效的分子标记。RAPD-SCAR分子标记技术的利用使种质鉴定更为快速准确,提高了育种速度,缩短了育种周期,为相关的研究工作提供分子遗传学依据。     

RAPD标记在油菜核不育两系及其杂种纯度检验上的研究Ⅰ.DNA快速制备及纯度检测

DNA分子标记技术是检测遗传差异的一项新技术,特别是RAPD标记技术应用更加广泛,DNA质量是保证RAPD分析成功的关键.本文采用改良SDS法对油菜叶片总DNA进行了提取,经琼脂糖凝胶电泳和紫外光光度计分析,结果表明:1、所提取的DNA浓度和纯度都高,可以作为分子生物学研究所用,并为本实验后续的PCR扩增奠定了良好的材料基础;2、不同时期叶片DNA的含量不一样,苗期幼叶DNA含量比青荚期无柄叶DNA含量高.     

Genetic relationships in cultivars of hop, Humulus lupulus L., determined by RAPD analysis

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to evaluate the genetic variability and relationship of 65 hop cultivars from all the major hop-growing regions in the world. Twenty-eight selected random primers used in the RAPD reaction generated an average of 38.6%) polymorphic fragments, which was sufficient to produce 47 different RAPD profiles among the cultivars examined. The level of genetic variability was much higher than previously reported. Genetic similarity was estimated and UPGMA cluster analysis was performed using the RAPD data. Cluster analysis separated the cultivars into genetically related RAPD groups which were compared with pedigree data and grouping of the hop cultivars by essential oil type. The RAPD groups, strongly supported by pedigree data, gave more precise information on the level and distribution of genetic variability within hop cultivars than characterization by essential oils. Cultivars were divided into American and European groups, supporting the distinction between two geo-graphically distinct hop germplasms. Five genetically distinct groups revealed differences within the European germplasm, reflecting past hop breeding practices which have been adopted in different regions. The use of RAPD markers for hop germplasm characterization and genetic diversity study is discussed.     

中国主产棉区黄萎病菌的RAPD分析

在提取我国１２个省主产棉区２６个菌系ｇＤＮＡ的基础上,采用ＯＰＹ和ＯＰＢ两组随机引物,对这些菌系的基因组进行了ＰＣＲ扩增和在分析,４０个引物中,１２个引物扩增扩增出满意的适合于分析的多态性谱带。聚类分析将２６个菌纱分为Ａ、Ｂ两个群,Ｖａ菌系属于单独的Ａ群,Ｂ群则包括了所有的大丽轮枝菌系。Ｂ群又分为Ｂａ（Ｃｓ、Ｙｃ）及Ｂｂ两个亚群。Ｂｂ亚群下面分３个组,Ｂｂ１（ＡＶ２、ＡＶ３及Ｌｙ）、Ｂｂ２（Ｓａ、     

金龟甲基因组DNA提取方法比较研究

摘 要：为了筛选适宜金龟甲RAPD-PCR的基因组DNA提取方法,于2009年在青岛农业大学实验室内,分别采用改良的SDS法、平衡酚法、裂解液法和CTAB法提取棕色鳃金龟(Holotrichia titanis Reitter)的基因组DNA,通过DNA沉淀性状观察、产量和质量分析,以及随机引物PCR (RAPD-PCR)比较,筛选最优的金龟甲基因组DNA提取方法。研究结果表明,改良的SDS法提取的基因组DNA产量较高,但纯度较低,并且降解严重,RAPD-PCR扩增谱带弥散较严重;裂解液法提取的基因组DNA纯度较高,降解程度较低,但产量最低,RAPD-PCR扩增谱带弥散较严重,并且存在非特异扩增现象;CTAB法提取的基因组DNA不仅产量和纯度较低,降解严重,而且RAPD-PCR扩增结果不稳定,具非特异扩增现象;平衡酚法提取的基因组DNA产量和纯度高,降解轻微,RAPD-PCR扩增结果稳定,扩增谱带弥散轻微。因此,在上述4种方法中,平衡酚法是最适合PAPD-PCR的金龟甲基因组DNA提取方法,裂解液法和改良的SDS法次之,CTAB法最差。