RNA测序的研究进展

RNA测序研究是基因功能及结构研究的基础,能够从整体水平研究基因功能及其结构。随着高通量测序和定量检测技术的不断发展,能够通过RNA测序对转录组进行更深度更完整的研究。该研究进展包括改善转录起始位点的预测、链特异性测序、融合基因的检测、microRNA定量的分析以及RNA可变剪切的识别。目前利用单分子测序技术可以实现RNA的直接测序,通过二代测序技术与单分子测序技术相结合的方式,能更深层次、更全面地获得转录组信息。     

地方农业高校生物技术专业“生物信息学”课程的教学模式探索

随着自然科学、生命科学研究进入迅猛发展阶段,开设生物技术专业的地方农业高校逐步增多,而"生物信息学"是吉林农业大学生物技术专业的核心课程,是生命科学与大数据信息发展过程中的重要课程。本文针对吉林农业大学生物技术专业的生物信息学教学现状,分析和总结了教学环节中存在的主要问题,尝试从教材的选用、教学方法及教学改进三个方面对生物信息学教学体系的改革提出建议,希望对生命科学体系的教学改革提供一些帮助。     

诱导子协同对黄芪愈伤组织生理生化指标的影响

[目的]利用水杨酸和真菌诱导子协同作用,研究其对黄芪细胞培养物生理生化指标的影响,为药用植物作为生物反应器生产有用的次生代谢产物提供理论基础和技术体系。[方法]以黄芪组织培养物为材料,测定黄芪愈伤组织中POD、PAL、CAT的生物活性。[结果]黄芪愈伤组织中过氧化物酶、苯丙氨酸解氨酶及过氧化氢酶活性高于对照;H2O2和NO含量也明显高于对照。[结论]水杨酸和真菌诱导子的共同作用提高了黄芪愈伤组织的抗性,有利于黄芪愈伤组织生长,如在生产中加入诱导子,可创造更大的商业价值。     

芬顿反应制备低分子量硫酸软骨素及其降解机制

为了提高硫酸软骨素（chondroitin sulfate，CS）的生物活性和生物利用率，该研究通过芬顿反应制备了不同来源的低分子量硫酸软骨素（low molecular weight chondroitin sulfate，LMCS）并探究了其潜在降解机制。使用鸡来源的硫酸软骨素（chondroitin sulfate from chicken cartilage，CCS）、牛来源的硫酸软骨素（chondroitin sulfate from bovine cartilage，BCS）、鲨鱼来源的硫酸软骨素（chondroitin sulfate from shark cartilage，SCS），通过单因素试验优化CS的降解条件，随后测定了降解产物的化学组成和结构，并且通过密度泛函理论（density functional theory，DFT）和分子动力学模拟（molecular dynamics，MD）试验探究了其潜在的机制。结果表明，CS的降解条件分别为乙酸铜浓度0.5 mmol、pH值7.5和反应温度45 ℃。降解产物的单糖和双糖组成结果表明，CS中的硫酸软骨素A（CSA）的GlcA残基在降解反应中可能被优先攻击。红外图谱结果表明CS可能和羟基自由基反应生成了羧基衍生物。分子动力学模拟试验结果表明，CSA比非硫酸化软骨素（non-chondroitin sulfate，CSO）和硫酸软骨素C（CSC）更容易与·OH相互作用。密度泛函数计算表明，GlcA的C1-H(CSO: −65.288 3 kJ/mol、CSA: -69.985 3 kJ/mol、CSC: -64.826 2 kJ/mol)发生抽氢反应所需的能量比GalNAc(CSO: - 75.273 1 kJ/mol、CSA: -76.097 5 kJ/mol、CSC: -68.782 9 kJ/mol)的低。这些结果为生产LMCS提供了指导。