一株类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒的全基因组序列分析

为监测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的基因变异情况,采用RT-PCR方法对某猪场疑似患有猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)的猪组织样品进行鉴定,测序获得全基因,并对该毒株的NSP2基因缺失特征同源性和遗传进化及重组情况进行分析。结果显示:该猪场感染猪体的病原体为PRRSV,该毒株被命名为180404-2fei;180404-2fei毒株的NSP2区存在131(111+1+19)个氨基酸的不连续缺失,与报道的类NADC30毒株缺失特征一致;180404-2fei的NSP2基因与NADC30毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为92.2%和90.1%,180404-2fei毒株的ORF5基因与NADC30的核苷酸及氨基酸序列同源性分别为93.5%和92.0%;遗传进化和重组分析结果表明,180404-2fei毒株属于NADC30-Like亚群,可能是由NADC30与HP-PRRSV重组而来。本研究通过对一株类NADC30 PRRSV的全基因组序列进行分析,为研究PRRSV的遗传变异和PRRS的防控提供了参考依据。     

两株类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定

猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)又称为"猪蓝耳病",是一种由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的猪传染性疾病。本研究将采集到的2份疑似患有PRRS的流产胎儿的肺组织研磨后离心,取上清液接种猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophage,PAM)盲传3代。通过RT-PCR方法和间接免疫荧光方法,对组织样品及细胞培养物进行了鉴定和分型。结果显示本研究成功从2份样品中分离到了类NADC30,且该毒株可以在PAM细胞上增殖。该研究结果为研究类NADC30毒株的重组机制、致病情况及研制预防疫苗提供参考。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒核衣壳蛋白翻译起始位点的研究

猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus,PRRSV)核衣壳蛋白(Nucleocapsid protein,N蛋白)的表达是通过非连续性转录合成的亚基因组(Subgenomic,sg)mRNA翻译而来。但位于亚基因组前导序列中的2个AUG均不能作为N蛋白翻译的起始位点,其翻译使用的是N开放阅读框(ORF)中的首个AUG,因此,本研究旨在感染性克隆的基础上研究N蛋白的翻译起始位点。作者实验室已有在ORF6和ORF7之间插入酶切位点的感染性克隆pORF673,该突变克隆中含有3个潜在的AUG,分别构建了pORF673中N蛋白的其中2个潜在的起始密码子AUG突变的全长克隆,转染Marc-145细胞。这些突变体都能够拯救出子代病毒,其中2个突变病毒的N蛋白的前11个氨基酸完全改变,这些突变病毒都能够在Marc-145细胞上稳定传代。经RT-PCR分析子代病毒的N基因序列及其亚基因组序列,结果表明N蛋白的翻译偏向于使用其ORF的第1个潜在的AUG。如果后者移码,则病毒可以自身修复,这是首次发现病毒有矫正ORF的功能。本研究为N蛋白N端插入标签作为标记疫苗以及进一步研究N蛋白结构与功能奠定了基础。     

G1-like型禽H9N2亚型重组流感病毒的拯救及免疫原性评价

为拯救具有高复制特性的G1-like型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)疫苗候选株，利用反向遗传操作技术，将高复制特性H9N2亚型CZ株(Y280-Like)的6个内部基因(PB2、PB1、PA、M、NP、NS)与H9N2亚型40926株(G1-like)的HA和NA基因进行重配，构建G1-like型重组病毒。通过HA、HI试验及基因测序对拯救病毒进行鉴定，并对病毒在鸡胚上的复制能力、遗传稳定性及免疫原性进行评价。结果表明，利用6+2质粒系统成功拯救出G1-Like型H9N2亚型重组流感病毒，并具有良好的复制特性和遗传稳定性；将拯救的重组病毒株灭活后免疫SPF鸡，能刺激产生较高的HI抗体，为防控G1-like型AIV流行提供了技术和疫苗候选株储备。     

高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒细胞传代毒株反向遗传系统的优化

反向遗传系统已成为研究猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndromevirus,PRRSV）结构与功能非常重要的手段,并且在设计基因工程疫苗中发挥不可替代的作用。因而,有效提高感染性克隆拯救病毒的效率和稳定性以及降低经济成本是一个急需解决的课题。本研究在已构建完成的高致病性PRRSV细胞传代毒株反向遗传系统（pAJXM）的基础上,做了以下三方面的工作：（1）将T7启动子换成hCMV（人类巨细胞病毒,Human cytomegalovirus）启动子,从而全长cDNA克隆不需经过体外转录成mRNA的过程,直接通过DNA转染MARC-145细胞拯救病毒;（2）研究hCMV启动子的TATA框与病毒基因组5末端之间最佳的碱基数目,使体内转染获得的病毒基因组5末端序列为病毒的真实序列;（3）在病毒基因组3末端添加丁型肝炎病毒核酶（delta hepatitis virus ribozyme,HDVr）序列,体内转染获得的病毒基因组3末端的非病毒序列通过核酶自动去除。研究发现,基于DNA转染的反向操作系统是可行的,并且hCMV启动子的TATA框与病毒基因组5末端之间的碱基数目设置为25和在病毒基因组3末端添加HDVr序列后,能够有效地提高全长感染性cDNA克隆的病毒拯救效率和稳定性。     

猪流行性腹泻病毒单克隆抗体8A3的CHO细胞瞬时表达与稳转细胞池构建

为实现猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)单克隆抗体(monoclonal antibody, mAb)的体外高效表达，首先利用基因工程技术获得了PEDV鼠源mAb 8A3的轻链和重链序列，然后构建真核表达载体pCHO1.0-8A3-H-L,再利用CHO细胞对mAb 8A3进行瞬时表达，最后经稳定转染以获得稳定表达8A3的CHO细胞池。结果显示，CHO细胞表达的mAb 8A3在免疫印迹和间接免疫荧光分析中均可特异性识别PEDV,且具有正确的IgG抗体构型；且CHO细胞表达的mAb 8A3可以中和G2a、G2b和G1基因型PEDV。实现了PEDV mAb 8A3的CHO瞬时转染表达，并获得了稳定表达8A3的CHO细胞池，为PEDV mAb稳定表达细胞系的筛选奠定了基础，同时为PEDV的诊断和治疗提供了新型基因工程抗体材料。     

猪伪狂犬病病毒gB、gC和gD蛋白的表达及诊断抗原筛选

为研发猪伪狂犬病的免疫学诊断试剂，利用杆状病毒表达系统表达了猪伪狂犬病病毒(PRV)gB、gC和gD蛋白，并对蛋白进行SDS-PAGE和Western blot鉴定；将纯化后的3种蛋白分别制备成不同蛋白类型的疫苗免疫健康仔猪，比较蛋白的免疫原性；将3种蛋白分别作为包被抗原建立间接ELISA方法，检测从不同地区收集的临床血清，与PRV中和试验检测结果进行了比较。结果显示，成功拯救出重组杆状病毒rPRV-gB-His株、rPRV-gC-His株和rPRV-gD-His株，经IFA鉴定，均可与猪伪狂犬病病毒阳性血清发生特异性反应；表达出的蛋白经SDS-PAGE和Western blot鉴定，可见大小分别约为120 ku、65 ku和50 ku的蛋白条带；3种蛋白免疫原性比较结果显示gD蛋白疫苗免疫组猪血清中和效价最高(1∶22.4～1∶32.0);3种蛋白建立的间接ELISA方法检测30份临床血清，结果gD蛋白作为包被抗原建立的ELISA方法与PRV中和试验的符合率最高(100.0%)。表明gD蛋白是更好的诊断抗原，可用于PRV抗体检测试剂盒的开发。     

山东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及基因组序列分析

为了解目前我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行株基因组特征，本实验室于2020年从山东某养殖集团不同场区采集7份疑似感染PRRSV的组织样品，进行RT-PCR检测，将阳性样品接种猪肺泡巨噬细胞(PAM)分离病毒，利用间接免疫荧光试验(IFA)对分离病毒进行鉴定，经PCR对分离株全基因组序列分段扩增，采用生物信息学软件对分离株的ORF5基因及全基因组序列的同源性、NSP2氨基酸序列缺失特征和ORF5氨基酸变异位点及糖基化位点、ORF5基因与全因因组遗传演化关系分析以及全基因组的重组分析。结果显示：7份组织样品均呈PRRSV阳性，其中有6份阳性样品接种猪原代肺泡巨噬细胞(PAM)后产生细胞病变，且通过荧光显微镜可观察到特异性绿色荧光，表明分离到6株PRRSV；对6株PRRSV的全基因组序列扩增、测序、拼接，通过全基因组序列同源性对比发现6株PRRSV全基因序列之间的同源性约99.4%～100%，表明6株PRRSV是同一来源，选择其中1株(SDlz0720株)进行后续分析。序列分析结果显示：SDlz0720株NSP2氨基酸序列均具有“111+1+19aa”的缺失特征，与NADC30-...     

我国近5年类NADC30 PRRSV毒株序列的重组及限制性片段长度多态性分析

为了解我国类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株的流行和遗传变异情况，本研究利用生物信息学软件对本实验室2016-2020年获得的64条类NADC30毒株序列进行分析。Nsp2氨基酸序列比对结果表明，64株毒株均表现出与NADC30毒株一致的131个不连续的氨基酸缺失。其中，9株在Nsp2区域除该缺失特征外，另含有额外的氨基酸缺失。基于全基因组遗传演化分析结果表明，61株分布在Sublineage 1.8(类NADC30),3株分布在Lineage 8(HP-PRRSV)。而基于ORF5序列的遗传演化分析结果则更分散，56株分布在SubLineage 1.8,5株分布在Lineage 8,2株分布在Lineage 5(类VR2332),1株分布在Sublineage 1.5(类NADC34)。经RFP4和Simplot生物学软件进行重组分析结果表明，64株毒株中可能有44株为重组毒株，共表现出5种重组模式，其中以NADC30提供骨架，HP-PRRSV提供重组片段为主要模式。重组热点分布在非结构蛋白区域5′UTR～1 500 nt(Nsp1)、5 374～8 177 nt...