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基因组三维结构在DNA复制、DNA损伤修复、基因转录调控中扮演着重要的角色。Hi-C是目前研究基因组三维结构的主要手段之一,但是存在背景噪音大、试验成本高、试验流程繁琐,缺乏对随机连接噪音的评价等缺陷,因而限制了三维基因组学的发展。为此,我们开发了一种简单经济的染色体构象捕获技术,即DLO Hi-C(digestion-ligation-only Hi-C)。该技术去掉了生物素标记的步骤,只需要2轮简单的酶切酶连反应即可构建高质量的DLO Hi-C测序文库。为了评价文库中的随机连接噪音的比例,我们在文库构建步骤中加入了噪音评价的步骤。研究结果显示,与当前的in situ Hi-C等方法比较,我们的DLO Hi-C试验时间短、试验成本低、测序成本低,有更多的有效交互数据。将DLO Hi-C应用于肿瘤细胞系,我们找到了已知和新的基因组结构变异。所以,我们希望DLO Hi-C技术将对研究染色体的三维构象、基因的转录调控及基因组的组装有重要的促进作用。 相似文献
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以多年生黑麦草(Lolium perenne)为材料,采用不同酸碱度培养基质进行室内生物测定,研究不同酸碱条件下黑麦草种子萌发和幼苗生长的变化。结果表明,(1)不同pH条件下,黑麦草种子发芽率和发芽势未受到显著影响,pH 3.5时黑麦草种子发芽指数为21.40,显著低于其他处理;(2)不同pH处理对黑麦草幼苗根和芽的生长具有显著影响,pH 6.5时根长和芽长分别增加4.36%和20.64%,表明弱酸性条件更利于芽的生长;幼苗叶绿素含量随酸性或碱性增加而呈逐渐下降趋势。因此,弱酸性条件更有利于黑麦草种子萌发和幼苗生长,不同的是黑麦草幼苗对酸碱性的敏感度要大于种子。 相似文献
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通过对瓜州棉花种植历史及其地位的简述,分析了瓜州地区棉花种植的现状和产业化发展区位优势以及存在的主要问题,提出了在新形势下瓜州应加强对棉花产品的科学研究、推广规范化的栽培技术和优良品种、加大棉花系列产品开发力度,积极发挥政府引导作用、建立科学有效的市场信息平台的合理化建议。 相似文献
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为了解合肥市公园植物群落物种组成现状,通过样方法对合肥市包河公园、银河公园、杏花公园和古逍遥津4个城市公园的园林陆生植物进行了植物多样性分析。研究结果表明:(1)合肥市城市公园中共有园林植物70科140属152种,其中蔷薇科、禾本科、菊科等在合肥市公园应用较多;在属的地理分布类型上,合肥市园林植物以温带地理分布为主,温带性分布77属,占总属数的55%。(2)乔、灌、草植物种类比约为1: 0.67:1.22。乔木层中常绿和落叶比约为1:1.75,灌木层中常绿和落叶比约为1: 0.68,草本层中一、二年生草本与多年生草本比为1: 2.05;乔木层优势种依次为棕榈(Trachycarpus fortunei )、香樟(Cinnamomum camphora )、女贞(Ligustrum lucidum)、桂花(Osmanthus fragrans)等,灌木层优势种为十大功劳(Mahonia fortunei)和锦绣杜鹃(Rhododendron pulchrum ),草本层优势种为沿阶草(Ophiopogon bodinieri)。(3)合肥市园林植物中共发现外来植物22科39属40种,入侵植物13科26属27种,其中入侵菊科植物最多(7种),其次为禾本科(5种)。(4)合肥市公园物种丰富度表现为草本层>乔木层>灌木层,Simpson多样性指数、Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数表现为乔木层>灌木层>草本层的分布规律。该研究可为合肥城市公园植物选择及群落结构优化提供理论依据。 相似文献
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为了挖掘大白菜抗TuMV基因的多样性,制定抗TuMV的遗传改良策略和综合防治措施,对抗TuMV的显性位点进行QTL分析。以大白菜对TuMV高抗的‘89B’和高感的‘强势’为亲本,构建F_2群体。采用人工磨擦接种TuMV法对F_2群体进行单株接种鉴定,经卡平方测验F_2群体抗、感植株分离比例不符合3︰1(χ~2=4.8χ_(0.05)~2=3.84),非单基因遗传,为数量位点控制。选取表型高抗和高感的F_2单株各40株进行混池,对2个极端池以及2个亲本进行重测序分析。通过计算抗、感池与亲本间的△(SNP-index),获得两个抗TuMV位点区域,物理位置为A07染色体的13.9~14.4 Mb和A08染色体的16.4~17.4 Mb。上述两个区域共筛选出具有多态性位点的基因68个,其中6个基因与植物抗性有关,其编号分别为Bra028499、Bra028500、Bra016311、Bra016312、Bra016313和Bra016314,其中Bra028499和Bra028500编码抗病蛋白,Bra016311、Bra016312、Bra016313和Bra016314编码抗TMV蛋白。Bra028499、Bra028500、Bra016311和Bra016314含有TIR-NBS-LRR特殊结构域。在已定位克隆的植物抗病基因中,大约80%属于NBS基因家族,因此推测这些基因可能与大白菜抗TuMV有关。 相似文献
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为解决羊群疾病检索过程中出现的大量冗余数据及检索后仍需人工挑选准确答案造成的资源浪费,本研究通过以下3个步骤构建基于知识图谱的羊群疾病问答系统:(1)通过爬虫获取数据,人工提取部分信息,再进行自动化信息抽取,在命名实体识别任务中使用双向长短期记忆循环神经网络Bi-LSTM模型,并添加注意力机制提高识别效率,然后使用BIO规则进行实体标注,完成信息抽取,将数据融合后存储在Neo4j图数据库中,构建羊群疾病知识图谱。(2)针对属性映射,构建Bert-softmax模型;根据用户提问,采用Bert模型计算问句和属性的语义相似度,并通过softmax算法进行归一化处理,返回合适答案给用户,实现羊群疾病问答系统算法设计。(3)构建羊群疾病诊断平台,使用Bootstrap、Echarts、Vue组件实现羊群疾病问答系统的可视化,利用Python语言包含的flask框架搭建后台,封装疾病信息,通过web前端呈现给用户,并于后端建立连接,实现数据之间的交互。试验结果显示,基于Bi-LSTM+Attention+CRF模型实体识别的F1值为83.16%,构建的知识图谱包含实体4 576个,实体关系超13... 相似文献
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[目的]分析加拿大一枝黄花(Solidago canadensis L.)凋落物化感作用对其他植物的影响。[方法]利用水浸提法提取加拿大一枝黄花凋落物化感物质,研究了不同浓度浸提液对黑麦草(Lolium perenne L.)、高羊茅(Festuca elata Keng)和万寿菊(Tagetes erecta L.)等3种植物种子萌发和幼苗生长的影响。[结果]在相同浓度浸提液作用下,万寿菊种子萌发率为29.2%~51.7%,比其他2种植物低;凋落物浸提液对黑麦草和高羊茅幼苗芽长均具有促进作用,而万寿菊幼苗芽长随着浸提物浓度增加受到的抑制影响也逐渐增强;凋落物浸提液浓度较低(0.025 g/mL)时,对3种植物幼苗根长均具有促进作用,在较高浓度(0.075 g/mL)时呈抑制作用。[结论]加拿大一枝黄花叶片凋落物浸提液对受体植物的化感潜力存在物种间差异。 相似文献
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乙酰化木材的制备及其热塑性研究 总被引:12,自引:0,他引:12
利用乙酰化改性反应使木材获得热塑性,利用IR,DSC,SEM等对乙酰化木材的化学结构及热塑性进行了研究和表征。常规乙酰化方法不能使木材热塑化,而经三氟乙酸预处理制得的乙酰化木材在290-300℃熔融,可在110-130℃单独或与其他合成高聚物共混热压成半透明薄片。 相似文献