密码子使用偏性量化方法研究综述

在基因组学水平上研究密码子使用偏性模式、成因并分析进化过程中的选择压力在基因组学研究中有重要意义。文章概述了目前提出的密码子使用偏性的量化方法及实现原理。目前研究发现：有些量化密码子偏性的方法受高表达基因参考数据集未完全注释的限制,不同密码子位置对变异和选择的影响不同,以及不同密码子位置处GC含量和嘌呤含量的贡献不同。由此展望密码子偏性量化方法发展方向为：需要设计不需要相关参考基因集合先验知识的密码子使用偏性量化方法;考虑不同位置处背景核苷酸组成的密码子使用偏性的量化方法;同时考虑基因表达水平的密码子使用偏性量化方法。最后,归纳了目前可用的密码子使用偏性的量化工具和数据库。     

DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响

[目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC（Approximate Correlation）为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR（Finite Impulse Response）窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN（Paired Numeric）法、EIIP（Electron-Io Interaction Potential）法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。     

DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响

[目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approxi-mate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP(Electron-IoInteraction Potential)法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。     

湖南省耕地资源动态变化及成因分析

耕地在人类的生存和发展中占据着重要地位,为人类发展、社会进步提供了基本的资源和条件,尤其是在我国经济高速发展时期。随着我国城市化的不断发展,城市不断扩大,可利用的耕地逐渐减少,而耕地的减少给经济发展带来了巨大压力。同时,我国耕地资源的变动是在某个时期国家对经济、政治、文化采取不同措施的结果,目的是促进国家快速发展。改革开放后,我国人口持续增长,尤其是湖南省处于人口增长的前列,湖南省经济进入了前所未有的高速发展时期,加之湖南省土地政策落实到位,合理运用土地资源,尽可能协调建筑用地、商业用地等,使湖南省耕地面积分布得到了优化,促进了农业、林业等行业的发展,为湖南省经济发展提供了耕地保障。     

一种基于改进通用梳状滤波器的基因预测算法

针对IIR滤波器在设计和使用中存在系统稳定性和群延迟造成输出滞后的问题,以通用梳状滤波器为例提出了适用于IIR NPBF的改进预测算法.在HMR195序列集上的预测结果表明,所提算法能有效提高编码区预测准确率.