| 狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析 |
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| 引用本文： | 李国辉,曹愉夏,薛倩,张会永,殷建玫,朱云芬,沈海玉,窦新红,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威.狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析[J].中国畜牧兽医,2021,48(3):954-962. |
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| 作者姓名： | 李国辉 曹愉夏 薛倩 张会永 殷建玫 朱云芬 沈海玉 窦新红 苏一军 王克华 邹剑敏 韩威 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省家禽科学研究所, 国家级地方鸡种基因库, 扬州 225125;2. 江苏省家禽遗传育种重点实验室, 扬州 225125 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(31572358);江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目(NY-024);江苏省重点研发计划(现代农业)专项(BE2019353);江苏省公益类科研院所自主科研经费项目(BM2018026);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-42-G03);扬州市自然科学基金项目(YZ2018098);江苏省家禽遗传育种重点实验室资助项目(JQLAB-ZZ-202007)。 |
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| 摘 要： | 为了探究近交对繁殖效应的影响，本研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为素材，结合分子标记和系谱信息，组建高、低近交两个试验组，记录高、低近交组的繁殖性能数据。选取高、低近交组中正常个体各3只，采取卵巢组织进行RNA-seq测序，并对差异基因进行功能注释。结果在高、低近交组中共获得差异转录本1 114个，其中783个基因获得注释，307个上调，476个下调。GO和KEGG分析表明，差异基因主要富集在核糖体的生物合成、炎性反应、繁殖、生长、免疫系统过程、代谢过程等生物学过程，Pathway显著富集在叶酸的生物合成、卵母细胞成熟和代谢等生物学通路。功能分析发现，筛选出的差异基因（如GGH、CPEB1、GNMT和PIWIL等）与繁殖功能相关。此外，还包括一些与应激和免疫相关的基因（如APOC3、HSP70、CD38和LGMN等）。研究结果有助于了解狼山鸡繁殖性状近交衰退相关的基因及其调控机制，为家禽特定性状近交衰退分子机理提供参考。
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| 关 键 词： | 狼山鸡 近交 卵巢 RNA-seq测序 差异基因 |
| 收稿时间： | 2020-07-29 |
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