珠海淇澳岛4种红树植物ITS区段的序列测定

以改良的CTAB法提取珠海淇澳岛4种红树植物的总DNA,使用通用引物分别对其ITS区段的序列进行PCR扩增及测序,并对所测序列进行比对分析.结果表明,桐花树、木榄、杨叶肖槿和海漆的ITS1长度分别为404、362、460、439 bp;ITS2长度分别为219、208、231、226 bp;将4种红树植物ITS区段的序列测定结果提交到GenBank,获得了登录号.     

通江银耳DNA提取方法的比较及优化

探索直接用通江银耳子实体(新鲜或干品)提取高纯度DNA的方法,以便进行后期的分子生物学鉴定。比较4种DNA提取方法,确定CTAB沉降法为最佳提取方法,且5%为较好的提取浓度;比较不同储存条件下的DNA降解情况,确定液氮储存DNA的降解速度明显慢于其他储存方式。     

广东孑遗植物水松 rDNA ITS 序列分析

为鉴定广东水松的遗传多样性,应用改良 CTAB 法分别提取广东不同地区的孑遗植物水松基因组 DNA,以真核生物 rDNA ITS 序列的通用引物分别对其 ITS 区进行 PCR 扩增及测序后进行比对、分析,将得到的序列申请登录入 GenBank 核苷酸数据库。结果表明：广东地区不同来源水松的 rDNA ITS 序列长度均为988 bp,相互之间仅有2～3个碱基差异,说明该序列可作为从分子水平鉴别水松种质资源的参考标记。珠海、中山和广州地区孑遗植物水松 GenBank 核苷酸数据库登录号分别是 KF977874、KF977876和 KF977875。     

matK序列作为DNA条形码在中药鸡骨草中的应用

采用改良的CTAB法提取来自不同地区的9种中药鸡骨草的总DNA,利用豆科植物通用引物对matK序列进行PCR扩增,将扩增得到的序列提交到GeneBank中获得登录号.最后将所有序列进行聚类分析,计算种间及种内遗传距离,建立系统发育邻接树.结果表明,matK序列的全长为889～895 bp;不同植物之间的遗传距离较大,同种植物之间的遗传距离较小,且最大的种内遗传距离小于最小的种间遗传距离.因此,matK序列可以作为豆科植物的DNA条形码.     

不同地区毛鸡骨草与鸡骨草rbcL 序列差异分析

应用改良CTAB法提取不同产地毛鸡骨草与鸡骨草的总DNA,PCR 扩增其rbcL 序列并测序,应用MEGE5.1 软件作 序列同源性分析,计算遗传距离并构建系统发育邻接树。结果表明,毛鸡骨草与鸡骨草各具为一支,有亲缘关系,可见rbcL 序列可成功区分两者,因此,rbcL 序列可以作为鸡骨草的DNA 条形码。     

贵州苗药头花蓼的rbcL序列分析

为头花蓼的分子生物学鉴定提供依据,用改良的CTAB法提取贵州不同产地野生和栽培的头花蓼基因组DNA,采用通用引物对不同来源的头花蓼的rbcL序列进行PCR扩增,对扩增产物进行碱基序列测定,运用Clustal X和DNAMAN软件对目的序列进行序列比对和聚类分析。结果表明:改良的CTAB法可有效提取植物总DNA(OD260/OD280为1.1~2.0),rbcL序列长度为979~985bp,目的序列具有高度同源性;测序结果提交NCBI获得GenBank序列号为GP215865-870。rbcL序列信息可作为分子水平鉴定头花蓼的参考依据。     

贵州苗药头花蓼rDNA ITS序列分析

以改良CTAB法提取头花蓼的基因组DNA,采用通用引物对不同来源头花蓼的rDNA ITS 序列进行PCR 扩增,测序 和聚类分析。结果表明,不同来源头花蓼有13 处变异位点,序列长度变异范围为661-666 bp,序列差异主要集中在ITS1 区与ITS2区。rDNA ITS 序列可作为分子水平鉴定头花蓼的参考依据。