miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测

为探究miR-18a-5p在鸡不同生长时期组织表达变化规律及其生物信息学特点,本研究以苏禽3号鸡为试验动物,利用实时荧光定量PCR技术检测不同生长时期鸡miR-18a-5p的组织表达变化。通过文献和miRBase检索脊椎动物的miR-18a-5p序列,利用Ensembl数据库确定miR-18a-5p在基因组中的位置,根据成熟序列构建系统进化树;使用miRmap、microT、miRanda和TargetScan网站预测miR-18a-5p靶基因,并进行GO和KEGG分析。组织表达分析结果显示,miR-18a-5p序列在鸡心脏、脾脏、肾脏和下丘脑中的表达量显著高于除大脑以外的其他组织(P<0.05)。与3日龄雏鸡相比,90日龄鸡心脏、脾脏、肾脏、腿肌和下丘脑中miR-18a-5p的表达量均显著上升(P<0.05)。在50种脊椎动物中共发现52条miR-18a-5p序列,几乎所有物种都只有1条成熟序列;基因定位分析发现,鸡miR-18a-5p位于1号染色体上的基因间隔区。多序列比对分析表明,不同物种miR-18a-5p的成熟序列同源性较高,物种间较为保守。系统进化树分析发现,鸡miR-18a-5p与原鸽、斑胸草雀等其他鸟类聚为一类,这表明miR-18a-5p进化过程中是保守的。靶基因预测和功能分析发现,miR-18a-5p共有121个靶基因。GO分析结果显示,靶基因主要富集到蛋白质泛素化、细胞周期阻滞、白细胞介素-6产生的负调控等功能。KEGG 通路分析表明,靶基因主要富集到细胞周期及Wnt和FoxO信号通路等。多个与肌肉生长及细胞增殖等相关的基因富集到相关通路之上。综上,鸡miR-18a-5p是组织广泛表达的miRNA,其可能通过Wnt及FoxO信号通路调控肌肉生长及细胞增殖分化。本研究为miR-18a-5p功能及调控机制的深入研究提供参考依据。     

不同饲养模式对淘汰肉种鸡运动量、羽毛外观和体尺的影响

本论文旨在研究淘汰笼养肉种鸡下笼后不同饲养密度及活动空间下其运动量和羽毛外观的变化规律，为肉种鸡的合理淘汰提供有效方案。试验选取50周龄体况接近的待淘汰的肉种鸡L系母鸡225只随机分成4组，分别为Ⅰ组(45只)、Ⅱ组(45只)、Ⅲ组(90只)和笼养组(45只)，平养组放于饲养空间为12、24、24m²的隔间内，饲养密度分别为3.75、1.875和3.75只/m2，饲养周期为10周，分别在55、60周龄对各组鸡进行体尺、羽毛和运动步数测定。结果表明：(1)整个试验周期内，平养组的运动步数高于笼养组(P<0.05)，其中Ⅱ组>Ⅲ组>Ⅰ组(P<0.05)。(2) 4组鸡各部位羽毛评分得分最高为背羽；平养组羽毛总得分高于笼养组(P<0.05)，其中，Ⅱ组>Ⅲ组>Ⅰ组(P<0.05)；平养模式下60周龄时总得分较之55周龄增幅减缓。(3)相比于笼养组，平养组胫长有所提升(P>0.05)。综上，相比于笼养，平养组鸡避免了与笼具的相互摩擦，同时相同饲养密度下的鸡群总体活动空间越大，运动量增加，最终羽毛质量得到显著改善。     

优质鸡多元杂交组合性能测试及筛选

选用选育的优质鸡S3、W、S09、F及B系组成二元杂交组合:W♂×S09♀、S3♂×S09♀、W♂×B♀,及3个三元杂交组合:B♂×(W♂×S09♀)♀、F♂×(S3♂×S09♀)♀、S09♂×(W♂×B♀)♀,分别于12周龄对各杂交组合鸡的外观、生长及肉用性能进行测试。结果表明,继二元杂交基础上进行的三元杂交组公母鸡综合性能得到显著改善。外貌及体型方面:体斜长、龙骨长及胸深均相应提高,变异系数则相对更小,整体更趋于细致紧凑、均匀齐整;生长及肉用性能方面:12周龄时3组三系杂交公鸡体重分别为1385.50 g、1507.36 g和1482.02 g,相比于二系提高了23.5%、17.7%和35.7%,母鸡体重分别为1112.68 g、1197.69 g和1120.36 g,提高了27.9%、25.4%和26.1%,屠宰率、半净膛率及腹脂率等指标也均有不同程度的提高;三元杂交组合F♂×(S3♂×S09♀)组的体型、生长、饲料转化及肉用性能等均优于B♂×(W♂×S09♀)♀和S09♂×(W♂×B♀)♀组,其中12周龄3组公母鸡平均体重依次为1352.53 g、1249.09 g和1301.19 g,3组腹脂率为0.94%、0.60%和0.78%,两项指标F♂×(S3♂×S09♀)组显著占优(P0.05);饲料报酬分别为3.08、3.05和3.13,F♂×(S3♂×S09♀)同样最高,但未达到显著差异(P0.05),各组成活率都达到90.6%以上的较好水平。本试验为黄羽优质鸡配套系的组建提供了参考依据,达到了研究的预期目标。     

光照对优质肉鸡性器官发育及其性激素变化的影响

[目的]研究不同光照模式对优质肉鸡血液中性激素变化的影响。[方法]选用540只0日龄的优质肉鸡S3系母鸡放于3间封闭式鸡舍内,分别在育雏期和育成期设计3种不同类型的光照模式,研究光照对优质肉鸡性器官发育及其性激素变化的影响。[结果]3组鸡输卵管和卵巢组织在早期发育缓慢,光照对其影响不显著(P0.05),14周龄组(2)输卵管长度达到16.26 mm,显著大于组(1)和(3)(P0.05);14周龄后卵巢表面陆续出现有白色和黄色卵泡;16周龄3组小黄卵泡数和卵巢重量差异显著(P0.05),组(2)小黄卵泡数和卵巢重量分别为6.65个和17.42 g。10周龄3组4种性激素含量都略低,但各组间差异不显著(P0.05)。14周龄组(2)的促黄体生成素(LH)和人脑垂体促卵泡激素(PRL)含量显著高于组(1)(P0.05),但与组(3)无显著差异(P0.05);开产时组(2)促卵泡生长激素(FSH)、LH、睾酮(T)和PRL含量显著高于组(1)和(3)(P0.05)。[结论]组(2)光照方案最优,可根据市场需求加以推广应用。     

光照调控优质肉鸡性成熟的转录组分析

为探明不同光照模式调控下优质肉鸡性成熟的分子调控机制,以期为提高优质肉鸡生产性能提供理论依据.选用了0日龄F系母鸡,分别于3间密闭式鸡舍内设计不同类型的光照模式.12周龄时每组各选取3羽采集下丘脑,利用Illumina HiseqTm2000进行高通量测序,通过生物信息学方法进行差异表达基因筛选及功能分析.结果表明,9...     

皖江麻鸡配套系主要性状选育进展分析

总结分析了皖江麻鸡配套系世代的选育进展.结果表明,经过6个世代的选育,各品系外貌纯度提高到98%以上.配套系父本MA2系早期生长速度得到显著提高,公鸡6周龄体重由0世代876 g提高到6世代944 g,平均每世代提高11.3 g;母鸡由0世代741 g提高到6世代803 g,平均每世代提高10.3 g.母本父系MB1系6周龄体重公鸡由0世代781 g提高到6世代819 g,平均每世代提高6.3 g;母鸡由0世代669 g提高到6世代701 g,平均每世代提高5.3 g.66周龄入舍母鸡产蛋量提高较为显著,由0世代的17413枚提高到6世代的183.8枚,平均每世代提高1.58枚.母本母系MC2系66周龄入舍母鸡产蛋量得到显著提高,由0世代的177.9枚提高到6世代的191.9枚,平均每世代提高2.33枚.     

优质肉鸡VIP和DRD基因多态性与性成熟的关联分析

为探究鸡血管活性肠肽受体基因(VIP1和VIP2)和多巴胺受体基因(DRD1)多态性与性成熟的关系,采用PCR-SSCP和SNPs测序验证等方法对优质肉鸡F系287个个体进行了性成熟相关性状的关联分析。结果表明,VIP1基因处发现2个突变位点,分别为73352处C→T的突变,68818处T→C的突变;VIP2基因发现1个突变为36 127处A→G的突变。DRD1基因发现3个突变位点,分别为201处C→T的突变,208处A→G的突变及255处A→G的突变。与性成熟的关联性分析表明,VIP1基因73 352处的基因突变与冠高、冠长、冠重和睾丸重显著相关(P0.05),而与生长激素GH、睾酮激素TEST差异不相关(P0.05);VIP2和DRD1各处基因突变与性成熟相关指标均存在不同程度的差异显著(P0.05),但都与生长激素GH和睾酮激素TEST差异不相关(P0.05)。结果提示说明,VIP1、VIP2和DRD1基因可作为性成熟性状标记辅助选择的有效分子标记。     

FTO基因在不同品种鸡胚胎与生长期骨骼肌中的表达

以清远麻鸡和隐陛白羽鸡为试验素材,研究脂肪和肥胖相关基因(fat mass and obesity-associated,FTO)在2个品种胚胎期与生长期胸肌和腿肌组织中的表达模式及差异。结果表明,在胸肌组织中,FTO在两品种不同发育时期呈现不同的表达模式。在清远麻鸡,16胚龄时FTO表达量显著高于其他胚龄,出雏后l周达最高,8周时显著下降(P0.05);在隐性白羽鸡,FTO在20胚龄时表达骤然升高,在l周龄时呈现表达高峰,但8周时仍维持高表达水平。在20胚龄、1周和8周时FTO在隐性白羽鸡胸肌组织中的表达显著高于清远麻鸡。在腿肌组织中,FTO在两品种胚胎期及生长期不同发育时期的表达模式也不同。FTO在清远麻鸡12胚龄时表达量显著高于其他胚龄,出雏1周后FTO的表达相对稳定,各周龄间无显著差异;在隐性白羽鸡中,腿肌中FTO在20胚龄时表达量显著升高,这一高表达状态持续至出雏后8周,但FTO只有在8周时隐性白羽鸡腿肌组织中的表达显著高于清远麻鸡。综合FTO在两品种的胸肌和腿肌组织中的发育模式研究表明,FTO在鸡胚胎期和生长期骨骼肌中的表达存在显著的品种和组织差异性。本研究将为进一步深入研究FTO对鸡肌肉发育的分子遗传机制奠定基础。     

BMP15基因在不同品种鸡卵泡中的表达规律

以淮南麻黄鸡和邵伯鸡为试验素材,研究骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)基因在2个群体卵泡颗粒层和膜层中的表达模式及差异。结果表明,在颗粒层中,BMP15在2个群体的卵泡不同发育时期表达模式均呈先增加后降低的趋势,发育到小黄卵泡(small yellow follicle,SFY)时期呈现表达高峰,显著高于其他各等级卵泡的表达量(P0.05,P0.01),之后表达量显著下降;不同时期同一等级卵泡颗粒层中的表达均表现为24周高于43周,小黄卵泡时期表现为24周显著高于43周(P0.05)。在膜层中,BMP15在2个品种的卵泡不同发育时期表达模式均呈"低→高→低"的趋势,表达高峰出现在小黄卵泡(SYF)时期,显著高于其他各等级卵泡的表达量(P0.05)。不同时期同一等级卵泡膜层中的表达基本相似,均表现为24周表达量高于43周,在小黄卵泡(SYF)时期膜层表达量表现为24周显著高于43周(P0.05)。BMP15基因的表达量在各级卵泡的颗粒层和膜层在2个群体间差异不显著。综合BMP15在2个群体不同时期卵泡的颗粒层和膜层中的表达模式研究表明,BMP15在鸡的卵泡发育过程中的表达存在时间、品种和组织差异性。     

优质鸡鸡冠与开产性状的回归分析

[目的]研究优质鸡鸡冠发育和开产性状之间的相关性。[方法]选取健康的S3系母系群体共800只母鸡为研究对象,测定冠高、冠长和开产性状等6个指标,进行优质鸡鸡冠与开产性状的回归分析。[结果]S3系母鸡冠高1、冠长、开产体重的变异系数较大,均超过10%,说明S3系在鸡冠发育和开产性能方面具有较大的选择潜力和提升空间;S3系鸡冠冠高与冠长呈显著正相关(P0.05),其中冠高1与冠长的相关系数最大(0.42),冠高和冠长与开产日龄呈极显著负相关(P0.01),其中冠长与开产日龄的相关系数最大(-0.45),而与开产体重和开产蛋重呈显著正相关(P0.05),其中冠高2与开产体重的相关系数最大,达到0.26。采用Linear Regression过程的回归分析方法,成功构建了优质鸡S3系鸡冠发育与开产性状的回归方程,证实了冠高和冠长可作为选择开产性状的间接性指标。[结论]该研究结果对于今后优质鸡的性成熟选育具有重要的理论参考意义。