森林土壤微生物总DNA的提取方法

通过对土壤微生物总DNA的提取方法改进,获得改进提取法。利用改进提取法与MO BIO公司PowerSoil DNA Isolation Kit的试剂盒法,对4种不同林分的土壤微生物总DNA进行提取验证。结果表明,2种方法均能有效提取森林土壤总DNA,试剂盒法操作简单,DNA的提取质量高,后续PCR效果好,但其提取的DNA量较少且成本昂贵;改进提取法提取的DNA量是试剂盒法的2倍,较经济,但耗时较长,操作繁琐,后续PCR效果与试剂盒法比较相差不大,由于其DNA提取量多,该提取方法较适合应用于土壤宏基因组相关的分子生态学研究中。     

3种杉木林分不同季节细菌类群动态分析

通过对老龄杉木林、老龄杉木人工更新林以及天然更新的杉阔混交林其不同季节土壤细菌类群进行分析,揭示3种林分细菌类群的季节多样性及动态。结果表明:3种林分共检测到3 014种微生物类群,这些微生物类群分别属19门。其中约有127种未知种属的原核微生物,变形菌门、放线菌门、厚壁菌门为最主要的微生物门类。相同林分冬春季的细菌类群相似性最高,分别为0.794、0.710、0.695;3种林分秋冬季的细菌类群相似性最低,分别为0.106、0.079、0.067。不同林分间在冬春两季细菌类群相似性较高,夏秋两季细菌类群相似性较低。在林分之间的对比中,老龄杉木林和天然更新的杉阔混交林之间的细菌类群相似性最低。