一种用于桑RAD-Seq高通量测序的基因组DNA提取方法

[目的]筛选一种能够得到高质量桑树基因组DNA的方法。[方法]采用天根试剂盒法(Plant Genomic DNA Kit离心柱型),并稍加改进,从11个桑种的新鲜嫩叶中提取DNA。[结果]该方法简单快速,不需要复杂仪器,且能有效地除去桑叶中的多糖、多酚、蛋白质等杂质,得到的DNA能够满足RAD-Seq高通量的测序要求。[结论]建立了一种用于桑RAD-Seq高通量测序的基因组DNA提取方法。     

南充云雾山野生白桑 育2号 新疆白桑ITS序列及系统位置

研究了南充云雾山野生白桑、育2号、新疆白桑ITS序列长度、G+C%、变异位点和系统位置。ITS序列长度均为576bp,G+C百分含量分别为59.55%,59.55%,59.72%,南充云雾山野生白桑、育2号45位为A、505位、560位T;新疆白桑45位A、505位G、560位T。系统位置均在BranchesⅡ,与剑持、瑞穗桑同一分支。白桑ITS序列没有地理迁移的变化,是较早分化的物种。育2号、新疆白桑与剑持、瑞穗桑有较近的亲缘关系,宜长江流域以北栽培。ITS序列信息位点有限,在分析桑属的系统学时,需要另找片段,或与其它片段联合分析。     

四川桑树种质资源

报道了四川的野生、地方、选育、引进的桑树种质资源。四川有桑属植物9种,资源丰富。野生桑种分布不重叠,对研究桑属的起源、演化有重要的参考价值,且有特异性状,是桑树育种宝贵财富。地方桑树品种,种类繁多,长期在一个地区种植,具有明显的地区适应性。选育和引进的桑树品种,产叶量高,叶质好,推广时应注意引种适应性实验。     

丛枝菌根真菌对桑扦插苗生长的影响研究

采用温室盆栽的方法研究灭菌土中接种丛枝菌根真菌Glomus mosseae对桑扦插苗生长的影响.接种量为30个孢子菌剂(T1)、60个孢子菌剂(T2)和灭菌菌荆(CK).培育15 d统计发芽率,各处理均达到80%以上,接种丛枝菌根真菌对桑扦插苗的发芽率的影响不显著.培育30 d统计成活率,各处理分别为81.43±0.2%、84.67±0.1%、68.33±0.3%,接种丛枝菌根真菌能够显著提高扦插苗的成活率.培育90 d取根样制片观察,丛枝菌根真菌能够侵染扦插苗根系,T1,T2,CK的菌根侵染率分别为51.31±2.5%、69.23±2.2%和0,不同的接种处理,丛枝菌根真菌的侵染率不同.接种丛枝菌根真菌的处理后,主根长度、须根长度、须根数量、地下部分鲜质量和干质量都显著高于对照;T2的各项生长指标综合表现要好于T1.     

桑属ITS,TrnL-F,rps16序列分析及12个特殊桑资源评鉴

 【目的】分析桑属ITS,TrnL-F,rps16序列，探讨系统学价值，建立系统进化树，并对12个特殊桑资源进行评鉴，为开发利用提供理论依据。【方法】用67份桑资源，经DNA提取、PCR扩增、测序，测序结果用软件拼接、比对、除去非序列碱基，计算长度、G+C%含量、变异位点、信息位点、以构树、柘树为外类群，MP分析，根据分析结果，结合桑资源研究积累，对12个特殊桑资源进行评鉴。【结果】桑ITS(包括5.8S)基本序列576 bp ,变异范围576-590 bp，G+C% 59.55-62.25，40个信息位点；TrnL-F（包括tRNA-Leu内含子）基本序列923 bp , 变异范围920-924 bp, G+C%33.69-34.13，23个信息位点；rps16内含子基本序列929 bp ，变异范围923-929 bp，G+C%32.51-32.72，17个信息位点。最适碱基进化模型分别为(GTR+G),(GTR),(GTR+G),可能的分支概率，混合卡方概率值分别为0.000001 ,0.027175,0.000222, 三片段合并最适进化模型(GTR+G)，基于模型，MP分析， 2538个位点，80个信息位点。分支图首先将黑桑M. nigra分出，其它桑种分成两支，第一支桑(mulberry)，包括长穗桑、瑞穗桑、蒙桑、鬼桑、鸡桑、山桑、白桑、广东桑，第二支乔木桑(arbor)，包括华桑、奶桑、川桑。12个特殊桑资源，神农华桑♀（优质木材桑）分在第二支，乔木特性，其它11个特殊桑资源分在第一支，具桑(mulberry)特性。【结论】桑属TrnL-F;rps16序列信息位点有限，单独研究桑属系统学，价值不大，与ITS序列合并，能增加分支图的信息位点，使分支图更具客观性，更近于似然。基于ITS,TrnL-F;rps16序列MP分支图，新疆黑桑为最原始类型，乌克兰等栽培种是进化类型。桑属可根据分支的亲缘关系，结合桑资源研究积累，评鉴特殊桑资源。     

神农架及鄂西山区桑属(Morus)种质资源研究

研究了神衣架及鄂西山区桑属植物种质资源,该地区共有桑种9个,变种1个,根据收集的410份资源,探讨了桑属植物分布规律及适生环境,种性特征,珍稀资源．分析讨论了来风水桑的分类归属,过渡类型的存在与亲缘关系,并提出了珍稀资源开发利用建议．     

基于SSR标记分析四川省桑树种质资源的群体结构和遗传多样性

利用14对SSR引物对四川省89份桑树种质资源的基因组DNA进行PCR,分析种质资源间的群体结构和遗传多样性。共扩增出迁移率不同的条带65条,多态性条带65条,多态性条带比率达100%;Structure群体结构分析将89份桑树种质资源划分为4个群体,4个群体的多态性信息含量在0.552 0~0.599 8之间,总体为0.657 7;基因多样度在0.554 8~0.600 3之间,总体为0.579 0;等位基因数目在66~76个之间,总体为134个;等位基因丰富度在3.327 2~3.549 1之间,总体为3.983 1;遗传多样性主要来源于品种内,属中等偏高水平;14对SSR引物位点的总基因多样度Ht在0.291~0.931之间,整体为0.699;Nei’s种群内基因多样度Hs为0.287~0.910,整体为0.662;种群间基因多样度为0.003~0.098,整体为0.037;种群间基因分化系数为0.008~0.047,整体为0.053;基因流为2.901~62.000,整体为8.934,遗传变异主要发生在群体内,群体间分化程度低,基因流大。UPGMA聚类分析与群体结构分析结果大致相同,2种分析结果都显示分群无地理迁移规律。     

基于ITS分析云南光叶桑和钦州长果桑在桑属中的亲缘关系及分化时间

云南光叶桑、钦州长果桑在形态分类学上均属同一桑种Morus macroura。通过PCR扩增2份地方品种资源材料的ITS序列并分析序列差异及构建系统进化树,阐明各自在桑属中的遗传分化关系。2份材料的ITS序列长度均为576 bp,其中:云南光叶桑的G+C含量为59.90%,碱基序列45位A变G,560位T变G,与昆明奶桑(Morus macroura)、荥经川桑(Morus notabilis)、云南毛叶奶桑(Morus macroura var.mawa)、云南长穗桑(Morus wittiorum)、云南奶桑(Morus macroura)、雅安华桑(Morus cathayana)同在第Ⅰ类群,有较近的亲缘关系;钦州长果桑的G+C含量为59.72%,碱基序列45位为A,560位T变G,与云南华桑(Morus cathayana)同在第Ⅱ类群,有较近的亲缘关系。应用松散分子钟方法估算云南光叶桑与荥经川桑、雅安华桑、云南长穗桑的分化时间为8.23 Ma,钦州长果桑与云南华桑的分化时间为9.67 Ma,二者起源的地质年代是新第三纪中新世与上新世之交,是为了抵御地球寒冷、旱化,向南、向山地迁移形成的物种。     

《桑树病虫害防治学》本科课程教学改革探索

根据国家本科教育总体方针,推进宽口径人才培养模式,专业课学时数被逐渐减少,但又必须达到教学大纲的基本要求。笔者通过10多年的授课实践,结合教学体会、经验,探讨了《桑树病虫害防治学》本科课程的教学改革。     

四川省广安市果桑嫁接不成活原因分析

<正>果桑是以产桑果为主要目的的桑树品种的统称。桑果口味鲜美,具有极丰富的营养和多种医疗保健功能~([1])。前不久接到四川省广安市一个桑园业主,发来一些照片让我们分析一下果桑嫁接不成活原因,他在年初2月14日至3月6日在定植四年生的叶用桑树上,边剪枝锯桩边嫁接(芽接),春季整个桑园接穗均不发芽(图1)。通过详细分析、询问,发现这一果桑嫁接不成活原因涉及果桑(桑属)的一般知识,而目前许多蚕桑专业人员对这方面的