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以GenBank中已登录的梅花鹿(Cervus nippon)、马鹿(Cervus elaphus)、普通牛(Bos taurus)、水牛(Bubalus bubalis)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因mRNA序列为研究材料,通过DNAStar 7.0等生物信息学软件对6个物种的IGF-1基因进行序列比较及分子进化分析。结果表明:鹿科与牛科动物IGF-1基因编码区均为465bp,并且碱基组成表现为GCAT,且G+C含量高于A+T;6个物种IGF-1基因密码子第1位富含A,密码子第2位4种碱基的分布相对均匀,密码子的第3位碱基C含量较高;编码区碱基序列中共检测到20个变异位点,包括10个单一变异和10个简约变异,鹿科和牛科动物IGF-1基因核苷酸和氨基酸序列的相似性均较高;(4)NJ和UPGMA两种方法构建的分子进化树均把6个物种聚为2个大类:鹿科和牛科,其中牛科又分支出牛亚科和羊亚科两类。 相似文献
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实时荧光定量PCR是具有高度灵敏度和特异性的核酸分析技术,以SYBR Green染料法为基础的相对定量和绝对定量检测方法,由于操作简单、成本较低而倍受青睐。本试验以梅花鹿P21基因为待检测基因,以β—actin作为内参基因,对不同浓度稀释的模板进行相对实时荧光定量PCR检测,然后分别对P21基因和β—actin基因进行绝对定量检测。结果表明,绝对定量的结果比相对定量结果更准确可靠,相对定量在模板256倍稀释后出现较大偏差,在模板浓度较低(低于1000拷贝)时2种方法都会出现较大误差。因此,建议尽量用绝对定量检测目的基因,当模板浓度太低时建议对样品进行浓缩处理。 相似文献
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