几个地方绵羊品种线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b基因多态性研究

用12种限制性内切酶分析了6个地方绵羊品种线粒体DNA（mtDNA）细胞色素b（cytb）基因的RFLP。结果表明，在71只绵羊个体中，检出的14种限制性态型可归结成4种单倍型，其间的差异主要来源于几个限制性位点的点突变；4种单倍型间和6个绵羊群体间的平均遗传距离（D）分别为0．412％和0．041％，遗传多态程度（π）为0．028％，说明遗传多样性较为贫乏；单倍型聚类结果和群体聚类结果提示，我国地方绵羊品种的起源可能是单一的。     

我国主要地方绵羊品种mtDNA细胞色素b基因PCR-RFLP研究

应用PCR-RFLP方法，对我国9个地方绵羊品种和3个引人品种共计120个个体的线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(cyt b)基因进行了分析。结果表明，12种限制性内切酶在所研究的个体中共检测到22个酶切位点，15种限制性态型，其中StuⅠ、EcoRⅠ和MboⅡ表现出多态，15种限制性态型归结为4种基因单倍型，即单倍型Ⅰ、单倍型Ⅱ、单倍型Ⅲ和单倍型Ⅳ。单倍型Ⅰ为受试绵羊品种的基本单倍型。线粒体DNA细胞色素b基因遗传多态度为0．0142％，说明我国地方绵羊品种线粒体DNA多态度贫乏。     

河北省山羊品种mtDNA遗传多样性研究

用 1 2种识别 6碱基的限制性内切酶ApaⅠ、BamHⅠ、Bg1Ⅰ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、KpnⅠ、PvuⅡ、PstⅠ、SacⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ研究了河北省 5个山羊品种和类群共计 61个个体mtDNA的RFLP。结果检测到 3 3个酶切位点 ,1 4种限制性态型 ,3种基因单倍型 ,其中EcoRⅠ和CalⅠ表现出多态。基因单倍型间平均遗传距离为 0 .0 0 3 9,群体平均遗传多态度π值为 0 .1 2 %,表明其遗传分化程度较低     

三江白猪Hal基因型及其血液生化指标的测定

随机选取216头三江白猪，提取基因组DNA进行聚合酶链式反应，获得了氟烷基因（Hal）特异片段．测得其显性等位基因Hal、的基因频率为92．13％，隐性等位基因Hal^n的基因频率为7．87％。然后对不同氟烷基因型三江白猪的14项血液生化指标进行了测定，结果表明：Hal、Hal、基因型三江白猪的葡萄糖含量、丙氨酸氨基转移酶活性与Hal^N Hal^n、Hal^n Hal^n基因型的相应指标之间差异显著（P〈0．05）．Hal^N Hal^n与Hal^n Hal^n两指标之间差异不显著（P〉0．05）。3种基因型之间乳酸脱氢酶、天门冬氨酸氨基转移酶、胆碱酯酶、碱性磷酸酶活性以及总胆固醇、总胆红素、总蛋白、白蛋白、钙、磷、甘油三酯、肌酐含量差异显著（P〈0．05）。     

贵州威宁黄牛线粒体DNA D-loop区全序列分析

为了解贵州威宁黄牛的遗传多样性及遗传背景，测定了19个个体的线粒体DNAD-loop区全序列。威宁黄牛D-loop区全序列中，A＋T平均含量为61．4％，G＋C含量为38．6％。经比对，共检测到威宁黄牛D-loop区8种单倍型，核苷酸多态位点45个，其中7种为普通牛血统的单倍型，1种为瘤牛血统的单倍型，表明威宁黄牛同时受到普通牛和瘤牛的影响。在威宁黄牛19个个体中，其单倍型多样度为0．715，核苷酸歧异度（π值）为2．415％，表明威宁黄牛品种的遗传多样性丰富。     

六个猪种群ME1基因的遗传多态性

本试验采用PCR-SSCP技术,对6个猪种群的ME1基因进行研究,从分子水平上研究其多态性.结果表明,307个样本中检测到5种单倍型,其中,长白猪和大白猪各检测出5种单倍型;马身猪、杜洛克猪和山西白猪分别检测出3种单倍型;山西黑猪检测出4种单倍型.大白猪、长白猪、马身猪和山西黑猪均属于高度多态性.研究结果可为寻找与繁殖性能相关遗传标记的研究提供一定的理论参考.     

三江白猪相对于亲本特异性条带的筛选

本试验是出于三江白猪的保种计划所做的研究。利用PAPD技术，在前期研究的基础上，利用已筛选出的15条10bp的随机引物，在已经优化的RAPD反应条件基础上，对三江白猪及其亲本长白猪与东北民猪组织DNA进行PCR分析。从中筛选出三江白猪相对于亲本的特异性条带，找出三江白猪相对于亲本的基因组变异情况，为三江白猪种间特异性条带的确定奠定基础，     

几个绵羊品种线粒体DNA限制性片断长度多态性比较研究

用ApaⅠ等15种识别6碱基的限制性内切酶研究了蒙古羊、乌珠穆沁羊、湖羊和小尾寒羊线粒体DNA的RFLP。结果表明，在所研究的个体中共检测到32个酶切位点，16种限制性态型，其中BglⅠ表现出多态，XhoⅠ无切点。16种限制性态型可归结为2种基因单倍型，即单倍型Ⅰ（BglⅠ－A）、单倍型Ⅱ（BglⅠ-B），单倍型Ⅰ为受试绵品种的基本单倍型。线粒体DNA多态度π值平均为0.0192%，表明受试绵羊品种线粒体DNA多态性比较贫乏。     

三江黄牛mtDNA Cytb基因序列多态性及其系统进化分析

根据普通牛线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列设计引物,扩增获得三江黄牛线粒体细胞色素b基因全序列,并以绵羊为外属对牛亚科代表性的17个品种的Cytb基因序列进行系统进化分析,以期了解三江黄牛的遗传多样性。结果表明:三江黄牛线粒体Cytb基因序列长1 140 bp,T、C、A、G 4种碱基的平均百分比分别为25.78%、28.55%、32.15%和13.52%;三江黄牛共有16种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.6923,平均核苷酸多样性(Pi)为0.006 25,遗传多样性较为丰富;系统进化分析显示三江黄牛是中国众多黄牛类群中的一支,与北方黄牛的亲缘关系较近,推测其是由普通牛和瘤牛共同进化而来,目前应该扩大种群的数量,以维持群体内部的遗传多样性。     

三江白猪H-FABP基因的多态性分析及与繁殖性能的关系

心脏脂肪酸结合蛋白(Heart fatty-acid binding protein,H-FABP)是一类结构特殊的蛋白质,对脂肪酸具有特别的亲和力,它可以结合多种配体,加强细胞内的脂肪酸向特定细胞器或者细胞膜的转运扩散. 三江白猪为我国自己培育的第1个瘦肉型猪种,以其繁殖能力强、抗逆性强、肉味鲜美而著称于世.试验通过对三江白猪H-FABP基因的5'-上游区和第二内含子的遗传多态性研究,分析其与三江白猪高繁殖性能的关系,为三江白猪分子育种奠定基础.     

晋汾白猪ApoA5基因单倍型与体重和肉质性状的相关性分析

试验旨在探究晋汾白猪载脂蛋白A5（apolipoprotein A5,ApoA5）基因的单倍型与体重和肉质性状的相关性。选取180头晋汾白猪为研究群体,利用PCR技术检测ApoA5基因的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）,并采用Haploview软件分析这些SNP位点的连锁不平衡程度;筛选非完全连锁的SNP位点,构建不同的ApoA5基因单倍型,统计不同单倍型的基因频率,并通过SPSS软件分析不同ApoA5基因单倍型与晋汾白猪体重和肉质性状的相关性,鉴定优良性状的ApoA5基因单倍型。结果显示,晋汾白猪ApoA5基因共检测到21个SNPs位点,其中5个完全连锁单倍型块,分别包含5、2、3、4和2个SNPs位点;另外10个非完全连锁的标签SNP组合成不同的ApoA5基因单倍型,其中Hap 1的基因频率最高,达到46.7%,远高于其他单倍型;ApoA5基因单倍型与晋汾白猪的初生重、断奶重、6月龄体重、肌内脂肪含量、剪切力和滴水损失均具有明显的相关性,而与pH_{24 h}没有明显的相关性;ApoA5基因Hap 11晋汾白猪的初生重、断奶重、6月龄体重和肌内脂肪含量均最高,且剪切力最低,滴水损失也相对较低;Hap 6的初生重最低;Hap 2的断奶重和6月龄体重均最低;Hap 3的肌内脂肪含量最低,剪切力最高;Hap 10的滴水损失最高。晋汾白猪ApoA5基因Hap 11属于优良性状单倍型,是一个具有优良性状的分子标记,可以用于晋汾白猪的分子育种,提高选种效率。     

Correlation Analysis Between Haplotypes of ApoA5 Gene on Body Weight and Meat Quality in Jinfen White Pigs

This study was aimed to explore the correlation between the haplotypes of apolipoprotein A5 (ApoA5) gene and body weight,meat quality in Jinfen White pigs.180 Jinfen White pigs were selected,PCR was used to detect the single nucleotide polymorphism (SNP) of ApoA5 gene,and the linkage of these SNPs was analyzed by Haploview software.Non-fully linked SNPs were screened to form the haplotypes of ApoA5 gene,and the frequency of different haplotypes of ApoA5 gene were calculated.The correlation between the haplotypes of ApoA5 gene and body weight,meat quality was analyzed by SPSS software to identify the haplotypes of ApoA5 gene with excellent traits.The results showed that ApoA5 gene of Jinfen White pigs contained 21 SNPs and 5 completely linked regions which included 5,2,3,4 and 2 SNPs,respectively.Ten non-completely linked tag SNPs were selected to form the haplotypes of ApoA5 gene,Hap 1 had the highest gene frequency (46.7%).The haplotypes of ApoA5 gene had a significant correlation with the birth weight,weaning weight,6-month-old body weight,intramuscular fat content,shear force and drip loss,but no significant correlation with pH_{24 h} in Jinfen White pigs.Hap 11 of ApoA5 gene in Jinfen White pigs had the highest birth weight,weaning weight,6-month-old body weight and intramuscular fat content,the lowest shear force,and the lower drip loss.Hap 6 had the lowest birth weight.Hap 2 had the lowest weaning and 6-month-old weight.Hap 3 had the lowest intramuscular fat content and the highest shear force.Hap 10 had the highest drip loss.Hap 11 of ApoA5 gene in Jinfen White pigs had excellent traits,which could be used as a molecular marker to use in molecular breeding of Jinfen White pigs and improve the breeding efficiency.     

阿坝藏族羌族自治州若尔盖地区藏猪mtDNA D-Loop的遗传多样性分析

旨在通过获得和对比若尔盖地区藏猪mtDNA D-Loop高变区的部分序列,为该地区藏猪遗传资源的保护与利用提供参考。本试验收集了若尔盖地区9个乡镇共80头藏猪耳组织,以甘南州藏猪mtDNA D-Loop基因序列为模板设计引物,采用PCR扩增测序技术获得了80条核苷酸序列,并采用生物信息学的数据处理方法进行分析。结果表明,若尔盖地区藏猪mtDNA D-Loop高变区（435 bp）的A+T含量（56.46%）明显高于G+C含量（43.54%）,存在碱基偏倚性现象;在80条长度为435 bp的序列中,共检测到14个变异位点,鉴定了17个单倍型,单倍型多样度（Hd）、核苷酸多样度（Pi）和平均核苷酸差异数（k）分别为0.881、0.004 66和2.028,其中Hd、Pi和k在降扎乡藏猪群体中最高,Pi和k在占哇乡藏猪中最低;共享单倍型8个,特有单倍型9个,且若尔盖地区不同藏猪群体间特有单倍型数差异较大,其中,降扎乡藏猪的特有单倍型数量最多,占单倍型总数的17.65%（3/17）;Hap_1和Hap_15单倍型是4个乡镇（降扎乡、益哇乡、热尔乡和冻列乡）群体的共享单倍型,表明这4个乡镇藏猪群体存在两个共同的母系祖先单倍型。若尔盖地区藏猪的平均遗传距离为0.004 66,其中降扎乡和冻列乡藏猪间的遗传距离最大为0.006 90,包座乡和益哇乡藏猪间的遗传距离最小为0.002 16;构建的NJ分子系统进化树将若尔盖地区藏猪分为2支,而加入中国地方家猪、野猪和引种猪后,若尔盖地区藏猪在进化树中比较分散,说明该地区藏猪母源血统遗传复杂,彼此之间基因交流多。本研究进一步证实了若尔盖地区藏猪比西藏林芝、山南、日喀则、甘孜州、阿坝州藏猪的遗传多样性程度高,受到人工选择强度低,应强化对若尔盖地区藏猪遗传资源的保护与利用。     

猪钙蛋白酶抑制蛋白基因外显子9多态性检测及其对山西白猪背膘厚的影响

本研究采用PCR-SSCP方法检测了杜洛克猪、大白猪、长白猪、山西白猪、山西黑猪和马身猪6个品种共416头个体的钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)基因外显子9的多态性,在扩增片段内检测到5个SNPs,分别是第37位的T→G突变、150位的A→G突变、167、193和256位点的C→T突变,其中第193和256位点的C→T突变位于外显子9内,为错义突变,分别引起苏氨酸→异亮氨酸和苏氨酸→蛋氨酸的转变;5个SNPs位点形成A、B、C、D、E、F和G 7种单倍型,其分布与猪的经济类型相一致。在引入猪种大白猪和杜洛克猪群体中,有3种单倍型A、B和C,单倍型B频率较高,分别为0.40和0.53;长白猪群体中只有B和C 2种单倍型,单倍型C频率较高,为0.72;马身猪除含有A、B、C 3种单倍型外,还含有单倍型E,频率为0.16。统计分析结果表明,CAST基因单倍型类型对山西白猪6月龄活体背膘厚无显著影响。     

我国北方部分山羊品种mtDNA遗传多样性

用１２种认别６碱基的限制性内切酶Ａｐａ Ｉ、Ｂａｍ ＨＩ、Ｂｇ１ Ｉ、Ｅｃｏ ＲＩ、Ｅｃｏ ＲＶ、Ｋｐｎ Ｉ、Ｐｖｕ Ⅱ、Ｐｓｔ Ｉ、Ｓａｃ Ｉ、Ｃｌａ Ｉ和Ｘｈｏ Ｉ,研究了我国北方地区９个山羊品种和类群共计１１０个体线粒体ＤＮＡ（ｍｔＮＤＡ）的限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）,利用Ｎｅｉ氏公式计算了各基因单倍型间的遗传距离Ｐ、群体遗传多态性π值以及各群体间的净遗传距离,并利用ＵＰＧＭＡ方法对各     

长白和大白猪主要生长性状的遗传参数估计

旨在分析母猪的出生年份、出生季节、初生重、开测日龄等固定效应对长白、大白猪主要生长性状的影响,并对目标生长性状进行遗传参数估计（遗传力、遗传方差、表型相关和遗传相关）,为猪的遗传改良提供基本依据。本试验利用GLM模型分析试验猪群（398头长白猪和1 176头大白猪）的固定效应对猪生长性状的影响,并采用多性状动物模型对目标性状进行遗传参数估计。目标生长性状包括达100 kg体重日龄（age to 100 kg,AGE）、达100 kg背膘厚（backfat to 100 kg,BF）、100 kg平均日增重（average daily gain to 100 kg,ADG）。研究表明,在大白和长白猪中,猪的出生年、出生季、初生重以及开测日龄对生长性状均具有极显著的影响（P<0.001）;长白猪的AGE、ADG和BF的遗传力分别为0.321、0.327和0.324,大白猪对应性状的遗传力分别为0.454、0.469和0.408;长白猪的ADG和AGE之间的遗传相关、表型相关分别为-0.990、-0.995,大白猪的ADG和AGE之间的遗传相关、表型相关分别为-0.993、-0.998,均呈现较强的负相关。长白、大白猪的生长性状（AGE、ADG、BF）均属于中等遗传力性状,其出生年份、出生季节、初生重和开测日龄对猪的生长性状影响较大。在遗传参数估计分析时,提高样本数量并提升表型数据质量,可以增加遗传参数估计的可靠性。本研究中的生长性状遗传参数估计结果较为可靠,可为后续的遗传改良提供参考。     

中俄猪16个遗传标记基因位点的多态与繁殖性状的相关研究

检测了俄罗斯大白猪及萍乡华中二头乌猪１６个遗传标记基因位点的多态性,分析了二个猪种群体间在上述１６个基因位点上的遗传变异,探讨了所测遗传标记基因位点与种猪繁殖性状的相关性。同时,对两个猪种母猪体内抗红细胞抗原“天然抗体”的存在种类及效价与其繁殖性状的相关性进行了研究;     

焦磷酸测序鉴别猪线粒体细胞色素b基因单倍型

为了鉴别猪线粒体细胞色素 b(cytochrom e B,cyt b)基因单倍型 ,选择 9个不同品种共 4 15头猪作为试验材料 ,采用实时 DNA测序新方法焦磷酸测序 ,分析了 cyt b单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism s,SNPs)。分析结果显示 3种不同单倍型 E、A1和 A2。除 1头临高猪属于单倍型 A2外 ,其他 6个中国地方品种猪均属于单倍型A1;瑞典长白猪和大白猪存在单倍型 E和 A1,而皮特兰猪存在单倍型 E和 A2。此外 ,基于焦磷酸测序 ,在通城猪中发现了 1个新的 SNP位点。