宁夏地区荷斯坦牛乳房性状的遗传参数估计和主成分分析

旨在评估宁夏地区荷斯坦牛乳房性状的遗传水平。本研究使用DMU（v6.0）软件的AI-REML模块结合EM算法并配合多性状动物模型对宁夏地区12 415头荷斯坦牛，包括111 735个观察值的9个乳房性状进行遗传参数估计，运用主成分分析法（PCA）探讨构象性状之间的关系。结果表明，宁夏地区荷斯坦牛乳房性状遗传力处于中等偏低水平，乳房深度遗传力值为0.242，乳房质地为0.080，悬韧带为0.183，前乳房附着为0.230，前乳头位置为0.231，前乳头长度为0.173，后乳房高为0.272，后乳房宽为0.378，后乳头位置为0.169。各性状遗传相关范围为-0.277~0.706，表型相关范围为-0.084~0.316。研究共筛选出特征值≥1的4个主成分，占总方差的64.19%，且9个乳房性状在前3个主成分中已全部体现，荷载系数均在0.4以上。本研究通过对宁夏地区奶牛DHI数据的深入挖掘和遗传参数估计，准确地把握了宁夏奶牛群体的结构特征，对于奶牛的选种选配和育种规划具有重要意义。     

湖羊生长性状遗传参数的估测

对湖羊生长性状的表型参数和遗传参数的估测表明，性别对这些生长性状有极显著的影响，在遗传参数的估测中剔除性别的效应可提高估计的正确性。初生重、断奶重、三月龄重、六月龄重、周岁重和日增重等性状都属于高遗传力性状，遗传力分别为０．４１９０，０．３０４２．０．６０２３，０．６０７７，０．３９５６和０．６９４５．根据相关分析结果，为提高湖羊的生长速度和肉用性能，把日增重和三月龄重作为主要选择性状，预期可获得较好的效果     

朱砂叶螨对两种杀螨剂的抗性遗传力及风险评估

在室内抗性培育的基础上,应用数量遗传学中的域性状分析法研究了朱砂叶螨对甲氰菊酯和阿维菌素两种杀螨剂的抗性现实遗传力,并对两种药剂在不同杀死率下,朱砂叶螨抗性发展的速率进行了预测。结果表明,用甲氰菊酯、阿维菌素分别连续汰选16、18代后,朱砂叶螨对两者的抗性分别为28.61和4.36倍,抗性现实遗传力分别为0.2685和0.1385。在室内选择条件下,杀死率为50％～90％时,要获得10倍抗性,甲氰菊酯需要约13～6代,阿维菌素需要约28～13代。生物源农药阿维菌素的抗性风险明显低于菊酯类药剂甲氰菊酯。试验结果为朱砂叶螨抗性治理提供了理论依据。     

棉铃虫对拟除虫菊酯类杀虫剂抗性遗传力的分析

采用域性状分析法,估算了棉铃虫对氰戊菊酯、三氟氯氰菊酯和溴氟菊酯的抗性现实遗传力,并对3种菊酯的抗性风险进行了评估。结果表明,棉铃虫对氰戊菊酯、三氟氯氰菊酯和溴氟菊酯的抗性现实遗传力分别为0.2027、0.1554和0.1084。假设田间种群的抗性现实遗传力为估算值的一半,杀死率为80％,预计抗性增长到10倍时,氰戊菊酯可使用14次,三氟氯氰菊酯可使用19次,溴氟菊酯可使用31次。三氟氯氰菊酯和溴氟菊酯的抗性风险明显低于氰戊菊酯;棉铃虫对含氟菊酯的抗性发展速度明显低于不含氟的菊酯。试验结果为实际应用提供了理论依据。     

Genetic risk factors for osteochondrosis in various horse breeds

Osteochondrosis (OC) is an injury to cartilage canals with a following necrosis in the growth cartilage, from there it can develop to osteochondrosis dissecans (OCD). Due to its high impact in the equine industry, new insights into predisposing factors and potential high‐risk genetic variants are warranted. This article reviews advancements in quantitative and molecular genetics in refining estimation of genetic parameters and identifying predisposing genetic loci. Heritabilities were highest for hock OC with estimates at 0.29–0.46 in Hanoverian warmblood and Norwegian trotters, whereas in Thoroughbreds only very low genetic variation seemed to be present in hock OC lesions. Whole genome scans using the Illumina Equine SNP50 or SNP70 Beadchip were performed in Thoroughbred, Standardbred, French and Norwegian trotter, Hanoverian and Dutch warmblood. Validation studies in Spanish Purebred and Hanoverian warmblood horses corroborated OC risk loci on ECA 3, 14, 27 and 29. Particularly, a strong association with hock‐OCD was found for a single nucleotide polymorphism (SNP) on horse chromosome (ECA) 3 upstream to the LCORL gene. Gene expression and microRNA analyses may be helpful to understand pathophysiological processes in equine OC and to connect OCD‐associated genomic regions with potential candidate genes. Furthermore progress in elucidating the underlying genetic variants and pathophysiological changes in OC may be expected from whole genome DNA and RNA next‐generation sequencing studies.     

Heritability and genetic correlations between rumination time and production traits in Holstein dairy cows during different lactation phases

So far, rumination has been used as a proxy for monitoring dairy cow health at farm level. However, investigating its genetic aspects as well as its correlation with other important productive traits may turn this management tool into a new informative selection criterion. However, scientific evidences on genetic correlation among rumination time (RT) and milk production and milk composition are still scarce. Therefore, the objective of this study was to estimate the heritability of RT across three lactation phases and its genetic correlation with milk production, milk composition and somatic cell count (SCC). Results of our study showed that heritability for RT was 0.34 and was constant across lactation. The mean genetic correlations between RT and milk production and composition traits were 0.07 (milk production), ?0.07 (protein yield), ?0.31 (fat yield), and ?0.32 (fat/protein ratio). The mean genetic correlation between RT and the SCC was 0.05.     

Estimated Breeding Value in Iranian Buffaloes

This study was conducted from 1992-2002 on 65,534 individual milk records and fat percentage in 473 herds, in six provinces of Khuzestan, Mazndaran, W. Azerbaijan, E. Azerbaijan, Ardabil and Gilan. The data was analyzed by SAS sotfware using GLM procedure. The heritability and breeding value of 1,195 animals were calculated by DFRML procedure. The average milk yield per lactation, days of lactation, fat percentage and LSM of fat percentage were 1,513 kg, 202 days, 5.04 and 6.77, respectively. The estimated heritability of milk was 0.16. The LSM of average milk production in the provinces of Gilan, Mazandaran, E. Azerbaijan, W. Azerbaijan, Khuzestan and Ardabil were： 1,452, 1,586, 1,382, 1,183, 2,135 and 1,189 kg, respectively. These results indicated that Khuzestan province has the highest potential in the field of milk production. The top five highest breeding value bulls have been introduced to artificial insemination＇s station in the city of Uremia.     

我国北部冬麦区小麦区域试验重复次数和试点数量的优化设计

农作物品种区域试验重复次数和试点数量的合理配置有利于提高试验的成本效率和品种选择效率。本研究分析了2010—2019年期间北部冬麦区小麦品种区域试验的重复次数和试点数量设置的合理性,依据小麦品种试验的信噪比和遗传力水平随重复次数和试点数量的变化规律,提出了重复次数和试点数量的优化设计方案。结果表明:(1)北部冬麦区小麦单点试验的遗传力平均达到0.87,需要的重复次数平均值仅为1.4,说明3次重复可以充分保证试验精确度的需求。(2)北部冬麦区水地组和旱地组小麦区域试验达到0.75的遗传力水平时,需要的试点数量分别为11个和13个,目前有效试点数量分别约为11个和8个,分别达到0.75和0.60的遗传力水平。(3)小麦品种区域试验结果对品种的审定和应用十分重要,而每年都可能有少数试验点因为各种异常情况而报废,为保证试验结果的可靠性,可按H=0.75的水平需求安排试验点数量和重复次数,即重复次数可保持当前的3次;水地组的试点数量可保持在11个左右;旱地组可将试点增加到13个;如要将遗传力提高到0.80的水平,则需约16个试点。     

略阳乌鸡体重和产蛋数性状遗传参数估计

【目的】略阳乌鸡是陕西省特有的家禽品种,该品种具有体型大、肉质好、氨基酸含量丰富、对林地散养适应性强的优点,但也存在生长缓慢,产蛋性能差的不足。为此,在系统测定略阳乌鸡生产性能的基础上,开展对体重和产蛋性状遗传参数的估计,阐明遗传效应对上述性状的调控作用及性状间的遗传关系,期望为这些性状的选育奠定理论基础。【方法】对略阳乌鸡蛋用系一世代71个半同胞家系799只公鸡和804只母鸡6、10、14、20周龄和开产日龄体重进行测定,以个体为单位记录从开产到31、35和40周龄产蛋数,以四分位数±1.5倍四分位距为界删除异常值,更正性别记录错误。以性别为固定效应,育种值为随机效应用单变量动物模型估计各性状遗传力,用双变量动物模型估计性状间遗传相关,用逆伽玛分布指定育种值和残差项方差先验分布,用贝叶斯算法执行130 000次迭代,弃去前30 000次迭代结果,以100为间隔抽取1 000个估计值获得方差和协方差后验分布,计算各性状遗传力和性状间遗传相关。用R语言PerformanceAnalytics软件包chart.Correlation命令计算性状间表型相关。【结果】略阳乌鸡6、10、14、20周龄公鸡体重为（0.56±0.07）、（1.07±0.13）、（1.56±0.19）、（1.97±0.21）kg,母鸡体重为（0.47±0.06）、（0.86±0.12）、（1.18±0.16）、（1.48±0.19）kg,开产体重为（1.68±0.23）kg;31、35和40周产蛋数为（31.2±11.5）、（42.5±16.7）和（54.7±20.4）枚。体重遗传力随年龄逐渐减小,分别为0.74、0.76、0.63、0.54和0.52,置信区间在0.25—0.33之间。产蛋数遗传力为0.27、0.25和0.26,置信区间在0.35—0.42之间。10、14、20周龄体重间维持中等偏上（0.52—0.68）的遗传相关性,但6周龄体重（0.21—0.52）和开产体重（0.21—0.46）与各时间点体重遗传相关性较弱。体重间遗传相关系数置信区间在0.13—0.34之间。在3个时间点产蛋数间遗传相关系数趋近于1,置信区间在0.03—0.06之间。体重和产蛋数间遗传相关系数均不显著。在时间维度上,各体重性状间表型相关系数在0.43—0.90之间（P<0.001）,产蛋数性状间表型相关系数在0.79—0.94之间（P<0.001）。6—20周龄体重与产蛋数间维持了弱（0.023—0.15）正相关关系,但开产体重与产蛋数存在弱负相关关系（-0.17—-0.14）。【结论】首次估计了略阳乌鸡品种特异性的遗传参数,发现略阳乌鸡体重性状主要受遗传效应调控,而产蛋数性状受环境影响更大,阐明了早期与晚期性状间、体重与产蛋数间的遗传关系,为早期选种和多性状育种奠定了理论基础。这些结果建议在略阳乌鸡群体中对体重性状表型选择有望取得良好效果,但对产蛋数性状应建立纯系利用杂种优势;体重和产蛋数间不存在负遗传相关关系,可同时对两个性状选育提高。     

快速型黄羽肉鸡饲料利用效率性状的基因组选择研究

旨在探究快速型黄羽肉鸡饲料利用效率性状的遗传参数,评估不同方法所得估计育种值的准确性。本研究以自主培育的快速型黄羽肉鸡E系1 923个个体（其中公鸡1 199只,母鸡724只）为研究素材,采用"京芯一号"鸡55K SNP芯片进行基因分型。分别利用传统最佳线性无偏预测（BLUP）、基因组最佳线性无偏预测（GBLUP）和一步法（SSGBLUP）3种方法,基于加性效应模型进行遗传参数估计,通过10倍交叉验证比较3种方法所得估计育种值的准确性。研究性状包括4个生长性状和4个饲料利用效率性状：42日龄体重（BW42D）、56日龄体重（BW56D）、日均增重（ADG）、日均采食量（ADFI）和饲料转化率（FCR）、剩余采食量（RFI）、剩余增长体重（RG）、剩余采食和增长体重（RIG）。结果显示,4个饲料利用效率性状均为低遗传力（0.08~0.20）,其他生长性状为中等偏低遗传力（0.11~0.35）;4个饲料利用效率性状间均为高度遗传相关,RFI、RIG与ADFI间为中度遗传相关,RFI与ADG间无显著相关性,RIG与ADG间为低度遗传相关。本研究在获得SSGBLUP方法的最佳基因型和系谱矩阵权重比基础上,比较8个性状的估计育种值准确性,SSGBLUP方法获得的准确性分别比传统BLUP和GBLUP方法提高3.85%~14.43%和5.21%~17.89%。综上,以RIG为选择指标能够在降低日均采食量的同时保持日均增重,比RFI更适合快速型黄羽肉鸡的选育目标;采用最佳权重比进行SSGBLUP分析,对目标性状估计育种值的预测性能最优,建议作为快速型黄羽肉鸡基因组选择方法。