养殖大鳞鲃发病死亡F_3个体的微卫星标记分析

采用24个已报道的多态微卫星标记对天津市天祥水产有限责任公司养殖的大鳞鲃Barbus capito F_2亲本及F_3成活和病发死亡个体进行基因分型,结果有8个标记无多态,13个标记用以分析本研究群体的遗传多样性、亲缘关系及遗传结构。遗传参数分析显示,13个标记在87个大鳞鲃个体中分别检测到2~7个等位基因,平均等位基因数(4.27~4.53)极显著高于平均有效等位基因数(3.09~3.22)(P0.01);观察杂合度(0.58~0.64)整体低于期望杂合度(0.64~0.65),多态位点比例明显下降(8/24),表明大鳞鲃F2及F_3个体的纯合度增加,遗传多样性下降。聚类分析显示,F2亲本与成活子代亲缘关系更近,聚在一起;而死亡子代单独聚为1支。遗传结构分析显示,亲本与子代清晰地划分成两大类群,多数亲本与多数成活个体归为第一类群(划分概率为51.8%~97.7%),少数亲本与多数死亡个体归为第二类群(划分概率为52.9%~98.4%),这与亲缘关系分析的结果一致,表明少数亲本是F_3死亡个体遗传组成的直接贡献者。本研究初步认定,由于几个亲本的近亲交配,子代基因组纯合度增加,遗传多样性下降,抗逆性下降,这可能是F_3出现不明缘由病发死亡的主要原因之一。     

五个天祝白牦牛群体近交程度分析

为了研究天祝白牦牛群体的近交程度,以5个天祝白牦牛群体共计598头牦牛为研究对象,借助FAO推荐的17个微卫星座位对群体的近交程度做了评估,结果在JDL、LZH两个群体检测到了一定程度的近交,但差异不显著(P0.05),而在其他群体显著(0.01P0.05)或极显著地(P0.01)表现出杂合子过剩,未检测到近交。     

居群遗传学与遗传多样性研究在珍稀濒危植物保护中的应用

本文介绍了有效居群大小、近交繁殖、遗传漂变和基因流等重要概念，而后详述居群遗传学原理在珍稀濒危植物保护中的应用及前景。也对珍稀濒危植物保护中遗传多样性因子所起的重要作用及研究进展作了评述。从遗传多样性水平上看，本文分析的主要关键是讨论什么时候以及什么情况下，居群遗传学在珍稀濒危植物保护应用中起至关重要的作用，并强调居群统计学过程和外在因素的影响在珍稀濒危植物保护中也占同等重要的位置。     

狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析

为了探究近交对繁殖效应的影响,本研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为素材,结合分子标记和系谱信息,组建高、低近交两个试验组,记录高、低近交组的繁殖性能数据。选取高、低近交组中正常个体各3只,采取卵巢组织进行RNA-seq测序,并对差异基因进行功能注释。结果在高、低近交组中共获得差异转录本1 114个,其中783个基因获得注释,307个上调,476个下调。GO和KEGG分析表明,差异基因主要富集在核糖体的生物合成、炎性反应、繁殖、生长、免疫系统过程、代谢过程等生物学过程,Pathway显著富集在叶酸的生物合成、卵母细胞成熟和代谢等生物学通路。功能分析发现,筛选出的差异基因（如GGH、CPEB1、GNMT和PIWIL等）与繁殖功能相关。此外,还包括一些与应激和免疫相关的基因（如APOC3、HSP70、CD38和LGMN等）。研究结果有助于了解狼山鸡繁殖性状近交衰退相关的基因及其调控机制,为家禽特定性状近交衰退分子机理提供参考。     

长白种猪优化选配减少近交畸形的研究

以华南某1 500头规模种猪场2009年到2010年1 502窝长白猪分娩信息进行优化、选配减少近交畸形的研究,结果显示血缘选配优化时将近交系数控制在1%比3%效果明显,平均产活仔数从10.39头/窝提高到10.46头/窝(P＞0.05),畸形率从10.30%下降到4.79%(P＜0.01);对其中402窝出现畸形仔猪...     

奶牛场选种选配的原则和方法

奶牛的群体选育是保证奶牛业持续健康发展的重要工作,奶牛的选种选配除了要避免近交外,还要根据现有牛群的基本情况有针对性的选择重点改良目标,以保持奶牛品质的不断提高。在实际生产中,要在做好体形线性评定基础上,分析牛群的基本结构和生产性能数据,根据公牛的相应数据制定出选种选配计划。按计划严格落实才能取得成效。     

控制近交和世代离散情况下多性状、多QTL的最优化选择

在世代离散的情形下,应用计算机随机模拟技术研究当候选个体的遗传贡献和施加给QTL的相对权重一起被最优化时,使用多性状、多QTL信息的QTL优化选择所能获得的潜在的额外遗传优势.用一个实际育种猪群的参数进行模拟,选择是直接针对窝产活仔数和达100 kg日龄进行,每个性状都有2个不同效应大小的QTL正在和相应的多基因一起分离.将优化QTL选择与标准QTL选择和常规BLUP选择进行比较发现,综合了遗传贡献优化和QTL相对权重优化的QTL优化选择在固定的近交速率下能增加更多的遗传反应,同时避免了短期和长期选择反应之间的矛盾.     

近交危害及其防止措施

所谓近交是指亲缘交配，它是指五代以内双方具有共同祖先的公母畜交配。在家畜中近交程度最大的是父女、母子和全同胞交配。其次是半同胞、祖孙、叔侄、姑侄、堂兄妹、表兄妹间的交配。近交是育种工作的重要工具，在培养或改良新品种中发挥着重要作用。但对于个体养殖户和...     

肉鸡体重杂种性能不同选择方法的比较

本文比较了纯系选择与组合选择两种方法在肉鸡三系配套杂交方案中父本品系遗传进展与近交速率的变化情况,模拟试验结果表明,在遗传参数和总的测定笼位一定的情况下,包含纯种与杂种信息的组合选择获得的累积遗传进展(△G)总是高于纯系选择,近交速率(△F)也高于纯系选择方法。例如当核心群公鸡数(ns)为90时,在组合选择下到第6世代的累积遗传进展与近交速率分别为0.8222与2.50%,均高于PLS下的0.4981与2.18%。在同样的选择方法下,核心育种群越大,近交速率越小。综合分析可以看出,组合选择优于纯系选择。     

一种计算近交系数方法的算法实现

近交有其特殊的用途，畜牧学上常采用近交系数来表示近交程度。本研究用算法语言描述阿部西田细分系谱计算近交系数。